Lineage for Protein: Immunoglobulin light chain kappa variable domain, VL-kappa

  1. Root: SCOP 1.71
  2. 546417Class b: All beta proteins [48724] (149 folds)
  3. 546418Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (25 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
    some members of the fold have additional strands
  4. 546419Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (4 families) (S)
  5. 546420Family b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like) [48727] (28 proteins)
  6. 547289Protein Immunoglobulin light chain kappa variable domain, VL-kappa [88519] (14 species)
    VL-kappa domains of human and mouse antibodies are clustered by the sequence similarity within the germline encoded segment and then by the size of the complementarity determining regions CDR1 and CDR2, so the clusters may correspond to putative germline families in the species genomes; VL-kappa domains with artificial or grafted exogenous CDRs are listed as engineered species

Species:

  1. 547290Engineered (including hybrid species) [88533] (52 PDB entries)
    1. Domains for 1ad0:
      1. 547324Domain d1ad0a1: 1ad0 A:1-107 [20124]
        Other proteins in same PDB: d1ad0a2, d1ad0b1, d1ad0b2, d1ad0c2, d1ad0d1, d1ad0d2
      2. 547325Domain d1ad0c1: 1ad0 C:1-107 [20126]
        Other proteins in same PDB: d1ad0a2, d1ad0b1, d1ad0b2, d1ad0c2, d1ad0d1, d1ad0d2
        part of humanized Fab A5B7
    2. Domains for 1ad9:
      1. 547338Domain d1ad9a1: 1ad9 A:1-107 [20214]
        Other proteins in same PDB: d1ad9a2, d1ad9b1, d1ad9b2, d1ad9h1, d1ad9h2, d1ad9l2
        part of humanized Fab CTM01
        complexed with so4
      2. 547339Domain d1ad9l1: 1ad9 L:1-107 [20212]
        Other proteins in same PDB: d1ad9a2, d1ad9b1, d1ad9b2, d1ad9h1, d1ad9h2, d1ad9l2
    3. Domain for 1b2w:
    4. Domains for 1bvk:
      1. 547343Domain d1bvka_: 1bvk A: [20278]
        Other proteins in same PDB: d1bvkb_, d1bvkc_, d1bvke_, d1bvkf_
      2. 547344Domain d1bvkd_: 1bvk D: [20280]
        Other proteins in same PDB: d1bvkb_, d1bvkc_, d1bvke_, d1bvkf_
        part of humanized anti-lysozyme Fv HuLys11
    5. Domains for 1bvl:
      1. 547350Domain d1bvlb_: 1bvl B: [20283]
        Other proteins in same PDB: d1bvla_, d1bvlc_
      2. 547351Domain d1bvld_: 1bvl D: [20285]
        Other proteins in same PDB: d1bvla_, d1bvlc_
        part of humanized anti-lysozyme Fv HuLys11
    6. Domain for 1fgv:
    7. Domains for 1fvc:
      1. 547309Domain d1fvca_: 1fvc A: [19862]
        Other proteins in same PDB: d1fvcb_, d1fvcd_
      2. 547310Domain d1fvcc_: 1fvc C: [19864]
        Other proteins in same PDB: d1fvcb_, d1fvcd_
        part of humanized Fv 4D5, herceptin
    8. Domains for 1fvd:
      1. 547321Domain d1fvda1: 1fvd A:1-107 [19866]
        Other proteins in same PDB: d1fvda2, d1fvdb1, d1fvdb2, d1fvdc2, d1fvdd1, d1fvdd2
      2. 547322Domain d1fvdc1: 1fvd C:1-107 [19868]
        Other proteins in same PDB: d1fvda2, d1fvdb1, d1fvdb2, d1fvdc2, d1fvdd1, d1fvdd2
        part of humanized Fab 4D5, herceptin
    9. Domains for 1fve:
      1. 547331Domain d1fvea1: 1fve A:1-107 [19870]
        Other proteins in same PDB: d1fvea2, d1fveb1, d1fveb2, d1fvec2, d1fved1, d1fved2
      2. 547332Domain d1fvec1: 1fve C:1-107 [19872]
        Other proteins in same PDB: d1fvea2, d1fveb1, d1fveb2, d1fvec2, d1fved1, d1fved2
        part of humanized Fab 4D5, herceptin
    10. Domains for 1gpo:
      1. 547301Domain d1gpol1: 1gpo L:1-112 [20224]
        Other proteins in same PDB: d1gpoh1, d1gpoh2, d1gpoi1, d1gpoi2, d1gpol2, d1gpom2
      2. 547302Domain d1gpom1: 1gpo M:1-112 [20226]
        Other proteins in same PDB: d1gpoh1, d1gpoh2, d1gpoi1, d1gpoi2, d1gpol2, d1gpom2
        complexed with so4
    11. Domains for 1i9r:
      1. 547352Domain d1i9rl1: 1i9r L:1-111 [71155]
        Other proteins in same PDB: d1i9ra_, d1i9rb_, d1i9rc_, d1i9rh1, d1i9rh2, d1i9rk1, d1i9rk2, d1i9rl2, d1i9rm2, d1i9rx1, d1i9rx2, d1i9ry2
      2. 547353Domain d1i9rm1: 1i9r M:1-111 [71157]
        Other proteins in same PDB: d1i9ra_, d1i9rb_, d1i9rc_, d1i9rh1, d1i9rh2, d1i9rk1, d1i9rk2, d1i9rl2, d1i9rm2, d1i9rx1, d1i9rx2, d1i9ry2
      3. 547354Domain d1i9ry1: 1i9r Y:1-111 [71161]
        Other proteins in same PDB: d1i9ra_, d1i9rb_, d1i9rc_, d1i9rh1, d1i9rh2, d1i9rk1, d1i9rk2, d1i9rl2, d1i9rm2, d1i9rx1, d1i9rx2, d1i9ry2
        part of humanized Fab 5C8 against C40 ligand
        complexed with zn
    12. Domain for 1it9:
    13. Domains for 1ivl:
      1. 547305Domain d1ivla_: 1ivl A: [20516]
      2. 547306Domain d1ivlb_: 1ivl B: [20517]
        VL domain of synthetic antibody M29B; "reversed" dimerisation mode
        complexed with ipa
    14. Domain for 1jps:
    15. Domain for 1jpt:
    16. Domain for 1jv5:
    17. Domain for 1l7i:
    18. Domains for 1mhp:
      1. 547336Domain d1mhpl1: 1mhp L:2-106 [84969]
        Other proteins in same PDB: d1mhpa_, d1mhpb_, d1mhph1, d1mhph2, d1mhpl2, d1mhpx_
        part of humanized anti-alpha1 integrin I-domain Fab
        complexed with mn; mutant
      2. 547337Domain d1mhpy_: 1mhp Y: [84972]
        Other proteins in same PDB: d1mhpa_, d1mhpb_, d1mhph1, d1mhph2, d1mhpl2, d1mhpx_
        part of humanized anti-alpha1 integrin I-domain Fab; only V domain is ordered
        complexed with mn; mutant
    19. Domain for 1n8z:
    20. Domains for 1om3:
      1. 547316Domain d1om3l1: 1om3 L:2-107 [87063]
        Other proteins in same PDB: d1om3h1, d1om3h2, d1om3k1, d1om3k2, d1om3l2, d1om3m2
      2. 547317Domain d1om3m1: 1om3 M:2-107 [87065]
        Other proteins in same PDB: d1om3h1, d1om3h2, d1om3k1, d1om3k2, d1om3l2, d1om3m2
        part of engineered Fab 2G12
    21. Domains for 1op3:
      1. 547296Domain d1op3k1: 1op3 K:2-107 [87210]
        Other proteins in same PDB: d1op3h1, d1op3h2, d1op3k2, d1op3l2, d1op3m1, d1op3m2
      2. 547297Domain d1op3l1: 1op3 L:2-107 [87212]
        Other proteins in same PDB: d1op3h1, d1op3h2, d1op3k2, d1op3l2, d1op3m1, d1op3m2
        part of engineered Fab 2G12
        complexed with box, man
    22. Domains for 1op5:
      1. 547357Domain d1op5k1: 1op5 K:2-107 [87218]
        Other proteins in same PDB: d1op5h1, d1op5h2, d1op5k2, d1op5l2, d1op5m1, d1op5m2
      2. 547358Domain d1op5l1: 1op5 L:2-107 [87220]
        Other proteins in same PDB: d1op5h1, d1op5h2, d1op5k2, d1op5l2, d1op5m1, d1op5m2
        part of engineered Fab 2G12
        complexed with man, nag
    23. Domains for 1pg7:
      1. 547327Domain d1pg7l1: 1pg7 L:1-107 [94678]
        Other proteins in same PDB: d1pg7h1, d1pg7h2, d1pg7i1, d1pg7i2, d1pg7l2, d1pg7m2, d1pg7w1, d1pg7w2, d1pg7x1, d1pg7x2, d1pg7y1, d1pg7y2, d1pg7z1, d1pg7z2
      2. 547328Domain d1pg7m1: 1pg7 M:1-107 [94680]
        Other proteins in same PDB: d1pg7h1, d1pg7h2, d1pg7i1, d1pg7i2, d1pg7l2, d1pg7m2, d1pg7w1, d1pg7w2, d1pg7x1, d1pg7x2, d1pg7y1, d1pg7y2, d1pg7z1, d1pg7z2
        part of humanized Fab D3H44 against human tissue factor
    24. Domain for 1rjl:
    25. Domain for 1s3k:
    26. Domains for 1s78:
      1. 547355Domain d1s78c1: 1s78 C:1-107 [98624]
        Other proteins in same PDB: d1s78a1, d1s78a2, d1s78a3, d1s78a4, d1s78b1, d1s78b2, d1s78b3, d1s78b4, d1s78c2, d1s78d1, d1s78d2, d1s78e2, d1s78f1, d1s78f2
      2. 547356Domain d1s78e1: 1s78 E:1-107 [98628]
        Other proteins in same PDB: d1s78a1, d1s78a2, d1s78a3, d1s78a4, d1s78b1, d1s78b2, d1s78b3, d1s78b4, d1s78c2, d1s78d1, d1s78d2, d1s78e2, d1s78f1, d1s78f2
        part of anti-ERBb2 Fab Pertuzumab
        complexed with man, nag
    27. Domains for 1t04:
      1. 547347Domain d1t04a1: 1t04 A:1-108 [112182]
        Other proteins in same PDB: d1t04a2, d1t04b1, d1t04b2, d1t04c2, d1t04d1, d1t04d2
      2. 547348Domain d1t04c1: 1t04 C:1-108 [112186]
        Other proteins in same PDB: d1t04a2, d1t04b1, d1t04b2, d1t04c2, d1t04d1, d1t04d2
    28. Domain for 1t3f:
    29. Domain for 1tjg:
    30. Domain for 1tjh:
    31. Domain for 1tji:
    32. Domains for 1tzh:
      1. 547333Domain d1tzha1: 1tzh A:1-107 [107477]
        Other proteins in same PDB: d1tzha2, d1tzhb1, d1tzhb2, d1tzhh1, d1tzhh2, d1tzhl2, d1tzhv_, d1tzhw_
      2. 547334Domain d1tzhl1: 1tzh L:1-107 [107483]
        Other proteins in same PDB: d1tzha2, d1tzhb1, d1tzhb2, d1tzhh1, d1tzhh2, d1tzhl2, d1tzhv_, d1tzhw_
    33. Domain for 1tzi:
    34. Domain for 1u8h:
    35. Domain for 1u8i:
    36. Domain for 1u8j:
    37. Domain for 1u8k:
    38. Domain for 1u8l:
    39. Domain for 1u8m:
    40. Domain for 1u8n:
    41. Domain for 1u8o:
    42. Domain for 1u8p:
    43. Domain for 1u8q:
    44. Domain for 1u91:
    45. Domain for 1u92:
    46. Domain for 1u93:
    47. Domain for 1u95:
    48. Domain for 1uj3:
    49. Domain for 2f5a:
    50. Domain for 2f5b:
    51. Domain for 2fgw:
    52. Domain for 2imn:
      • 547293Domain d2imn__: 2imn - [19856]
        VL domain only of humanized antibody MCPC603
        complexed with ace, so4; mutant
  2. 547362Human (Homo sapiens), cluster 1 [TaxId:9606] [88520] (18 PDB entries)
    1. Domain for 1ar2:
      • 547404Domain d1ar2__: 1ar2 - [20522]
        VL of Bence-Jones protein REI; disulfide-free mutant
    2. Domains for 1b0w:
      1. 547367Domain d1b0wa_: 1b0w A: [20532]
      2. 547368Domain d1b0wb_: 1b0w B: [20533]
      3. 547369Domain d1b0wc_: 1b0w C: [20534]
        VL dimer of Bence-Jones protein BRE
    3. Domains for 1b6d:
      1. 547388Domain d1b6da1: 1b6d A:1-107 [20603]
        Other proteins in same PDB: d1b6da2, d1b6db2
      2. 547389Domain d1b6db1: 1b6d B:1-107 [20604]
        Other proteins in same PDB: d1b6da2, d1b6db2
        part of Bence-Jones protein DEL
    4. Domains for 1bre:
      1. 547377Domain d1brea_: 1bre A: [20538]
      2. 547378Domain d1breb_: 1bre B: [20539]
      3. 547379Domain d1brec_: 1bre C: [20540]
      4. 547380Domain d1bred_: 1bre D: [20541]
      5. 547381Domain d1bree_: 1bre E: [20542]
      6. 547382Domain d1bref_: 1bre F: [20543]
        VL dimer of Bence-Jones protein BRE
    5. Domains for 1bww:
      1. 547363Domain d1bwwa_: 1bww A: [20518]
      2. 547364Domain d1bwwb_: 1bww B: [20519]
        VL dimer of Bence-Jones protein REI
        mutant
    6. Domains for 1dee:
      1. 547390Domain d1deea1: 1dee A:1-107 [20442]
        Other proteins in same PDB: d1deea2, d1deeb1, d1deeb2, d1deec2, d1deed1, d1deed2, d1deee2, d1deef1, d1deef2, d1deeg_, d1deeh_
      2. 547391Domain d1deec1: 1dee C:1001-1107 [20444]
        Other proteins in same PDB: d1deea2, d1deeb1, d1deeb2, d1deec2, d1deed1, d1deed2, d1deee2, d1deef1, d1deef2, d1deeg_, d1deeh_
      3. 547392Domain d1deee1: 1dee E:2001-2107 [20446]
        Other proteins in same PDB: d1deea2, d1deeb1, d1deeb2, d1deec2, d1deed1, d1deed2, d1deee2, d1deef1, d1deef2, d1deeg_, d1deeh_
        part of IgM RF 2A2
    7. Domain for 1dfb:
    8. Domain for 1dql:
    9. Domain for 1f6l:
    10. Domains for 1hez:
      1. 547394Domain d1heza1: 1hez A:1-107 [60983]
        Other proteins in same PDB: d1heza2, d1hezb1, d1hezb2, d1hezc2, d1hezd1, d1hezd2, d1heze_
      2. 547395Domain d1hezc1: 1hez C:1-107 [60987]
        Other proteins in same PDB: d1heza2, d1hezb1, d1hezb2, d1hezc2, d1hezd1, d1hezd2, d1heze_
        part of IgM RF 2A2
        complexed with imd
    11. Domain for 1igm:
    12. Domains for 1qp1:
      1. 547374Domain d1qp1a_: 1qp1 A: [20535]
      2. 547375Domain d1qp1b_: 1qp1 B: [20536]
      3. 547376Domain d1qp1c_: 1qp1 C: [20537]
        VL dimer of Bence-Jones protein BRE
    13. Domains for 1rei:
      1. 547383Domain d1reia_: 1rei A: [20520]
      2. 547384Domain d1reib_: 1rei B: [20521]
        VL dimer of Bence-Jones protein REI
    14. Domain for 1rz7:
    15. Domains for 1rzg:
      1. 547371Domain d1rzgb1: 1rzg B:1-107 [98156]
        Other proteins in same PDB: d1rzga1, d1rzga2, d1rzgb2, d1rzgc1, d1rzgc2, d1rzgd2
      2. 547372Domain d1rzgd1: 1rzg D:1-107 [98160]
        Other proteins in same PDB: d1rzga1, d1rzga2, d1rzgb2, d1rzgc1, d1rzgc2, d1rzgd2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 412D
        complexed with suc
    16. Domains for 1rzi:
      1. 547396Domain d1rzia1: 1rzi A:2-107 [98166]
        Other proteins in same PDB: d1rzia2, d1rzib1, d1rzib2, d1rzic2, d1rzid1, d1rzid2, d1rzie2, d1rzif1, d1rzif2, d1rzig2, d1rzih1, d1rzih2, d1rzii2, d1rzij1, d1rzij2, d1rzik2, d1rzil1, d1rzil2, d1rzim2, d1rzin1, d1rzin2, d1rzio2, d1rzip1, d1rzip2
      2. 547397Domain d1rzic1: 1rzi C:1-107 [98170]
        Other proteins in same PDB: d1rzia2, d1rzib1, d1rzib2, d1rzic2, d1rzid1, d1rzid2, d1rzie2, d1rzif1, d1rzif2, d1rzig2, d1rzih1, d1rzih2, d1rzii2, d1rzij1, d1rzij2, d1rzik2, d1rzil1, d1rzil2, d1rzim2, d1rzin1, d1rzin2, d1rzio2, d1rzip1, d1rzip2
      3. 547398Domain d1rzie1: 1rzi E:2-107 [98174]
        Other proteins in same PDB: d1rzia2, d1rzib1, d1rzib2, d1rzic2, d1rzid1, d1rzid2, d1rzie2, d1rzif1, d1rzif2, d1rzig2, d1rzih1, d1rzih2, d1rzii2, d1rzij1, d1rzij2, d1rzik2, d1rzil1, d1rzil2, d1rzim2, d1rzin1, d1rzin2, d1rzio2, d1rzip1, d1rzip2
      4. 547399Domain d1rzig1: 1rzi G:2-107 [98178]
        Other proteins in same PDB: d1rzia2, d1rzib1, d1rzib2, d1rzic2, d1rzid1, d1rzid2, d1rzie2, d1rzif1, d1rzif2, d1rzig2, d1rzih1, d1rzih2, d1rzii2, d1rzij1, d1rzij2, d1rzik2, d1rzil1, d1rzil2, d1rzim2, d1rzin1, d1rzin2, d1rzio2, d1rzip1, d1rzip2
      5. 547400Domain d1rzii1: 1rzi I:2-107 [98182]
        Other proteins in same PDB: d1rzia2, d1rzib1, d1rzib2, d1rzic2, d1rzid1, d1rzid2, d1rzie2, d1rzif1, d1rzif2, d1rzig2, d1rzih1, d1rzih2, d1rzii2, d1rzij1, d1rzij2, d1rzik2, d1rzil1, d1rzil2, d1rzim2, d1rzin1, d1rzin2, d1rzio2, d1rzip1, d1rzip2
      6. 547401Domain d1rzik1: 1rzi K:2-107 [98186]
        Other proteins in same PDB: d1rzia2, d1rzib1, d1rzib2, d1rzic2, d1rzid1, d1rzid2, d1rzie2, d1rzif1, d1rzif2, d1rzig2, d1rzih1, d1rzih2, d1rzii2, d1rzij1, d1rzij2, d1rzik2, d1rzil1, d1rzil2, d1rzim2, d1rzin1, d1rzin2, d1rzio2, d1rzip1, d1rzip2
      7. 547402Domain d1rzim1: 1rzi M:2-107 [98190]
        Other proteins in same PDB: d1rzia2, d1rzib1, d1rzib2, d1rzic2, d1rzid1, d1rzid2, d1rzie2, d1rzif1, d1rzif2, d1rzig2, d1rzih1, d1rzih2, d1rzii2, d1rzij1, d1rzij2, d1rzik2, d1rzil1, d1rzil2, d1rzim2, d1rzin1, d1rzin2, d1rzio2, d1rzip1, d1rzip2
      8. 547403Domain d1rzio1: 1rzi O:2-107 [98194]
        Other proteins in same PDB: d1rzia2, d1rzib1, d1rzib2, d1rzic2, d1rzid1, d1rzid2, d1rzie2, d1rzif1, d1rzif2, d1rzig2, d1rzih1, d1rzih2, d1rzii2, d1rzij1, d1rzij2, d1rzik2, d1rzil1, d1rzil2, d1rzim2, d1rzin1, d1rzin2, d1rzio2, d1rzip1, d1rzip2
        part of anti HIV-1 gp120-reactive Fab 47E
    17. Domain for 1vge:
    18. Domains for 1wtl:
      1. 547365Domain d1wtla_: 1wtl A: [20530]
      2. 547366Domain d1wtlb_: 1wtl B: [20531]
        VL dimer of Bence-Jones protein WAT
  3. 547405Human (Homo sapiens), cluster 2 [TaxId:9606] [88521] (10 PDB entries)
    1. Domains for 1eeq:
      1. 547406Domain d1eeqa_: 1eeq A: [20544]
      2. 547407Domain d1eeqb_: 1eeq B: [20545]
        VL dimer of Bence-Jones protein LEN
        mutant
    2. Domains for 1eeu:
      1. 547408Domain d1eeua_: 1eeu A: [20546]
      2. 547409Domain d1eeub_: 1eeu B: [20547]
        VL dimer of Bence-Jones protein LEN
        complexed with ipa; mutant
    3. Domain for 1efq:
      • 547410Domain d1efqa_: 1efq A: [20548]
        VL dimer of Bence-Jones protein LEN
        complexed with ium, zn; mutant
    4. Domains for 1ek3:
      1. 547413Domain d1ek3a_: 1ek3 A: [59434]
      2. 547414Domain d1ek3b_: 1ek3 B: [59435]
        VL dimer of Bence-Jones protein REC
        complexed with ca, cl
    5. Domain for 1lve:
    6. Domains for 1qac:
      1. 547411Domain d1qaca_: 1qac A: [20549]
      2. 547412Domain d1qacb_: 1qac B: [20550]
        VL dimer of Bence-Jones protein LEN
    7. Domain for 2lve:
    8. Domain for 3lve:
      • 547415Domain d3lve__: 3lve - [20552]
        VL dimer of Bence-Jones protein LEN
        complexed with zn; mutant
    9. Domains for 4lve:
      1. 547418Domain d4lvea_: 4lve A: [20554]
      2. 547419Domain d4lveb_: 4lve B: [20555]
        VL dimer of Bence-Jones protein LEN
        mutant
    10. Domain for 5lve:
  4. 547421Human (Homo sapiens), cluster 3.1 [TaxId:9606] [88522] (5 PDB entries)
    1. Domains for 1dn0:
      1. 547425Domain d1dn0a1: 1dn0 A:1-107 [19830]
        Other proteins in same PDB: d1dn0a2, d1dn0b1, d1dn0b2, d1dn0c2, d1dn0d1, d1dn0d2
      2. 547426Domain d1dn0c1: 1dn0 C:1-107 [19832]
        Other proteins in same PDB: d1dn0a2, d1dn0b1, d1dn0b2, d1dn0c2, d1dn0d1, d1dn0d2
        part of Fab Kau cold agglutinin IgM
    2. Domains for 1hzh:
      1. 547427Domain d1hzhl1: 1hzh L:1-107 [61445]
        Other proteins in same PDB: d1hzhh1, d1hzhh2, d1hzhh3, d1hzhh4, d1hzhk1, d1hzhk2, d1hzhk3, d1hzhk4, d1hzhl2, d1hzhm2
      2. 547428Domain d1hzhm1: 1hzh M:1-107 [61447]
        Other proteins in same PDB: d1hzhh1, d1hzhh2, d1hzhh3, d1hzhh4, d1hzhk1, d1hzhk2, d1hzhk3, d1hzhk4, d1hzhl2, d1hzhm2
        part of intact IgG B12 antibody
        complexed with fuc, gal, man, nag
    3. Domain for 1iqd:
    4. Domains for 1n0x:
      1. 547422Domain d1n0xl1: 1n0x L:1-107 [91532]
        Other proteins in same PDB: d1n0xh1, d1n0xh2, d1n0xk1, d1n0xk2, d1n0xl2, d1n0xm2
      2. 547423Domain d1n0xm1: 1n0x M:1-107 [91534]
        Other proteins in same PDB: d1n0xh1, d1n0xh2, d1n0xk1, d1n0xk2, d1n0xl2, d1n0xm2
        part of an anti HIV-1 Fab
        complexed with cxs, gol, k, orn, so4
    5. Domains for 1qlr:
      1. 547429Domain d1qlra1: 1qlr A:1-107 [19834]
        Other proteins in same PDB: d1qlra2, d1qlrb1, d1qlrb2, d1qlrc2, d1qlrd1, d1qlrd2
      2. 547430Domain d1qlrc1: 1qlr C:1-107 [19836]
        Other proteins in same PDB: d1qlra2, d1qlrb1, d1qlrb2, d1qlrc2, d1qlrd1, d1qlrd2
        part of Fab Kau cold agglutinin IgM
        complexed with fuc, nag
  5. 547431Human (Homo sapiens), cluster 3.2 [TaxId:9606] [88523] (7 PDB entries)
    1. Domain for 1g9m:
    2. Domain for 1g9n:
    3. Domain for 1gc1:
    4. Domains for 1rhh:
      1. 547432Domain d1rhha1: 1rhh A:1-106A [97473]
        Other proteins in same PDB: d1rhha2, d1rhhb1, d1rhhb2, d1rhhc2, d1rhhd1, d1rhhd2
      2. 547433Domain d1rhhc1: 1rhh C:1-106A [97477]
        Other proteins in same PDB: d1rhha2, d1rhhb1, d1rhhb2, d1rhhc2, d1rhhd1, d1rhhd2
        part of HIV-1 neutralizing Fab x5
    5. Domains for 1rz8:
      1. 547434Domain d1rz8a1: 1rz8 A:1-109 [98137]
        Other proteins in same PDB: d1rz8a2, d1rz8b1, d1rz8b2, d1rz8c2, d1rz8d1, d1rz8d2
      2. 547435Domain d1rz8c1: 1rz8 C:1-109 [98141]
        Other proteins in same PDB: d1rz8a2, d1rz8b1, d1rz8b2, d1rz8c2, d1rz8d1, d1rz8d2
        part of anti HIV-1 gp120 Fab 17B
    6. Domain for 1rzj:
    7. Domain for 1rzk:
  6. 547441Mouse (Mus musculus), cluster 1.1 [TaxId:10090] [88524] (126 PDB entries)
    1. Domain for 1a3l:
    2. Domains for 1a4j:
      1. 547522Domain d1a4ja1: 1a4j A:1-112 [20232]
        Other proteins in same PDB: d1a4ja2, d1a4jb1, d1a4jb2, d1a4jh1, d1a4jh2, d1a4jl2
        part of humanized Diels-Alder catalytic Fab; germline precursor
      2. 547523Domain d1a4jl1: 1a4j L:1-112 [20230]
        Other proteins in same PDB: d1a4ja2, d1a4jb1, d1a4jb2, d1a4jh1, d1a4jh2, d1a4jl2
    3. Domains for 1a4k:
      1. 547540Domain d1a4ka1: 1a4k A:1-112 [20236]
        Other proteins in same PDB: d1a4ka2, d1a4kb1, d1a4kb2, d1a4kh1, d1a4kh2, d1a4kl2
        part of humanized Diels-Alder catalytic Fab
        complexed with cd, fra
      2. 547541Domain d1a4kl1: 1a4k L:1-112 [20234]
        Other proteins in same PDB: d1a4ka2, d1a4kb1, d1a4kb2, d1a4kh1, d1a4kh2, d1a4kl2
    4. Domain for 1ae6:
    5. Domain for 1axt:
    6. Domain for 1bfv:
    7. Domains for 1bln:
      1. 547558Domain d1blna1: 1bln A:1-107 [20330]
        Other proteins in same PDB: d1blna2, d1blnb1, d1blnb2, d1blnc2, d1blnd1, d1blnd2
      2. 547559Domain d1blnc1: 1bln C:1-107 [20332]
        Other proteins in same PDB: d1blna2, d1blnb1, d1blnb2, d1blnc2, d1blnd1, d1blnd2
        part of anti-P-glycoprotein Fab MRK-16
    8. Domain for 1c1e:
    9. Domain for 1cbv:
    10. Domain for 1cfv:
    11. Domain for 1cgs:
    12. Domain for 1cl7:
    13. Domain for 1cly:
    14. Domain for 1clz:
    15. Domain for 1cr9:
    16. Domain for 1cu4:
    17. Domain for 1dba:
    18. Domain for 1dbb:
    19. Domain for 1dbj:
    20. Domain for 1dbk:
    21. Domain for 1dbm:
    22. Domain for 1dlf:
    23. Domain for 1dsf:
      • 547494Domain d1dsfl_: 1dsf L: [20246]
        Other proteins in same PDB: d1dsfh_
        part of anticancer Fv B1; disulfide-stabilized
        mutant
    24. Domain for 1ehl:
    25. Domains for 1f3d:
      1. 547457Domain d1f3dj1: 1f3d J:1-107 [20461]
        Other proteins in same PDB: d1f3dh1, d1f3dh2, d1f3dj2, d1f3dk1, d1f3dk2, d1f3dl2
        part of catalytic Fab 4B2
        complexed with so4, tpm
      2. 547458Domain d1f3dl1: 1f3d L:1-107 [20460]
        Other proteins in same PDB: d1f3dh1, d1f3dh2, d1f3dj2, d1f3dk1, d1f3dk2, d1f3dl2
    26. Domain for 1f8t:
    27. Domain for 1f90:
    28. Domains for 1fl3:
      1. 547543Domain d1fl3b1: 1fl3 B:2-113 [20487]
        Other proteins in same PDB: d1fl3a1, d1fl3a2, d1fl3b2, d1fl3h1, d1fl3h2, d1fl3l2
        part of blue fluorescent Fab 19G2
        complexed with spb
      2. 547544Domain d1fl3l1: 1fl3 L:2-113 [20485]
        Other proteins in same PDB: d1fl3a1, d1fl3a2, d1fl3b2, d1fl3h1, d1fl3h2, d1fl3l2
    29. Domains for 1fl5:
      1. 547502Domain d1fl5a1: 1fl5 A:1-107 [65015]
        Other proteins in same PDB: d1fl5a2, d1fl5b1, d1fl5b2, d1fl5h1, d1fl5h2, d1fl5l2
        part of humanized catalytic Fab 28b4 with a sulfide oxidase activity
        complexed with so4; mutant
      2. 547503Domain d1fl5l1: 1fl5 L:1-107 [65021]
        Other proteins in same PDB: d1fl5a2, d1fl5b1, d1fl5b2, d1fl5h1, d1fl5h2, d1fl5l2
    30. Domains for 1fl6:
      1. 547568Domain d1fl6a1: 1fl6 A:1-107 [65023]
        Other proteins in same PDB: d1fl6a2, d1fl6b1, d1fl6b2, d1fl6h1, d1fl6h2, d1fl6l2
        part of humanized catalytic Fab 28b4 with a sulfide oxidase activity
        complexed with aah; mutant
      2. 547569Domain d1fl6l1: 1fl6 L:1-107 [65029]
        Other proteins in same PDB: d1fl6a2, d1fl6b1, d1fl6b2, d1fl6h1, d1fl6h2, d1fl6l2
    31. Domain for 1flr:
    32. Domain for 1fpt:
    33. Domain for 1hyx:
    34. Domain for 1hyy:
    35. Domain for 1i9i:
    36. Domain for 1i9j:
    37. Domains for 1igf:
      1. 547562Domain d1igfl1: 1igf L:1-107 [19812]
        Other proteins in same PDB: d1igfh1, d1igfh2, d1igfj1, d1igfj2, d1igfl2, d1igfm2
      2. 547563Domain d1igfm1: 1igf M:1-107 [19814]
        Other proteins in same PDB: d1igfh1, d1igfh2, d1igfj1, d1igfj2, d1igfl2, d1igfm2
        part of Fab B13I2
        complexed with nag
    38. Domain for 1igi:
    39. Domains for 1igj:
      1. 547531Domain d1igja1: 1igj A:1-107 [19818]
        Other proteins in same PDB: d1igja2, d1igjb1, d1igjb2, d1igjc2, d1igjd1, d1igjd2
      2. 547532Domain d1igjc1: 1igj C:1-107 [19820]
        Other proteins in same PDB: d1igja2, d1igjb1, d1igjb2, d1igjc2, d1igjd1, d1igjd2
        part of Fab 26-10
        complexed with dgx
    40. Domain for 1jgu:
    41. Domain for 1jgv:
    42. Domains for 1jp5:
      1. 547564Domain d1jp5a1: 1jp5 A:1-112 [67001]
        Other proteins in same PDB: d1jp5a2, d1jp5b2
      2. 547565Domain d1jp5b1: 1jp5 B:1-112 [67003]
        Other proteins in same PDB: d1jp5a2, d1jp5b2
        part of scFv 1695; complexed with the epitope peptide from HIV-1 protease
    43. Domain for 1keg:
    44. Domain for 1kel:
    45. Domain for 1kem:
    46. Domains for 1kfa:
      1. 547577Domain d1kfal1: 1kfa L:1-112 [77365]
        Other proteins in same PDB: d1kfah1, d1kfah2, d1kfai1, d1kfai2, d1kfal2, d1kfam2
      2. 547578Domain d1kfam1: 1kfa M:1-112 [77367]
        Other proteins in same PDB: d1kfah1, d1kfah2, d1kfai1, d1kfai2, d1kfal2, d1kfam2
        part of anti-gibberellin A4 Fab 4-B8(8)/E9; conflict: annotated in PDB as human protein
        complexed with ga4
    47. Domain for 1kn2:
    48. Domain for 1kn4:
    49. Domain for 1ktr:
    50. Domain for 1l7t:
    51. Domains for 1lmk:
      1. 547549Domain d1lmka2: 1lmk A:201-312 [20035]
        Other proteins in same PDB: d1lmka1, d1lmkc1, d1lmke1, d1lmkg1
      2. 547550Domain d1lmkc2: 1lmk C:201-312 [20037]
        Other proteins in same PDB: d1lmka1, d1lmkc1, d1lmke1, d1lmkg1
      3. 547551Domain d1lmke2: 1lmk E:201-312 [20039]
        Other proteins in same PDB: d1lmka1, d1lmkc1, d1lmke1, d1lmkg1
      4. 547552Domain d1lmkg2: 1lmk G:201-312 [20041]
        Other proteins in same PDB: d1lmka1, d1lmkc1, d1lmke1, d1lmkg1
        part of scFv diabody L5MK16
    52. Domains for 1lo0:
      1. 547486Domain d1lo0l1: 1lo0 L:1-112 [74117]
        Other proteins in same PDB: d1lo0h1, d1lo0h2, d1lo0l2, d1lo0x2, d1lo0y1, d1lo0y2
        part of retro Diels-Alder catalytic Fab 9D9
        complexed with bc1
      2. 547487Domain d1lo0x1: 1lo0 X:1-112 [74119]
        Other proteins in same PDB: d1lo0h1, d1lo0h2, d1lo0l2, d1lo0x2, d1lo0y1, d1lo0y2
    53. Domains for 1lo2:
      1. 547488Domain d1lo2l1: 1lo2 L:1-112 [74125]
        Other proteins in same PDB: d1lo2h1, d1lo2h2, d1lo2l2, d1lo2x2, d1lo2y1, d1lo2y2
        part of retro Diels-Alder catalytic Fab 9D9
        complexed with ox1
      2. 547489Domain d1lo2x1: 1lo2 X:1-112 [74127]
        Other proteins in same PDB: d1lo2h1, d1lo2h2, d1lo2l2, d1lo2x2, d1lo2y1, d1lo2y2
    54. Domains for 1lo3:
      1. 547512Domain d1lo3l1: 1lo3 L:1-112 [74133]
        Other proteins in same PDB: d1lo3h1, d1lo3h2, d1lo3l2, d1lo3x2, d1lo3y1, d1lo3y2
        part of retro Diels-Alder catalytic Fab 9D9
        complexed with an1
      2. 547513Domain d1lo3x1: 1lo3 X:1-112 [74135]
        Other proteins in same PDB: d1lo3h1, d1lo3h2, d1lo3l2, d1lo3x2, d1lo3y1, d1lo3y2
    55. Domain for 1lo4:
    56. Domain for 1m71:
    57. Domain for 1m7d:
    58. Domain for 1m7i:
    59. Domain for 1maj:
    60. Domain for 1mak:
    61. Domains for 1mh5:
      1. 547499Domain d1mh5a1: 1mh5 A:1-107 [91266]
        Other proteins in same PDB: d1mh5a2, d1mh5b1, d1mh5b2, d1mh5h1, d1mh5h2, d1mh5l2
      2. 547500Domain d1mh5l1: 1mh5 L:1-107 [91272]
        Other proteins in same PDB: d1mh5a2, d1mh5b1, d1mh5b2, d1mh5h1, d1mh5h2, d1mh5l2
        part of the esterolytic Fab ms6-164
        complexed with hal, so4
        part of anti-testosterone Fab 77
    62. Domain for 1mie:
    63. Domain for 1mj7:
    64. Domain for 1mj8:
    65. Domains for 1mjj:
      1. 547468Domain d1mjja1: 1mjj A:1-107 [91294]
        Other proteins in same PDB: d1mjja2, d1mjjb1, d1mjjb2, d1mjjh1, d1mjjh2, d1mjjl2
      2. 547469Domain d1mjjl1: 1mjj L:1-107 [91300]
        Other proteins in same PDB: d1mjja2, d1mjjb1, d1mjjb2, d1mjjh1, d1mjjh2, d1mjjl2
        part of the esterolytic Fab ms6-164
        complexed with hal, so4
    66. Domain for 1mju:
    67. Domain for 1mnu:
    68. Domain for 1mpa:
    69. Domain for 1mrc:
    70. Domain for 1mrd:
    71. Domain for 1mre:
    72. Domain for 1mrf:
    73. Domains for 1n4x:
      1. 547453Domain d1n4xl_: 1n4x L: [85326]
        Other proteins in same PDB: d1n4xh_, d1n4xi_
      2. 547454Domain d1n4xm_: 1n4x M: [85327]
        Other proteins in same PDB: d1n4xh_, d1n4xi_
        part of scFv 1695
        complexed with cl
    74. Domains for 1nak:
      1. 547582Domain d1nakl1: 1nak L:1-107 [91757]
        Other proteins in same PDB: d1nakh1, d1nakh2, d1naki1, d1naki2, d1nakl2, d1nakm2
      2. 547583Domain d1nakm1: 1nak M:1-107 [91759]
        Other proteins in same PDB: d1nakh1, d1nakh2, d1naki1, d1naki2, d1nakl2, d1nakm2
        part of Fab 83.1 against HIV-1 gp120
    75. Domain for 1nbv:
    76. Domain for 1ncw:
    77. Domains for 1nd0:
      1. 547553Domain d1nd0a1: 1nd0 A:1-107 [85559]
        Other proteins in same PDB: d1nd0a2, d1nd0b1, d1nd0b2, d1nd0c2, d1nd0d1, d1nd0d2, d1nd0e2, d1nd0f1, d1nd0f2, d1nd0g2, d1nd0h1, d1nd0h2
      2. 547554Domain d1nd0c1: 1nd0 C:1-107 [85563]
        Other proteins in same PDB: d1nd0a2, d1nd0b1, d1nd0b2, d1nd0c2, d1nd0d1, d1nd0d2, d1nd0e2, d1nd0f1, d1nd0f2, d1nd0g2, d1nd0h1, d1nd0h2
      3. 547555Domain d1nd0e1: 1nd0 E:1-107 [85567]
        Other proteins in same PDB: d1nd0a2, d1nd0b1, d1nd0b2, d1nd0c2, d1nd0d1, d1nd0d2, d1nd0e2, d1nd0f1, d1nd0f2, d1nd0g2, d1nd0h1, d1nd0h2
      4. 547556Domain d1nd0g1: 1nd0 G:1-107 [85571]
        Other proteins in same PDB: d1nd0a2, d1nd0b1, d1nd0b2, d1nd0c2, d1nd0d1, d1nd0d2, d1nd0e2, d1nd0f1, d1nd0f2, d1nd0g2, d1nd0h1, d1nd0h2
        part of cationic cyclization catalytic Fab 4C6
        complexed with dp4, so4
    78. Domain for 1nld:
    79. Domains for 1nqb:
      1. 547464Domain d1nqba2: 1nqb A:121-233 [20043]
        Other proteins in same PDB: d1nqba1, d1nqbc1
      2. 547465Domain d1nqbc2: 1nqb C:121-233 [20045]
        Other proteins in same PDB: d1nqba1, d1nqbc1
        part of scFv trivalent antibody; N-terminal, VH domain is from B1-8 antibody (1A6U CH H); C-terminal, VL domain is from NQ11 antibody
    80. Domain for 1plg:
    81. Domain for 1pz5:
    82. Domain for 1q72:
    83. Domain for 1qfu:
    84. Domain for 1qkz:
    85. Domain for 1qyg:
    86. Domain for 1rfd:
    87. Domain for 1riu:
    88. Domain for 1riv:
    89. Domain for 1rmf:
    90. Domain for 1ru9:
    91. Domain for 1rua:
    92. Domain for 1ruk:
    93. Domain for 1rul:
    94. Domain for 1rum:
    95. Domain for 1rup:
    96. Domain for 1ruq:
    97. Domain for 1rur:
    98. Domain for 1s3k:
    99. Domain for 1s5i:
    100. Domains for 1t66:
      1. 547516Domain d1t66c1: 1t66 C:1-112 [106545]
        Other proteins in same PDB: d1t66c2, d1t66d1, d1t66d2, d1t66h1, d1t66h2, d1t66l2
      2. 547517Domain d1t66l1: 1t66 L:1-112 [106551]
        Other proteins in same PDB: d1t66c2, d1t66d1, d1t66d2, d1t66h1, d1t66h2, d1t66l2
        complexed with flu
    101. Domain for 1tet:
    102. Domains for 1ub5:
      1. 547495Domain d1ub5b1: 1ub5 B:1-113 [99145]
        Other proteins in same PDB: d1ub5a1, d1ub5a2, d1ub5b2, d1ub5h1, d1ub5h2, d1ub5l2
        part of blue fluorescent Fab 19G2
        complexed with spb
      2. 547496Domain d1ub5l1: 1ub5 L:1-113 [99149]
        Other proteins in same PDB: d1ub5a1, d1ub5a2, d1ub5b2, d1ub5h1, d1ub5h2, d1ub5l2
    103. Domains for 1ub6:
      1. 547525Domain d1ub6b1: 1ub6 B:2-113 [99153]
        Other proteins in same PDB: d1ub6a1, d1ub6a2, d1ub6b2, d1ub6h1, d1ub6h2, d1ub6l2
        part of blue fluorescent Fab 19G2
      2. 547526Domain d1ub6l1: 1ub6 L:2-113 [99157]
        Other proteins in same PDB: d1ub6a1, d1ub6a2, d1ub6b2, d1ub6h1, d1ub6h2, d1ub6l2
    104. Domain for 1ucb:
    105. Domains for 1uz6:
      1. 547596Domain d1uz6e1: 1uz6 E:1-106 [108150]
        Other proteins in same PDB: d1uz6e2, d1uz6f1, d1uz6f2, d1uz6h1, d1uz6h2, d1uz6l2, d1uz6m2, d1uz6p1, d1uz6p2, d1uz6v2, d1uz6w1, d1uz6w2
      2. 547597Domain d1uz6l1: 1uz6 L:1-106 [108156]
        Other proteins in same PDB: d1uz6e2, d1uz6f1, d1uz6f2, d1uz6h1, d1uz6h2, d1uz6l2, d1uz6m2, d1uz6p1, d1uz6p2, d1uz6v2, d1uz6w1, d1uz6w2
      3. 547598Domain d1uz6m1: 1uz6 M:1-106 [108158]
        Other proteins in same PDB: d1uz6e2, d1uz6f1, d1uz6f2, d1uz6h1, d1uz6h2, d1uz6l2, d1uz6m2, d1uz6p1, d1uz6p2, d1uz6v2, d1uz6w1, d1uz6w2
      4. 547599Domain d1uz6v1: 1uz6 V:1-106 [108162]
        Other proteins in same PDB: d1uz6e2, d1uz6f1, d1uz6f2, d1uz6h1, d1uz6h2, d1uz6l2, d1uz6m2, d1uz6p1, d1uz6p2, d1uz6v2, d1uz6w1, d1uz6w2
        MQ P03976 P01837 #
        natural chimera
        complexed with so4
    106. Domains for 1uz8:
      1. 547593Domain d1uz8a1: 1uz8 A:1-106 [108166]
        Other proteins in same PDB: d1uz8a2, d1uz8b1, d1uz8b2, d1uz8h1, d1uz8h2, d1uz8l2
      2. 547594Domain d1uz8l1: 1uz8 L:1-106 [108172]
        Other proteins in same PDB: d1uz8a2, d1uz8b1, d1uz8b2, d1uz8h1, d1uz8h2, d1uz8l2
        MQ P03976 P01837 #
        natural chimera
        complexed with fuc, gal, mag
    107. Domain for 1vpo:
    108. Domain for 1yec:
    109. Domains for 1yed:
      1. 547584Domain d1yeda1: 1yed A:1-107 [20150]
        Other proteins in same PDB: d1yeda2, d1yedb1, d1yedb2, d1yedh1, d1yedh2, d1yedl2
        part of Fab D2.4
        complexed with pnb
      2. 547585Domain d1yedl1: 1yed L:1-107 [20148]
        Other proteins in same PDB: d1yeda2, d1yedb1, d1yedb2, d1yedh1, d1yedh2, d1yedl2
    110. Domain for 1yee:
    111. Domain for 1yef:
    112. Domain for 1yeg:
    113. Domain for 1yeh:
    114. Domain for 1yei:
    115. Domain for 1yej:
    116. Domain for 1yek:
    117. Domain for 2bfv:
    118. Domain for 2cgr:
    119. Domain for 2dbl:
    120. Domain for 2dlf:
    121. Domain for 2h1p:
    122. Domain for 2igf:
    123. Domain for 2jel:
    124. Domain for 2mpa:
    125. Domains for 2pcp:
      1. 547529Domain d2pcpa1: 2pcp A:1-107 [20370]
        Other proteins in same PDB: d2pcpa2, d2pcpb1, d2pcpb2, d2pcpc2, d2pcpd1, d2pcpd2
      2. 547530Domain d2pcpc1: 2pcp C:1-107 [20372]
        Other proteins in same PDB: d2pcpa2, d2pcpb1, d2pcpb2, d2pcpc2, d2pcpd1, d2pcpd2
        part of Fab 6B5
        complexed with 1pc
    126. Domain for 4fab:
  7. 547602Mouse (Mus musculus), cluster 1.2 [TaxId:10090] [88525] (35 PDB entries)
    1. Domain for 1a3r:
    2. Domain for 1a5f:
    3. Domains for 1ap2:
      1. 547637Domain d1ap2a_: 1ap2 A: [20182]
        Other proteins in same PDB: d1ap2b_, d1ap2d_
      2. 547638Domain d1ap2c_: 1ap2 C: [20184]
        Other proteins in same PDB: d1ap2b_, d1ap2d_
        part of P-glycoprotein-specific scFv C219
    4. Domain for 1bbd:
    5. Domain for 1ck0:
    6. Domain for 1frg:
    7. Domain for 1h3p:
    8. Domains for 1hil:
      1. 547616Domain d1hila1: 1hil A:1-108 [19786]
        Other proteins in same PDB: d1hila2, d1hilb1, d1hilb2, d1hilc2, d1hild1, d1hild2
      2. 547617Domain d1hilc1: 1hil C:1-108 [19788]
        Other proteins in same PDB: d1hila2, d1hilb1, d1hilb2, d1hilc2, d1hild1, d1hild2
        part of Fab 17/9
    9. Domains for 1him:
      1. 547643Domain d1himh1: 1him H:1-108 [19793]
        Other proteins in same PDB: d1himh2, d1himj2, d1himl1, d1himl2, d1himm1, d1himm2
      2. 547644Domain d1himj1: 1him J:1-108 [19795]
        Other proteins in same PDB: d1himh2, d1himj2, d1himl1, d1himl2, d1himm1, d1himm2
        part of Fab 17/9; chain identifiers are mixed up
        complexed with nh2
    10. Domain for 1hin:
    11. Domain for 1ifh:
    12. Domain for 1il1:
    13. Domain for 1mcp:
    14. Domains for 1mhh:
      1. 547618Domain d1mhha1: 1mhh A:1-107 [79119]
        Other proteins in same PDB: d1mhha2, d1mhhb1, d1mhhb2, d1mhhc2, d1mhhd1, d1mhhd2, d1mhhe_, d1mhhf_
      2. 547619Domain d1mhhc1: 1mhh C:1-107 [79123]
        Other proteins in same PDB: d1mhha2, d1mhhb1, d1mhhb2, d1mhhc2, d1mhhd1, d1mhhd2, d1mhhe_, d1mhhf_
        part of anti-HCV Fab 19D9D6
        complexed with aea, edo; mutant
    15. Domain for 1mvu:
      • 547607Domain d1mvua_: 1mvu A: [91474]
        Other proteins in same PDB: d1mvub_
        part of P-glycoprotein-specific scFv C219; complexed with synthetic epitope peptide, chain P
        complexed with so4; mutant
    16. Domain for 1n64:
    17. Domain for 1nlb:
    18. Domains for 1pkq:
      1. 547650Domain d1pkqa1: 1pkq A:1-107 [88148]
        Other proteins in same PDB: d1pkqa2, d1pkqb1, d1pkqb2, d1pkqe_, d1pkqf2, d1pkqg1, d1pkqg2, d1pkqj_
      2. 547651Domain d1pkqf1: 1pkq F:1-107 [88153]
        Other proteins in same PDB: d1pkqa2, d1pkqb1, d1pkqb2, d1pkqe_, d1pkqf2, d1pkqg1, d1pkqg2, d1pkqj_
        part of humanized Fab 8-18c5
    19. Domain for 1q9k:
    20. Domains for 1q9l:
      1. 547628Domain d1q9la1: 1q9l A:1-107 [96280]
        Other proteins in same PDB: d1q9la2, d1q9lb1, d1q9lb2, d1q9lc2, d1q9ld1, d1q9ld2
      2. 547629Domain d1q9lc1: 1q9l C:1-107 [96284]
        Other proteins in same PDB: d1q9la2, d1q9lb1, d1q9lb2, d1q9lc2, d1q9ld1, d1q9ld2
        part of Fab s25-2
        complexed with mg, zn
    21. Domains for 1q9o:
      1. 547612Domain d1q9oa1: 1q9o A:1-107 [96292]
        Other proteins in same PDB: d1q9oa2, d1q9ob1, d1q9ob2, d1q9oc2, d1q9od1, d1q9od2
      2. 547613Domain d1q9oc1: 1q9o C:1-107 [96296]
        Other proteins in same PDB: d1q9oa2, d1q9ob1, d1q9ob2, d1q9oc2, d1q9od1, d1q9od2
        part of Fab s45-18
        complexed with mg
    22. Domain for 1q9q:
    23. Domain for 1q9r:
    24. Domain for 1q9t:
    25. Domain for 1q9v:
    26. Domains for 1q9w:
      1. 547609Domain d1q9wa1: 1q9w A:1-107 [96320]
        Other proteins in same PDB: d1q9wa2, d1q9wb1, d1q9wb2, d1q9wc2, d1q9wd1, d1q9wd2
      2. 547610Domain d1q9wc1: 1q9w C:1-107 [96324]
        Other proteins in same PDB: d1q9wa2, d1q9wb1, d1q9wb2, d1q9wc2, d1q9wd1, d1q9wd2
        part of Fab s45-18
        complexed with gp1, gp4, kdo, mg
    27. Domain for 1sbs:
    28. Domains for 1t4k:
      1. 547652Domain d1t4ka1: 1t4k A:1-107 [112235]
        Other proteins in same PDB: d1t4ka2, d1t4kb1, d1t4kb2, d1t4kc2, d1t4kd1, d1t4kd2
      2. 547653Domain d1t4kc1: 1t4k C:1-107 [112239]
        Other proteins in same PDB: d1t4ka2, d1t4kb1, d1t4kb2, d1t4kc2, d1t4kd1, d1t4kd2
        MQ P01632 P01837 # natural chimera; catalytic antibody with aldolase activity
        complexed with zn
    29. Domains for 2ap2:
      1. 547635Domain d2ap2a_: 2ap2 A: [20178]
        Other proteins in same PDB: d2ap2b_, d2ap2d_
      2. 547636Domain d2ap2c_: 2ap2 C: [20180]
        Other proteins in same PDB: d2ap2b_, d2ap2d_
        part of P-glycoprotein-specific scFv C219
    30. Domain for 2ck0:
    31. Domain for 2imm:
      • 547611Domain d2imm__: 2imm - [19857]
        VL domain only of MCPC603
        complexed with ace, so4
    32. Domain for 2mcp:
    33. Domain for 3ck0:
    34. Domains for 43c9:
      1. 547624Domain d43c9a_: 43c9 A: [20386]
        Other proteins in same PDB: d43c9b_, d43c9d_, d43c9f_, d43c9h_
      2. 547625Domain d43c9c_: 43c9 C: [20388]
        Other proteins in same PDB: d43c9b_, d43c9d_, d43c9f_, d43c9h_
      3. 547626Domain d43c9e_: 43c9 E: [20390]
        Other proteins in same PDB: d43c9b_, d43c9d_, d43c9f_, d43c9h_
      4. 547627Domain d43c9g_: 43c9 G: [20392]
        Other proteins in same PDB: d43c9b_, d43c9d_, d43c9f_, d43c9h_
        part of sterolytic and amidolytic Fv 43c9
    35. Domains for 43ca:
      1. 547630Domain d43caa_: 43ca A: [20394]
        Other proteins in same PDB: d43cab_, d43cad_, d43caf_, d43cah_
      2. 547631Domain d43cac_: 43ca C: [20396]
        Other proteins in same PDB: d43cab_, d43cad_, d43caf_, d43cah_
      3. 547632Domain d43cae_: 43ca E: [20398]
        Other proteins in same PDB: d43cab_, d43cad_, d43caf_, d43cah_
      4. 547633Domain d43cag_: 43ca G: [20400]
        Other proteins in same PDB: d43cab_, d43cad_, d43caf_, d43cah_
        part of sterolytic and amidolytic Fv 43c9
        complexed with npo
  8. 547654Mouse (Mus musculus), cluster 2 [TaxId:10090] [88526] (24 PDB entries)
    1. Domain for 1acy:
    2. Domains for 1afv:
      1. 547683Domain d1afvl1: 1afv L:1-112 [20130]
        Other proteins in same PDB: d1afva_, d1afvb_, d1afvh1, d1afvh2, d1afvk1, d1afvk2, d1afvl2, d1afvm2
      2. 547684Domain d1afvm1: 1afv M:1-112 [20132]
        Other proteins in same PDB: d1afva_, d1afvb_, d1afvh1, d1afvh2, d1afvk1, d1afvk2, d1afvl2, d1afvm2
        part of Fab 25.3 against HIV-1 capsid protein (p24)
        complexed with pb
    3. Domain for 1ai1:
    4. Domain for 1egj:
    5. Domain for 1ejo:
    6. Domains for 1f11:
      1. 547676Domain d1f11a1: 1f11 A:1-107 [20456]
        Other proteins in same PDB: d1f11a2, d1f11b1, d1f11b2, d1f11c2, d1f11d1, d1f11d2
      2. 547677Domain d1f11c1: 1f11 C:1-107 [20458]
        Other proteins in same PDB: d1f11a2, d1f11b1, d1f11b2, d1f11c2, d1f11d1, d1f11d2
        part of anti-Pres2 Fab F124
    7. Domain for 1f58:
    8. Domain for 1ggb:
    9. Domain for 1ggc:
    10. Domains for 1ggi:
      1. 547674Domain d1ggil1: 1ggi L:1-107 [19876]
        Other proteins in same PDB: d1ggih1, d1ggih2, d1ggij1, d1ggij2, d1ggil2, d1ggim2
      2. 547675Domain d1ggim1: 1ggi M:1-107 [19878]
        Other proteins in same PDB: d1ggih1, d1ggih2, d1ggij1, d1ggij2, d1ggil2, d1ggim2
        part of Fab 50.1
    11. Domain for 1h0d:
    12. Domains for 1i7z:
      1. 547661Domain d1i7za1: 1i7z A:1-107 [61919]
        Other proteins in same PDB: d1i7za2, d1i7zb1, d1i7zb2, d1i7zc2, d1i7zd1, d1i7zd2
      2. 547662Domain d1i7zc1: 1i7z C:1-107 [61923]
        Other proteins in same PDB: d1i7za2, d1i7zb1, d1i7zb2, d1i7zc2, d1i7zd1, d1i7zd2
        part of humanized Fab GNC92H2
        complexed with coc
    13. Domain for 1ibg:
    14. Domain for 1iqw:
    15. Domains for 1j05:
      1. 547655Domain d1j05a_: 1j05 A: [90735]
        Other proteins in same PDB: d1j05b_, d1j05h_
      2. 547656Domain d1j05l_: 1j05 L: [90738]
        Other proteins in same PDB: d1j05b_, d1j05h_
        part of anti-CEA Fv T84.66
        complexed with gol, po4
    16. Domains for 1mf2:
      1. 547665Domain d1mf2l1: 1mf2 L:1-107 [20174]
        Other proteins in same PDB: d1mf2h1, d1mf2h2, d1mf2l2, d1mf2m2, d1mf2n1, d1mf2n2
      2. 547666Domain d1mf2m1: 1mf2 M:1-107 [20176]
        Other proteins in same PDB: d1mf2h1, d1mf2h2, d1mf2l2, d1mf2m2, d1mf2n1, d1mf2n2
        part of Fab F11.2.32 against HIV-1 protease
    17. Domains for 1moe:
      1. 547667Domain d1moea1: 1moe A:1-119 [85030]
        Other proteins in same PDB: d1moea2, d1moeb2
      2. 547668Domain d1moeb1: 1moe B:1-119 [85032]
        Other proteins in same PDB: d1moea2, d1moeb2
        part of anti-CEA scFv T84.66; VL to VH linkage: includes linker residues 112-119; assembles as a diabody
        complexed with so4
    18. Domain for 1nsn:
    19. Domain for 1qfw:
    20. Domain for 1qnz:
    21. Domain for 2f58:
    22. Domains for 2hrp:
      1. 547659Domain d2hrpl1: 2hrp L:1-107 [20170]
        Other proteins in same PDB: d2hrph1, d2hrph2, d2hrpl2, d2hrpm2, d2hrpn1, d2hrpn2
      2. 547660Domain d2hrpm1: 2hrp M:1-107 [20172]
        Other proteins in same PDB: d2hrph1, d2hrph2, d2hrpl2, d2hrpm2, d2hrpn1, d2hrpn2
        part of Fab F11.2.32 against HIV-1 protease
    23. Domain for 32c2:
    24. Domain for 3f58:
  9. 547687Mouse (Mus musculus), cluster 3.1 [TaxId:10090] [88527] (12 PDB entries)
    1. Domain for 15c8:
    2. Domains for 1aif:
      1. 547699Domain d1aifa1: 1aif A:1-109 [20076]
        Other proteins in same PDB: d1aifa2, d1aifb1, d1aifb2, d1aifh1, d1aifh2, d1aifl2
      2. 547700Domain d1aifl1: 1aif L:1-109 [20078]
        Other proteins in same PDB: d1aifa2, d1aifb1, d1aifb2, d1aifh1, d1aifh2, d1aifl2
        part of Fab 409.5.3
    3. Domain for 1cf8:
    4. Domain for 1fig:
    5. Domains for 1hq4:
      1. 547693Domain d1hq4a1: 1hq4 A:1-107 [83621]
        Other proteins in same PDB: d1hq4a2, d1hq4b1, d1hq4b2, d1hq4c2, d1hq4d1, d1hq4d2
      2. 547694Domain d1hq4c1: 1hq4 C:1-107 [83625]
        Other proteins in same PDB: d1hq4a2, d1hq4b1, d1hq4b2, d1hq4c2, d1hq4d1, d1hq4d2
        part of catalytic Fab HA-19A4 with a polyene cyclase activity
        complexed with cd
    6. Domain for 1iai:
    7. Domains for 1ken:
      1. 547702Domain d1kenl1: 1ken L:1-108 [72381]
        Other proteins in same PDB: d1kena_, d1kenb_, d1kenc_, d1kend_, d1kene_, d1kenf_, d1kenh1, d1kenh2, d1kenl2, d1kent1, d1kent2, d1kenu2
      2. 547703Domain d1kenu1: 1ken U:1-108 [72385]
        Other proteins in same PDB: d1kena_, d1kenb_, d1kenc_, d1kend_, d1kene_, d1kenf_, d1kenh1, d1kenh2, d1kenl2, d1kent1, d1kent2, d1kenu2
        part of Fab against influenza virus hemagglutinin
        complexed with man, nag
    8. Domains for 1ob1:
      1. 547696Domain d1ob1a1: 1ob1 A:1-106A [86748]
        Other proteins in same PDB: d1ob1a2, d1ob1b1, d1ob1b2, d1ob1c1, d1ob1c2, d1ob1d2, d1ob1e1, d1ob1e2, d1ob1f1, d1ob1f2
      2. 547697Domain d1ob1d1: 1ob1 D:1-106A [86754]
        Other proteins in same PDB: d1ob1a2, d1ob1b1, d1ob1b2, d1ob1c1, d1ob1c2, d1ob1d2, d1ob1e1, d1ob1e2, d1ob1f1, d1ob1f2
        part of anti-Pf MSP1 Fab
        complexed with cac
    9. Domain for 1orq:
    10. Domain for 1ors:
    11. Domain for 25c8:
    12. Domain for 35c8:
  10. 547704Mouse (Mus musculus), cluster 3.2 [TaxId:10090] [88528] (19 PDB entries)
    1. Domain for 1ay1:
    2. Domain for 1baf:
    3. Domain for 1bgx:
    4. Domain for 1bql:
    5. Domain for 1dqd:
    6. Domain for 1eo8:
    7. Domain for 1for:
    8. Domain for 1mim:
    9. Domains for 1ots:
      1. 547718Domain d1otsd1: 1ots D:1-106 [87419]
        Other proteins in same PDB: d1otsa_, d1otsb_, d1otsc1, d1otsc2, d1otsd2, d1otse1, d1otse2, d1otsf2
      2. 547719Domain d1otsf1: 1ots F:1-106 [87423]
        Other proteins in same PDB: d1otsa_, d1otsb_, d1otsc1, d1otsc2, d1otsd2, d1otse1, d1otse2, d1otsf2
        part of anti-CLC chloride channel Fab
        complexed with cl
    10. Domains for 1ott:
      1. 547725Domain d1ottd1: 1ott D:1-106 [87429]
        Other proteins in same PDB: d1otta_, d1ottb_, d1ottc1, d1ottc2, d1ottd2, d1otte1, d1otte2, d1ottf2
      2. 547726Domain d1ottf1: 1ott F:1-106 [87433]
        Other proteins in same PDB: d1otta_, d1ottb_, d1ottc1, d1ottc2, d1ottd2, d1otte1, d1otte2, d1ottf2
        part of anti-CLC chloride channel Fab
        complexed with cl; mutant
    11. Domains for 1otu:
      1. 547727Domain d1otud1: 1otu D:1-106 [87439]
        Other proteins in same PDB: d1otua_, d1otub_, d1otuc1, d1otuc2, d1otud2, d1otue1, d1otue2, d1otuf2
      2. 547728Domain d1otuf1: 1otu F:1-106 [87443]
        Other proteins in same PDB: d1otua_, d1otub_, d1otuc1, d1otuc2, d1otud2, d1otue1, d1otue2, d1otuf2
        part of anti-CLC chloride channel Fab
        complexed with cl; mutant
    12. Domain for 1psk:
    13. Domain for 1qok:
    14. Domain for 1rvf:
    15. Domain for 1sy6:
    16. Domains for 1v7m:
      1. 547716Domain d1v7ml1: 1v7m L:1-107 [100454]
        Other proteins in same PDB: d1v7mh1, d1v7mh2, d1v7mi1, d1v7mi2, d1v7ml2, d1v7mm2, d1v7mv_, d1v7mx_
      2. 547717Domain d1v7mm1: 1v7m M:1-107 [100456]
        Other proteins in same PDB: d1v7mh1, d1v7mh2, d1v7mi1, d1v7mi2, d1v7ml2, d1v7mm2, d1v7mv_, d1v7mx_
        part of anti-trombopoetin Fab tn1
    17. Domains for 1v7n:
      1. 547721Domain d1v7nl1: 1v7n L:1-107 [100468]
        Other proteins in same PDB: d1v7nh1, d1v7nh2, d1v7ni1, d1v7ni2, d1v7nj1, d1v7nj2, d1v7nk1, d1v7nk2, d1v7nl2, d1v7nm2, d1v7nn2, d1v7no2, d1v7nv_, d1v7nx_, d1v7ny_, d1v7nz_
      2. 547722Domain d1v7nm1: 1v7n M:1-107 [100470]
        Other proteins in same PDB: d1v7nh1, d1v7nh2, d1v7ni1, d1v7ni2, d1v7nj1, d1v7nj2, d1v7nk1, d1v7nk2, d1v7nl2, d1v7nm2, d1v7nn2, d1v7no2, d1v7nv_, d1v7nx_, d1v7ny_, d1v7nz_
      3. 547723Domain d1v7nn1: 1v7n N:1-107 [100472]
        Other proteins in same PDB: d1v7nh1, d1v7nh2, d1v7ni1, d1v7ni2, d1v7nj1, d1v7nj2, d1v7nk1, d1v7nk2, d1v7nl2, d1v7nm2, d1v7nn2, d1v7no2, d1v7nv_, d1v7nx_, d1v7ny_, d1v7nz_
      4. 547724Domain d1v7no1: 1v7n O:1-107 [100474]
        Other proteins in same PDB: d1v7nh1, d1v7nh2, d1v7ni1, d1v7ni2, d1v7nj1, d1v7nj2, d1v7nk1, d1v7nk2, d1v7nl2, d1v7nm2, d1v7nn2, d1v7no2, d1v7nv_, d1v7nx_, d1v7ny_, d1v7nz_
        part of anti-trombopoetin Fab tn1
        mutant
    18. Domain for 2iff:
    19. Domain for 3hfl:
  11. 547731Mouse (Mus musculus), cluster 3.3 [TaxId:10090] [88529] (2 PDB entries)
    1. Domains for 1a6t:
      1. 547733Domain d1a6ta1: 1a6t A:1-107 [20248]
        Other proteins in same PDB: d1a6ta2, d1a6tb1, d1a6tb2, d1a6tc2, d1a6td1, d1a6td2
      2. 547734Domain d1a6tc1: 1a6t C:1-107 [20250]
        Other proteins in same PDB: d1a6ta2, d1a6tb1, d1a6tb2, d1a6tc2, d1a6td1, d1a6td2
        part of human rhinovirus 14 neutralizing Fab Mab1-IA
    2. Domain for 1clo:
  12. 547735Mouse (Mus musculus), cluster 3.4 [TaxId:10090] [88530] (3 PDB entries)
    1. Domain for 1e6j:
    2. Domain for 1e6o:
    3. Domain for 2fbj:
  13. 547739Mouse (Mus musculus), cluster 4 [TaxId:10090] [88531] (170 PDB entries)
    1. Domains for 12e8:
      1. 547790Domain d12e8l1: 12e8 L:1-107 [20268]
        Other proteins in same PDB: d12e8h1, d12e8h2, d12e8l2, d12e8m2, d12e8p1, d12e8p2
      2. 547791Domain d12e8m1: 12e8 M:1-107 [20270]
        Other proteins in same PDB: d12e8h1, d12e8h2, d12e8l2, d12e8m2, d12e8p1, d12e8p2
        part of Fab 2E8 specific to the low density lipoprotein receptor binding region of apolipoprotein E
    2. Domain for 1a0q:
    3. Domain for 1a14:
      • 547854Domain d1a14l_: 1a14 L: [20060]
        Other proteins in same PDB: d1a14h_, d1a14n_
        part of Fab NC10; only Fv coordinates are included
        complexed with ca, man, nag
    4. Domain for 1a2y:
    5. Domain for 1a7n:
    6. Domain for 1a7o:
    7. Domain for 1a7p:
    8. Domain for 1a7q:
    9. Domain for 1a7r:
    10. Domains for 1ahw:
      1. 547915Domain d1ahwa1: 1ahw A:1-108 [20218]
        Other proteins in same PDB: d1ahwa2, d1ahwb1, d1ahwb2, d1ahwc1, d1ahwc2, d1ahwd2, d1ahwe1, d1ahwe2, d1ahwf1, d1ahwf2
      2. 547916Domain d1ahwd1: 1ahw D:1-108 [20220]
        Other proteins in same PDB: d1ahwa2, d1ahwb1, d1ahwb2, d1ahwc1, d1ahwc2, d1ahwd2, d1ahwe1, d1ahwe2, d1ahwf1, d1ahwf2
        part of anti-human tissue factor Fab 5G9
    11. Domain for 1aj7:
    12. Domain for 1ar1:
    13. Domains for 1axs:
      1. 547879Domain d1axsa1: 1axs A:1-107 [20200]
        Other proteins in same PDB: d1axsa2, d1axsb1, d1axsb2, d1axsh1, d1axsh2, d1axsl2
        part of humanized oxy-cope catalytic Fab az-28
        complexed with cd, hop
      2. 547880Domain d1axsl1: 1axs L:1-107 [20198]
        Other proteins in same PDB: d1axsa2, d1axsb1, d1axsb2, d1axsh1, d1axsh2, d1axsl2
    14. Domain for 1b4j:
    15. Domain for 1bbj:
    16. Domains for 1bj1:
      1. 547836Domain d1bj1j1: 1bj1 J:1-107 [20324]
        Other proteins in same PDB: d1bj1h1, d1bj1h2, d1bj1j2, d1bj1k1, d1bj1k2, d1bj1l2, d1bj1v_, d1bj1w_
        part of humanized Fab-12 neutralizing VEGF
        complexed with so4
      2. 547837Domain d1bj1l1: 1bj1 L:1-107 [20322]
        Other proteins in same PDB: d1bj1h1, d1bj1h2, d1bj1j2, d1bj1k1, d1bj1k2, d1bj1l2, d1bj1v_, d1bj1w_
    17. Domain for 1bm3:
    18. Domain for 1bog:
    19. Domain for 1bz7:
    20. Domain for 1c08:
    21. Domain for 1c12:
    22. Domain for 1c5b:
    23. Domain for 1c5c:
    24. Domain for 1cfn:
    25. Domain for 1cfq:
    26. Domain for 1cfs:
    27. Domain for 1cft:
    28. Domains for 1cic:
      1. 547850Domain d1cica1: 1cic A:1-107 [19964]
        Other proteins in same PDB: d1cica2, d1cicb1, d1cicb2, d1cicc2, d1cicd1, d1cicd2
        part of D1.3 anti-idiotope Fab E225
      2. 547851Domain d1cicc1: 1cic C:1-107 [19962]
        Other proteins in same PDB: d1cica2, d1cicb1, d1cicb2, d1cicc2, d1cicd1, d1cicd2
        part of Fab D1.3
    29. Domains for 1ct8:
      1. 547819Domain d1ct8a1: 1ct8 A:1-107 [20408]
        Other proteins in same PDB: d1ct8a2, d1ct8b1, d1ct8b2, d1ct8c2, d1ct8d1, d1ct8d2
      2. 547820Domain d1ct8c1: 1ct8 C:1-107 [20410]
        Other proteins in same PDB: d1ct8a2, d1ct8b1, d1ct8b2, d1ct8c2, d1ct8d1, d1ct8d2
        part of catalytic Fab 7C8
    30. Domains for 1cz8:
      1. 547852Domain d1cz8l1: 1cz8 L:1-107 [20326]
        Other proteins in same PDB: d1cz8h1, d1cz8h2, d1cz8l2, d1cz8v_, d1cz8w_, d1cz8x2, d1cz8y1, d1cz8y2
      2. 547853Domain d1cz8x1: 1cz8 X:1-107 [20328]
        Other proteins in same PDB: d1cz8h1, d1cz8h2, d1cz8l2, d1cz8v_, d1cz8w_, d1cz8x2, d1cz8y1, d1cz8y2
        part of humanized Fab-12 neutralizing VEGF; affinity matured
        complexed with so4; mutant
    31. Domains for 1d5b:
      1. 547901Domain d1d5ba1: 1d5b A:1-107 [20204]
        Other proteins in same PDB: d1d5ba2, d1d5bb1, d1d5bb2, d1d5bh1, d1d5bh2, d1d5bl2
        part of humanized oxy-cope catalytic Fab az-28
      2. 547902Domain d1d5bl1: 1d5b L:1-107 [20202]
        Other proteins in same PDB: d1d5ba2, d1d5bb1, d1d5bb2, d1d5bh1, d1d5bh2, d1d5bl2
    32. Domain for 1d5i:
    33. Domain for 1d6v:
    34. Domain for 1dqj:
    35. Domain for 1dqm:
    36. Domains for 1dqq:
      1. 547756Domain d1dqqa1: 1dqq A:1-107 [20420]
        Other proteins in same PDB: d1dqqa2, d1dqqb1, d1dqqb2, d1dqqc2, d1dqqd1, d1dqqd2
      2. 547757Domain d1dqqc1: 1dqq C:1-107 [20422]
        Other proteins in same PDB: d1dqqa2, d1dqqb1, d1dqqb2, d1dqqc2, d1dqqd1, d1dqqd2
        part of anti-lysozyme Fab HYHEL-63
    37. Domains for 1dvf:
      1. 547778Domain d1dvfa_: 1dvf A: [19952]
        Other proteins in same PDB: d1dvfb_, d1dvfd_
        part of Fv D1.3
        CASP1
        complexed with zn
      2. 547779Domain d1dvfc_: 1dvf C: [20106]
        Other proteins in same PDB: d1dvfb_, d1dvfd_
        part of Fv E5.2, anti-idiotopic antibody to D1.3
        CASP1
        complexed with zn
    38. Domains for 1dzb:
      1. 547811Domain d1dzba2: 1dzb A:201-307 [20489]
        Other proteins in same PDB: d1dzba1, d1dzbb1, d1dzbx_, d1dzby_
      2. 547812Domain d1dzbb2: 1dzb B:201-307 [20491]
        Other proteins in same PDB: d1dzba1, d1dzbb1, d1dzbx_, d1dzby_
        part of anti-lysozyme scFv 1F9
    39. Domain for 1e4w:
    40. Domains for 1e4x:
      1. 547800Domain d1e4xl1: 1e4x L:1-107 [59240]
        Other proteins in same PDB: d1e4xh1, d1e4xh2, d1e4xi1, d1e4xi2, d1e4xl2, d1e4xm2
      2. 547801Domain d1e4xm1: 1e4x M:1-107 [59242]
        Other proteins in same PDB: d1e4xh1, d1e4xh2, d1e4xi1, d1e4xi2, d1e4xl2, d1e4xm2
        part of anti-TGFalpha Fab TAB2
    41. Domain for 1eap:
    42. Domain for 1emt:
    43. Domain for 1ezv:
    44. Domain for 1fai:
    45. Domains for 1fbi:
      1. 547897Domain d1fbil1: 1fbi L:1-107 [20024]
        Other proteins in same PDB: d1fbih1, d1fbih2, d1fbil2, d1fbip2, d1fbiq1, d1fbiq2, d1fbix_, d1fbiy_
      2. 547898Domain d1fbip1: 1fbi P:1-107 [20026]
        Other proteins in same PDB: d1fbih1, d1fbih2, d1fbil2, d1fbip2, d1fbiq1, d1fbiq2, d1fbix_, d1fbiy_
        part of Fab F9.13.7
    46. Domain for 1fdl:
    47. Domains for 1fe8:
      1. 547802Domain d1fe8l1: 1fe8 L:1-107 [59792]
        Other proteins in same PDB: d1fe8a_, d1fe8b_, d1fe8c_, d1fe8h1, d1fe8h2, d1fe8i1, d1fe8i2, d1fe8j1, d1fe8j2, d1fe8l2, d1fe8m2, d1fe8n2
      2. 547803Domain d1fe8m1: 1fe8 M:1-107 [59794]
        Other proteins in same PDB: d1fe8a_, d1fe8b_, d1fe8c_, d1fe8h1, d1fe8h2, d1fe8i1, d1fe8i2, d1fe8j1, d1fe8j2, d1fe8l2, d1fe8m2, d1fe8n2
      3. 547804Domain d1fe8n1: 1fe8 N:1-107 [59796]
        Other proteins in same PDB: d1fe8a_, d1fe8b_, d1fe8c_, d1fe8h1, d1fe8h2, d1fe8i1, d1fe8i2, d1fe8j1, d1fe8j2, d1fe8l2, d1fe8m2, d1fe8n2
        part of Fab RU5 inhibiting the collagen binding by the von willebrand factor a3 domain
        complexed with cac, fuc, nag
    48. Domain for 1fgn:
    49. Domain for 1fh5:
    50. Domains for 1fj1:
      1. 547882Domain d1fj1a1: 1fj1 A:1-107 [20118]
        Other proteins in same PDB: d1fj1a2, d1fj1b1, d1fj1b2, d1fj1c2, d1fj1d1, d1fj1d2, d1fj1e_, d1fj1f_
      2. 547883Domain d1fj1c1: 1fj1 C:1-107 [20120]
        Other proteins in same PDB: d1fj1a2, d1fj1b1, d1fj1b2, d1fj1c2, d1fj1d1, d1fj1d2, d1fj1e_, d1fj1f_
        part of Fab LA-2 against OspA
    51. Domain for 1fns:
    52. Domains for 1fsk:
      1. 547925Domain d1fskb1: 1fsk B:1-107 [20466]
        Other proteins in same PDB: d1fska_, d1fskb2, d1fskc1, d1fskc2, d1fskd_, d1fske2, d1fskf1, d1fskf2, d1fskg_, d1fskh2, d1fski1, d1fski2, d1fskj_, d1fskk2, d1fskl1, d1fskl2
      2. 547926Domain d1fske1: 1fsk E:1-107 [20468]
        Other proteins in same PDB: d1fska_, d1fskb2, d1fskc1, d1fskc2, d1fskd_, d1fske2, d1fskf1, d1fskf2, d1fskg_, d1fskh2, d1fski1, d1fski2, d1fskj_, d1fskk2, d1fskl1, d1fskl2
      3. 547927Domain d1fskh1: 1fsk H:1-107 [20470]
        Other proteins in same PDB: d1fska_, d1fskb2, d1fskc1, d1fskc2, d1fskd_, d1fske2, d1fskf1, d1fskf2, d1fskg_, d1fskh2, d1fski1, d1fski2, d1fskj_, d1fskk2, d1fskl1, d1fskl2
      4. 547928Domain d1fskk1: 1fsk K:1-107 [20472]
        Other proteins in same PDB: d1fska_, d1fskb2, d1fskc1, d1fskc2, d1fskd_, d1fske2, d1fskf1, d1fskf2, d1fskg_, d1fskh2, d1fski1, d1fski2, d1fskj_, d1fskk2, d1fskl1, d1fskl2
        part of anti-bet v1 Fab BV16
    53. Domain for 1g7h:
    54. Domain for 1g7i:
    55. Domain for 1g7j:
    56. Domain for 1g7l:
    57. Domain for 1g7m:
    58. Domain for 1gaf:
    59. Domain for 1ghf:
    60. Domain for 1h8n:
    61. Domains for 1h8o:
      1. 547860Domain d1h8oa1: 1h8o A:4-111 [60785]
        Other proteins in same PDB: d1h8oa2, d1h8ob2
      2. 547861Domain d1h8ob1: 1h8o B:4-112 [60787]
        Other proteins in same PDB: d1h8oa2, d1h8ob2
        part of anti-ampicillin scFv
        complexed with so4; mutant
    62. Domains for 1h8s:
      1. 547845Domain d1h8sa1: 1h8s A:4-111 [60789]
        Other proteins in same PDB: d1h8sa2, d1h8sb2
      2. 547846Domain d1h8sb1: 1h8s B:4-112 [60791]
        Other proteins in same PDB: d1h8sa2, d1h8sb2
        part of anti-ampicillin scFv
        complexed with aic, so4; mutant
    63. Domain for 1hh6:
    64. Domain for 1hh9:
    65. Domain for 1hi6:
    66. Domain for 1hkl:
    67. Domain for 1hys:
    68. Domain for 1i3g:
      • 547827Domain d1i3gl_: 1i3g L: [66019]
        Other proteins in same PDB: d1i3gh_
        part of anti-ampicillin scFv
        complexed with mpd
    69. Domain for 1i8i:
      • 547815Domain d1i8ia_: 1i8i A: [71128]
        Other proteins in same PDB: d1i8ib_
        part of dsFv MR1; complex with a EGFR-VIII peptide
        mutant
    70. Domain for 1i8k:
      • 547748Domain d1i8ka_: 1i8k A: [71130]
        Other proteins in same PDB: d1i8kb_
        part of dsFv MR1; complex with a EGFR-VIII peptide
        mutant
    71. Domains for 1i8m:
      1. 547808Domain d1i8ma1: 1i8m A:1-107 [66082]
        Other proteins in same PDB: d1i8ma2, d1i8mb1, d1i8mb2, d1i8mh1, d1i8mh2, d1i8ml2
        part of anti-ssDNA Fab
        complexed with so4
      2. 547809Domain d1i8ml1: 1i8m L:1-107 [66088]
        Other proteins in same PDB: d1i8ma2, d1i8mb1, d1i8mb2, d1i8mh1, d1i8mh2, d1i8ml2
    72. Domain for 1iai:
    73. Domain for 1ic4:
    74. Domain for 1ic5:
    75. Domain for 1ic7:
    76. Domain for 1igc:
    77. Domains for 1igt:
      1. 547884Domain d1igta1: 1igt A:1-108 [19764]
        Other proteins in same PDB: d1igta2, d1igtb1, d1igtb2, d1igtb3, d1igtb4, d1igtc2, d1igtd1, d1igtd2, d1igtd3, d1igtd4
      2. 547885Domain d1igtc1: 1igt C:1-108 [19766]
        Other proteins in same PDB: d1igta2, d1igtb1, d1igtb2, d1igtb3, d1igtb4, d1igtc2, d1igtd1, d1igtd2, d1igtd3, d1igtd4
        part of intact IgG2a antibody Mab231
        complexed with fuc, gal, man, nag
    78. Domains for 1igy:
      1. 547919Domain d1igya1: 1igy A:2-107 [19768]
        Other proteins in same PDB: d1igya2, d1igyb1, d1igyb2, d1igyb3, d1igyb4, d1igyc2, d1igyd1, d1igyd2, d1igyd3, d1igyd4
      2. 547920Domain d1igyc1: 1igy C:2-107 [19770]
        Other proteins in same PDB: d1igya2, d1igyb1, d1igyb2, d1igyb3, d1igyb4, d1igyc2, d1igyd1, d1igyd2, d1igyd3, d1igyd4
        part of intact IgG1 antibody Mab61.1.3
        complexed with fuc, gal, man, nag
    79. Domain for 1ikf:
    80. Domain for 1j1o:
    81. Domain for 1j1p:
    82. Domain for 1j1x:
    83. Domain for 1j5o:
    84. Domain for 1jfq:
    85. Domain for 1jgl:
    86. Domain for 1jhk:
    87. Domain for 1jhl:
    88. Domain for 1jnl:
    89. Domain for 1jnn:
    90. Domain for 1jrh:
    91. Domain for 1k4c:
    92. Domain for 1k4d:
    93. Domain for 1k6q:
    94. Domain for 1kb5:
    95. Domain for 1kb9:
    96. Domain for 1kc5:
    97. Domain for 1kcr:
    98. Domain for 1kcs:
    99. Domain for 1kcu:
    100. Domain for 1kcv:
    101. Domain for 1kip:
    102. Domain for 1kiq:
    103. Domain for 1kir:
    104. Domains for 1kno:
      1. 547921Domain d1knoa1: 1kno A:1-108 [20008]
        Other proteins in same PDB: d1knoa2, d1knob1, d1knob2, d1knoc2, d1knod1, d1knod2, d1knoe2, d1knof1, d1knof2
      2. 547922Domain d1knoc1: 1kno C:1-108 [20010]
        Other proteins in same PDB: d1knoa2, d1knob1, d1knob2, d1knoc2, d1knod1, d1knod2, d1knoe2, d1knof1, d1knof2
      3. 547923Domain d1knoe1: 1kno E:1-108 [20012]
        Other proteins in same PDB: d1knoa2, d1knob1, d1knob2, d1knoc2, d1knod1, d1knod2, d1knoe2, d1knof1, d1knof2
        part of Fab CNJ206
        complexed with pnp, zn
    105. Domains for 1kyo:
      1. 547905Domain d1kyok_: 1kyo K: [73263]
        Other proteins in same PDB: d1kyoa1, d1kyoa2, d1kyob1, d1kyob2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyol1, d1kyol2, d1kyom1, d1kyom2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyow_
      2. 547906Domain d1kyov_: 1kyo V: [73278]
        Other proteins in same PDB: d1kyoa1, d1kyoa2, d1kyob1, d1kyob2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod1, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyol1, d1kyol2, d1kyom1, d1kyom2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo1, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyow_
        part of Fv against Rieske protein from the yeast cytochrome bc1 complex
        complexed with fes, hem, m3l, sma
    106. Domain for 1mam:
    107. Domain for 1mex:
    108. Domain for 1mlb:
    109. Domains for 1mlc:
      1. 547824Domain d1mlca1: 1mlc A:1-108 [20052]
        Other proteins in same PDB: d1mlca2, d1mlcb1, d1mlcb2, d1mlcc2, d1mlcd1, d1mlcd2, d1mlce_, d1mlcf_
      2. 547825Domain d1mlcc1: 1mlc C:1-108 [20054]
        Other proteins in same PDB: d1mlca2, d1mlcb1, d1mlcb2, d1mlcc2, d1mlcd1, d1mlcd2, d1mlce_, d1mlcf_
        part of Fab D44.1
    110. Domain for 1mqk:
      • 547740Domain d1mqkl_: 1mqk L: [85054]
        Other proteins in same PDB: d1mqkh_
        part of Fv against Paracoccus denitrificans cytochrome c oxidase
    111. Domain for 1n5y:
    112. Domain for 1n6q:
    113. Domain for 1n7m:
      • 547763Domain d1n7mh1: 1n7m H:1-107 [80252]
        Other proteins in same PDB: d1n7mh2, d1n7ml1, d1n7ml2
        part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; germline antibody; chain identifiers are probably mixed up
        complexed with mmp
    114. Domain for 1nby:
    115. Domain for 1nbz:
    116. Domain for 1nca:
    117. Domain for 1ncb:
    118. Domain for 1ncc:
    119. Domain for 1ncd:
    120. Domain for 1ndg:
    121. Domain for 1ndm:
    122. Domains for 1ngw:
      1. 547954Domain d1ngwa1: 1ngw A:1-107 [80488]
        Other proteins in same PDB: d1ngwa2, d1ngwb1, d1ngwb2, d1ngwh1, d1ngwh2, d1ngwl2
      2. 547955Domain d1ngwl1: 1ngw L:1-107 [80494]
        Other proteins in same PDB: d1ngwa2, d1ngwb1, d1ngwb2, d1ngwh1, d1ngwh2, d1ngwl2
        part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; chimeric affinity matured antibody
        complexed with mmp
    123. Domains for 1ngx:
      1. 547942Domain d1ngxa1: 1ngx A:1-107 [85702]
        Other proteins in same PDB: d1ngxa2, d1ngxb1, d1ngxb2, d1ngxh1, d1ngxh2, d1ngxl2
      2. 547943Domain d1ngxl1: 1ngx L:1-107 [85708]
        Other proteins in same PDB: d1ngxa2, d1ngxb1, d1ngxb2, d1ngxh1, d1ngxh2, d1ngxl2
        part of metal chelatase catalytic Fab 7G12; chimeric germline antibody
        complexed with jef
    124. Domain for 1ngy:
    125. Domain for 1ngz:
    126. Domain for 1nma:
      • 547907Domain d1nmal_: 1nma L: [20064]
        Other proteins in same PDB: d1nmah_, d1nman_
        part of Fab NC10; only Fv coordinates are included
        complexed with man, nag; mutant
    127. Domain for 1nmb:
      • 547866Domain d1nmbl_: 1nmb L: [20062]
        Other proteins in same PDB: d1nmbh_, d1nmbn_
        part of Fab NC10; only Fv coordinates are included
        complexed with ca, man, nag; mutant
    128. Domains for 1nmc:
      1. 547867Domain d1nmcc_: 1nmc C: [20059]
        Other proteins in same PDB: d1nmca_, d1nmcb_, d1nmch_, d1nmcn_
        part of Fab NC10; only Fv coordinates are included
        complexed with ca, man, nag
      2. 547868Domain d1nmcl_: 1nmc L: [20056]
        Other proteins in same PDB: d1nmca_, d1nmcb_, d1nmch_, d1nmcn_
    129. Domain for 1oak:
    130. Domain for 1opg:
      • 547805Domain