Lineage for Species: Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId: 9606]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2017114Class b: All beta proteins [48724] (177 folds)
  3. 2017115Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (33 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
    some members of the fold have additional strands
  4. 2017116Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (5 families) (S)
  5. 2020524Family b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) [48942] (24 protein domains)
  6. 2021990Protein Class II MHC alpha chain, C-terminal domain [88618] (6 species)
  7. 2021998Species Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId:9606] [88621] (37 PDB entries)
    Uniprot P01903 28-207
    probably orthologous to the mouse I-E group

PDB entries in Species: Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId: 9606]:

  1. Domain(s) for 1a6a:
  2. Domain(s) for 1aqd:
    1. 2022015Domain d1aqda1: 1aqd A:82-181 [21585]
      Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb1, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde1, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh1, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk1, d1aqdk2
    2. 2022016Domain d1aqdd1: 1aqd D:82-179 [21587]
      Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb1, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde1, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh1, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk1, d1aqdk2
    3. 2022017Domain d1aqdg1: 1aqd G:82-179 [21589]
      Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb1, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde1, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh1, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk1, d1aqdk2
    4. 2022018Domain d1aqdj1: 1aqd J:82-179 [21591]
      Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb1, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde1, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh1, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk1, d1aqdk2
  3. Domain(s) for 1bx2:
    1. 2022043Domain d1bx2a1: 1bx2 A:82-181 [21609]
      Other proteins in same PDB: d1bx2a2, d1bx2b1, d1bx2b2, d1bx2d2, d1bx2e1, d1bx2e2
      complexed with nag
    2. 2022044Domain d1bx2d1: 1bx2 D:82-181 [21611]
      Other proteins in same PDB: d1bx2a2, d1bx2b1, d1bx2b2, d1bx2d2, d1bx2e1, d1bx2e2
      complexed with nag
  4. Domain(s) for 1d5m:
  5. Domain(s) for 1d5x:
  6. Domain(s) for 1d5z:
  7. Domain(s) for 1d6e:
  8. Domain(s) for 1dlh:
    1. 2022041Domain d1dlha1: 1dlh A:82-182 [21597]
      Other proteins in same PDB: d1dlha2, d1dlhb1, d1dlhb2, d1dlhd2, d1dlhe1, d1dlhe2
      complexed with nag, ndg
    2. 2022042Domain d1dlhd1: 1dlh D:82-182 [21599]
      Other proteins in same PDB: d1dlha2, d1dlhb1, d1dlhb2, d1dlhd2, d1dlhe1, d1dlhe2
      complexed with nag, ndg
  9. Domain(s) for 1fv1:
    1. 2022001Domain d1fv1a1: 1fv1 A:82-181 [21605]
      Other proteins in same PDB: d1fv1a2, d1fv1b1, d1fv1b2, d1fv1d2, d1fv1e1, d1fv1e2
      complexed with gol, so4
    2. 2022002Domain d1fv1d1: 1fv1 D:82-181 [21607]
      Other proteins in same PDB: d1fv1a2, d1fv1b1, d1fv1b2, d1fv1d2, d1fv1e1, d1fv1e2
      complexed with gol, so4
  10. Domain(s) for 1fyt:
  11. Domain(s) for 1h15:
    1. 2022050Domain d1h15a1: 1h15 A:82-182 [76454]
      Other proteins in same PDB: d1h15a2, d1h15b1, d1h15b2, d1h15d2, d1h15e1, d1h15e2
      protein/DNA complex; complexed with nag
    2. 2022051Domain d1h15d1: 1h15 D:82-182 [76458]
      Other proteins in same PDB: d1h15a2, d1h15b1, d1h15b2, d1h15d2, d1h15e1, d1h15e2
      protein/DNA complex; complexed with nag
  12. Domain(s) for 1hqr:
  13. Domain(s) for 1hxy:
  14. Domain(s) for 1j8h:
  15. Domain(s) for 1jwm:
  16. Domain(s) for 1jws:
  17. Domain(s) for 1jwu:
  18. Domain(s) for 1kg0:
  19. Domain(s) for 1klg:
  20. Domain(s) for 1klu:
  21. Domain(s) for 1lo5:
  22. Domain(s) for 1pyw:
  23. Domain(s) for 1r5i:
    1. 2022034Domain d1r5ia1: 1r5i A:82-181 [97087]
      Other proteins in same PDB: d1r5ia2, d1r5ib1, d1r5ib2, d1r5id1, d1r5id2, d1r5ie2, d1r5if1, d1r5if2, d1r5ih1, d1r5ih2
      complexed with po4
    2. 2022035Domain d1r5ie1: 1r5i E:82-181 [97092]
      Other proteins in same PDB: d1r5ia2, d1r5ib1, d1r5ib2, d1r5id1, d1r5id2, d1r5ie2, d1r5if1, d1r5if2, d1r5ih1, d1r5ih2
      complexed with po4
  24. Domain(s) for 1seb:
    1. 2022048Domain d1seba1: 1seb A:82-181 [21601]
      Other proteins in same PDB: d1seba2, d1sebb1, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe2, d1sebf1, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2
    2. 2022049Domain d1sebe1: 1seb E:82-181 [21603]
      Other proteins in same PDB: d1seba2, d1sebb1, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe2, d1sebf1, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2
  25. Domain(s) for 1sje:
  26. Domain(s) for 1sjh:
  27. Domain(s) for 1t5w:
    1. 2022019Domain d1t5wa1: 1t5w A:82-181 [106481]
      Other proteins in same PDB: d1t5wa2, d1t5wb1, d1t5wb2, d1t5wd2, d1t5we1, d1t5we2
    2. 2022020Domain d1t5wd1: 1t5w D:82-181 [106485]
      Other proteins in same PDB: d1t5wa2, d1t5wb1, d1t5wb2, d1t5wd2, d1t5we1, d1t5we2
  28. Domain(s) for 1t5x:
  29. Domain(s) for 2iam:
  30. Domain(s) for 2ian:
    1. 2022037Domain d2iana1: 2ian A:82-181 [137162]
      Other proteins in same PDB: d2iana2, d2ianb1, d2ianb2, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf2, d2iang1, d2iang2, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank2, d2ianl1, d2ianl2, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp2, d2ianq1, d2ianq2, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
      automated match to d1pywa1
      mutant
    2. 2022038Domain d2ianf1: 2ian F:82-181 [137166]
      Other proteins in same PDB: d2iana2, d2ianb1, d2ianb2, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf2, d2iang1, d2iang2, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank2, d2ianl1, d2ianl2, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp2, d2ianq1, d2ianq2, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
      automated match to d1jwua1
      mutant
    3. 2022039Domain d2iank1: 2ian K:82-181 [137170]
      Other proteins in same PDB: d2iana2, d2ianb1, d2ianb2, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf2, d2iang1, d2iang2, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank2, d2ianl1, d2ianl2, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp2, d2ianq1, d2ianq2, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
      automated match to d1jwua1
      mutant
    4. 2022040Domain d2ianp1: 2ian P:82-181 [137174]
      Other proteins in same PDB: d2iana2, d2ianb1, d2ianb2, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf2, d2iang1, d2iang2, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank2, d2ianl1, d2ianl2, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp2, d2ianq1, d2ianq2, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
      automated match to d1jwua1
      mutant
  31. Domain(s) for 2seb:
  32. Domain(s) for 3c5j:
  33. Domain(s) for 3o6f:
    1. 2022045Domain d3o6fa2: 3o6f A:82-181 [214201]
      Other proteins in same PDB: d3o6fa1, d3o6fc1, d3o6fc2, d3o6fd1, d3o6fd2, d3o6fe1, d3o6fg1, d3o6fg2, d3o6fh1, d3o6fh2
      automated match to d1pywa1
    2. 2022046Domain d3o6fe2: 3o6f E:82-180 [214207]
      Other proteins in same PDB: d3o6fa1, d3o6fc1, d3o6fc2, d3o6fd1, d3o6fd2, d3o6fe1, d3o6fg1, d3o6fg2, d3o6fh1, d3o6fh2
      automated match to d1jwua1
  34. Domain(s) for 4e41:
    1. 2022023Domain d4e41a2: 4e41 A:82-181 [220249]
      Other proteins in same PDB: d4e41a1, d4e41b1, d4e41b2, d4e41d1, d4e41d2, d4e41e1, d4e41e2, d4e41f1, d4e41g1, d4e41g2, d4e41i1, d4e41i2, d4e41j1, d4e41j2
      automated match to d1jwua1
      complexed with na; mutant
    2. 2022024Domain d4e41f2: 4e41 F:82-181 [220257]
      Other proteins in same PDB: d4e41a1, d4e41b1, d4e41b2, d4e41d1, d4e41d2, d4e41e1, d4e41e2, d4e41f1, d4e41g1, d4e41g2, d4e41i1, d4e41i2, d4e41j1, d4e41j2
      automated match to d1jwua1
      complexed with na; mutant
  35. Domain(s) for 4h25:
    1. 2022006Domain d4h25a2: 4h25 A:82-182 [228335]
      Other proteins in same PDB: d4h25a1, d4h25b1, d4h25b2, d4h25b3, d4h25b4, d4h25d1, d4h25e1, d4h25e2, d4h25e3, d4h25e4
      automated match to d1kg0a1
      complexed with ipa
    2. 2022007Domain d4h25d2: 4h25 D:82-182 [228337]
      Other proteins in same PDB: d4h25a1, d4h25b1, d4h25b2, d4h25b3, d4h25b4, d4h25d1, d4h25e1, d4h25e2, d4h25e3, d4h25e4
      automated match to d1kg0a1
      complexed with ipa
  36. Domain(s) for 4h26:
    1. 2022025Domain d4h26a2: 4h26 A:82-181 [228341]
      Other proteins in same PDB: d4h26a1, d4h26b1, d4h26b2, d4h26b3, d4h26b4, d4h26d1, d4h26e1, d4h26e2, d4h26e3, d4h26e4
      automated match to d1fv1a1
    2. 2022026Domain d4h26d2: 4h26 D:82-181 [228340]
      Other proteins in same PDB: d4h26a1, d4h26b1, d4h26b2, d4h26b3, d4h26b4, d4h26d1, d4h26e1, d4h26e2, d4h26e3, d4h26e4
      automated match to d1fv1a1
  37. Domain(s) for 4i5b:
    1. 2022029Domain d4i5ba2: 4i5b A:82-181 [234811]
      Other proteins in same PDB: d4i5ba1, d4i5bb1, d4i5bb2, d4i5bd1, d4i5be1, d4i5be2
      automated match to d4i5bd2
    2. 2022030Domain d4i5bd2: 4i5b D:82-188 [229425]
      Other proteins in same PDB: d4i5ba1, d4i5bb1, d4i5bb2, d4i5bd1, d4i5be1, d4i5be2
      automated match to d1fv1a1

More info for Species Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId:9606] from b.1.1.2 Class II MHC alpha chain, C-terminal domain

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