SCOPe 2.06: Protein: Class II MHC beta chain, N-terminal domain

Lineage for Protein: Class II MHC beta chain, N-terminal domain

Root: SCOPe 2.06
Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (385 folds)
Fold d.19: MHC antigen-recognition domain [54451] (1 superfamily)
dimeric
Superfamily d.19.1: MHC antigen-recognition domain [54452] (2 families)
Family d.19.1.1: MHC antigen-recognition domain [54453] (13 proteins)
Protein Class II MHC beta chain, N-terminal domain [88819] (15 species)

Species:

Human (Homo sapiens), HLA-DM [TaxId:9606] [88820] (1 PDB entry)
- Domain for 1hdm:
  - Domain d1hdmb2: 1hdm B:3-87 [38158]
    Other proteins in same PDB: d1hdma1, d1hdma2, d1hdmb1
Human (Homo sapiens), HLA-DQ2 [TaxId:9606] [102835] (1 PDB entry)
- Domains for 1s9v:
  1. Domain d1s9vb2: 1s9v B:3-94 [98763]
    Other proteins in same PDB: d1s9va1, d1s9va2, d1s9vb1, d1s9vd1, d1s9vd2, d1s9ve1
    complexed with deamidated gliadin peptide
    complexed with edo
  2. Domain d1s9ve2: 1s9v E:3-94 [98767]
    Other proteins in same PDB: d1s9va1, d1s9va2, d1s9vb1, d1s9vd1, d1s9vd2, d1s9ve1
    complexed with deamidated gliadin peptide
    complexed with edo
Human (Homo sapiens), HLA-DQ6 [TaxId:9606] [102836] (1 PDB entry)
- Domain for 1uvq:
  - Domain d1uvqb2: 1uvq B:3-94 [100065]
    Other proteins in same PDB: d1uvqa1, d1uvqa2, d1uvqb1
    complexed with a hypocretin peptide
    complexed with acy, gly, nag, zn
Human (Homo sapiens), HLA-DQ8 [TaxId:9606] [88825] (1 PDB entry)
- Domain for 1jk8:
  - Domain d1jk8b2: 1jk8 B:3-94 [63148]
    Other proteins in same PDB: d1jk8a1, d1jk8a2, d1jk8b1
    complexed with a human insulin peptide
    complexed with nag

Human (Homo sapiens), HLA-DR1 [TaxId:9606] [88821] (18 PDB entries)

Domains for 1aqd:
1. Domain d1aqdb2: 1aqd B:4-92 [38160]
  Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqda2, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqdd2, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdg2, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdj2, d1aqdk1
2. Domain d1aqde2: 1aqd E:4-92 [38162]
  Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqda2, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqdd2, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdg2, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdj2, d1aqdk1
3. Domain d1aqdh2: 1aqd H:4-92 [38164]
  Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqda2, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqdd2, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdg2, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdj2, d1aqdk1
4. Domain d1aqdk2: 1aqd K:4-92 [38166]
  Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqda2, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqdd2, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdg2, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdj2, d1aqdk1
Domains for 1dlh:
1. Domain d1dlhb2: 1dlh B:3-92 [38172]
  Other proteins in same PDB: d1dlha1, d1dlha2, d1dlhb1, d1dlhd1, d1dlhd2, d1dlhe1
  complexed with nag, ndg
2. Domain d1dlhe2: 1dlh E:3-92 [38174]
  Other proteins in same PDB: d1dlha1, d1dlha2, d1dlhb1, d1dlhd1, d1dlhd2, d1dlhe1
  complexed with nag, ndg
Domain for 1fyt:
- Domain d1fytb2: 1fyt B:3-92 [38170]
  Other proteins in same PDB: d1fyta1, d1fyta2, d1fytb1, d1fytd1, d1fytd2, d1fyte1, d1fyte2
  complexed with nag

Domains for 1h15:

Domain d1h15b2: 1h15 B:2-92 [76457]
Other proteins in same PDB: d1h15a1, d1h15a2, d1h15b1, d1h15d1, d1h15d2, d1h15e1
complexed with a peptide from Epstein barr virus DNA polymerase, chains C and H
protein/DNA complex; complexed with nag

Domain d1h15e2: 1h15 E:2-92 [76461]
Other proteins in same PDB: d1h15a1, d1h15a2, d1h15b1, d1h15d1, d1h15d2, d1h15e1
complexed with a peptide from Epstein barr virus DNA polymerase, chains C and H
protein/DNA complex; complexed with nag

Domain for 1hxy:
- Domain d1hxyb2: 1hxy B:3-92 [61389]
  Other proteins in same PDB: d1hxya1, d1hxya2, d1hxyb1, d1hxyd1, d1hxyd2
  complexed with zn
Domain for 1kg0:
- Domain d1kg0b2: 1kg0 B:3-92 [72444]
  Other proteins in same PDB: d1kg0a1, d1kg0a2, d1kg0b1, d1kg0c_
Domain for 1klg:
- Domain d1klgb2: 1klg B:1-92 [72717]
  Other proteins in same PDB: d1klga1, d1klga2, d1klgb1, d1klgd1, d1klgd2
  mutant
Domain for 1klu:
- Domain d1klub2: 1klu B:1-92 [72727]
  Other proteins in same PDB: d1klua1, d1klua2, d1klub1, d1klud1, d1klud2
Domain for 1lo5:
- Domain d1lo5b2: 1lo5 B:3-92 [78119]
  Other proteins in same PDB: d1lo5a1, d1lo5a2, d1lo5b1, d1lo5d1, d1lo5d2
  complexed with a peptide from hemagglutinin
Domain for 1pyw:
- Domain d1pywb2: 1pyw B:1-92 [95380]
  Other proteins in same PDB: d1pywa1, d1pywa2, d1pywb1, d1pywd1, d1pywd2
Domains for 1r5i:
1. Domain d1r5ib2: 1r5i B:1-92 [97090]
  Other proteins in same PDB: d1r5ia1, d1r5ia2, d1r5ib1, d1r5id1, d1r5id2, d1r5ie1, d1r5ie2, d1r5if1, d1r5ih1, d1r5ih2
  complexed with po4
2. Domain d1r5if2: 1r5i F:1-92 [97095]
  Other proteins in same PDB: d1r5ia1, d1r5ia2, d1r5ib1, d1r5id1, d1r5id2, d1r5ie1, d1r5ie2, d1r5if1, d1r5ih1, d1r5ih2
  complexed with po4
Domains for 1seb:
1. Domain d1sebb2: 1seb B:1-92 [38176]
  Other proteins in same PDB: d1seba1, d1seba2, d1sebb1, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe1, d1sebe2, d1sebf1, d1sebh1, d1sebh2
2. Domain d1sebf2: 1seb F:1-92 [38178]
  Other proteins in same PDB: d1seba1, d1seba2, d1sebb1, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe1, d1sebe2, d1sebf1, d1sebh1, d1sebh2
Domain for 2iam:
- Domain d2iamb2: 2iam B:1-92 [137161]
  Other proteins in same PDB: d2iama1, d2iama2, d2iamb1, d2iamc1, d2iamc2, d2iamd1, d2iamd2
  automated match to d1klub2
  mutant

Domains for 2ian:

Domain d2ianb2: 2ian B:3-92 [137165]
Other proteins in same PDB: d2iana1, d2iana2, d2ianb1, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf1, d2ianf2, d2iang1, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank1, d2iank2, d2ianl1, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp1, d2ianp2, d2ianq1, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
automated match to d1klub2
mutant

Domain d2iang2: 2ian G:2-92 [137169]
Other proteins in same PDB: d2iana1, d2iana2, d2ianb1, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf1, d2ianf2, d2iang1, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank1, d2iank2, d2ianl1, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp1, d2ianp2, d2ianq1, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
automated match to d1klub2
mutant

Domain d2ianl2: 2ian L:3-92 [137173]
Other proteins in same PDB: d2iana1, d2iana2, d2ianb1, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf1, d2ianf2, d2iang1, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank1, d2iank2, d2ianl1, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp1, d2ianp2, d2ianq1, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
automated match to d1klub2
mutant

Domain d2ianq2: 2ian Q:3-92 [137177]
Other proteins in same PDB: d2iana1, d2iana2, d2ianb1, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf1, d2ianf2, d2iang1, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank1, d2iank2, d2ianl1, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp1, d2ianp2, d2ianq1, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
automated match to d1klub2
mutant

Domain for 2seb:
- Domain d2sebb2: 2seb B:2-92 [38168]
  Other proteins in same PDB: d2seba1, d2seba2, d2sebb1, d2sebd1, d2sebd2
  complexed with nag

Domains for 4e41:

Domain d4e41b1: 4e41 B:4-92 [220250]
Other proteins in same PDB: d4e41a1, d4e41a2, d4e41b2, d4e41d1, d4e41d2, d4e41e1, d4e41e2, d4e41f1, d4e41f2, d4e41g2, d4e41i1, d4e41i2, d4e41j1, d4e41j2
automated match to d1klub2
complexed with na; mutant

Domain d4e41g1: 4e41 G:4-92 [220258]
Other proteins in same PDB: d4e41a1, d4e41a2, d4e41b2, d4e41d1, d4e41d2, d4e41e1, d4e41e2, d4e41f1, d4e41f2, d4e41g2, d4e41i1, d4e41i2, d4e41j1, d4e41j2
automated match to d1klub2
complexed with na; mutant

Domains for 4i5b:
1. Domain d4i5bb1: 4i5b B:2-92 [234812]
  Other proteins in same PDB: d4i5ba1, d4i5ba2, d4i5bb2, d4i5bd1, d4i5bd2, d4i5be2
  automated match to d4i5be1
2. Domain d4i5be1: 4i5b E:2-92 [229427]
  Other proteins in same PDB: d4i5ba1, d4i5ba2, d4i5bb2, d4i5bd1, d4i5bd2, d4i5be2
  automated match to d1klub2
Domains for 5lax:
1. Domain d5laxb1: 5lax B:1-92 [327022]
  Other proteins in same PDB: d5laxa1, d5laxa2, d5laxa3, d5laxb2, d5laxb3, d5laxc1, d5laxc2, d5laxd2, d5laxd3
  automated match to d1klub2
  complexed with mla
2. Domain d5laxd1: 5lax D:4-92 [327004]
  Other proteins in same PDB: d5laxa1, d5laxa2, d5laxa3, d5laxb2, d5laxb3, d5laxc1, d5laxc2, d5laxd2, d5laxd3
  automated match to d1klub2
  complexed with mla

Human (Homo sapiens), HLA-DR2 [TaxId:9606] [88822] (13 PDB entries)
Uniprot P04229 30-219

Domains for 1bx2:
1. Domain d1bx2b2: 1bx2 B:3-92 [38184]
  Other proteins in same PDB: d1bx2a1, d1bx2a2, d1bx2b1, d1bx2d1, d1bx2d2, d1bx2e1
  complexed with nag
2. Domain d1bx2e2: 1bx2 E:3-92 [38186]
  Other proteins in same PDB: d1bx2a1, d1bx2a2, d1bx2b1, d1bx2d1, d1bx2d2, d1bx2e1
  complexed with nag
Domains for 1fv1:
1. Domain d1fv1b2: 1fv1 B:1-92 [38180]
  Other proteins in same PDB: d1fv1a1, d1fv1a2, d1fv1b1, d1fv1d1, d1fv1d2, d1fv1e1
  complexed with gol, so4
2. Domain d1fv1e2: 1fv1 E:1-92 [38182]
  Other proteins in same PDB: d1fv1a1, d1fv1a2, d1fv1b1, d1fv1d1, d1fv1d2, d1fv1e1
  complexed with gol, so4
Domain for 1hqr:
- Domain d1hqrb2: 1hqr B:202-292 [38188]
  Other proteins in same PDB: d1hqra1, d1hqra2, d1hqrb1, d1hqrd1, d1hqrd2
  complexed with zn
Domain for 1jwm:
- Domain d1jwmb2: 1jwm B:1-92 [84239]
  Other proteins in same PDB: d1jwma1, d1jwma2, d1jwmb1, d1jwmd1, d1jwmd2
Domain for 1jws:
- Domain d1jwsb2: 1jws B:1-92 [84245]
  Other proteins in same PDB: d1jwsa1, d1jwsa2, d1jwsb1, d1jwsd1, d1jwsd2
Domain for 1jwu:
- Domain d1jwub2: 1jwu B:1-92 [84251]
  Other proteins in same PDB: d1jwua1, d1jwua2, d1jwub1, d1jwud1, d1jwud2
Domain for 1sje:
- Domain d1sjeb2: 1sje B:1-92 [105643]
  Other proteins in same PDB: d1sjea1, d1sjea2, d1sjeb1, d1sjed1, d1sjed2
Domain for 1sjh:
- Domain d1sjhb2: 1sjh B:1-92 [105651]
  Other proteins in same PDB: d1sjha1, d1sjha2, d1sjhb1, d1sjhd1, d1sjhd2
Domains for 1t5w:
1. Domain d1t5wb2: 1t5w B:1-92 [106484]
  Other proteins in same PDB: d1t5wa1, d1t5wa2, d1t5wb1, d1t5wd1, d1t5wd2, d1t5we1
2. Domain d1t5we2: 1t5w E:1-92 [106488]
  Other proteins in same PDB: d1t5wa1, d1t5wa2, d1t5wb1, d1t5wd1, d1t5wd2, d1t5we1
Domain for 1t5x:
- Domain d1t5xb2: 1t5x B:1-92 [106492]
  Other proteins in same PDB: d1t5xa1, d1t5xa2, d1t5xb1, d1t5xd1, d1t5xd2
Domain for 1ymm:
- Domain d1ymmb2: 1ymm B:3-92 [123704]
  Other proteins in same PDB: d1ymma1, d1ymma2, d1ymmb1, d1ymmd1, d1ymme1, d1ymme2
  automatically matched to d1bx2b2
  complexed with nag

Domains for 1zgl:

Domain d1zglb2: 1zgl B:1-92 [125034]
Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb1, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle1, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh1, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk1, d1zglp1, d1zglp2, d1zglp3, d1zglr1, d1zglr2, d1zglr3, d1zglt1, d1zglt2, d1zglt3, d1zglv1, d1zglv2, d1zglv3
automatically matched to d1fv1b2

Domain d1zgle2: 1zgl E:2-92 [125038]
Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb1, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle1, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh1, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk1, d1zglp1, d1zglp2, d1zglp3, d1zglr1, d1zglr2, d1zglr3, d1zglt1, d1zglt2, d1zglt3, d1zglv1, d1zglv2, d1zglv3
automatically matched to d1fv1b2

Domain d1zglh2: 1zgl H:1-92 [125042]
Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb1, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle1, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh1, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk1, d1zglp1, d1zglp2, d1zglp3, d1zglr1, d1zglr2, d1zglr3, d1zglt1, d1zglt2, d1zglt3, d1zglv1, d1zglv2, d1zglv3
automatically matched to d1fv1b2

Domain d1zglk2: 1zgl K:1-92 [125046]
Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb1, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle1, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh1, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk1, d1zglp1, d1zglp2, d1zglp3, d1zglr1, d1zglr2, d1zglr3, d1zglt1, d1zglt2, d1zglt3, d1zglv1, d1zglv2, d1zglv3
automatically matched to d1fv1b2

Domain for 2nna:
- Domain d2nnab2: 2nna B:1-92 [148316]
  Other proteins in same PDB: d2nnab1, d2nnab3
  automatically matched to d1bx2b2

Human (Homo sapiens), HLA-DR3 [TaxId:9606] [88823] (1 PDB entry)
- Domain for 1a6a:
  - Domain d1a6ab2: 1a6a B:5-92 [38190]
    Other proteins in same PDB: d1a6aa1, d1a6aa2, d1a6ab1
    complexed with nag

Human (Homo sapiens), HLA-DR4 [TaxId:9606] [88824] (9 PDB entries)

Domain for 1d5m:
- Domain d1d5mb2: 1d5m B:2-92 [38192]
  Other proteins in same PDB: d1d5ma1, d1d5ma2, d1d5mb1, d1d5mc1, d1d5mc2
  complexed with nag
Domain for 1d5x:
- Domain d1d5xb2: 1d5x B:1-92 [38198]
  Other proteins in same PDB: d1d5xa1, d1d5xa2, d1d5xb1, d1d5xc1, d1d5xc2
Domain for 1d5z:
- Domain d1d5zb2: 1d5z B:1-92 [38194]
  Other proteins in same PDB: d1d5za1, d1d5za2, d1d5zb1, d1d5zc1, d1d5zc2
Domain for 1d6e:
- Domain d1d6eb2: 1d6e B:3-92 [38196]
  Other proteins in same PDB: d1d6ea1, d1d6ea2, d1d6eb1, d1d6ec1, d1d6ec2
Domain for 1j8h:
- Domain d1j8hb2: 1j8h B:3-92 [71605]
  Other proteins in same PDB: d1j8ha1, d1j8ha2, d1j8hb1, d1j8hd1, d1j8hd2, d1j8he1, d1j8he2
  complexed with nag, ndg
Domain for 2g9h:
- Domain d2g9hb2: 2g9h B:1-92 [134805]
  Other proteins in same PDB: d2g9ha1, d2g9ha2, d2g9hb1, d2g9hd1, d2g9hd2
  automatically matched to d1d5xb2
  complexed with dio, epe, so4, zn

Domains for 2icw:

Domain d2icwb2: 2icw B:1-92 [137246]
Other proteins in same PDB: d2icwa1, d2icwa2, d2icwb1, d2icwd1, d2icwd2, d2icwe1, d2icwg_, d2icwh_, d2icwj1, d2icwj2, d2icwl2, d2icwl3
automatically matched to d1d5xb2

Domain d2icwe2: 2icw E:1-92 [137250]
Other proteins in same PDB: d2icwa1, d2icwa2, d2icwb1, d2icwd1, d2icwd2, d2icwe1, d2icwg_, d2icwh_, d2icwj1, d2icwj2, d2icwl2, d2icwl3
automatically matched to d1d5xb2

Domain for 2ipk:
- Domain d2ipkb2: 2ipk B:1-92 [137580]
  Other proteins in same PDB: d2ipka1, d2ipka2, d2ipkb1, d2ipkd1, d2ipkd2
  automatically matched to d1d5xb2
Domains for 2oje:
1. Domain d2ojeb2: 2oje B:1-92 [139106]
  Other proteins in same PDB: d2ojea1, d2ojea2, d2ojeb1, d2ojed1, d2ojee1, d2ojee2, d2ojef1, d2ojeh1
  automatically matched to d1d5xb2
  complexed with po4
2. Domain d2ojef2: 2oje F:1-92 [139111]
  Other proteins in same PDB: d2ojea1, d2ojea2, d2ojeb1, d2ojed1, d2ojee1, d2ojee2, d2ojef1, d2ojeh1
  automatically matched to d1d5xb2
  complexed with po4

Mouse (Mus musculus), H2-DM [TaxId:10090] [88831] (1 PDB entry)
- Domain for 1k8i:
  - Domain d1k8ib2: 1k8i B:1-94 [68304]
    Other proteins in same PDB: d1k8ia1, d1k8ia2, d1k8ib1
    complexed with nag
Mouse (Mus musculus), I-A(G7) [TaxId:10090] [88830] (4 PDB entries)
1. Domain for 1es0:
  - Domain d1es0b2: 1es0 B:5-93 [38218]
    Other proteins in same PDB: d1es0a1, d1es0a2, d1es0a3, d1es0b1, d1es0b3
2. Domains for 1f3j:
  1. Domain d1f3jb2: 1f3j B:4-93 [38220]
    Other proteins in same PDB: d1f3ja1, d1f3ja2, d1f3jb1, d1f3jd1, d1f3jd2, d1f3je1
    complexed with nag
  2. Domain d1f3je2: 1f3j E:4-93 [38222]
    Other proteins in same PDB: d1f3ja1, d1f3ja2, d1f3jb1, d1f3jd1, d1f3jd2, d1f3je1
    complexed with nag
3. Domain for 2pxy:
  - Domain d2pxyd2: 2pxy D:4-93 [149925]
    Other proteins in same PDB: d2pxya_, d2pxyb_, d2pxyc1, d2pxyc2, d2pxyc3, d2pxyd1
    automatically matched to d1f3jb2
4. Domain for 2z31:
  - Domain d2z31d2: 2z31 D:4-93 [153954]
    Other proteins in same PDB: d2z31a_, d2z31b_, d2z31c1, d2z31c2, d2z31c3, d2z31d1
    automatically matched to d1f3jb2

Mouse (Mus musculus), I-AB [TaxId:10090] [88828] (6 PDB entries)

Domains for 1lnu:

Domain d1lnub2: 1lnu B:1-120 [74100]
Other proteins in same PDB: d1lnua1, d1lnua2, d1lnub1, d1lnuc1, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnue1, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnug1, d1lnug2, d1lnuh1
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B, D, F and H
complexed with nag, ndg

Domain d1lnud2: 1lnu D:1-120 [74104]
Other proteins in same PDB: d1lnua1, d1lnua2, d1lnub1, d1lnuc1, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnue1, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnug1, d1lnug2, d1lnuh1
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B, D, F and H
complexed with nag, ndg

Domain d1lnuf2: 1lnu F:1-120 [74108]
Other proteins in same PDB: d1lnua1, d1lnua2, d1lnub1, d1lnuc1, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnue1, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnug1, d1lnug2, d1lnuh1
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B, D, F and H
complexed with nag, ndg

Domain d1lnuh2: 1lnu H:1-120 [74112]
Other proteins in same PDB: d1lnua1, d1lnua2, d1lnub1, d1lnuc1, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnue1, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnug1, d1lnug2, d1lnuh1
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B, D, F and H
complexed with nag, ndg

Domain for 1muj:
- Domain d1mujb2: 1muj B:3-93 [79491]
  Other proteins in same PDB: d1muja1, d1muja2, d1muja3, d1mujb1, d1mujb3
  complex with a human clip peptide, chain C
  complexed with nag

Domains for 3c5z:

Domain d3c5zd2: 3c5z D:1-120 [155956]
Other proteins in same PDB: d3c5za1, d3c5za2, d3c5zb1, d3c5zb2, d3c5zc1, d3c5zc2, d3c5zd1, d3c5ze1, d3c5ze2, d3c5zf1, d3c5zf2, d3c5zg1, d3c5zg2, d3c5zh1
automated match to d1lnub2

Domain d3c5zh2: 3c5z H:1-120 [155960]
Other proteins in same PDB: d3c5za1, d3c5za2, d3c5zb1, d3c5zb2, d3c5zc1, d3c5zc2, d3c5zd1, d3c5ze1, d3c5ze2, d3c5zf1, d3c5zf2, d3c5zg1, d3c5zg2, d3c5zh1
automated match to d1lnub2

Domains for 3c60:

Domain d3c60d2: 3c60 D:1-120 [155964]
Other proteins in same PDB: d3c60a1, d3c60a2, d3c60b1, d3c60b2, d3c60c1, d3c60c2, d3c60d1, d3c60e1, d3c60e2, d3c60f1, d3c60f2, d3c60g1, d3c60g2, d3c60h1
automated match to d1lnub2

Domain d3c60h2: 3c60 H:1-120 [155968]
Other proteins in same PDB: d3c60a1, d3c60a2, d3c60b1, d3c60b2, d3c60c1, d3c60c2, d3c60d1, d3c60e1, d3c60e2, d3c60f1, d3c60f2, d3c60g1, d3c60g2, d3c60h1
automated match to d1lnub2

Domains for 3c6l:

Domain d3c6ld2: 3c6l D:1-120 [155982]
Other proteins in same PDB: d3c6la1, d3c6la2, d3c6lc1, d3c6lc2, d3c6ld1, d3c6le1, d3c6le2, d3c6lg1, d3c6lg2, d3c6lh1
automatically matched to d1lnub2
complexed with ca

Domain d3c6lh2: 3c6l H:1-120 [155988]
Other proteins in same PDB: d3c6la1, d3c6la2, d3c6lc1, d3c6lc2, d3c6ld1, d3c6le1, d3c6le2, d3c6lg1, d3c6lg2, d3c6lh1
automatically matched to d1lnub2
complexed with ca

Domain for 4p46:
- Domain d4p46d1: 4p46 D:-25-94 [257420]
  Other proteins in same PDB: d4p46a1, d4p46a2, d4p46b1, d4p46b2, d4p46c1, d4p46c2, d4p46d2
  automated match to d1lnub2

Mouse (Mus musculus), I-AD [TaxId:10090] [88829] (2 PDB entries)
1. Domain for 1iao:
  - Domain d1iaob2: 1iao B:6-93 [38216]
    Other proteins in same PDB: d1iaoa1, d1iaoa2, d1iaob1, d1iaob3
    complexed with nag
2. Domain for 2iad:
  - Domain d2iadb2: 2iad B:5-93 [38214]
    Other proteins in same PDB: d2iada1, d2iada2, d2iada3, d2iadb1
Mouse (Mus musculus), I-AK [TaxId:10090] [88826] (3 PDB entries)
1. Domains for 1d9k:
  1. Domain d1d9kd2: 1d9k D:2-92 [38202]
    Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc1, d1d9kc2, d1d9kd1, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg1, d1d9kg2, d1d9kh1
    complexed with ndg
  2. Domain d1d9kh2: 1d9k H:2-92 [38204]
    Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc1, d1d9kc2, d1d9kd1, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg1, d1d9kg2, d1d9kh1
    complexed with ndg
2. Domain for 1iak:
  - Domain d1iakb2: 1iak B:5-92 [38200]
    Other proteins in same PDB: d1iaka1, d1iaka2, d1iakb1
    complexed with nag
3. Domain for 1jl4:
  - Domain d1jl4b2: 1jl4 B:7-92 [63160]
    Other proteins in same PDB: d1jl4a1, d1jl4a2, d1jl4b1, d1jl4b3, d1jl4d1, d1jl4d2
Mouse (Mus musculus), I-AU [TaxId:10090] [89860] (2 PDB entries)
1. Domain for 1k2d:
  - Domain d1k2db2: 1k2d B:5-92 [84294]
    Other proteins in same PDB: d1k2da1, d1k2da2, d1k2da3, d1k2db1
    complexed with nag, ndg
2. Domains for 1u3h:
  1. Domain d1u3hd2: 1u3h D:1-92 [119513]
    Other proteins in same PDB: d1u3ha1, d1u3hb1, d1u3hc1, d1u3hc2, d1u3hc3, d1u3hd1, d1u3he_, d1u3hf_, d1u3hg1, d1u3hg2, d1u3hg3, d1u3hh1
    automated match to d1k2db2
  2. Domain d1u3hh2: 1u3h H:1-92 [119517]
    Other proteins in same PDB: d1u3ha1, d1u3hb1, d1u3hc1, d1u3hc2, d1u3hc3, d1u3hd1, d1u3he_, d1u3hf_, d1u3hg1, d1u3hg2, d1u3hg3, d1u3hh1
    automated match to d1k2db2

Mouse (Mus musculus), I-EK [TaxId:10090] [88827] (9 PDB entries)

Domains for 1fne:

Domain d1fneb2: 1fne B:4-92 [59899]
Other proteins in same PDB: d1fnea1, d1fnea2, d1fneb1, d1fnec1, d1fnec2, d1fned1
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D
complexed with nag

Domain d1fned2: 1fne D:4-92 [59903]
Other proteins in same PDB: d1fnea1, d1fnea2, d1fneb1, d1fnec1, d1fnec2, d1fned1
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D
complexed with nag

Domains for 1fng:

Domain d1fngb2: 1fng B:4-92 [59907]
Other proteins in same PDB: d1fnga1, d1fnga2, d1fngb1, d1fngc1, d1fngc2, d1fngd1
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D
complexed with nag

Domain d1fngd2: 1fng D:4-92 [59911]
Other proteins in same PDB: d1fnga1, d1fnga2, d1fngb1, d1fngc1, d1fngc2, d1fngd1
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D
complexed with nag

Domains for 1i3r:

Domain d1i3rb2: 1i3r B:1-120 [61623]
Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3ra2, d1i3rb1, d1i3rc1, d1i3rc2, d1i3rd1, d1i3re1, d1i3re2, d1i3rf1, d1i3rg1, d1i3rg2, d1i3rh1
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B, D, F and H
complexed with nag, ndg; mutant

Domain d1i3rd2: 1i3r D:1-120 [61627]
Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3ra2, d1i3rb1, d1i3rc1, d1i3rc2, d1i3rd1, d1i3re1, d1i3re2, d1i3rf1, d1i3rg1, d1i3rg2, d1i3rh1
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B, D, F and H
complexed with nag, ndg; mutant

Domain d1i3rf2: 1i3r F:1-120 [61631]
Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3ra2, d1i3rb1, d1i3rc1, d1i3rc2, d1i3rd1, d1i3re1, d1i3re2, d1i3rf1, d1i3rg1, d1i3rg2, d1i3rh1
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B, D, F and H
complexed with nag, ndg; mutant

Domain d1i3rh2: 1i3r H:1-120 [61635]
Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3ra2, d1i3rb1, d1i3rc1, d1i3rc2, d1i3rd1, d1i3re1, d1i3re2, d1i3rf1, d1i3rg1, d1i3rg2, d1i3rh1
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B, D, F and H
complexed with nag, ndg; mutant

Domains for 1iea:

Domain d1ieab2: 1iea B:4-92 [38206]
Other proteins in same PDB: d1ieaa1, d1ieaa2, d1ieab1, d1ieac1, d1ieac2, d1iead1
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D
complexed with nag

Domain d1iead2: 1iea D:4-92 [38208]
Other proteins in same PDB: d1ieaa1, d1ieaa2, d1ieab1, d1ieac1, d1ieac2, d1iead1
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D
complexed with nag

Domains for 1ieb:

Domain d1iebb2: 1ieb B:4-92 [38210]
Other proteins in same PDB: d1ieba1, d1ieba2, d1iebb1, d1iebc1, d1iebc2, d1iebd1
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D
complexed with nag, ndg, so4

Domain d1iebd2: 1ieb D:4-92 [38212]
Other proteins in same PDB: d1ieba1, d1ieba2, d1iebb1, d1iebc1, d1iebc2, d1iebd1
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D
complexed with nag, ndg, so4

Domains for 1kt2:

Domain d1kt2b2: 1kt2 B:2-120 [72954]
Other proteins in same PDB: d1kt2a1, d1kt2a2, d1kt2b1, d1kt2c1, d1kt2c2, d1kt2d1
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D
complexed with nag

Domain d1kt2d2: 1kt2 D:2-120 [72958]
Other proteins in same PDB: d1kt2a1, d1kt2a2, d1kt2b1, d1kt2c1, d1kt2c2, d1kt2d1
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D
complexed with nag

Domains for 1ktd:

Domain d1ktdb2: 1ktd B:1-120 [72967]
Other proteins in same PDB: d1ktda1, d1ktda2, d1ktdb1, d1ktdc1, d1ktdc2, d1ktdd1
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D
complexed with nag, so4

Domain d1ktdd2: 1ktd D:1-120 [72971]
Other proteins in same PDB: d1ktda1, d1ktda2, d1ktdb1, d1ktdc1, d1ktdc2, d1ktdd1
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D
complexed with nag, so4

Domains for 1r5v:
1. Domain d1r5vb2: 1r5v B:32-120 [97119]
  Other proteins in same PDB: d1r5va1, d1r5va2, d1r5vb1, d1r5vb3, d1r5vc1, d1r5vc2, d1r5vd1, d1r5vd3
2. Domain d1r5vd2: 1r5v D:32-120 [97123]
  Other proteins in same PDB: d1r5va1, d1r5va2, d1r5vb1, d1r5vb3, d1r5vc1, d1r5vc2, d1r5vd1, d1r5vd3
Domains for 1r5w:
1. Domain d1r5wb2: 1r5w B:32-120 [97127]
  Other proteins in same PDB: d1r5wa1, d1r5wa2, d1r5wb1, d1r5wb3, d1r5wc1, d1r5wc2, d1r5wd1, d1r5wd3
2. Domain d1r5wd2: 1r5w D:32-120 [97131]
  Other proteins in same PDB: d1r5wa1, d1r5wa2, d1r5wb1, d1r5wb3, d1r5wc1, d1r5wc2, d1r5wd1, d1r5wd3

More info for Protein Class II MHC beta chain, N-terminal domain from d.19.1.1: MHC antigen-recognition domain

Timeline for Protein Class II MHC beta chain, N-terminal domain from d.19.1.1: MHC antigen-recognition domain:

Protein Class II MHC beta chain, N-terminal domain from d.19.1.1: MHC antigen-recognition domain first appeared in SCOP 1.65
Protein Class II MHC beta chain, N-terminal domain from d.19.1.1: MHC antigen-recognition domain appears in SCOPe 2.05
Protein Class II MHC beta chain, N-terminal domain from d.19.1.1: MHC antigen-recognition domain appears in SCOPe 2.07
Protein Class II MHC beta chain, N-terminal domain from d.19.1.1: MHC antigen-recognition domain appears in the current release, SCOPe 2.08