SCOPe 2.03: Protein: Cytochrome c oxidase

Lineage for Protein: Cytochrome c oxidase

Root: SCOPe 2.03
Class b: All beta proteins [48724] (174 folds)
Fold b.6: Cupredoxin-like [49502] (2 superfamilies)
sandwich; 7 strands in 2 sheets, greek-key
variations: some members have additional 1-2 strands
Superfamily b.6.1: Cupredoxins [49503] (8 families)
contains copper-binding site
Family b.6.1.2: Periplasmic domain of cytochrome c oxidase subunit II [49541] (3 proteins)
Protein Cytochrome c oxidase [49544] (4 species)

Species:

Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] [49545] (24 PDB entries)

Domains for 1occ:

Domain d1occb1: 1occ B:91-227 [23031]
Other proteins in same PDB: d1occa_, d1occb2, d1occc_, d1occd_, d1occe_, d1occf_, d1occg_, d1occh_, d1occi_, d1occj_, d1occk_, d1occl_, d1occm_, d1occn_, d1occo2, d1occp_, d1occq_, d1occr_, d1occs_, d1occt_, d1occu_, d1occv_, d1occw_, d1occx_, d1occy_, d1occz_
complexed with cu, hea, mg, zn

Domain d1occo1: 1occ O:91-227 [23032]
Other proteins in same PDB: d1occa_, d1occb2, d1occc_, d1occd_, d1occe_, d1occf_, d1occg_, d1occh_, d1occi_, d1occj_, d1occk_, d1occl_, d1occm_, d1occn_, d1occo2, d1occp_, d1occq_, d1occr_, d1occs_, d1occt_, d1occu_, d1occv_, d1occw_, d1occx_, d1occy_, d1occz_
complexed with cu, hea, mg, zn

Domains for 1oco:

Domain d1ocob1: 1oco B:91-227 [23035]
Other proteins in same PDB: d1ocoa_, d1ocob2, d1ococ_, d1ocod_, d1ocoe_, d1ocof_, d1ocog_, d1ocoh_, d1ocoi_, d1ocoj_, d1ocok_, d1ocol_, d1ocom_, d1ocon_, d1ocoo2, d1ocop_, d1ocoq_, d1ocor_, d1ocos_, d1ocot_, d1ocou_, d1ocov_, d1ocow_, d1ocox_, d1ocoy_, d1ocoz_
complexed with cmo, cu, hea, mg, na, zn

Domain d1ocoo1: 1oco O:91-227 [23036]
Other proteins in same PDB: d1ocoa_, d1ocob2, d1ococ_, d1ocod_, d1ocoe_, d1ocof_, d1ocog_, d1ocoh_, d1ocoi_, d1ocoj_, d1ocok_, d1ocol_, d1ocom_, d1ocon_, d1ocoo2, d1ocop_, d1ocoq_, d1ocor_, d1ocos_, d1ocot_, d1ocou_, d1ocov_, d1ocow_, d1ocox_, d1ocoy_, d1ocoz_
complexed with cmo, cu, hea, mg, na, zn

Domains for 1ocr:

Domain d1ocrb1: 1ocr B:91-227 [23029]
Other proteins in same PDB: d1ocra_, d1ocrb2, d1ocrc_, d1ocrd_, d1ocre_, d1ocrf_, d1ocrg_, d1ocrh_, d1ocri_, d1ocrj_, d1ocrk_, d1ocrl_, d1ocrm_, d1ocrn_, d1ocro2, d1ocrp_, d1ocrq_, d1ocrr_, d1ocrs_, d1ocrt_, d1ocru_, d1ocrv_, d1ocrw_, d1ocrx_, d1ocry_, d1ocrz_
complexed with cu, hea, mg, na, zn

Domain d1ocro1: 1ocr O:91-227 [23030]
Other proteins in same PDB: d1ocra_, d1ocrb2, d1ocrc_, d1ocrd_, d1ocre_, d1ocrf_, d1ocrg_, d1ocrh_, d1ocri_, d1ocrj_, d1ocrk_, d1ocrl_, d1ocrm_, d1ocrn_, d1ocro2, d1ocrp_, d1ocrq_, d1ocrr_, d1ocrs_, d1ocrt_, d1ocru_, d1ocrv_, d1ocrw_, d1ocrx_, d1ocry_, d1ocrz_
complexed with cu, hea, mg, na, zn

Domains for 1ocz:

Domain d1oczb1: 1ocz B:91-227 [23033]
Other proteins in same PDB: d1ocza_, d1oczb2, d1oczc_, d1oczd_, d1ocze_, d1oczf_, d1oczg_, d1oczh_, d1oczi_, d1oczj_, d1oczk_, d1oczl_, d1oczm_, d1oczn_, d1oczo2, d1oczp_, d1oczq_, d1oczr_, d1oczs_, d1oczt_, d1oczu_, d1oczv_, d1oczw_, d1oczx_, d1oczy_, d1oczz_
complexed with azi, cu, hea, mg, na, zn

Domain d1oczo1: 1ocz O:91-227 [23034]
Other proteins in same PDB: d1ocza_, d1oczb2, d1oczc_, d1oczd_, d1ocze_, d1oczf_, d1oczg_, d1oczh_, d1oczi_, d1oczj_, d1oczk_, d1oczl_, d1oczm_, d1oczn_, d1oczo2, d1oczp_, d1oczq_, d1oczr_, d1oczs_, d1oczt_, d1oczu_, d1oczv_, d1oczw_, d1oczx_, d1oczy_, d1oczz_
complexed with azi, cu, hea, mg, na, zn

Domains for 1v54:

Domain d1v54b1: 1v54 B:91-227 [100322]
Other proteins in same PDB: d1v54a_, d1v54b2, d1v54c_, d1v54d_, d1v54e_, d1v54f_, d1v54g_, d1v54h_, d1v54i_, d1v54j_, d1v54k_, d1v54l_, d1v54m_, d1v54n_, d1v54o2, d1v54p_, d1v54q_, d1v54r_, d1v54s_, d1v54t_, d1v54u_, d1v54v_, d1v54w_, d1v54x_, d1v54y_, d1v54z_
complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, unx, zn

Domain d1v54o1: 1v54 O:91-227 [100336]
Other proteins in same PDB: d1v54a_, d1v54b2, d1v54c_, d1v54d_, d1v54e_, d1v54f_, d1v54g_, d1v54h_, d1v54i_, d1v54j_, d1v54k_, d1v54l_, d1v54m_, d1v54n_, d1v54o2, d1v54p_, d1v54q_, d1v54r_, d1v54s_, d1v54t_, d1v54u_, d1v54v_, d1v54w_, d1v54x_, d1v54y_, d1v54z_
complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, unx, zn

Domains for 1v55:

Domain d1v55b1: 1v55 B:91-227 [100350]
Other proteins in same PDB: d1v55a_, d1v55b2, d1v55c_, d1v55d_, d1v55e_, d1v55f_, d1v55g_, d1v55h_, d1v55i_, d1v55j_, d1v55k_, d1v55l_, d1v55m_, d1v55n_, d1v55o2, d1v55p_, d1v55q_, d1v55r_, d1v55s_, d1v55t_, d1v55u_, d1v55v_, d1v55w_, d1v55x_, d1v55y_, d1v55z_
complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, unx, zn

Domain d1v55o1: 1v55 O:91-227 [100364]
Other proteins in same PDB: d1v55a_, d1v55b2, d1v55c_, d1v55d_, d1v55e_, d1v55f_, d1v55g_, d1v55h_, d1v55i_, d1v55j_, d1v55k_, d1v55l_, d1v55m_, d1v55n_, d1v55o2, d1v55p_, d1v55q_, d1v55r_, d1v55s_, d1v55t_, d1v55u_, d1v55v_, d1v55w_, d1v55x_, d1v55y_, d1v55z_
complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, unx, zn

Domains for 2dyr:

Domain d2dyrb1: 2dyr B:91-227 [131900]
Other proteins in same PDB: d2dyra_, d2dyrb2, d2dyrc_, d2dyrd_, d2dyre_, d2dyrf_, d2dyrg_, d2dyrh_, d2dyri_, d2dyrj_, d2dyrk_, d2dyrl_, d2dyrm_, d2dyrn_, d2dyro2, d2dyrp_, d2dyrq_, d2dyrr_, d2dyrs_, d2dyrt_, d2dyru_, d2dyrv_, d2dyrw_, d2dyrx_, d2dyry_, d2dyrz_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, unx, zn

Domain d2dyro1: 2dyr O:91-227 [131914]
Other proteins in same PDB: d2dyra_, d2dyrb2, d2dyrc_, d2dyrd_, d2dyre_, d2dyrf_, d2dyrg_, d2dyrh_, d2dyri_, d2dyrj_, d2dyrk_, d2dyrl_, d2dyrm_, d2dyrn_, d2dyro2, d2dyrp_, d2dyrq_, d2dyrr_, d2dyrs_, d2dyrt_, d2dyru_, d2dyrv_, d2dyrw_, d2dyrx_, d2dyry_, d2dyrz_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, unx, zn

Domains for 2dys:

Domain d2dysb1: 2dys B:91-227 [131928]
Other proteins in same PDB: d2dysa_, d2dysb2, d2dysc_, d2dysd_, d2dyse_, d2dysf_, d2dysg_, d2dysh_, d2dysi_, d2dysj_, d2dysk_, d2dysl_, d2dysm_, d2dysn_, d2dyso2, d2dysp_, d2dysq_, d2dysr_, d2dyss_, d2dyst_, d2dysu_, d2dysv_, d2dysw_, d2dysx_, d2dysy_, d2dysz_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cu, cua, dcw, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, unx, zn

Domain d2dyso1: 2dys O:91-227 [131942]
Other proteins in same PDB: d2dysa_, d2dysb2, d2dysc_, d2dysd_, d2dyse_, d2dysf_, d2dysg_, d2dysh_, d2dysi_, d2dysj_, d2dysk_, d2dysl_, d2dysm_, d2dysn_, d2dyso2, d2dysp_, d2dysq_, d2dysr_, d2dyss_, d2dyst_, d2dysu_, d2dysv_, d2dysw_, d2dysx_, d2dysy_, d2dysz_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cu, cua, dcw, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, unx, zn

Domains for 2eij:

Domain d2eijb1: 2eij B:91-227 [132140]
Other proteins in same PDB: d2eija_, d2eijb2, d2eijc_, d2eijd_, d2eije_, d2eijf_, d2eijg_, d2eijh_, d2eiji_, d2eijj_, d2eijk_, d2eijl_, d2eijm_, d2eijn_, d2eijo2, d2eijp_, d2eijq_, d2eijr_, d2eijs_, d2eijt_, d2eiju_, d2eijv_, d2eijw_, d2eijx_, d2eijy_, d2eijz_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, zn

Domain d2eijo1: 2eij O:91-227 [132154]
Other proteins in same PDB: d2eija_, d2eijb2, d2eijc_, d2eijd_, d2eije_, d2eijf_, d2eijg_, d2eijh_, d2eiji_, d2eijj_, d2eijk_, d2eijl_, d2eijm_, d2eijn_, d2eijo2, d2eijp_, d2eijq_, d2eijr_, d2eijs_, d2eijt_, d2eiju_, d2eijv_, d2eijw_, d2eijx_, d2eijy_, d2eijz_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, zn

Domains for 2eik:

Domain d2eikb1: 2eik B:91-227 [132168]
Other proteins in same PDB: d2eika_, d2eikb2, d2eikc_, d2eikd_, d2eike_, d2eikf_, d2eikg_, d2eikh_, d2eiki_, d2eikj_, d2eikk_, d2eikl_, d2eikm_, d2eikn_, d2eiko2, d2eikp_, d2eikq_, d2eikr_, d2eiks_, d2eikt_, d2eiku_, d2eikv_, d2eikw_, d2eikx_, d2eiky_, d2eikz_
automated match to d1v54b1
complexed with cd, cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, zn

Domain d2eiko1: 2eik O:91-227 [132182]
Other proteins in same PDB: d2eika_, d2eikb2, d2eikc_, d2eikd_, d2eike_, d2eikf_, d2eikg_, d2eikh_, d2eiki_, d2eikj_, d2eikk_, d2eikl_, d2eikm_, d2eikn_, d2eiko2, d2eikp_, d2eikq_, d2eikr_, d2eiks_, d2eikt_, d2eiku_, d2eikv_, d2eikw_, d2eikx_, d2eiky_, d2eikz_
automated match to d1v54b1
complexed with cd, cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, zn

Domains for 2eil:

Domain d2eilb1: 2eil B:91-227 [132196]
Other proteins in same PDB: d2eila_, d2eilb2, d2eilc_, d2eild_, d2eile_, d2eilf_, d2eilg_, d2eilh_, d2eili_, d2eilj_, d2eilk_, d2eill_, d2eilm_, d2eiln_, d2eilo2, d2eilp_, d2eilq_, d2eilr_, d2eils_, d2eilt_, d2eilu_, d2eilv_, d2eilw_, d2eilx_, d2eily_, d2eilz_
automated match to d1v54b1
complexed with cd, cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, zn

Domain d2eilo1: 2eil O:91-227 [132210]
Other proteins in same PDB: d2eila_, d2eilb2, d2eilc_, d2eild_, d2eile_, d2eilf_, d2eilg_, d2eilh_, d2eili_, d2eilj_, d2eilk_, d2eill_, d2eilm_, d2eiln_, d2eilo2, d2eilp_, d2eilq_, d2eilr_, d2eils_, d2eilt_, d2eilu_, d2eilv_, d2eilw_, d2eilx_, d2eily_, d2eilz_
automated match to d1v54b1
complexed with cd, cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, zn

Domains for 2eim:

Domain d2eimb1: 2eim B:91-227 [132224]
Other proteins in same PDB: d2eima_, d2eimb2, d2eimc_, d2eimd_, d2eime_, d2eimf_, d2eimg_, d2eimh_, d2eimi_, d2eimj_, d2eimk_, d2eiml_, d2eimm_, d2eimn_, d2eimo2, d2eimp_, d2eimq_, d2eimr_, d2eims_, d2eimt_, d2eimu_, d2eimv_, d2eimw_, d2eimx_, d2eimy_, d2eimz_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, zn

Domain d2eimo1: 2eim O:91-227 [132238]
Other proteins in same PDB: d2eima_, d2eimb2, d2eimc_, d2eimd_, d2eime_, d2eimf_, d2eimg_, d2eimh_, d2eimi_, d2eimj_, d2eimk_, d2eiml_, d2eimm_, d2eimn_, d2eimo2, d2eimp_, d2eimq_, d2eimr_, d2eims_, d2eimt_, d2eimu_, d2eimv_, d2eimw_, d2eimx_, d2eimy_, d2eimz_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, zn

Domains for 2ein:

Domain d2einb1: 2ein B:91-227 [132252]
Other proteins in same PDB: d2eina_, d2einb2, d2einc_, d2eind_, d2eine_, d2einf_, d2eing_, d2einh_, d2eini_, d2einj_, d2eink_, d2einl_, d2einm_, d2einn_, d2eino2, d2einp_, d2einq_, d2einr_, d2eins_, d2eint_, d2einu_, d2einv_, d2einw_, d2einx_, d2einy_, d2einz_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, zn

Domain d2eino1: 2ein O:91-227 [132266]
Other proteins in same PDB: d2eina_, d2einb2, d2einc_, d2eind_, d2eine_, d2einf_, d2eing_, d2einh_, d2eini_, d2einj_, d2eink_, d2einl_, d2einm_, d2einn_, d2eino2, d2einp_, d2einq_, d2einr_, d2eins_, d2eint_, d2einu_, d2einv_, d2einw_, d2einx_, d2einy_, d2einz_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, zn

Domains for 2occ:

Domain d2occb1: 2occ B:91-227 [23027]
Other proteins in same PDB: d2occa_, d2occb2, d2occc_, d2occd_, d2occe_, d2occf_, d2occg_, d2occh_, d2occi_, d2occj_, d2occk_, d2occl_, d2occm_, d2occn_, d2occo2, d2occp_, d2occq_, d2occr_, d2occs_, d2occt_, d2occu_, d2occv_, d2occw_, d2occx_, d2occy_, d2occz_
complexed with cu, hea, mg, na, per, zn

Domain d2occo1: 2occ O:91-227 [23028]
Other proteins in same PDB: d2occa_, d2occb2, d2occc_, d2occd_, d2occe_, d2occf_, d2occg_, d2occh_, d2occi_, d2occj_, d2occk_, d2occl_, d2occm_, d2occn_, d2occo2, d2occp_, d2occq_, d2occr_, d2occs_, d2occt_, d2occu_, d2occv_, d2occw_, d2occx_, d2occy_, d2occz_
complexed with cu, hea, mg, na, per, zn

Domains for 2y69:

Domain d2y69b2: 2y69 B:91-227 [198669]
Other proteins in same PDB: d2y69a_, d2y69b1, d2y69c_, d2y69d_, d2y69g_, d2y69h_, d2y69i_, d2y69l_, d2y69n_, d2y69o1, d2y69p_, d2y69q_, d2y69t_, d2y69u_, d2y69v_, d2y69y_
automated match to d1v54b1
complexed with chd, cu, cua, dmu, hea, mg, oxy, pek, pgv, zn

Domain d2y69o2: 2y69 O:91-227 [198672]
Other proteins in same PDB: d2y69a_, d2y69b1, d2y69c_, d2y69d_, d2y69g_, d2y69h_, d2y69i_, d2y69l_, d2y69n_, d2y69o1, d2y69p_, d2y69q_, d2y69t_, d2y69u_, d2y69v_, d2y69y_
automated match to d1v54b1
complexed with chd, cu, cua, dmu, hea, mg, oxy, pek, pgv, zn

Domains for 2zxw:

Domain d2zxwb2: 2zxw B:91-227 [198818]
Other proteins in same PDB: d2zxwa_, d2zxwb1, d2zxwc_, d2zxwd_, d2zxwe_, d2zxwf_, d2zxwg_, d2zxwh_, d2zxwi_, d2zxwj_, d2zxwk_, d2zxwl_, d2zxwm_, d2zxwn_, d2zxwo1, d2zxwp_, d2zxwq_, d2zxwr_, d2zxws_, d2zxwt_, d2zxwu_, d2zxwv_, d2zxww_, d2zxwx_, d2zxwy_, d2zxwz_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, per, pgv, psc, tgl, unx, zn

Domain d2zxwo2: 2zxw O:91-227 [198820]
Other proteins in same PDB: d2zxwa_, d2zxwb1, d2zxwc_, d2zxwd_, d2zxwe_, d2zxwf_, d2zxwg_, d2zxwh_, d2zxwi_, d2zxwj_, d2zxwk_, d2zxwl_, d2zxwm_, d2zxwn_, d2zxwo1, d2zxwp_, d2zxwq_, d2zxwr_, d2zxws_, d2zxwt_, d2zxwu_, d2zxwv_, d2zxww_, d2zxwx_, d2zxwy_, d2zxwz_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, per, pgv, psc, tgl, unx, zn

Domains for 3abk:

Domain d3abkb2: 3abk B:91-227 [198841]
Other proteins in same PDB: d3abka_, d3abkb1, d3abkc_, d3abkd_, d3abke_, d3abkf_, d3abkg_, d3abkh_, d3abki_, d3abkj_, d3abkk_, d3abkl_, d3abkm_, d3abkn_, d3abko1, d3abkp_, d3abkq_, d3abkr_, d3abks_, d3abkt_, d3abku_, d3abkv_, d3abkw_, d3abkx_, d3abky_, d3abkz_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, no, pek, pgv, psc, tgl, unx, zn

Domain d3abko2: 3abk O:91-227 [198843]
Other proteins in same PDB: d3abka_, d3abkb1, d3abkc_, d3abkd_, d3abke_, d3abkf_, d3abkg_, d3abkh_, d3abki_, d3abkj_, d3abkk_, d3abkl_, d3abkm_, d3abkn_, d3abko1, d3abkp_, d3abkq_, d3abkr_, d3abks_, d3abkt_, d3abku_, d3abkv_, d3abkw_, d3abkx_, d3abky_, d3abkz_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, no, pek, pgv, psc, tgl, unx, zn

Domains for 3abl:

Domain d3ablb2: 3abl B:91-227 [198845]
Other proteins in same PDB: d3abla_, d3ablb1, d3ablc_, d3abld_, d3able_, d3ablf_, d3ablg_, d3ablh_, d3abli_, d3ablj_, d3ablk_, d3abll_, d3ablm_, d3abln_, d3ablo1, d3ablp_, d3ablq_, d3ablr_, d3abls_, d3ablt_, d3ablu_, d3ablv_, d3ablw_, d3ablx_, d3ably_, d3ablz_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, per, pgv, psc, tgl, unx, zn

Domain d3ablo2: 3abl O:91-227 [198847]
Other proteins in same PDB: d3abla_, d3ablb1, d3ablc_, d3abld_, d3able_, d3ablf_, d3ablg_, d3ablh_, d3abli_, d3ablj_, d3ablk_, d3abll_, d3ablm_, d3abln_, d3ablo1, d3ablp_, d3ablq_, d3ablr_, d3abls_, d3ablt_, d3ablu_, d3ablv_, d3ablw_, d3ablx_, d3ably_, d3ablz_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, per, pgv, psc, tgl, unx, zn

Domains for 3abm:

Domain d3abmb2: 3abm B:91-227 [198849]
Other proteins in same PDB: d3abma_, d3abmb1, d3abmc_, d3abmd_, d3abme_, d3abmf_, d3abmg_, d3abmh_, d3abmi_, d3abmj_, d3abmk_, d3abml_, d3abmm_, d3abmn_, d3abmo1, d3abmp_, d3abmq_, d3abmr_, d3abms_, d3abmt_, d3abmu_, d3abmv_, d3abmw_, d3abmx_, d3abmy_, d3abmz_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, per, pgv, psc, tgl, unx, zn

Domain d3abmo2: 3abm O:91-227 [198851]
Other proteins in same PDB: d3abma_, d3abmb1, d3abmc_, d3abmd_, d3abme_, d3abmf_, d3abmg_, d3abmh_, d3abmi_, d3abmj_, d3abmk_, d3abml_, d3abmm_, d3abmn_, d3abmo1, d3abmp_, d3abmq_, d3abmr_, d3abms_, d3abmt_, d3abmu_, d3abmv_, d3abmw_, d3abmx_, d3abmy_, d3abmz_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, per, pgv, psc, tgl, unx, zn

Domains for 3ag1:

Domain d3ag1b2: 3ag1 B:91-227 [198855]
Other proteins in same PDB: d3ag1a_, d3ag1b1, d3ag1c_, d3ag1d_, d3ag1e_, d3ag1f_, d3ag1g_, d3ag1h_, d3ag1i_, d3ag1j_, d3ag1k_, d3ag1l_, d3ag1m_, d3ag1n_, d3ag1o1, d3ag1p_, d3ag1q_, d3ag1r_, d3ag1s_, d3ag1t_, d3ag1u_, d3ag1v_, d3ag1w_, d3ag1x_, d3ag1y_, d3ag1z_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cmo, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, unx, zn

Domain d3ag1o2: 3ag1 O:91-227 [198857]
Other proteins in same PDB: d3ag1a_, d3ag1b1, d3ag1c_, d3ag1d_, d3ag1e_, d3ag1f_, d3ag1g_, d3ag1h_, d3ag1i_, d3ag1j_, d3ag1k_, d3ag1l_, d3ag1m_, d3ag1n_, d3ag1o1, d3ag1p_, d3ag1q_, d3ag1r_, d3ag1s_, d3ag1t_, d3ag1u_, d3ag1v_, d3ag1w_, d3ag1x_, d3ag1y_, d3ag1z_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cmo, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, unx, zn

Domains for 3ag2:

Domain d3ag2b2: 3ag2 B:91-227 [198859]
Other proteins in same PDB: d3ag2a_, d3ag2b1, d3ag2c_, d3ag2d_, d3ag2e_, d3ag2f_, d3ag2g_, d3ag2h_, d3ag2i_, d3ag2j_, d3ag2k_, d3ag2l_, d3ag2m_, d3ag2n_, d3ag2o1, d3ag2p_, d3ag2q_, d3ag2r_, d3ag2s_, d3ag2t_, d3ag2u_, d3ag2v_, d3ag2w_, d3ag2x_, d3ag2y_, d3ag2z_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cmo, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, unx, zn

Domain d3ag2o2: 3ag2 O:91-227 [198861]
Other proteins in same PDB: d3ag2a_, d3ag2b1, d3ag2c_, d3ag2d_, d3ag2e_, d3ag2f_, d3ag2g_, d3ag2h_, d3ag2i_, d3ag2j_, d3ag2k_, d3ag2l_, d3ag2m_, d3ag2n_, d3ag2o1, d3ag2p_, d3ag2q_, d3ag2r_, d3ag2s_, d3ag2t_, d3ag2u_, d3ag2v_, d3ag2w_, d3ag2x_, d3ag2y_, d3ag2z_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cmo, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, unx, zn

Domains for 3ag3:

Domain d3ag3b2: 3ag3 B:91-227 [198863]
Other proteins in same PDB: d3ag3a_, d3ag3b1, d3ag3c_, d3ag3d_, d3ag3e_, d3ag3f_, d3ag3g_, d3ag3h_, d3ag3i_, d3ag3j_, d3ag3k_, d3ag3l_, d3ag3m_, d3ag3n_, d3ag3o1, d3ag3p_, d3ag3q_, d3ag3r_, d3ag3s_, d3ag3t_, d3ag3u_, d3ag3v_, d3ag3w_, d3ag3x_, d3ag3y_, d3ag3z_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, no, pek, pgv, psc, tgl, unx, zn

Domain d3ag3o2: 3ag3 O:91-227 [198865]
Other proteins in same PDB: d3ag3a_, d3ag3b1, d3ag3c_, d3ag3d_, d3ag3e_, d3ag3f_, d3ag3g_, d3ag3h_, d3ag3i_, d3ag3j_, d3ag3k_, d3ag3l_, d3ag3m_, d3ag3n_, d3ag3o1, d3ag3p_, d3ag3q_, d3ag3r_, d3ag3s_, d3ag3t_, d3ag3u_, d3ag3v_, d3ag3w_, d3ag3x_, d3ag3y_, d3ag3z_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, no, pek, pgv, psc, tgl, unx, zn

Domains for 3ag4:

Domain d3ag4b2: 3ag4 B:91-227 [198867]
Other proteins in same PDB: d3ag4a_, d3ag4b1, d3ag4c_, d3ag4d_, d3ag4e_, d3ag4f_, d3ag4g_, d3ag4h_, d3ag4i_, d3ag4j_, d3ag4k_, d3ag4l_, d3ag4m_, d3ag4n_, d3ag4o1, d3ag4p_, d3ag4q_, d3ag4r_, d3ag4s_, d3ag4t_, d3ag4u_, d3ag4v_, d3ag4w_, d3ag4x_, d3ag4y_, d3ag4z_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cu, cua, cyn, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, unx, zn

Domain d3ag4o2: 3ag4 O:91-227 [198869]
Other proteins in same PDB: d3ag4a_, d3ag4b1, d3ag4c_, d3ag4d_, d3ag4e_, d3ag4f_, d3ag4g_, d3ag4h_, d3ag4i_, d3ag4j_, d3ag4k_, d3ag4l_, d3ag4m_, d3ag4n_, d3ag4o1, d3ag4p_, d3ag4q_, d3ag4r_, d3ag4s_, d3ag4t_, d3ag4u_, d3ag4v_, d3ag4w_, d3ag4x_, d3ag4y_, d3ag4z_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cu, cua, cyn, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, unx, zn

Domains for 3aso:

Domain d3asob2: 3aso B:91-227 [198926]
Other proteins in same PDB: d3asoa_, d3asob1, d3asoc_, d3asod_, d3asoe_, d3asof_, d3asog_, d3asoh_, d3asoi_, d3asoj_, d3asok_, d3asol_, d3asom_, d3ason_, d3asoo1, d3asop_, d3asoq_, d3asor_, d3asos_, d3asot_, d3asou_, d3asov_, d3asow_, d3asox_, d3asoy_, d3asoz_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, unx, zn

Domain d3asoo2: 3aso O:91-227 [198936]
Other proteins in same PDB: d3asoa_, d3asob1, d3asoc_, d3asod_, d3asoe_, d3asof_, d3asog_, d3asoh_, d3asoi_, d3asoj_, d3asok_, d3asol_, d3asom_, d3ason_, d3asoo1, d3asop_, d3asoq_, d3asor_, d3asos_, d3asot_, d3asou_, d3asov_, d3asow_, d3asox_, d3asoy_, d3asoz_
automated match to d1v54b1
complexed with cdl, chd, cu, cua, dmu, hea, mg, na, pek, pgv, psc, tgl, unx, zn

Paracoccus denitrificans [TaxId:266] [49546] (4 PDB entries)
1. Domain for 1ar1:
  - Domain d1ar1b1: 1ar1 B:108-252 [23037]
    Other proteins in same PDB: d1ar1a_, d1ar1b2, d1ar1c_, d1ar1d_
    complexed with ca, cu, hea, lda, mg
2. Domain for 1qle:
  - Domain d1qleb1: 1qle B:108-252 [23038]
    Other proteins in same PDB: d1qlea_, d1qleb2, d1qlec_, d1qled_, d1qleh_, d1qlel_
    complexed with ca, cu, cua, hea, mn, pc1
3. Domain for 3ehb:
  - Domain d3ehbb1: 3ehb B:108-253 [158150]
    Other proteins in same PDB: d3ehba_, d3ehbb2, d3ehbc_, d3ehbd_
    automated match to d1ar1b1
    complexed with ca, cu, hea, lda, lmt, mg, per; mutant
4. Domain for 3hb3:
  - Domain d3hb3b2: 3hb3 B:108-252 [199494]
    Other proteins in same PDB: d3hb3a_, d3hb3b1, d3hb3c_, d3hb3d_
    automated match to d1ar1b1
    complexed with ca, cu1, hea, lda, lmt, mn, peo
Rhodobacter sphaeroides [TaxId:1063] [74870] (5 PDB entries)
1. Domains for 1m56:
  1. Domain d1m56b1: 1m56 B:130-289 [74472]
    Other proteins in same PDB: d1m56a_, d1m56b2, d1m56c_, d1m56d_, d1m56g_, d1m56h2, d1m56i_, d1m56j_
    complexed with ca, cu, hea, mg, peh
  2. Domain d1m56h1: 1m56 H:130-289 [74477]
    Other proteins in same PDB: d1m56a_, d1m56b2, d1m56c_, d1m56d_, d1m56g_, d1m56h2, d1m56i_, d1m56j_
    complexed with ca, cu, hea, mg, peh
2. Domains for 1m57:
  1. Domain d1m57b1: 1m57 B:130-289 [74482]
    Other proteins in same PDB: d1m57a_, d1m57b2, d1m57c_, d1m57d_, d1m57g_, d1m57h2, d1m57i_, d1m57j_
    complexed with ca, cu, hea, mg, peh; mutant
  2. Domain d1m57h1: 1m57 H:130-289 [74487]
    Other proteins in same PDB: d1m57a_, d1m57b2, d1m57c_, d1m57d_, d1m57g_, d1m57h2, d1m57i_, d1m57j_
    complexed with ca, cu, hea, mg, peh; mutant
3. Domains for 2gsm:
  1. Domain d2gsmb1: 2gsm B:130-281 [135590]
    Other proteins in same PDB: d2gsma_, d2gsmb2, d2gsmc_, d2gsmd2
    automatically matched to d1m56b1
    complexed with ca, cd, cu, dmu, hea, mg, oh, trd
  2. Domain d2gsmd1: 2gsm D:130-281 [135593]
    Other proteins in same PDB: d2gsma_, d2gsmb2, d2gsmc_, d2gsmd2
    automatically matched to d1m56b1
    complexed with ca, cd, cu, dmu, hea, mg, oh, trd
4. Domains for 3dtu:
  1. Domain d3dtub1: 3dtu B:130-281 [157857]
    Other proteins in same PDB: d3dtua_, d3dtub2, d3dtuc_, d3dtud2
    automatically matched to d1m56b1
    complexed with ca, cd, cu, dmu, dxc, hea, hto, mg, oh, po4, trd
  2. Domain d3dtud1: 3dtu D:130-281 [157860]
    Other proteins in same PDB: d3dtua_, d3dtub2, d3dtuc_, d3dtud2
    automatically matched to d1m56b1
    complexed with ca, cd, cu, dmu, dxc, hea, hto, mg, oh, po4, trd
5. Domain for 3fye:
  - Domain d3fyeb2: 3fye B:130-285 [232211]
    Other proteins in same PDB: d3fyea_, d3fyeb1, d3fyec_
    automated match to d1m56b1
    complexed with ca, cd, cu1, dmu, hea, hto, mg, trd, unx
Thermus thermophilus, ba3 type [TaxId:274] [49547] (25 PDB entries)
1. Domain for 1ehk:
  - Domain d1ehkb1: 1ehk B:41-168 [23041]
    Other proteins in same PDB: d1ehka_, d1ehkb2, d1ehkc_
    complexed with bng, cu, cua, has, hem
2. Domain for 1xme:
  - Domain d1xmeb1: 1xme B:41-168 [122144]
    Other proteins in same PDB: d1xmea_, d1xmeb2, d1xmec_
    automated match to d1ehkb1
    complexed with bng, cu, cua, gol, has, hem
3. Domains for 2cua:
  1. Domain d2cuaa_: 2cua A: [23039]
    complexed with cua, zn
  2. Domain d2cuab_: 2cua B: [23040]
    complexed with cua, zn
4. Domain for 2fwl:
  - Domain d2fwlb1: 2fwl B:35-168 [134248]
    Other proteins in same PDB: d2fwla1
    automatically matched to d2cuab_
    complexed with cua, hec
5. Domain for 2qpd:
  - Domain d2qpdb1: 2qpd B:37-168 [151199]
    Other proteins in same PDB: d2qpdb2, d2qpdc1
    automatically matched to d2cuab_
    complexed with cu1, cua, has, hem
6. Domain for 2qpe:
  - Domain d2qpeb1: 2qpe B:37-168 [151202]
    Other proteins in same PDB: d2qpea_, d2qpeb2, d2qpec_
    automatically matched to d2cuab_
    complexed with cu1, cua, has, hem
7. Domain for 3bvd:
  - Domain d3bvdb1: 3bvd B:37-168 [155660]
    Other proteins in same PDB: d3bvdb2, d3bvdc1
    automatically matched to d2cuab_
    complexed with cu, cua, has, hem, xe
8. Domain for 3eh4:
  - Domain d3eh4b2: 3eh4 B:41-168 [199329]
    Other proteins in same PDB: d3eh4b1, d3eh4c_
    automated match to d1ehkb1
    complexed with bng, cu1, cua, has, hem
9. Domain for 3eh5:
  - Domain d3eh5b2: 3eh5 B:41-168 [199331]
    Other proteins in same PDB: d3eh5b1, d3eh5c_
    automated match to d1ehkb1
    complexed with bng, cu1, cua, has, hem
10. Domain for 3qjq:
  - Domain d3qjqb2: 3qjq B:41-168 [200355]
    Other proteins in same PDB: d3qjqa_, d3qjqb1, d3qjqc_
    automated match to d1ehkb1
    complexed with cmo, cu1, cua, has, hem
11. Domain for 3qjs:
  - Domain d3qjsb2: 3qjs B:37-168 [233334]
    Other proteins in same PDB: d3qjsa_, d3qjsb1, d3qjsc_
    automated match to d2qpeb1
    complexed with cmo, cu1, cua, has, hem
12. Domain for 3qjt:
  - Domain d3qjtb2: 3qjt B:37-168 [233336]
    Other proteins in same PDB: d3qjta_, d3qjtb1, d3qjtc_
    automated match to d2qpeb1
    complexed with cmo, cu1, cua, has, hem
13. Domain for 3qju:
  - Domain d3qjub2: 3qju B:41-168 [200357]
    Other proteins in same PDB: d3qjua_, d3qjub1, d3qjuc_
    automated match to d1ehkb1
    complexed with cmo, cu1, cua, has, hem
14. Domain for 3qjv:
  - Domain d3qjvb2: 3qjv B:41-168 [200359]
    Other proteins in same PDB: d3qjva_, d3qjvb1, d3qjvc_
    automated match to d1ehkb1
    complexed with cmo, cu1, cua, has, hem
15. Domain for 3s8f:
  - Domain d3s8fb2: 3s8f B:41-168 [200597]
    Other proteins in same PDB: d3s8fa_, d3s8fb1, d3s8fc_
    automated match to d1ehkb1
    complexed with cu, cua, has, hem, olc, per
16. Domain for 3s8g:
  - Domain d3s8gb2: 3s8g B:41-168 [200599]
    Other proteins in same PDB: d3s8ga_, d3s8gb1, d3s8gc_
    automated match to d1ehkb1
    complexed with cu, cua, has, hem, olc, per; mutant
17. Domain for 4fa7:
  - Domain d4fa7b2: 4fa7 B:41-168 [202022]
    Other proteins in same PDB: d4fa7a_, d4fa7b1, d4fa7c_
    automated match to d1ehkb1
    complexed with cu, cua, has, hem, olc, peo; mutant
18. Domain for 4faa:
  - Domain d4faab2: 4faa B:41-168 [202025]
    Other proteins in same PDB: d4faaa_, d4faab1, d4faac_
    automated match to d1ehkb1
    complexed with cu, cua, has, hem, olc, peo; mutant
19. Domain for 4g70:
  - Domain d4g70b2: 4g70 B:41-168 [221736]
    Other proteins in same PDB: d4g70a_, d4g70b1, d4g70c_
    automated match to d1ehkb1
    complexed with cua, cub, has, hem, olc, per; mutant
20. Domain for 4g71:
  - Domain d4g71b2: 4g71 B:41-168 [221739]
    Other proteins in same PDB: d4g71a_, d4g71b1, d4g71c_
    automated match to d1ehkb1
    complexed with cua, cub, has, hem, olc, per; mutant
21. Domain for 4g7q:
  - Domain d4g7qb2: 4g7q B:41-168 [221751]
    Other proteins in same PDB: d4g7qa_, d4g7qb1, d4g7qc_
    automated match to d1ehkb1
    complexed with cua, cub, has, hem, olc, per; mutant
22. Domain for 4g7s:
  - Domain d4g7sb2: 4g7s B:41-168 [221754]
    Other proteins in same PDB: d4g7sa_, d4g7sb1, d4g7sc_
    automated match to d1ehkb1
    complexed with cua, cub, has, hem, olc, per; mutant
23. Domain for 4gp4:
  - Domain d4gp4b2: 4gp4 B:41-168 [222063]
    Other proteins in same PDB: d4gp4a_, d4gp4b1, d4gp4c_
    automated match to d1ehkb1
    complexed with cu, cua, has, hem, olc, per; mutant
24. Domain for 4gp5:
  - Domain d4gp5b2: 4gp5 B:41-168 [222067]
    Other proteins in same PDB: d4gp5a_, d4gp5b1, d4gp5c_
    automated match to d1ehkb1
    complexed with cu, cua, has, hem, olc, per; mutant
25. Domain for 4gp8:
  - Domain d4gp8b2: 4gp8 B:41-168 [222071]
    Other proteins in same PDB: d4gp8a_, d4gp8b1, d4gp8c_
    automated match to d1ehkb1
    complexed with cu, cua, has, hem, olc, per; mutant

More info for Protein Cytochrome c oxidase from b.6.1.2: Periplasmic domain of cytochrome c oxidase subunit II

Timeline for Protein Cytochrome c oxidase from b.6.1.2: Periplasmic domain of cytochrome c oxidase subunit II:

Protein Cytochrome c oxidase from b.6.1.2: Periplasmic domain of cytochrome c oxidase subunit II first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55
Protein Cytochrome c oxidase from b.6.1.2: Periplasmic domain of cytochrome c oxidase subunit II appears in SCOPe 2.02
Protein Cytochrome c oxidase from b.6.1.2: Periplasmic domain of cytochrome c oxidase subunit II appears in SCOPe 2.04
Protein Cytochrome c oxidase from b.6.1.2: Periplasmic domain of cytochrome c oxidase subunit II appears in the current release, SCOPe 2.08