SCOPe 2.05: Protein: Class II MHC beta chain, C-terminal domain

Lineage for Protein: Class II MHC beta chain, C-terminal domain

Root: SCOPe 2.05
Class b: All beta proteins [48724] (176 folds)
Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (31 superfamilies)
sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
some members of the fold have additional strands
Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (5 families)
Family b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) [48942] (24 proteins)
Protein Class II MHC beta chain, C-terminal domain [88625] (6 species)

Species:

Human (Homo sapiens), HLA-DM [TaxId:9606] [88626] (1 PDB entry)
probably orthologous to the mouse H2-DM
- Domain for 1hdm:
  - Domain d1hdmb1: 1hdm B:88-185 [21584]
    Other proteins in same PDB: d1hdma1, d1hdma2, d1hdmb2
Human (Homo sapiens), HLA-DQ group [TaxId:9606] [88630] (3 PDB entries)
probably orthologous to the mouse I-A group
1. Domain for 1jk8:
  - Domain d1jk8b1: 1jk8 B:95-192 [63147]
    Other proteins in same PDB: d1jk8a1, d1jk8a2, d1jk8b2
    complexed with a human insulin peptide
    complexed with nag
2. Domains for 1s9v:
  1. Domain d1s9vb1: 1s9v B:95-190 [98762]
    Other proteins in same PDB: d1s9va1, d1s9va2, d1s9vb2, d1s9vd1, d1s9vd2, d1s9ve2
    complexed with deamidated gliadin peptide
    complexed with edo
  2. Domain d1s9ve1: 1s9v E:95-190 [98766]
    Other proteins in same PDB: d1s9va1, d1s9va2, d1s9vb2, d1s9vd1, d1s9vd2, d1s9ve2
    complexed with deamidated gliadin peptide
    complexed with edo
3. Domain for 1uvq:
  - Domain d1uvqb1: 1uvq B:95-191 [100064]
    Other proteins in same PDB: d1uvqa1, d1uvqa2, d1uvqb2
    complexed with a hypocretin peptide
    complexed with acy, gly, nag, zn

Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId:9606] [88628] (40 PDB entries)
Uniprot P04229 30-219
probably orthologous to the mouse I-E group

Domain for 1a6a:
- Domain d1a6ab1: 1a6a B:93-191 [21616]
  Other proteins in same PDB: d1a6aa1, d1a6aa2, d1a6ab2
  complexed with nag
Domains for 1aqd:
1. Domain d1aqdb1: 1aqd B:93-190 [21586]
  Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd1, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg1, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj1, d1aqdj2, d1aqdk2
2. Domain d1aqde1: 1aqd E:93-190 [21588]
  Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd1, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg1, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj1, d1aqdj2, d1aqdk2
3. Domain d1aqdh1: 1aqd H:93-190 [21590]
  Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd1, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg1, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj1, d1aqdj2, d1aqdk2
4. Domain d1aqdk1: 1aqd K:93-191 [21592]
  Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd1, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg1, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj1, d1aqdj2, d1aqdk2
Domains for 1bx2:
1. Domain d1bx2b1: 1bx2 B:93-193 [21610]
  Other proteins in same PDB: d1bx2a1, d1bx2a2, d1bx2b2, d1bx2d1, d1bx2d2, d1bx2e2
  complexed with nag
2. Domain d1bx2e1: 1bx2 E:93-191 [21612]
  Other proteins in same PDB: d1bx2a1, d1bx2a2, d1bx2b2, d1bx2d1, d1bx2d2, d1bx2e2
  complexed with nag
Domain for 1d5m:
- Domain d1d5mb1: 1d5m B:93-190 [21618]
  Other proteins in same PDB: d1d5ma1, d1d5ma2, d1d5mb2, d1d5mc1, d1d5mc2
  complexed with nag
Domain for 1d5x:
- Domain d1d5xb1: 1d5x B:93-190 [21624]
  Other proteins in same PDB: d1d5xa1, d1d5xa2, d1d5xb2, d1d5xc1, d1d5xc2
Domain for 1d5z:
- Domain d1d5zb1: 1d5z B:93-190 [21620]
  Other proteins in same PDB: d1d5za1, d1d5za2, d1d5zb2, d1d5zc1, d1d5zc2
Domain for 1d6e:
- Domain d1d6eb1: 1d6e B:93-190 [21622]
  Other proteins in same PDB: d1d6ea1, d1d6ea2, d1d6eb2, d1d6ec1, d1d6ec2
Domains for 1dlh:
1. Domain d1dlhb1: 1dlh B:93-190 [21598]
  Other proteins in same PDB: d1dlha1, d1dlha2, d1dlhb2, d1dlhd1, d1dlhd2, d1dlhe2
  complexed with nag, ndg
2. Domain d1dlhe1: 1dlh E:93-190 [21600]
  Other proteins in same PDB: d1dlha1, d1dlha2, d1dlhb2, d1dlhd1, d1dlhd2, d1dlhe2
  complexed with nag, ndg
Domains for 1fv1:
1. Domain d1fv1b1: 1fv1 B:93-190 [21606]
  Other proteins in same PDB: d1fv1a1, d1fv1a2, d1fv1b2, d1fv1d1, d1fv1d2, d1fv1e2
  complexed with gol, so4
2. Domain d1fv1e1: 1fv1 E:93-190 [21608]
  Other proteins in same PDB: d1fv1a1, d1fv1a2, d1fv1b2, d1fv1d1, d1fv1d2, d1fv1e2
  complexed with gol, so4
Domain for 1fyt:
- Domain d1fytb1: 1fyt B:93-190 [21596]
  Other proteins in same PDB: d1fyta1, d1fyta2, d1fytb2, d1fytd1, d1fytd2, d1fyte1, d1fyte2
  complexed with nag
Domains for 1h15:
1. Domain d1h15b1: 1h15 B:93-190 [76456]
  Other proteins in same PDB: d1h15a1, d1h15a2, d1h15b2, d1h15d1, d1h15d2, d1h15e2
  protein/DNA complex; complexed with nag
2. Domain d1h15e1: 1h15 E:93-190 [76460]
  Other proteins in same PDB: d1h15a1, d1h15a2, d1h15b2, d1h15d1, d1h15d2, d1h15e2
  protein/DNA complex; complexed with nag
Domain for 1hqr:
- Domain d1hqrb1: 1hqr B:293-390 [21614]
  Other proteins in same PDB: d1hqra1, d1hqra2, d1hqrb2, d1hqrd1, d1hqrd2
  complexed with zn
Domain for 1hxy:
- Domain d1hxyb1: 1hxy B:93-190 [61388]
  Other proteins in same PDB: d1hxya1, d1hxya2, d1hxyb2, d1hxyd1, d1hxyd2
  complexed with zn
Domain for 1j8h:
- Domain d1j8hb1: 1j8h B:93-190 [71604]
  Other proteins in same PDB: d1j8ha1, d1j8ha2, d1j8hb2, d1j8hd1, d1j8hd2, d1j8he1, d1j8he2
  complexed with nag, ndg
Domain for 1jwm:
- Domain d1jwmb1: 1jwm B:93-190 [84238]
  Other proteins in same PDB: d1jwma1, d1jwma2, d1jwmb2, d1jwmd1, d1jwmd2
Domain for 1jws:
- Domain d1jwsb1: 1jws B:93-190 [84244]
  Other proteins in same PDB: d1jwsa1, d1jwsa2, d1jwsb2, d1jwsd1, d1jwsd2
Domain for 1jwu:
- Domain d1jwub1: 1jwu B:93-190 [84250]
  Other proteins in same PDB: d1jwua1, d1jwua2, d1jwub2, d1jwud1, d1jwud2
Domain for 1kg0:
- Domain d1kg0b1: 1kg0 B:93-190 [72443]
  Other proteins in same PDB: d1kg0a1, d1kg0a2, d1kg0b2, d1kg0c_
Domain for 1klg:
- Domain d1klgb1: 1klg B:93-190 [72716]
  Other proteins in same PDB: d1klga1, d1klga2, d1klgb2, d1klgd1, d1klgd2
  mutant
Domain for 1klu:
- Domain d1klub1: 1klu B:93-190 [72726]
  Other proteins in same PDB: d1klua1, d1klua2, d1klub2, d1klud1, d1klud2
Domain for 1lo5:
- Domain d1lo5b1: 1lo5 B:93-190 [78118]
  Other proteins in same PDB: d1lo5a1, d1lo5a2, d1lo5b2, d1lo5d1, d1lo5d2
Domain for 1pyw:
- Domain d1pywb1: 1pyw B:93-190 [95379]
  Other proteins in same PDB: d1pywa1, d1pywa2, d1pywb2, d1pywd1, d1pywd2
Domains for 1r5i:
1. Domain d1r5ib1: 1r5i B:93-190 [97089]
  Other proteins in same PDB: d1r5ia1, d1r5ia2, d1r5ib2, d1r5id_, d1r5ie1, d1r5ie2, d1r5if2, d1r5ih_
  complexed with po4
2. Domain d1r5if1: 1r5i F:93-190 [97094]
  Other proteins in same PDB: d1r5ia1, d1r5ia2, d1r5ib2, d1r5id_, d1r5ie1, d1r5ie2, d1r5if2, d1r5ih_
  complexed with po4
Domains for 1seb:
1. Domain d1sebb1: 1seb B:93-192 [21602]
  Other proteins in same PDB: d1seba1, d1seba2, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe1, d1sebe2, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2
2. Domain d1sebf1: 1seb F:93-192 [21604]
  Other proteins in same PDB: d1seba1, d1seba2, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe1, d1sebe2, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2
Domain for 1sje:
- Domain d1sjeb1: 1sje B:93-190 [105642]
  Other proteins in same PDB: d1sjea1, d1sjea2, d1sjeb2, d1sjed1, d1sjed2
Domain for 1sjh:
- Domain d1sjhb1: 1sjh B:93-190 [105650]
  Other proteins in same PDB: d1sjha1, d1sjha2, d1sjhb2, d1sjhd1, d1sjhd2
Domains for 1t5w:
1. Domain d1t5wb1: 1t5w B:93-190 [106483]
  Other proteins in same PDB: d1t5wa1, d1t5wa2, d1t5wb2, d1t5wd1, d1t5wd2, d1t5we2
2. Domain d1t5we1: 1t5w E:93-190 [106487]
  Other proteins in same PDB: d1t5wa1, d1t5wa2, d1t5wb2, d1t5wd1, d1t5wd2, d1t5we2
Domain for 1t5x:
- Domain d1t5xb1: 1t5x B:93-190 [106491]
  Other proteins in same PDB: d1t5xa1, d1t5xa2, d1t5xb2, d1t5xd1, d1t5xd2
Domain for 1ymm:
- Domain d1ymmb1: 1ymm B:93-189 [123703]
  Other proteins in same PDB: d1ymma1, d1ymma2, d1ymmb2, d1ymmd1, d1ymme1, d1ymme2
  automatically matched to d1bx2b1
  complexed with nag

Domains for 1zgl:

Domain d1zglb1: 1zgl B:93-189 [125033]
Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb2, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle2, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh2, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglr1, d1zglr2, d1zglt1, d1zglt2, d1zglv1, d1zglv2
automatically matched to d1fv1b1

Domain d1zgle1: 1zgl E:93-189 [125037]
Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb2, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle2, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh2, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglr1, d1zglr2, d1zglt1, d1zglt2, d1zglv1, d1zglv2
automatically matched to d1fv1b1

Domain d1zglh1: 1zgl H:93-189 [125041]
Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb2, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle2, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh2, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglr1, d1zglr2, d1zglt1, d1zglt2, d1zglv1, d1zglv2
automatically matched to d1fv1b1

Domain d1zglk1: 1zgl K:93-189 [125045]
Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb2, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle2, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh2, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglr1, d1zglr2, d1zglt1, d1zglt2, d1zglv1, d1zglv2
automatically matched to d1fv1b1

Domain for 2g9h:
- Domain d2g9hb1: 2g9h B:93-190 [134804]
  Other proteins in same PDB: d2g9ha1, d2g9ha2, d2g9hb2, d2g9hd1, d2g9hd2
  automatically matched to d1d5xb1
  complexed with dio, epe, so4, zn
Domain for 2iam:
- Domain d2iamb1: 2iam B:93-190 [137160]
  Other proteins in same PDB: d2iama1, d2iama2, d2iamb2, d2iamc1, d2iamc2, d2iamd1, d2iamd2
  automated match to d1klub1
  mutant

Domains for 2ian:

Domain d2ianb1: 2ian B:93-190 [137164]
Other proteins in same PDB: d2iana1, d2iana2, d2ianb2, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf1, d2ianf2, d2iang2, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank1, d2iank2, d2ianl2, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp1, d2ianp2, d2ianq2, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
automated match to d1klub1
mutant

Domain d2iang1: 2ian G:93-190 [137168]
Other proteins in same PDB: d2iana1, d2iana2, d2ianb2, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf1, d2ianf2, d2iang2, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank1, d2iank2, d2ianl2, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp1, d2ianp2, d2ianq2, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
automated match to d1klub1
mutant

Domain d2ianl1: 2ian L:93-190 [137172]
Other proteins in same PDB: d2iana1, d2iana2, d2ianb2, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf1, d2ianf2, d2iang2, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank1, d2iank2, d2ianl2, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp1, d2ianp2, d2ianq2, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
automated match to d1klub1
mutant

Domain d2ianq1: 2ian Q:93-190 [137176]
Other proteins in same PDB: d2iana1, d2iana2, d2ianb2, d2iand1, d2iand2, d2iane1, d2iane2, d2ianf1, d2ianf2, d2iang2, d2iani1, d2iani2, d2ianj1, d2ianj2, d2iank1, d2iank2, d2ianl2, d2iann1, d2iann2, d2iano1, d2iano2, d2ianp1, d2ianp2, d2ianq2, d2ians1, d2ians2, d2iant1, d2iant2
automated match to d1klub1
mutant

Domains for 2icw:
1. Domain d2icwb1: 2icw B:93-190 [137245]
  Other proteins in same PDB: d2icwa1, d2icwa2, d2icwb2, d2icwd1, d2icwd2, d2icwe2, d2icwg_, d2icwh_, d2icwj1, d2icwl_
  automatically matched to d1d5xb1
2. Domain d2icwe1: 2icw E:93-190 [137249]
  Other proteins in same PDB: d2icwa1, d2icwa2, d2icwb2, d2icwd1, d2icwd2, d2icwe2, d2icwg_, d2icwh_, d2icwj1, d2icwl_
  automatically matched to d1d5xb1
Domain for 2ipk:
- Domain d2ipkb1: 2ipk B:93-190 [137579]
  Other proteins in same PDB: d2ipka1, d2ipka2, d2ipkb2, d2ipkd1, d2ipkd2
  automatically matched to d1d5xb1
Domain for 2nna:
- Domain d2nnab1: 2nna B:93-190 [148315]
  Other proteins in same PDB: d2nnab2
  automatically matched to d1bx2b1
Domains for 2oje:
1. Domain d2ojeb1: 2oje B:93-190 [139105]
  Other proteins in same PDB: d2ojea1, d2ojea2, d2ojeb2, d2ojed1, d2ojee1, d2ojee2, d2ojef2, d2ojeh1
  automatically matched to d1d5xb1
  complexed with po4
2. Domain d2ojef1: 2oje F:93-190 [139110]
  Other proteins in same PDB: d2ojea1, d2ojea2, d2ojeb2, d2ojed1, d2ojee1, d2ojee2, d2ojef2, d2ojeh1
  automatically matched to d1d5xb1
  complexed with po4
Domain for 2seb:
- Domain d2sebb1: 2seb B:93-190 [21594]
  Other proteins in same PDB: d2seba1, d2seba2, d2sebb2, d2sebd1, d2sebd2
  complexed with nag

Domains for 4e41:

Domain d4e41b2: 4e41 B:93-190 [220251]
Other proteins in same PDB: d4e41a1, d4e41a2, d4e41b1, d4e41d1, d4e41d2, d4e41e1, d4e41e2, d4e41f1, d4e41f2, d4e41g1, d4e41i1, d4e41i2, d4e41j1, d4e41j2
automated match to d1klub1
complexed with na; mutant

Domain d4e41g2: 4e41 G:93-190 [220259]
Other proteins in same PDB: d4e41a1, d4e41a2, d4e41b1, d4e41d1, d4e41d2, d4e41e1, d4e41e2, d4e41f1, d4e41f2, d4e41g1, d4e41i1, d4e41i2, d4e41j1, d4e41j2
automated match to d1klub1
complexed with na; mutant

Domains for 4i5b:
1. Domain d4i5bb2: 4i5b B:93-193 [234813]
  Other proteins in same PDB: d4i5ba1, d4i5ba2, d4i5bb1, d4i5bd1, d4i5bd2, d4i5be1
  automated match to d4i5be2
2. Domain d4i5be2: 4i5b E:93-191 [229428]
  Other proteins in same PDB: d4i5ba1, d4i5ba2, d4i5bb1, d4i5bd1, d4i5bd2, d4i5be1
  automated match to d1sebb1

Mouse (Mus musculus), H2-DM [TaxId:10090] [88627] (1 PDB entry)
probably orthologous to the human HLA-DM
- Domain for 1k8i:
  - Domain d1k8ib1: 1k8i B:95-190 [68303]
    Other proteins in same PDB: d1k8ia1, d1k8ia2, d1k8ib2
    complexed with nag

Mouse (Mus musculus), I-A group [TaxId:10090] [88631] (17 PDB entries)
probably orthologous to the human HLA-DQ group

Domains for 1d9k:
1. Domain d1d9kd1: 1d9k D:93-190 [21628]
  Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc1, d1d9kc2, d1d9kd2, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg1, d1d9kg2, d1d9kh2
  complexed with ndg
2. Domain d1d9kh1: 1d9k H:93-190 [21630]
  Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc1, d1d9kc2, d1d9kd2, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg1, d1d9kg2, d1d9kh2
  complexed with ndg
Domain for 1es0:
- Domain d1es0b1: 1es0 B:94-189 [21644]
  Other proteins in same PDB: d1es0a1, d1es0a2, d1es0b2
  contains covalently bound peptides
Domains for 1f3j:
1. Domain d1f3jb1: 1f3j B:94-191 [21646]
  Other proteins in same PDB: d1f3ja1, d1f3ja2, d1f3jb2, d1f3jd1, d1f3jd2, d1f3je2
  complexed with nag
2. Domain d1f3je1: 1f3j E:94-191 [21648]
  Other proteins in same PDB: d1f3ja1, d1f3ja2, d1f3jb2, d1f3jd1, d1f3jd2, d1f3je2
  complexed with nag
Domain for 1iak:
- Domain d1iakb1: 1iak B:93-190 [21626]
  Other proteins in same PDB: d1iaka1, d1iaka2, d1iakb2
  complexed with nag
Domain for 1iao:
- Domain d1iaob1: 1iao B:94-188 [21642]
  Other proteins in same PDB: d1iaoa1, d1iaoa2, d1iaob2
  complexed with nag
Domain for 1jl4:
- Domain d1jl4b1: 1jl4 B:93-190 [63159]
  Other proteins in same PDB: d1jl4a1, d1jl4a2, d1jl4b2, d1jl4d1, d1jl4d2
Domain for 1k2d:
- Domain d1k2db1: 1k2d B:93-190 [84293]
  Other proteins in same PDB: d1k2da1, d1k2da2, d1k2db2
  complexed with nag, ndg

Domains for 1lnu:

Domain d1lnub1: 1lnu B:121-217 [74099]
Other proteins in same PDB: d1lnua1, d1lnua2, d1lnub2, d1lnuc1, d1lnuc2, d1lnud2, d1lnue1, d1lnue2, d1lnuf2, d1lnug1, d1lnug2, d1lnuh2
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B, D, F and H
complexed with nag, ndg

Domain d1lnud1: 1lnu D:121-217 [74103]
Other proteins in same PDB: d1lnua1, d1lnua2, d1lnub2, d1lnuc1, d1lnuc2, d1lnud2, d1lnue1, d1lnue2, d1lnuf2, d1lnug1, d1lnug2, d1lnuh2
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B, D, F and H
complexed with nag, ndg

Domain d1lnuf1: 1lnu F:121-217 [74107]
Other proteins in same PDB: d1lnua1, d1lnua2, d1lnub2, d1lnuc1, d1lnuc2, d1lnud2, d1lnue1, d1lnue2, d1lnuf2, d1lnug1, d1lnug2, d1lnuh2
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B, D, F and H
complexed with nag, ndg

Domain d1lnuh1: 1lnu H:121-217 [74111]
Other proteins in same PDB: d1lnua1, d1lnua2, d1lnub2, d1lnuc1, d1lnuc2, d1lnud2, d1lnue1, d1lnue2, d1lnuf2, d1lnug1, d1lnug2, d1lnuh2
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B, D, F and H
complexed with nag, ndg

Domain for 1muj:
- Domain d1mujb1: 1muj B:94-192 [79490]
  Other proteins in same PDB: d1muja1, d1muja2, d1mujb2
  complexed with nag
Domains for 1u3h:
1. Domain d1u3hd1: 1u3h D:93-190 [119512]
  Other proteins in same PDB: d1u3ha1, d1u3hb1, d1u3hc1, d1u3hc2, d1u3hd2, d1u3he_, d1u3hf_, d1u3hg1, d1u3hg2, d1u3hh2
  automated match to d1k2db1
2. Domain d1u3hh1: 1u3h H:93-190 [119516]
  Other proteins in same PDB: d1u3ha1, d1u3hb1, d1u3hc1, d1u3hc2, d1u3hd2, d1u3he_, d1u3hf_, d1u3hg1, d1u3hg2, d1u3hh2
  automated match to d1k2db1
Domain for 2iad:
- Domain d2iadb1: 2iad B:94-190 [21640]
  Other proteins in same PDB: d2iada1, d2iada2, d2iadb2
  contains covalently bound peptides
Domain for 2pxy:
- Domain d2pxyd1: 2pxy D:94-191 [149924]
  Other proteins in same PDB: d2pxya_, d2pxyb_, d2pxyc1, d2pxyc2, d2pxyd2
  automatically matched to d1f3jb1
Domain for 2z31:
- Domain d2z31d1: 2z31 D:94-190 [153953]
  Other proteins in same PDB: d2z31a_, d2z31b_, d2z31c1, d2z31c2, d2z31d2
  automatically matched to d1f3jb1

Domains for 3c5z:

Domain d3c5zd1: 3c5z D:121-217 [155955]
Other proteins in same PDB: d3c5za1, d3c5za2, d3c5zb1, d3c5zb2, d3c5zc1, d3c5zc2, d3c5zd2, d3c5ze1, d3c5ze2, d3c5zf1, d3c5zf2, d3c5zg1, d3c5zg2, d3c5zh2
automated match to d1lnub1

Domain d3c5zh1: 3c5z H:121-217 [155959]
Other proteins in same PDB: d3c5za1, d3c5za2, d3c5zb1, d3c5zb2, d3c5zc1, d3c5zc2, d3c5zd2, d3c5ze1, d3c5ze2, d3c5zf1, d3c5zf2, d3c5zg1, d3c5zg2, d3c5zh2
automated match to d1lnub1

Domains for 3c60:

Domain d3c60d1: 3c60 D:121-217 [155963]
Other proteins in same PDB: d3c60a1, d3c60a2, d3c60b1, d3c60b2, d3c60c1, d3c60c2, d3c60d2, d3c60e1, d3c60e2, d3c60f1, d3c60f2, d3c60g1, d3c60g2, d3c60h2
automated match to d1lnub1

Domain d3c60h1: 3c60 H:121-217 [155967]
Other proteins in same PDB: d3c60a1, d3c60a2, d3c60b1, d3c60b2, d3c60c1, d3c60c2, d3c60d2, d3c60e1, d3c60e2, d3c60f1, d3c60f2, d3c60g1, d3c60g2, d3c60h2
automated match to d1lnub1

Domains for 3c6l:

Domain d3c6ld1: 3c6l D:121-217 [155981]
Other proteins in same PDB: d3c6la1, d3c6la2, d3c6lc1, d3c6lc2, d3c6ld2, d3c6le1, d3c6le2, d3c6lg1, d3c6lg2, d3c6lh2
automatically matched to d1lnub1
complexed with ca

Domain d3c6lh1: 3c6l H:121-217 [155987]
Other proteins in same PDB: d3c6la1, d3c6la2, d3c6lc1, d3c6lc2, d3c6ld2, d3c6le1, d3c6le2, d3c6lg1, d3c6lg2, d3c6lh2
automatically matched to d1lnub1
complexed with ca

Domain for 4p46:
- Domain d4p46d2: 4p46 D:95-192 [257421]
  Other proteins in same PDB: d4p46a1, d4p46a2, d4p46b1, d4p46b2, d4p46c1, d4p46c2, d4p46d1
  automated match to d1lnub1

Mouse (Mus musculus), I-E group [TaxId:10090] [88629] (9 PDB entries)
probably orthologous to the human HLA-DR group

Domains for 1fne:

Domain d1fneb1: 1fne B:93-188 [59898]
Other proteins in same PDB: d1fnea1, d1fnea2, d1fneb2, d1fnec1, d1fnec2, d1fned2
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D
complexed with nag

Domain d1fned1: 1fne D:93-188 [59902]
Other proteins in same PDB: d1fnea1, d1fnea2, d1fneb2, d1fnec1, d1fnec2, d1fned2
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D
complexed with nag

Domains for 1fng:

Domain d1fngb1: 1fng B:93-188 [59906]
Other proteins in same PDB: d1fnga1, d1fnga2, d1fngb2, d1fngc1, d1fngc2, d1fngd2
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D
complexed with nag

Domain d1fngd1: 1fng D:93-188 [59910]
Other proteins in same PDB: d1fnga1, d1fnga2, d1fngb2, d1fngc1, d1fngc2, d1fngd2
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D
complexed with nag

Domains for 1i3r:

Domain d1i3rb1: 1i3r B:121-216 [61622]
Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3ra2, d1i3rb2, d1i3rc1, d1i3rc2, d1i3rd2, d1i3re1, d1i3re2, d1i3rf2, d1i3rg1, d1i3rg2, d1i3rh2
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B, D, F and H
complexed with nag, ndg; mutant

Domain d1i3rd1: 1i3r D:121-216 [61626]
Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3ra2, d1i3rb2, d1i3rc1, d1i3rc2, d1i3rd2, d1i3re1, d1i3re2, d1i3rf2, d1i3rg1, d1i3rg2, d1i3rh2
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B, D, F and H
complexed with nag, ndg; mutant

Domain d1i3rf1: 1i3r F:121-216 [61630]
Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3ra2, d1i3rb2, d1i3rc1, d1i3rc2, d1i3rd2, d1i3re1, d1i3re2, d1i3rf2, d1i3rg1, d1i3rg2, d1i3rh2
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B, D, F and H
complexed with nag, ndg; mutant

Domain d1i3rh1: 1i3r H:121-216 [61634]
Other proteins in same PDB: d1i3ra1, d1i3ra2, d1i3rb2, d1i3rc1, d1i3rc2, d1i3rd2, d1i3re1, d1i3re2, d1i3rf2, d1i3rg1, d1i3rg2, d1i3rh2
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B, D, F and H
complexed with nag, ndg; mutant

Domains for 1iea:

Domain d1ieab1: 1iea B:93-188 [21632]
Other proteins in same PDB: d1ieaa1, d1ieaa2, d1ieab2, d1ieac1, d1ieac2, d1iead2
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D
complexed with nag

Domain d1iead1: 1iea D:93-188 [21634]
Other proteins in same PDB: d1ieaa1, d1ieaa2, d1ieab2, d1ieac1, d1ieac2, d1iead2
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D
complexed with nag

Domains for 1ieb:

Domain d1iebb1: 1ieb B:93-188 [21636]
Other proteins in same PDB: d1ieba1, d1ieba2, d1iebb2, d1iebc1, d1iebc2, d1iebd2
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D
complexed with nag, ndg, so4

Domain d1iebd1: 1ieb D:93-188 [21638]
Other proteins in same PDB: d1ieba1, d1ieba2, d1iebb2, d1iebc1, d1iebc2, d1iebd2
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D
complexed with nag, ndg, so4

Domains for 1kt2:

Domain d1kt2b1: 1kt2 B:121-215 [72953]
Other proteins in same PDB: d1kt2a1, d1kt2a2, d1kt2b2, d1kt2c1, d1kt2c2, d1kt2d2
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D
complexed with nag

Domain d1kt2d1: 1kt2 D:121-215 [72957]
Other proteins in same PDB: d1kt2a1, d1kt2a2, d1kt2b2, d1kt2c1, d1kt2c2, d1kt2d2
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D
complexed with nag

Domains for 1ktd:

Domain d1ktdb1: 1ktd B:121-215 [72966]
Other proteins in same PDB: d1ktda1, d1ktda2, d1ktdb2, d1ktdc1, d1ktdc2, d1ktdd2
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D
complexed with nag, so4

Domain d1ktdd1: 1ktd D:121-215 [72970]
Other proteins in same PDB: d1ktda1, d1ktda2, d1ktdb2, d1ktdc1, d1ktdc2, d1ktdd2
contains covalently bound peptides at the N-termini of chains B and D
complexed with nag, so4

Domains for 1r5v:
1. Domain d1r5vb1: 1r5v B:121-215 [97118]
  Other proteins in same PDB: d1r5va1, d1r5va2, d1r5vb2, d1r5vc1, d1r5vc2, d1r5vd2
2. Domain d1r5vd1: 1r5v D:121-215 [97122]
  Other proteins in same PDB: d1r5va1, d1r5va2, d1r5vb2, d1r5vc1, d1r5vc2, d1r5vd2
Domains for 1r5w:
1. Domain d1r5wb1: 1r5w B:121-215 [97126]
  Other proteins in same PDB: d1r5wa1, d1r5wa2, d1r5wb2, d1r5wc1, d1r5wc2, d1r5wd2
2. Domain d1r5wd1: 1r5w D:121-215 [97130]
  Other proteins in same PDB: d1r5wa1, d1r5wa2, d1r5wb2, d1r5wc1, d1r5wc2, d1r5wd2

More info for Protein Class II MHC beta chain, C-terminal domain from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like)

Timeline for Protein Class II MHC beta chain, C-terminal domain from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like):

Protein Class II MHC beta chain, C-terminal domain from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) first appeared in SCOP 1.65
Protein Class II MHC beta chain, C-terminal domain from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) appears in SCOPe 2.04
Protein Class II MHC beta chain, C-terminal domain from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) appears in SCOPe 2.06
Protein Class II MHC beta chain, C-terminal domain from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) appears in the current release, SCOPe 2.08