Lineage for Species: Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]

  1. Root: SCOPe 2.07
  2. 2344607Class b: All beta proteins [48724] (178 folds)
  3. 2380450Fold b.38: Sm-like fold [50181] (5 superfamilies)
    core: barrel, open; n*=4, S*=8; meander; SH3-like topology
  4. 2380451Superfamily b.38.1: Sm-like ribonucleoproteins [50182] (7 families) (S)
  5. 2380452Family b.38.1.1: Sm motif of small nuclear ribonucleoproteins, SNRNP [50183] (10 protein domains)
    forms homo and heteroheptameric ring structures
    Pfam PF01423
  6. 2380633Protein D1 core SNRNP protein [50184] (4 species)
  7. 2380634Species Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] [50185] (6 PDB entries)

PDB entries in Species: Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]:

  1. Domain(s) for 1b34:
  2. Domain(s) for 1vu2:
    1. 2380637Domain d1vu2a_: 1vu2 A: [240850]
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      complexed with so4
      complexed with so4
    2. 2380638Domain d1vu2g_: 1vu2 g: [240854]
      Other proteins in same PDB: d1vu24_, d1vu2b_, d1vu2c_, d1vu2d_, d1vu2f_, d1vu2h_, d1vu2j_, d1vu2k_, d1vu2l_, d1vu2n_, d1vu2p_, d1vu2r_, d1vu2s_, d1vu2t_, d1vu2v_, d1vu2x_, d1vu2z_
      complexed with so4
      complexed with so4
    3. 2380639Domain d1vu2i_: 1vu2 I: [240856]
      Other proteins in same PDB: d1vu24_, d1vu2b_, d1vu2c_, d1vu2d_, d1vu2f_, d1vu2h_, d1vu2j_, d1vu2k_, d1vu2l_, d1vu2n_, d1vu2p_, d1vu2r_, d1vu2s_, d1vu2t_, d1vu2v_, d1vu2x_, d1vu2z_
      complexed with so4
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    4. 2380640Domain d1vu2o_: 1vu2 o: [240860]
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      complexed with so4
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    5. 2380641Domain d1vu2q_: 1vu2 Q: [240862]
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      complexed with so4
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    6. 2380642Domain d1vu2w_: 1vu2 w: [240866]
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      complexed with so4
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    7. 2380643Domain d1vu2y_: 1vu2 Y: [240868]
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      complexed with so4
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  3. Domain(s) for 1vu3:
    1. 2380651Domain d1vu3a_: 1vu3 A: [240870]
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      complexed with so4
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    2. 2380652Domain d1vu3g_: 1vu3 g: [240874]
      Other proteins in same PDB: d1vu3b_, d1vu3c_, d1vu3d_, d1vu3f_, d1vu3h_, d1vu3j_, d1vu3k_, d1vu3l_, d1vu3n_, d1vu3p_, d1vu3r_, d1vu3s_, d1vu3t_, d1vu3v_, d1vu3x_, d1vu3z_
      complexed with so4
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    3. 2380653Domain d1vu3i_: 1vu3 I: [240876]
      Other proteins in same PDB: d1vu3b_, d1vu3c_, d1vu3d_, d1vu3f_, d1vu3h_, d1vu3j_, d1vu3k_, d1vu3l_, d1vu3n_, d1vu3p_, d1vu3r_, d1vu3s_, d1vu3t_, d1vu3v_, d1vu3x_, d1vu3z_
      complexed with so4
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    4. 2380654Domain d1vu3o_: 1vu3 o: [240880]
      Other proteins in same PDB: d1vu3b_, d1vu3c_, d1vu3d_, d1vu3f_, d1vu3h_, d1vu3j_, d1vu3k_, d1vu3l_, d1vu3n_, d1vu3p_, d1vu3r_, d1vu3s_, d1vu3t_, d1vu3v_, d1vu3x_, d1vu3z_
      complexed with so4
      complexed with so4
    5. 2380655Domain d1vu3q_: 1vu3 Q: [240882]
      Other proteins in same PDB: d1vu3b_, d1vu3c_, d1vu3d_, d1vu3f_, d1vu3h_, d1vu3j_, d1vu3k_, d1vu3l_, d1vu3n_, d1vu3p_, d1vu3r_, d1vu3s_, d1vu3t_, d1vu3v_, d1vu3x_, d1vu3z_
      complexed with so4
      complexed with so4
    6. 2380656Domain d1vu3y_: 1vu3 Y: [240887]
      Other proteins in same PDB: d1vu3b_, d1vu3c_, d1vu3d_, d1vu3f_, d1vu3h_, d1vu3j_, d1vu3k_, d1vu3l_, d1vu3n_, d1vu3p_, d1vu3r_, d1vu3s_, d1vu3t_, d1vu3v_, d1vu3x_, d1vu3z_
      complexed with so4
      complexed with so4
  4. Domain(s) for 3s6n:
  5. Domain(s) for 4f77:
    1. 2380644Domain d4f77a_: 4f77 A: [251904]
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    2. 2380645Domain d4f77g_: 4f77 g: [251908]
      Other proteins in same PDB: d4f774_, d4f77b_, d4f77c_, d4f77d_, d4f77f_, d4f77h_, d4f77j_, d4f77k_, d4f77l_, d4f77n_, d4f77p_, d4f77r_, d4f77s_, d4f77t_, d4f77v_, d4f77x_, d4f77z_
      complexed with so4
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    3. 2380646Domain d4f77i_: 4f77 I: [251910]
      Other proteins in same PDB: d4f774_, d4f77b_, d4f77c_, d4f77d_, d4f77f_, d4f77h_, d4f77j_, d4f77k_, d4f77l_, d4f77n_, d4f77p_, d4f77r_, d4f77s_, d4f77t_, d4f77v_, d4f77x_, d4f77z_
      complexed with so4
      complexed with so4
    4. 2380647Domain d4f77o_: 4f77 o: [251914]
      Other proteins in same PDB: d4f774_, d4f77b_, d4f77c_, d4f77d_, d4f77f_, d4f77h_, d4f77j_, d4f77k_, d4f77l_, d4f77n_, d4f77p_, d4f77r_, d4f77s_, d4f77t_, d4f77v_, d4f77x_, d4f77z_
      complexed with so4
      complexed with so4
    5. 2380648Domain d4f77q_: 4f77 Q: [251916]
      Other proteins in same PDB: d4f774_, d4f77b_, d4f77c_, d4f77d_, d4f77f_, d4f77h_, d4f77j_, d4f77k_, d4f77l_, d4f77n_, d4f77p_, d4f77r_, d4f77s_, d4f77t_, d4f77v_, d4f77x_, d4f77z_
      complexed with so4
      complexed with so4
    6. 2380649Domain d4f77w_: 4f77 w: [251920]
      Other proteins in same PDB: d4f774_, d4f77b_, d4f77c_, d4f77d_, d4f77f_, d4f77h_, d4f77j_, d4f77k_, d4f77l_, d4f77n_, d4f77p_, d4f77r_, d4f77s_, d4f77t_, d4f77v_, d4f77x_, d4f77z_
      complexed with so4
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    7. 2380650Domain d4f77y_: 4f77 Y: [251922]
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      complexed with so4
      complexed with so4
  6. Domain(s) for 5xjl:

More info for Species Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] from b.38.1.1 D1 core SNRNP protein

Timeline for Species Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] from b.38.1.1 D1 core SNRNP protein: