Class b: All beta proteins [48724] (165 folds) |
Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (27 superfamilies) sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key some members of the fold have additional strands |
Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (4 families) |
Family b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) [48942] (23 proteins) |
Protein Class II MHC alpha chain, C-terminal domain [88618] (6 species) |
Human (Homo sapiens), HLA-DM [TaxId:9606] [88619] (1 PDB entry) probably orthologous to the mouse H2-DM |
Domain d1hdma1: 1hdm A:94-196 [21583] Other proteins in same PDB: d1hdma2, d1hdmb1, d1hdmb2 |
Human (Homo sapiens), HLA-DQ group [TaxId:9606] [88623] (3 PDB entries) probably orthologous to the mouse I-A group |
Domain d1jk8a1: 1jk8 A:85-181 [63145] Other proteins in same PDB: d1jk8a2, d1jk8b1, d1jk8b2 complexed with a human insulin peptide complexed with nag |
Domain d1uvqa1: 1uvq A:85-183 [100062] Other proteins in same PDB: d1uvqa2, d1uvqb1, d1uvqb2 complexed with a hypocretin peptide complexed with acy, bma, fuc, gly, nag, zn |
Human (Homo sapiens), HLA-DR group [TaxId:9606] [88621] (29 PDB entries) probably orthologous to the mouse I-E group |
Domain d1a6aa1: 1a6a A:82-180 [21615] Other proteins in same PDB: d1a6aa2, d1a6ab1, d1a6ab2 complexed with nag |
Domain d1aqda1: 1aqd A:82-181 [21585] Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb1, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde1, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh1, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk1, d1aqdk2 |
Domain d1aqdd1: 1aqd D:82-179 [21587] Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb1, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde1, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh1, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk1, d1aqdk2 |
Domain d1aqdg1: 1aqd G:82-179 [21589] Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb1, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde1, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh1, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk1, d1aqdk2 |
Domain d1aqdj1: 1aqd J:82-179 [21591] Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb1, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde1, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh1, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk1, d1aqdk2 |
Domain d1kg0a1: 1kg0 A:82-182 [72441] Other proteins in same PDB: d1kg0a2, d1kg0b1, d1kg0b2, d1kg0c_ |
Domain d1seba1: 1seb A:82-181 [21601] Other proteins in same PDB: d1seba2, d1sebb1, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe2, d1sebf1, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2 |
Domain d1sebe1: 1seb E:82-181 [21603] Other proteins in same PDB: d1seba2, d1sebb1, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe2, d1sebf1, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2 |
Mouse (Mus musculus), H2-DM [TaxId:10090] [88620] (1 PDB entry) probably orthologous to the human HLA-DM |
Domain d1k8ia1: 1k8i A:93-191 [68301] Other proteins in same PDB: d1k8ia2, d1k8ib1, d1k8ib2 complexed with nag |
Mouse (Mus musculus), I-A group [TaxId:10090] [88624] (20 PDB entries) probably orthologous to the human HLA-DQ group |
Domain d1d9kc1: 1d9k C:82-182 [21627] Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc2, d1d9kd1, d1d9kd2, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg2, d1d9kh1, d1d9kh2 |
Domain d1d9kg1: 1d9k G:82-182 [21629] Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc2, d1d9kd1, d1d9kd2, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg2, d1d9kh1, d1d9kh2 |
Domain d1es0a1: 1es0 A:83-180 [21643] Other proteins in same PDB: d1es0a2, d1es0b1, d1es0b2 contains covalently bound peptides |
Domain d1iaka1: 1iak A:82-181 [21625] Other proteins in same PDB: d1iaka2, d1iakb1, d1iakb2 complexed with nag |
Domain d1iaoa1: 1iao A:83-178 [21641] Other proteins in same PDB: d1iaoa2, d1iaob1, d1iaob2 complexed with nag |
Domain d1k2da1: 1k2d A:82-181 [84291] Other proteins in same PDB: d1k2da2, d1k2db1, d1k2db2 complexed with nag |
Domain d1lnua1: 1lnu A:84-182 [74097] Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub1, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh1, d1lnuh2 |
Domain d1lnuc1: 1lnu C:84-182 [74101] Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub1, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh1, d1lnuh2 |
Domain d1lnue1: 1lnu E:84-182 [74105] Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub1, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh1, d1lnuh2 |
Domain d1lnug1: 1lnu G:84-182 [74109] Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub1, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh1, d1lnuh2 complexed with nag |
Domain d1muja1: 1muj A:84-183 [79488] Other proteins in same PDB: d1muja2, d1mujb1, d1mujb2 complexed with nag |
Domain d1u3hc1: 1u3h C:82-181 [119510] Other proteins in same PDB: d1u3hc2, d1u3hd1, d1u3hd2, d1u3hg2, d1u3hh1, d1u3hh2 automatically matched to d1k2da1 mutant |
Domain d1u3hg1: 1u3h G:82-181 [119514] Other proteins in same PDB: d1u3hc2, d1u3hd1, d1u3hd2, d1u3hg2, d1u3hh1, d1u3hh2 automatically matched to d1k2da1 mutant |
Domain d1zgla1: 1zgl A:83-179 [125031] Other proteins in same PDB: d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglr1, d1zglr2, d1zglt1, d1zglt2, d1zglv1, d1zglv2 automatically matched to d1k2da1 |
Domain d1zgld1: 1zgl D:83-179 [125035] Other proteins in same PDB: d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglr1, d1zglr2, d1zglt1, d1zglt2, d1zglv1, d1zglv2 automatically matched to d1k2da1 |
Domain d1zglg1: 1zgl G:83-179 [125039] Other proteins in same PDB: d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglr1, d1zglr2, d1zglt1, d1zglt2, d1zglv1, d1zglv2 automatically matched to d1k2da1 |
Domain d1zglj1: 1zgl J:83-179 [125043] Other proteins in same PDB: d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglr1, d1zglr2, d1zglt1, d1zglt2, d1zglv1, d1zglv2 automatically matched to d1k2da1 |
Domain d2fsea1: 2fse A:83-181 [134017] Other proteins in same PDB: d2fsea2, d2fseb1, d2fseb2, d2fsec2, d2fsed1, d2fsed2 automatically matched to d1k2da1 |
Domain d2fsec1: 2fse C:83-180 [134021] Other proteins in same PDB: d2fsea2, d2fseb1, d2fseb2, d2fsec2, d2fsed1, d2fsed2 automatically matched to d1k2da1 |
Domain d2g9ha1: 2g9h A:83-179 [134802] Other proteins in same PDB: d2g9ha2, d2g9hb1, d2g9hb2 automatically matched to d1k2da1 complexed with dio, epe, so4, zn |
Domain d2iada1: 2iad A:83-186 [21639] Other proteins in same PDB: d2iada2, d2iadb1, d2iadb2 contains covalently bound peptides |
Domain d2iama1: 2iam A:83-179 [137158] Other proteins in same PDB: d2iama2, d2iamb1, d2iamb2 automatically matched to d1k2da1 mutant |
Domain d2iana1: 2ian A:83-179 [137162] Other proteins in same PDB: d2iana2, d2ianb1, d2ianb2, d2ianf2, d2iang1, d2iang2, d2iank2, d2ianl1, d2ianl2, d2ianp2, d2ianq1, d2ianq2 automatically matched to d1k2da1 mutant |
Domain d2ianf1: 2ian F:83-179 [137166] Other proteins in same PDB: d2iana2, d2ianb1, d2ianb2, d2ianf2, d2iang1, d2iang2, d2iank2, d2ianl1, d2ianl2, d2ianp2, d2ianq1, d2ianq2 automatically matched to d1k2da1 mutant |
Domain d2iank1: 2ian K:83-179 [137170] Other proteins in same PDB: d2iana2, d2ianb1, d2ianb2, d2ianf2, d2iang1, d2iang2, d2iank2, d2ianl1, d2ianl2, d2ianp2, d2ianq1, d2ianq2 automatically matched to d1k2da1 mutant |
Domain d2ianp1: 2ian P:83-179 [137174] Other proteins in same PDB: d2iana2, d2ianb1, d2ianb2, d2ianf2, d2iang1, d2iang2, d2iank2, d2ianl1, d2ianl2, d2ianp2, d2ianq1, d2ianq2 automatically matched to d1k2da1 mutant |
Domain d2icwa1: 2icw A:83-179 [137243] Other proteins in same PDB: d2icwa2, d2icwb1, d2icwb2, d2icwd2, d2icwe1, d2icwe2, d2icwg1, d2icwh1 automatically matched to d1k2da1 mutant |
Domain d2icwd1: 2icw D:83-179 [137247] Other proteins in same PDB: d2icwa2, d2icwb1, d2icwb2, d2icwd2, d2icwe1, d2icwe2, d2icwg1, d2icwh1 automatically matched to d1k2da1 mutant |
Domain d2ojea1: 2oje A:83-179 [139103] Other proteins in same PDB: d2ojea2, d2ojeb1, d2ojeb2, d2ojed1, d2ojee2, d2ojef1, d2ojef2, d2ojeh1 automatically matched to d1k2da1 complexed with po4 |
Domain d2ojee1: 2oje E:83-179 [139108] Other proteins in same PDB: d2ojea2, d2ojeb1, d2ojeb2, d2ojed1, d2ojee2, d2ojef1, d2ojef2, d2ojeh1 automatically matched to d1k2da1 complexed with po4 |
Mouse (Mus musculus), I-E group [TaxId:10090] [88622] (9 PDB entries) probably orthologous to the human HLA-DR group |
Domain d1i3ra1: 1i3r A:82-182 [61620] Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb1, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd1, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf1, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh1, d1i3rh2 |
Domain d1i3rc1: 1i3r C:82-182 [61624] Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb1, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd1, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf1, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh1, d1i3rh2 |
Domain d1i3re1: 1i3r E:82-182 [61628] Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb1, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd1, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf1, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh1, d1i3rh2 |
Domain d1i3rg1: 1i3r G:82-182 [61632] Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb1, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd1, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf1, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh1, d1i3rh2 complexed with nag; mutant |
Timeline for Protein Class II MHC alpha chain, C-terminal domain from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like):