Lineage for Species: Mouse (Mus musculus), I-A group [TaxId: 10090]

  1. Root: SCOP 1.73
  2. 651986Class b: All beta proteins [48724] (165 folds)
  3. 651987Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (27 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
    some members of the fold have additional strands
  4. 651988Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (4 families) (S)
  5. 654118Family b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) [48942] (23 proteins)
  6. 654849Protein Class II MHC alpha chain, C-terminal domain [88618] (6 species)
  7. 654899Species Mouse (Mus musculus), I-A group [TaxId:10090] [88624] (20 PDB entries)
    probably orthologous to the human HLA-DQ group

PDB entries in Species: Mouse (Mus musculus), I-A group [TaxId: 10090]:

  1. Domain(s) for 1d9k:
    1. 654931Domain d1d9kc1: 1d9k C:82-182 [21627]
      Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc2, d1d9kd1, d1d9kd2, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg2, d1d9kh1, d1d9kh2
    2. 654932Domain d1d9kg1: 1d9k G:82-182 [21629]
      Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc2, d1d9kd1, d1d9kd2, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg2, d1d9kh1, d1d9kh2
  2. Domain(s) for 1es0:
  3. Domain(s) for 1f3j:
    1. 654929Domain d1f3ja1: 1f3j A:83-181 [21645]
      Other proteins in same PDB: d1f3ja2, d1f3jb1, d1f3jb2, d1f3jd2, d1f3je1, d1f3je2
    2. 654930Domain d1f3jd1: 1f3j D:83-181 [21647]
      Other proteins in same PDB: d1f3ja2, d1f3jb1, d1f3jb2, d1f3jd2, d1f3je1, d1f3je2
      complexed with nag
  4. Domain(s) for 1iak:
  5. Domain(s) for 1iao:
  6. Domain(s) for 1jl4:
  7. Domain(s) for 1k2d:
  8. Domain(s) for 1lnu:
    1. 654910Domain d1lnua1: 1lnu A:84-182 [74097]
      Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub1, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh1, d1lnuh2
    2. 654911Domain d1lnuc1: 1lnu C:84-182 [74101]
      Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub1, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh1, d1lnuh2
    3. 654912Domain d1lnue1: 1lnu E:84-182 [74105]
      Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub1, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh1, d1lnuh2
    4. 654913Domain d1lnug1: 1lnu G:84-182 [74109]
      Other proteins in same PDB: d1lnua2, d1lnub1, d1lnub2, d1lnuc2, d1lnud1, d1lnud2, d1lnue2, d1lnuf1, d1lnuf2, d1lnug2, d1lnuh1, d1lnuh2
      complexed with nag
  9. Domain(s) for 1muj:
  10. Domain(s) for 1u3h:
    1. 654906Domain d1u3hc1: 1u3h C:82-181 [119510]
      Other proteins in same PDB: d1u3hc2, d1u3hd1, d1u3hd2, d1u3hg2, d1u3hh1, d1u3hh2
      automatically matched to d1k2da1
      mutant
    2. 654907Domain d1u3hg1: 1u3h G:82-181 [119514]
      Other proteins in same PDB: d1u3hc2, d1u3hd1, d1u3hd2, d1u3hg2, d1u3hh1, d1u3hh2
      automatically matched to d1k2da1
      mutant
  11. Domain(s) for 1ymm:
  12. Domain(s) for 1zgl:
    1. 654925Domain d1zgla1: 1zgl A:83-179 [125031]
      Other proteins in same PDB: d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglr1, d1zglr2, d1zglt1, d1zglt2, d1zglv1, d1zglv2
      automatically matched to d1k2da1
    2. 654926Domain d1zgld1: 1zgl D:83-179 [125035]
      Other proteins in same PDB: d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglr1, d1zglr2, d1zglt1, d1zglt2, d1zglv1, d1zglv2
      automatically matched to d1k2da1
    3. 654927Domain d1zglg1: 1zgl G:83-179 [125039]
      Other proteins in same PDB: d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglr1, d1zglr2, d1zglt1, d1zglt2, d1zglv1, d1zglv2
      automatically matched to d1k2da1
    4. 654928Domain d1zglj1: 1zgl J:83-179 [125043]
      Other proteins in same PDB: d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp1, d1zglp2, d1zglr1, d1zglr2, d1zglt1, d1zglt2, d1zglv1, d1zglv2
      automatically matched to d1k2da1
  13. Domain(s) for 2fse:
    1. 654923Domain d2fsea1: 2fse A:83-181 [134017]
      Other proteins in same PDB: d2fsea2, d2fseb1, d2fseb2, d2fsec2, d2fsed1, d2fsed2
      automatically matched to d1k2da1
    2. 654924Domain d2fsec1: 2fse C:83-180 [134021]
      Other proteins in same PDB: d2fsea2, d2fseb1, d2fseb2, d2fsec2, d2fsed1, d2fsed2
      automatically matched to d1k2da1
  14. Domain(s) for 2g9h:
  15. Domain(s) for 2iad:
  16. Domain(s) for 2iam:
  17. Domain(s) for 2ian:
    1. 654915Domain d2iana1: 2ian A:83-179 [137162]
      Other proteins in same PDB: d2iana2, d2ianb1, d2ianb2, d2ianf2, d2iang1, d2iang2, d2iank2, d2ianl1, d2ianl2, d2ianp2, d2ianq1, d2ianq2
      automatically matched to d1k2da1
      mutant
    2. 654916Domain d2ianf1: 2ian F:83-179 [137166]
      Other proteins in same PDB: d2iana2, d2ianb1, d2ianb2, d2ianf2, d2iang1, d2iang2, d2iank2, d2ianl1, d2ianl2, d2ianp2, d2ianq1, d2ianq2
      automatically matched to d1k2da1
      mutant
    3. 654917Domain d2iank1: 2ian K:83-179 [137170]
      Other proteins in same PDB: d2iana2, d2ianb1, d2ianb2, d2ianf2, d2iang1, d2iang2, d2iank2, d2ianl1, d2ianl2, d2ianp2, d2ianq1, d2ianq2
      automatically matched to d1k2da1
      mutant
    4. 654918Domain d2ianp1: 2ian P:83-179 [137174]
      Other proteins in same PDB: d2iana2, d2ianb1, d2ianb2, d2ianf2, d2iang1, d2iang2, d2iank2, d2ianl1, d2ianl2, d2ianp2, d2ianq1, d2ianq2
      automatically matched to d1k2da1
      mutant
  18. Domain(s) for 2icw:
    1. 654908Domain d2icwa1: 2icw A:83-179 [137243]
      Other proteins in same PDB: d2icwa2, d2icwb1, d2icwb2, d2icwd2, d2icwe1, d2icwe2, d2icwg1, d2icwh1
      automatically matched to d1k2da1
      mutant
    2. 654909Domain d2icwd1: 2icw D:83-179 [137247]
      Other proteins in same PDB: d2icwa2, d2icwb1, d2icwb2, d2icwd2, d2icwe1, d2icwe2, d2icwg1, d2icwh1
      automatically matched to d1k2da1
      mutant
  19. Domain(s) for 2ipk:
  20. Domain(s) for 2oje:
    1. 654919Domain d2ojea1: 2oje A:83-179 [139103]
      Other proteins in same PDB: d2ojea2, d2ojeb1, d2ojeb2, d2ojed1, d2ojee2, d2ojef1, d2ojef2, d2ojeh1
      automatically matched to d1k2da1
      complexed with po4
    2. 654920Domain d2ojee1: 2oje E:83-179 [139108]
      Other proteins in same PDB: d2ojea2, d2ojeb1, d2ojeb2, d2ojed1, d2ojee2, d2ojef1, d2ojef2, d2ojeh1
      automatically matched to d1k2da1
      complexed with po4

More info for Species Mouse (Mus musculus), I-A group [TaxId:10090] from b.1.1.2 Class II MHC alpha chain, C-terminal domain

Timeline for Species Mouse (Mus musculus), I-A group [TaxId:10090] from b.1.1.2 Class II MHC alpha chain, C-terminal domain: