SCOP 1.55: Protein: Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase

Lineage for Protein: Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase

Root: SCOP 1.55
Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (97 folds)
Fold c.1: TIM beta/alpha-barrel [51350] (23 superfamilies)
Superfamily c.1.14: RuBisCo, C-terminal domain [51649] (1 family)
Family c.1.14.1: RuBisCo, large subunit, C-terminal domain [51650] (1 protein)
Protein Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase [51651] (6 species)

Species:

Alcaligenes eutrophus [TaxId:106590] [51655] (1 PDB entry)
- Domains for 1bxn:
  1. Domain d1bxna1: 1bxn A:151-467 [29376]
    Other proteins in same PDB: d1bxna2, d1bxnc2, d1bxne2, d1bxng2, d1bxni_, d1bxnj_, d1bxnk_, d1bxnl_
  2. Domain d1bxnc1: 1bxn C:151-467 [29377]
    Other proteins in same PDB: d1bxna2, d1bxnc2, d1bxne2, d1bxng2, d1bxni_, d1bxnj_, d1bxnk_, d1bxnl_
  3. Domain d1bxne1: 1bxn E:151-467 [29378]
    Other proteins in same PDB: d1bxna2, d1bxnc2, d1bxne2, d1bxng2, d1bxni_, d1bxnj_, d1bxnk_, d1bxnl_
  4. Domain d1bxng1: 1bxn G:151-467 [29379]
    Other proteins in same PDB: d1bxna2, d1bxnc2, d1bxne2, d1bxng2, d1bxni_, d1bxnj_, d1bxnk_, d1bxnl_
Galdieria partita [TaxId:83374] [51654] (1 PDB entry)
- Domains for 1bwv:
  1. Domain d1bwva1: 1bwv A:150-478 [29372]
    Other proteins in same PDB: d1bwva2, d1bwvc2, d1bwve2, d1bwvg2, d1bwvs_, d1bwvu_, d1bwvw_, d1bwvy_
  2. Domain d1bwvc1: 1bwv C:150-478 [29373]
    Other proteins in same PDB: d1bwva2, d1bwvc2, d1bwve2, d1bwvg2, d1bwvs_, d1bwvu_, d1bwvw_, d1bwvy_
  3. Domain d1bwve1: 1bwv E:150-478 [29374]
    Other proteins in same PDB: d1bwva2, d1bwvc2, d1bwve2, d1bwvg2, d1bwvs_, d1bwvu_, d1bwvw_, d1bwvy_
  4. Domain d1bwvg1: 1bwv G:150-478 [29375]
    Other proteins in same PDB: d1bwva2, d1bwvc2, d1bwve2, d1bwvg2, d1bwvs_, d1bwvu_, d1bwvw_, d1bwvy_
Rhodospirillum rubrum [TaxId:1085] [51657] (5 PDB entries)
1. Domains for 1rba:
  1. Domain d1rbaa1: 1rba A:138-441 [29390]
    Other proteins in same PDB: d1rbaa2, d1rbab2
  2. Domain d1rbab1: 1rba B:138-457 [29391]
    Other proteins in same PDB: d1rbaa2, d1rbab2
2. Domains for 1rus:
  1. Domain d1rusa1: 1rus A:138-457 [29388]
    Other proteins in same PDB: d1rusa2, d1rusb2
  2. Domain d1rusb1: 1rus B:138-457 [29389]
    Other proteins in same PDB: d1rusa2, d1rusb2
3. Domains for 2rus:
  1. Domain d2rusa1: 2rus A:138-457 [29384]
    Other proteins in same PDB: d2rusa2, d2rusb2
  2. Domain d2rusb1: 2rus B:138-457 [29385]
    Other proteins in same PDB: d2rusa2, d2rusb2
4. Domains for 5rub:
  1. Domain d5ruba1: 5rub A:138-457 [29382]
    Other proteins in same PDB: d5ruba2, d5rubb2
  2. Domain d5rubb1: 5rub B:138-457 [29383]
    Other proteins in same PDB: d5ruba2, d5rubb2
5. Domains for 9rub:
  1. Domain d9ruba1: 9rub A:138-460 [29386]
    Other proteins in same PDB: d9ruba2, d9rubb2
  2. Domain d9rubb1: 9rub B:138-459 [29387]
    Other proteins in same PDB: d9ruba2, d9rubb2

Spinach (Spinacia oleracea) [TaxId:3562] [51653] (8 PDB entries)

Domains for 1aa1:
1. Domain d1aa1b1: 1aa1 B:148-463 [29348]
  Other proteins in same PDB: d1aa1b2, d1aa1c_, d1aa1e2, d1aa1f_, d1aa1h2, d1aa1i_, d1aa1l2, d1aa1s_
2. Domain d1aa1e1: 1aa1 E:148-463 [29349]
  Other proteins in same PDB: d1aa1b2, d1aa1c_, d1aa1e2, d1aa1f_, d1aa1h2, d1aa1i_, d1aa1l2, d1aa1s_
3. Domain d1aa1h1: 1aa1 H:148-463 [29350]
  Other proteins in same PDB: d1aa1b2, d1aa1c_, d1aa1e2, d1aa1f_, d1aa1h2, d1aa1i_, d1aa1l2, d1aa1s_
4. Domain d1aa1l1: 1aa1 L:148-463 [29347]
  Other proteins in same PDB: d1aa1b2, d1aa1c_, d1aa1e2, d1aa1f_, d1aa1h2, d1aa1i_, d1aa1l2, d1aa1s_
Domain for 1aus:
- Domain d1ausl1: 1aus L:148-463 [29355]
  Other proteins in same PDB: d1ausl2, d1auss_
Domains for 1bur:
1. Domain d1bura1: 1bur A:148-475 [29335]
  Other proteins in same PDB: d1bura2, d1burb2, d1burc2, d1burd2, d1burs_, d1burt_, d1buru_, d1burv_
2. Domain d1burb1: 1bur B:148-475 [29336]
  Other proteins in same PDB: d1bura2, d1burb2, d1burc2, d1burd2, d1burs_, d1burt_, d1buru_, d1burv_
3. Domain d1burc1: 1bur C:148-475 [29337]
  Other proteins in same PDB: d1bura2, d1burb2, d1burc2, d1burd2, d1burs_, d1burt_, d1buru_, d1burv_
4. Domain d1burd1: 1bur D:148-475 [29338]
  Other proteins in same PDB: d1bura2, d1burb2, d1burc2, d1burd2, d1burs_, d1burt_, d1buru_, d1burv_
Domains for 1rbo:
1. Domain d1rbob1: 1rbo B:148-475 [29344]
  Other proteins in same PDB: d1rbob2, d1rboc_, d1rboe2, d1rbof_, d1rboh2, d1rboi_, d1rbol2, d1rbos_
2. Domain d1rboe1: 1rbo E:148-475 [29345]
  Other proteins in same PDB: d1rbob2, d1rboc_, d1rboe2, d1rbof_, d1rboh2, d1rboi_, d1rbol2, d1rbos_
3. Domain d1rboh1: 1rbo H:148-475 [29346]
  Other proteins in same PDB: d1rbob2, d1rboc_, d1rboe2, d1rbof_, d1rboh2, d1rboi_, d1rbol2, d1rbos_
4. Domain d1rbol1: 1rbo L:148-475 [29343]
  Other proteins in same PDB: d1rbob2, d1rboc_, d1rboe2, d1rbof_, d1rboh2, d1rboi_, d1rbol2, d1rbos_

Domains for 1rco:

Domain d1rcob1: 1rco B:148-475 [29357]
Other proteins in same PDB: d1rcob2, d1rcoc_, d1rcoe2, d1rcof_, d1rcoh2, d1rcoi_, d1rcok2, d1rcol2, d1rcom_, d1rcoo2, d1rcop_, d1rcor2, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov2, d1rcow_

Domain d1rcoe1: 1rco E:148-475 [29358]
Other proteins in same PDB: d1rcob2, d1rcoc_, d1rcoe2, d1rcof_, d1rcoh2, d1rcoi_, d1rcok2, d1rcol2, d1rcom_, d1rcoo2, d1rcop_, d1rcor2, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov2, d1rcow_

Domain d1rcoh1: 1rco H:148-475 [29359]
Other proteins in same PDB: d1rcob2, d1rcoc_, d1rcoe2, d1rcof_, d1rcoh2, d1rcoi_, d1rcok2, d1rcol2, d1rcom_, d1rcoo2, d1rcop_, d1rcor2, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov2, d1rcow_

Domain d1rcok1: 1rco K:148-475 [29360]
Other proteins in same PDB: d1rcob2, d1rcoc_, d1rcoe2, d1rcof_, d1rcoh2, d1rcoi_, d1rcok2, d1rcol2, d1rcom_, d1rcoo2, d1rcop_, d1rcor2, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov2, d1rcow_

Domain d1rcol1: 1rco L:148-475 [29356]
Other proteins in same PDB: d1rcob2, d1rcoc_, d1rcoe2, d1rcof_, d1rcoh2, d1rcoi_, d1rcok2, d1rcol2, d1rcom_, d1rcoo2, d1rcop_, d1rcor2, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov2, d1rcow_

Domain d1rcoo1: 1rco O:148-475 [29361]
Other proteins in same PDB: d1rcob2, d1rcoc_, d1rcoe2, d1rcof_, d1rcoh2, d1rcoi_, d1rcok2, d1rcol2, d1rcom_, d1rcoo2, d1rcop_, d1rcor2, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov2, d1rcow_

Domain d1rcor1: 1rco R:148-475 [29362]
Other proteins in same PDB: d1rcob2, d1rcoc_, d1rcoe2, d1rcof_, d1rcoh2, d1rcoi_, d1rcok2, d1rcol2, d1rcom_, d1rcoo2, d1rcop_, d1rcor2, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov2, d1rcow_

Domain d1rcov1: 1rco V:148-475 [29363]
Other proteins in same PDB: d1rcob2, d1rcoc_, d1rcoe2, d1rcof_, d1rcoh2, d1rcoi_, d1rcok2, d1rcol2, d1rcom_, d1rcoo2, d1rcop_, d1rcor2, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov2, d1rcow_

Domains for 1rcx:

Domain d1rcxb1: 1rcx B:148-475 [29365]
Other proteins in same PDB: d1rcxb2, d1rcxc_, d1rcxe2, d1rcxf_, d1rcxh2, d1rcxi_, d1rcxk2, d1rcxl2, d1rcxm_, d1rcxo2, d1rcxp_, d1rcxr2, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv2, d1rcxw_

Domain d1rcxe1: 1rcx E:148-475 [29366]
Other proteins in same PDB: d1rcxb2, d1rcxc_, d1rcxe2, d1rcxf_, d1rcxh2, d1rcxi_, d1rcxk2, d1rcxl2, d1rcxm_, d1rcxo2, d1rcxp_, d1rcxr2, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv2, d1rcxw_

Domain d1rcxh1: 1rcx H:148-475 [29367]
Other proteins in same PDB: d1rcxb2, d1rcxc_, d1rcxe2, d1rcxf_, d1rcxh2, d1rcxi_, d1rcxk2, d1rcxl2, d1rcxm_, d1rcxo2, d1rcxp_, d1rcxr2, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv2, d1rcxw_

Domain d1rcxk1: 1rcx K:148-475 [29368]
Other proteins in same PDB: d1rcxb2, d1rcxc_, d1rcxe2, d1rcxf_, d1rcxh2, d1rcxi_, d1rcxk2, d1rcxl2, d1rcxm_, d1rcxo2, d1rcxp_, d1rcxr2, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv2, d1rcxw_

Domain d1rcxl1: 1rcx L:148-475 [29364]
Other proteins in same PDB: d1rcxb2, d1rcxc_, d1rcxe2, d1rcxf_, d1rcxh2, d1rcxi_, d1rcxk2, d1rcxl2, d1rcxm_, d1rcxo2, d1rcxp_, d1rcxr2, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv2, d1rcxw_

Domain d1rcxo1: 1rcx O:148-475 [29369]
Other proteins in same PDB: d1rcxb2, d1rcxc_, d1rcxe2, d1rcxf_, d1rcxh2, d1rcxi_, d1rcxk2, d1rcxl2, d1rcxm_, d1rcxo2, d1rcxp_, d1rcxr2, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv2, d1rcxw_

Domain d1rcxr1: 1rcx R:148-475 [29370]
Other proteins in same PDB: d1rcxb2, d1rcxc_, d1rcxe2, d1rcxf_, d1rcxh2, d1rcxi_, d1rcxk2, d1rcxl2, d1rcxm_, d1rcxo2, d1rcxp_, d1rcxr2, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv2, d1rcxw_

Domain d1rcxv1: 1rcx V:148-475 [29371]
Other proteins in same PDB: d1rcxb2, d1rcxc_, d1rcxe2, d1rcxf_, d1rcxh2, d1rcxi_, d1rcxk2, d1rcxl2, d1rcxm_, d1rcxo2, d1rcxp_, d1rcxr2, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv2, d1rcxw_

Domains for 1rxo:
1. Domain d1rxob1: 1rxo B:148-463 [29352]
  Other proteins in same PDB: d1rxob2, d1rxoc_, d1rxoe2, d1rxof_, d1rxoh2, d1rxoi_, d1rxol2, d1rxos_
2. Domain d1rxoe1: 1rxo E:148-463 [29353]
  Other proteins in same PDB: d1rxob2, d1rxoc_, d1rxoe2, d1rxof_, d1rxoh2, d1rxoi_, d1rxol2, d1rxos_
3. Domain d1rxoh1: 1rxo H:148-463 [29354]
  Other proteins in same PDB: d1rxob2, d1rxoc_, d1rxoe2, d1rxof_, d1rxoh2, d1rxoi_, d1rxol2, d1rxos_
4. Domain d1rxol1: 1rxo L:148-463 [29351]
  Other proteins in same PDB: d1rxob2, d1rxoc_, d1rxoe2, d1rxof_, d1rxoh2, d1rxoi_, d1rxol2, d1rxos_
Domains for 8ruc:
1. Domain d8ruca1: 8ruc A:148-475 [29339]
  Other proteins in same PDB: d8ruca2, d8rucc2, d8ruce2, d8rucg2, d8ruci_, d8rucj_, d8ruck_, d8rucl_
2. Domain d8rucc1: 8ruc C:148-475 [29340]
  Other proteins in same PDB: d8ruca2, d8rucc2, d8ruce2, d8rucg2, d8ruci_, d8rucj_, d8ruck_, d8rucl_
3. Domain d8ruce1: 8ruc E:148-475 [29341]
  Other proteins in same PDB: d8ruca2, d8rucc2, d8ruce2, d8rucg2, d8ruci_, d8rucj_, d8ruck_, d8rucl_
4. Domain d8rucg1: 8ruc G:148-475 [29342]
  Other proteins in same PDB: d8ruca2, d8rucc2, d8ruce2, d8rucg2, d8ruci_, d8rucj_, d8ruck_, d8rucl_

Synechococcus sp., strain pcc 6301 [TaxId:1131] [51656] (2 PDB entries)
1. Domain for 1rbl:
  - Domain d1rbla1: 1rbl A:148-475 [29380]
    Other proteins in same PDB: d1rbla2, d1rblm_
2. Domain for 1rsc:
  - Domain d1rsca1: 1rsc A:148-475 [29381]
    Other proteins in same PDB: d1rsca2, d1rscm_
Tobacco (Nicotiana tabacum), variant turkish samsun [TaxId:4097] [51652] (5 PDB entries)
1. Domain for 1ej7:
  - Domain d1ej7l1: 1ej7 L:148-474 [29327]
    Other proteins in same PDB: d1ej7l2, d1ej7s_
2. Domain for 1rlc:
  - Domain d1rlcl1: 1rlc L:148-467 [29330]
    Other proteins in same PDB: d1rlcl2, d1rlcs_
3. Domains for 1rld:
  1. Domain d1rlda1: 1rld A:148-467 [29328]
    Other proteins in same PDB: d1rlda2, d1rldb2, d1rlds_, d1rldt_
  2. Domain d1rldb1: 1rld B:148-467 [29329]
    Other proteins in same PDB: d1rlda2, d1rldb2, d1rlds_, d1rldt_
4. Domain for 3rub:
  - Domain d3rubl1: 3rub L:148-467 [29326]
    Other proteins in same PDB: d3rubl2, d3rubs_
5. Domains for 4rub:
  1. Domain d4ruba1: 4rub A:148-473 [29331]
    Other proteins in same PDB: d4ruba2, d4rubb2, d4rubc2, d4rubd2, d4rubs_, d4rubt_, d4rubu_, d4rubv_
  2. Domain d4rubb1: 4rub B:148-473 [29332]
    Other proteins in same PDB: d4ruba2, d4rubb2, d4rubc2, d4rubd2, d4rubs_, d4rubt_, d4rubu_, d4rubv_
  3. Domain d4rubc1: 4rub C:148-473 [29333]
    Other proteins in same PDB: d4ruba2, d4rubb2, d4rubc2, d4rubd2, d4rubs_, d4rubt_, d4rubu_, d4rubv_
  4. Domain d4rubd1: 4rub D:148-473 [29334]
    Other proteins in same PDB: d4ruba2, d4rubb2, d4rubc2, d4rubd2, d4rubs_, d4rubt_, d4rubu_, d4rubv_

More info for Protein Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase from c.1.14.1: RuBisCo, large subunit, C-terminal domain

Timeline for Protein Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase from c.1.14.1: RuBisCo, large subunit, C-terminal domain:

Protein Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase from c.1.14.1: RuBisCo, large subunit, C-terminal domain appears in SCOP 1.57
Protein Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase from c.1.14.1: RuBisCo, large subunit, C-terminal domain appears in the current release, SCOPe 2.08