SCOP 1.55: Protein: MHC class II, N-terminal domains of alpha and beta chains

Lineage for Protein: MHC class II, N-terminal domains of alpha and beta chains

Root: SCOP 1.55
Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (184 folds)
Fold d.19: MHC antigen-recognition domain [54451] (1 superfamily)
Superfamily d.19.1: MHC antigen-recognition domain [54452] (1 family)
Family d.19.1.1: MHC antigen-recognition domain [54453] (7 proteins)
Protein MHC class II, N-terminal domains of alpha and beta chains [54458] (9 species)

Species:

Human (Homo sapiens), HLA-DM [TaxId:9606] [54459] (1 PDB entry)
- Domains for 1hdm:
  1. Domain d1hdma2: 1hdm A:13-93 [38157]
    Other proteins in same PDB: d1hdma1, d1hdmb1
  2. Domain d1hdmb2: 1hdm B:3-87 [38158]
    Other proteins in same PDB: d1hdma1, d1hdmb1
Human (Homo sapiens), HLA-DR1 [TaxId:9606] [54460] (5 PDB entries)
1. Domains for 1aqd:
  1. Domain d1aqda2: 1aqd A:3-81 [38159]
    Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdk1
  2. Domain d1aqdb2: 1aqd B:4-92 [38160]
    Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdk1
  3. Domain d1aqdd2: 1aqd D:3-81 [38161]
    Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdk1
  4. Domain d1aqde2: 1aqd E:4-92 [38162]
    Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdk1
  5. Domain d1aqdg2: 1aqd G:3-81 [38163]
    Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdk1
  6. Domain d1aqdh2: 1aqd H:4-92 [38164]
    Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdk1
  7. Domain d1aqdj2: 1aqd J:3-81 [38165]
    Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdk1
  8. Domain d1aqdk2: 1aqd K:4-92 [38166]
    Other proteins in same PDB: d1aqda1, d1aqdb1, d1aqdd1, d1aqde1, d1aqdg1, d1aqdh1, d1aqdj1, d1aqdk1
2. Domains for 1dlh:
  1. Domain d1dlha2: 1dlh A:3-81 [38171]
    Other proteins in same PDB: d1dlha1, d1dlhb1, d1dlhd1, d1dlhe1
  2. Domain d1dlhb2: 1dlh B:3-92 [38172]
    Other proteins in same PDB: d1dlha1, d1dlhb1, d1dlhd1, d1dlhe1
  3. Domain d1dlhd2: 1dlh D:3-81 [38173]
    Other proteins in same PDB: d1dlha1, d1dlhb1, d1dlhd1, d1dlhe1
  4. Domain d1dlhe2: 1dlh E:3-92 [38174]
    Other proteins in same PDB: d1dlha1, d1dlhb1, d1dlhd1, d1dlhe1
3. Domains for 1fyt:
  1. Domain d1fyta2: 1fyt A:2-81 [38169]
    Other proteins in same PDB: d1fyta1, d1fytb1, d1fytd1, d1fytd2, d1fyte1, d1fyte2
  2. Domain d1fytb2: 1fyt B:3-92 [38170]
    Other proteins in same PDB: d1fyta1, d1fytb1, d1fytd1, d1fytd2, d1fyte1, d1fyte2
4. Domains for 1seb:
  1. Domain d1seba2: 1seb A:1-81 [38175]
    Other proteins in same PDB: d1seba1, d1sebb1, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe1, d1sebf1, d1sebh1, d1sebh2
  2. Domain d1sebb2: 1seb B:1-92 [38176]
    Other proteins in same PDB: d1seba1, d1sebb1, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe1, d1sebf1, d1sebh1, d1sebh2
  3. Domain d1sebe2: 1seb E:1-81 [38177]
    Other proteins in same PDB: d1seba1, d1sebb1, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe1, d1sebf1, d1sebh1, d1sebh2
  4. Domain d1sebf2: 1seb F:1-92 [38178]
    Other proteins in same PDB: d1seba1, d1sebb1, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe1, d1sebf1, d1sebh1, d1sebh2
5. Domains for 2seb:
  1. Domain d2seba2: 2seb A:1-81 [38167]
    Other proteins in same PDB: d2seba1, d2sebb1, d2sebd1, d2sebd2
  2. Domain d2sebb2: 2seb B:2-92 [38168]
    Other proteins in same PDB: d2seba1, d2sebb1, d2sebd1, d2sebd2
Human (Homo sapiens), HLA-DR2 [TaxId:9606] [54461] (3 PDB entries)
1. Domains for 1bx2:
  1. Domain d1bx2a2: 1bx2 A:2-81 [38183]
    Other proteins in same PDB: d1bx2a1, d1bx2b1, d1bx2d1, d1bx2e1
  2. Domain d1bx2b2: 1bx2 B:3-92 [38184]
    Other proteins in same PDB: d1bx2a1, d1bx2b1, d1bx2d1, d1bx2e1
  3. Domain d1bx2d2: 1bx2 D:2-81 [38185]
    Other proteins in same PDB: d1bx2a1, d1bx2b1, d1bx2d1, d1bx2e1
  4. Domain d1bx2e2: 1bx2 E:3-92 [38186]
    Other proteins in same PDB: d1bx2a1, d1bx2b1, d1bx2d1, d1bx2e1
2. Domains for 1fv1:
  1. Domain d1fv1a2: 1fv1 A:3-81 [38179]
    Other proteins in same PDB: d1fv1a1, d1fv1b1, d1fv1d1, d1fv1e1
  2. Domain d1fv1b2: 1fv1 B:1-92 [38180]
    Other proteins in same PDB: d1fv1a1, d1fv1b1, d1fv1d1, d1fv1e1
  3. Domain d1fv1d2: 1fv1 D:4-81 [38181]
    Other proteins in same PDB: d1fv1a1, d1fv1b1, d1fv1d1, d1fv1e1
  4. Domain d1fv1e2: 1fv1 E:1-92 [38182]
    Other proteins in same PDB: d1fv1a1, d1fv1b1, d1fv1d1, d1fv1e1
3. Domains for 1hqr:
  1. Domain d1hqra2: 1hqr A:3-81 [38187]
    Other proteins in same PDB: d1hqra1, d1hqrb1, d1hqrd1, d1hqrd2
  2. Domain d1hqrb2: 1hqr B:202-292 [38188]
    Other proteins in same PDB: d1hqra1, d1hqrb1, d1hqrd1, d1hqrd2
Human (Homo sapiens), HLA-DR3 [TaxId:9606] [54462] (1 PDB entry)
- Domains for 1a6a:
  1. Domain d1a6aa2: 1a6a A:5-81 [38189]
    Other proteins in same PDB: d1a6aa1, d1a6ab1
  2. Domain d1a6ab2: 1a6a B:5-92 [38190]
    Other proteins in same PDB: d1a6aa1, d1a6ab1
Human (Homo sapiens), HLA-DR4 [TaxId:9606] [54463] (4 PDB entries)
1. Domains for 1d5m:
  1. Domain d1d5ma2: 1d5m A:4-81 [38191]
    Other proteins in same PDB: d1d5ma1, d1d5mb1, d1d5mc1, d1d5mc2
  2. Domain d1d5mb2: 1d5m B:2-92 [38192]
    Other proteins in same PDB: d1d5ma1, d1d5mb1, d1d5mc1, d1d5mc2
2. Domains for 1d5x:
  1. Domain d1d5xa2: 1d5x A:3-81 [38197]
    Other proteins in same PDB: d1d5xa1, d1d5xb1, d1d5xc1, d1d5xc2
  2. Domain d1d5xb2: 1d5x B:1-92 [38198]
    Other proteins in same PDB: d1d5xa1, d1d5xb1, d1d5xc1, d1d5xc2
3. Domains for 1d5z:
  1. Domain d1d5za2: 1d5z A:3-81 [38193]
    Other proteins in same PDB: d1d5za1, d1d5zb1, d1d5zc1, d1d5zc2
  2. Domain d1d5zb2: 1d5z B:1-92 [38194]
    Other proteins in same PDB: d1d5za1, d1d5zb1, d1d5zc1, d1d5zc2
4. Domains for 1d6e:
  1. Domain d1d6ea2: 1d6e A:4-81 [38195]
    Other proteins in same PDB: d1d6ea1, d1d6eb1, d1d6ec1, d1d6ec2
  2. Domain d1d6eb2: 1d6e B:3-92 [38196]
    Other proteins in same PDB: d1d6ea1, d1d6eb1, d1d6ec1, d1d6ec2
Mouse (Mus musculus), I-A(G7) [TaxId:10090] [54467] (2 PDB entries)
1. Domains for 1es0:
  1. Domain d1es0a2: 1es0 A:1B-82 [38217]
    Other proteins in same PDB: d1es0a1, d1es0b1
  2. Domain d1es0b2: 1es0 B:5-93 [38218]
    Other proteins in same PDB: d1es0a1, d1es0b1
2. Domains for 1f3j:
  1. Domain d1f3ja2: 1f3j A:1-82 [38219]
    Other proteins in same PDB: d1f3ja1, d1f3jb1, d1f3jd1, d1f3je1
  2. Domain d1f3jb2: 1f3j B:4-93 [38220]
    Other proteins in same PDB: d1f3ja1, d1f3jb1, d1f3jd1, d1f3je1
  3. Domain d1f3jd2: 1f3j D:1-82 [38221]
    Other proteins in same PDB: d1f3ja1, d1f3jb1, d1f3jd1, d1f3je1
  4. Domain d1f3je2: 1f3j E:4-93 [38222]
    Other proteins in same PDB: d1f3ja1, d1f3jb1, d1f3jd1, d1f3je1
Mouse (Mus musculus), I-AD [TaxId:10090] [54466] (2 PDB entries)
1. Domains for 1iao:
  1. Domain d1iaoa2: 1iao A:1-82 [38215]
    Other proteins in same PDB: d1iaoa1, d1iaob1
  2. Domain d1iaob2: 1iao B:6-93 [38216]
    Other proteins in same PDB: d1iaoa1, d1iaob1
2. Domains for 2iad:
  1. Domain d2iada2: 2iad A:1A-82 [38213]
    Other proteins in same PDB: d2iada1, d2iadb1
  2. Domain d2iadb2: 2iad B:5-93 [38214]
    Other proteins in same PDB: d2iada1, d2iadb1
Mouse (Mus musculus), I-AK [TaxId:10090] [54464] (2 PDB entries)
1. Domains for 1d9k:
  1. Domain d1d9kc2: 1d9k C:1-81 [38201]
    Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc1, d1d9kd1, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg1, d1d9kh1
  2. Domain d1d9kd2: 1d9k D:2-92 [38202]
    Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc1, d1d9kd1, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg1, d1d9kh1
  3. Domain d1d9kg2: 1d9k G:1-81 [38203]
    Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc1, d1d9kd1, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg1, d1d9kh1
  4. Domain d1d9kh2: 1d9k H:2-92 [38204]
    Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc1, d1d9kd1, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg1, d1d9kh1
2. Domains for 1iak:
  1. Domain d1iaka2: 1iak A:1-81 [38199]
    Other proteins in same PDB: d1iaka1, d1iakb1
  2. Domain d1iakb2: 1iak B:5-92 [38200]
    Other proteins in same PDB: d1iaka1, d1iakb1
Mouse (Mus musculus), I-EK [TaxId:10090] [54465] (2 PDB entries)
1. Domains for 1iea:
  1. Domain d1ieaa2: 1iea A:1-81 [38205]
    Other proteins in same PDB: d1ieaa1, d1ieab1, d1ieac1, d1iead1
  2. Domain d1ieab2: 1iea B:4-92 [38206]
    Other proteins in same PDB: d1ieaa1, d1ieab1, d1ieac1, d1iead1
  3. Domain d1ieac2: 1iea C:1-81 [38207]
    Other proteins in same PDB: d1ieaa1, d1ieab1, d1ieac1, d1iead1
  4. Domain d1iead2: 1iea D:4-92 [38208]
    Other proteins in same PDB: d1ieaa1, d1ieab1, d1ieac1, d1iead1
2. Domains for 1ieb:
  1. Domain d1ieba2: 1ieb A:1-81 [38209]
    Other proteins in same PDB: d1ieba1, d1iebb1, d1iebc1, d1iebd1
  2. Domain d1iebb2: 1ieb B:4-92 [38210]
    Other proteins in same PDB: d1ieba1, d1iebb1, d1iebc1, d1iebd1
  3. Domain d1iebc2: 1ieb C:1-81 [38211]
    Other proteins in same PDB: d1ieba1, d1iebb1, d1iebc1, d1iebd1
  4. Domain d1iebd2: 1ieb D:4-92 [38212]
    Other proteins in same PDB: d1ieba1, d1iebb1, d1iebc1, d1iebd1

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Protein MHC class II, N-terminal domains of alpha and beta chains from d.19.1.1: MHC antigen-recognition domain appears in SCOP 1.57
Protein MHC class II, N-terminal domains of alpha and beta chains from d.19.1.1: MHC antigen-recognition domain last appears in SCOP 1.63