SCOPe 2.08: Protein: Radixin

Lineage for Protein: Radixin

Root: SCOPe 2.08
Class b: All beta proteins [48724] (180 folds)
Fold b.55: PH domain-like barrel [50728] (3 superfamilies)
barrel, partly opened; n*=6, S*=12; meander; capped by an alpha-helix
Superfamily b.55.1: PH domain-like [50729] (14 families)
Family b.55.1.5: Third domain of FERM [50776] (8 proteins)
Protein Radixin [50779] (1 species)

Species:

Mouse (Mus musculus) [TaxId:10090] [50780] (9 PDB entries)
1. Domain for 1gc6:
  - Domain d1gc6a2: 1gc6 A:199-297 [27006]
    Other proteins in same PDB: d1gc6a1, d1gc6a3
    complexed with i3p
2. Domain for 1gc7:
  - Domain d1gc7a2: 1gc7 A:199-297 [27005]
    Other proteins in same PDB: d1gc7a1, d1gc7a3
3. Domain for 1j19:
  - Domain d1j19a2: 1j19 A:199-310 [83959]
    Other proteins in same PDB: d1j19a1, d1j19a3, d1j19a4
4. Domains for 2d10:
  1. Domain d2d10a2: 2d10 A:199-297 [131098]
    Other proteins in same PDB: d2d10a1, d2d10a3, d2d10b1, d2d10b3, d2d10c1, d2d10c3, d2d10d1, d2d10d3
    automatically matched to d1gc6a2
  2. Domain d2d10b2: 2d10 B:199-297 [131101]
    Other proteins in same PDB: d2d10a1, d2d10a3, d2d10b1, d2d10b3, d2d10c1, d2d10c3, d2d10d1, d2d10d3
    automatically matched to d1gc6a2
  3. Domain d2d10c2: 2d10 C:199-297 [131104]
    Other proteins in same PDB: d2d10a1, d2d10a3, d2d10b1, d2d10b3, d2d10c1, d2d10c3, d2d10d1, d2d10d3
    automatically matched to d1gc6a2
  4. Domain d2d10d2: 2d10 D:199-297 [131107]
    Other proteins in same PDB: d2d10a1, d2d10a3, d2d10b1, d2d10b3, d2d10c1, d2d10c3, d2d10d1, d2d10d3
    automatically matched to d1gc6a2
5. Domains for 2d11:
  1. Domain d2d11a2: 2d11 A:199-296 [131110]
    Other proteins in same PDB: d2d11a1, d2d11a3, d2d11b1, d2d11b3, d2d11c1, d2d11c3, d2d11d1, d2d11d3
    automatically matched to d1gc6a2
  2. Domain d2d11b2: 2d11 B:199-296 [131113]
    Other proteins in same PDB: d2d11a1, d2d11a3, d2d11b1, d2d11b3, d2d11c1, d2d11c3, d2d11d1, d2d11d3
    automatically matched to d1gc6a2
  3. Domain d2d11c2: 2d11 C:199-296 [131116]
    Other proteins in same PDB: d2d11a1, d2d11a3, d2d11b1, d2d11b3, d2d11c1, d2d11c3, d2d11d1, d2d11d3
    automatically matched to d1gc6a2
  4. Domain d2d11d2: 2d11 D:199-296 [131119]
    Other proteins in same PDB: d2d11a1, d2d11a3, d2d11b1, d2d11b3, d2d11c1, d2d11c3, d2d11d1, d2d11d3
    automatically matched to d1gc6a2
6. Domain for 2ems:
  - Domain d2emsa2: 2ems A:199-297 [146926]
    Other proteins in same PDB: d2emsa1, d2emsa3, d2emsa4
    automatically matched to d1gc6a2
7. Domains for 2emt:
  1. Domain d2emta2: 2emt A:199-297 [146929]
    Other proteins in same PDB: d2emta1, d2emta3, d2emta4, d2emtb1, d2emtb3, d2emtb4
    automatically matched to d1gc6a2
  2. Domain d2emtb2: 2emt B:199-297 [146932]
    Other proteins in same PDB: d2emta1, d2emta3, d2emta4, d2emtb1, d2emtb3, d2emtb4
    automatically matched to d1gc6a2
8. Domains for 2yvc:
  1. Domain d2yvca2: 2yvc A:199-297 [140079]
    Other proteins in same PDB: d2yvca1, d2yvca3, d2yvcb1, d2yvcb3, d2yvcb4, d2yvcc1, d2yvcc3
    automatically matched to d1gc6a2
  2. Domain d2yvcb2: 2yvc B:199-296 [140082]
    Other proteins in same PDB: d2yvca1, d2yvca3, d2yvcb1, d2yvcb3, d2yvcb4, d2yvcc1, d2yvcc3
    automatically matched to d1gc6a2
  3. Domain d2yvcc2: 2yvc C:199-296 [140085]
    Other proteins in same PDB: d2yvca1, d2yvca3, d2yvcb1, d2yvcb3, d2yvcb4, d2yvcc1, d2yvcc3
    automatically matched to d1gc6a2
9. Domain for 2zpy:
  - Domain d2zpya2: 2zpy A:199-297 [154759]
    Other proteins in same PDB: d2zpya1, d2zpya3
    automatically matched to d1gc6a2

More info for Protein Radixin from b.55.1.5: Third domain of FERM

Timeline for Protein Radixin from b.55.1.5: Third domain of FERM:

Protein Radixin from b.55.1.5: Third domain of FERM first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55
Protein Radixin from b.55.1.5: Third domain of FERM appears in SCOPe 2.07