SCOPe 2.08: Species: Mouse (Mus musculus) [TaxId: 10090]

Lineage for Species: Mouse (Mus musculus) [TaxId: 10090]

Root: SCOPe 2.08
Class b: All beta proteins [48724] (180 folds)
Fold b.55: PH domain-like barrel [50728] (3 superfamilies)
barrel, partly opened; n*=6, S*=12; meander; capped by an alpha-helix
Superfamily b.55.1: PH domain-like [50729] (14 families)
Family b.55.1.5: Third domain of FERM [50776] (8 proteins)
Protein Radixin [50779] (1 species)
Species Mouse (Mus musculus) [TaxId:10090] [50780] (9 PDB entries)

PDB entries in Species: Mouse (Mus musculus) [TaxId: 10090]:

Domain(s) for 1gc6:
- Domain d1gc6a2: 1gc6 A:199-297 [27006]
  Other proteins in same PDB: d1gc6a1, d1gc6a3
  complexed with i3p
Domain(s) for 1gc7:
- Domain d1gc7a2: 1gc7 A:199-297 [27005]
  Other proteins in same PDB: d1gc7a1, d1gc7a3
Domain(s) for 1j19:
- Domain d1j19a2: 1j19 A:199-310 [83959]
  Other proteins in same PDB: d1j19a1, d1j19a3, d1j19a4
Domain(s) for 2d10:
1. Domain d2d10a2: 2d10 A:199-297 [131098]
  Other proteins in same PDB: d2d10a1, d2d10a3, d2d10b1, d2d10b3, d2d10c1, d2d10c3, d2d10d1, d2d10d3
  automatically matched to d1gc6a2
2. Domain d2d10b2: 2d10 B:199-297 [131101]
  Other proteins in same PDB: d2d10a1, d2d10a3, d2d10b1, d2d10b3, d2d10c1, d2d10c3, d2d10d1, d2d10d3
  automatically matched to d1gc6a2
3. Domain d2d10c2: 2d10 C:199-297 [131104]
  Other proteins in same PDB: d2d10a1, d2d10a3, d2d10b1, d2d10b3, d2d10c1, d2d10c3, d2d10d1, d2d10d3
  automatically matched to d1gc6a2
4. Domain d2d10d2: 2d10 D:199-297 [131107]
  Other proteins in same PDB: d2d10a1, d2d10a3, d2d10b1, d2d10b3, d2d10c1, d2d10c3, d2d10d1, d2d10d3
  automatically matched to d1gc6a2
Domain(s) for 2d11:
1. Domain d2d11a2: 2d11 A:199-296 [131110]
  Other proteins in same PDB: d2d11a1, d2d11a3, d2d11b1, d2d11b3, d2d11c1, d2d11c3, d2d11d1, d2d11d3
  automatically matched to d1gc6a2
2. Domain d2d11b2: 2d11 B:199-296 [131113]
  Other proteins in same PDB: d2d11a1, d2d11a3, d2d11b1, d2d11b3, d2d11c1, d2d11c3, d2d11d1, d2d11d3
  automatically matched to d1gc6a2
3. Domain d2d11c2: 2d11 C:199-296 [131116]
  Other proteins in same PDB: d2d11a1, d2d11a3, d2d11b1, d2d11b3, d2d11c1, d2d11c3, d2d11d1, d2d11d3
  automatically matched to d1gc6a2
4. Domain d2d11d2: 2d11 D:199-296 [131119]
  Other proteins in same PDB: d2d11a1, d2d11a3, d2d11b1, d2d11b3, d2d11c1, d2d11c3, d2d11d1, d2d11d3
  automatically matched to d1gc6a2
Domain(s) for 2ems:
- Domain d2emsa2: 2ems A:199-297 [146926]
  Other proteins in same PDB: d2emsa1, d2emsa3, d2emsa4
  automatically matched to d1gc6a2
Domain(s) for 2emt:
1. Domain d2emta2: 2emt A:199-297 [146929]
  Other proteins in same PDB: d2emta1, d2emta3, d2emta4, d2emtb1, d2emtb3, d2emtb4
  automatically matched to d1gc6a2
2. Domain d2emtb2: 2emt B:199-297 [146932]
  Other proteins in same PDB: d2emta1, d2emta3, d2emta4, d2emtb1, d2emtb3, d2emtb4
  automatically matched to d1gc6a2
Domain(s) for 2yvc:
1. Domain d2yvca2: 2yvc A:199-297 [140079]
  Other proteins in same PDB: d2yvca1, d2yvca3, d2yvcb1, d2yvcb3, d2yvcb4, d2yvcc1, d2yvcc3
  automatically matched to d1gc6a2
2. Domain d2yvcb2: 2yvc B:199-296 [140082]
  Other proteins in same PDB: d2yvca1, d2yvca3, d2yvcb1, d2yvcb3, d2yvcb4, d2yvcc1, d2yvcc3
  automatically matched to d1gc6a2
3. Domain d2yvcc2: 2yvc C:199-296 [140085]
  Other proteins in same PDB: d2yvca1, d2yvca3, d2yvcb1, d2yvcb3, d2yvcb4, d2yvcc1, d2yvcc3
  automatically matched to d1gc6a2
Domain(s) for 2zpy:
- Domain d2zpya2: 2zpy A:199-297 [154759]
  Other proteins in same PDB: d2zpya1, d2zpya3
  automatically matched to d1gc6a2

More info for Species Mouse (Mus musculus) [TaxId:10090] from b.55.1.5 Radixin

Timeline for Species Mouse (Mus musculus) [TaxId:10090] from b.55.1.5 Radixin:

Species Mouse (Mus musculus) [TaxId:10090] from b.55.1.5 Radixin first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55
Species Mouse (Mus musculus) [TaxId:10090] from b.55.1.5 Radixin appears in SCOPe 2.07