SCOP 1.73: Protein: Histone H2A

Lineage for Protein: Histone H2A

Root: SCOP 1.73
Class a: All alpha proteins [46456] (258 folds)
Fold a.22: Histone-fold [47112] (1 superfamily)
core: 3 helices; long middle helix is flanked at each end with shorter ones
Superfamily a.22.1: Histone-fold [47113] (4 families)
Family a.22.1.1: Nucleosome core histones [47114] (5 proteins)
form octamers composed of two copies of each of the four histones
Protein Histone H2A [47115] (5 species)

Species:

African clawed frog (Xenopus laevis) [TaxId:8355] [47117] (20 PDB entries)
1. Domains for 1aoi:
  1. Domain d1aoic_: 1aoi C: [16440]
    Other proteins in same PDB: d1aoia_, d1aoib_, d1aoid_, d1aoie_, d1aoif_, d1aoih_
  2. Domain d1aoig_: 1aoi G: [16441]
    Other proteins in same PDB: d1aoia_, d1aoib_, d1aoid_, d1aoie_, d1aoif_, d1aoih_
    protein/DNA complex; complexed with mn; mutant
2. Domains for 1kx3:
  1. Domain d1kx3c_: 1kx3 C: [77579]
    Other proteins in same PDB: d1kx3a_, d1kx3b_, d1kx3d_, d1kx3e_, d1kx3f_, d1kx3h_
  2. Domain d1kx3g_: 1kx3 G: [77583]
    Other proteins in same PDB: d1kx3a_, d1kx3b_, d1kx3d_, d1kx3e_, d1kx3f_, d1kx3h_
    complexed with mn
3. Domains for 1kx4:
  1. Domain d1kx4c_: 1kx4 C: [77587]
    Other proteins in same PDB: d1kx4a_, d1kx4b_, d1kx4d_, d1kx4e_, d1kx4f_, d1kx4h_
  2. Domain d1kx4g_: 1kx4 G: [77591]
    Other proteins in same PDB: d1kx4a_, d1kx4b_, d1kx4d_, d1kx4e_, d1kx4f_, d1kx4h_
    complexed with cl, mn
4. Domains for 1kx5:
  1. Domain d1kx5c_: 1kx5 C: [77595]
    Other proteins in same PDB: d1kx5a_, d1kx5b_, d1kx5d_, d1kx5e_, d1kx5f_, d1kx5h_
  2. Domain d1kx5g_: 1kx5 G: [77599]
    Other proteins in same PDB: d1kx5a_, d1kx5b_, d1kx5d_, d1kx5e_, d1kx5f_, d1kx5h_
    complexed with cl, mn
5. Domains for 1m18:
  1. Domain d1m18c_: 1m18 C: [78373]
    Other proteins in same PDB: d1m18a_, d1m18b_, d1m18d_, d1m18e_, d1m18f_, d1m18h_
  2. Domain d1m18g_: 1m18 G: [78377]
    Other proteins in same PDB: d1m18a_, d1m18b_, d1m18d_, d1m18e_, d1m18f_, d1m18h_
    complexed with abu, bal, dib, imt, mn, pyb
6. Domains for 1m19:
  1. Domain d1m19c_: 1m19 C: [78381]
    Other proteins in same PDB: d1m19a_, d1m19b_, d1m19d_, d1m19e_, d1m19f_, d1m19h_
  2. Domain d1m19g_: 1m19 G: [78385]
    Other proteins in same PDB: d1m19a_, d1m19b_, d1m19d_, d1m19e_, d1m19f_, d1m19h_
    complexed with abu, bal, dib, imt, mn, pyb
7. Domains for 1m1a:
  1. Domain d1m1ac_: 1m1a C: [78389]
    Other proteins in same PDB: d1m1aa_, d1m1ab_, d1m1ad_, d1m1ae_, d1m1af_, d1m1ah_
  2. Domain d1m1ag_: 1m1a G: [78393]
    Other proteins in same PDB: d1m1aa_, d1m1ab_, d1m1ad_, d1m1ae_, d1m1af_, d1m1ah_
    complexed with abu, bal, dib, imt, mn, pyb
8. Domains for 1p34:
  1. Domain d1p34c_: 1p34 C: [93972]
    Other proteins in same PDB: d1p34a_, d1p34b_, d1p34d_, d1p34e_, d1p34f_, d1p34h_
  2. Domain d1p34g_: 1p34 G: [93976]
    Other proteins in same PDB: d1p34a_, d1p34b_, d1p34d_, d1p34e_, d1p34f_, d1p34h_
    mutant
9. Domains for 1p3a:
  1. Domain d1p3ac_: 1p3a C: [93982]
    Other proteins in same PDB: d1p3aa_, d1p3ab_, d1p3ad_, d1p3ae_, d1p3af_, d1p3ah_
  2. Domain d1p3ag_: 1p3a G: [93986]
    Other proteins in same PDB: d1p3aa_, d1p3ab_, d1p3ad_, d1p3ae_, d1p3af_, d1p3ah_
    mutant
10. Domains for 1p3b:
  1. Domain d1p3bc_: 1p3b C: [93990]
    Other proteins in same PDB: d1p3ba_, d1p3bb_, d1p3bd_, d1p3be_, d1p3bf_, d1p3bh_
  2. Domain d1p3bg_: 1p3b G: [93994]
    Other proteins in same PDB: d1p3ba_, d1p3bb_, d1p3bd_, d1p3be_, d1p3bf_, d1p3bh_
    mutant
11. Domains for 1p3f:
  1. Domain d1p3fc_: 1p3f C: [94000]
    Other proteins in same PDB: d1p3fa_, d1p3fb_, d1p3fd_, d1p3fe_, d1p3ff_, d1p3fh_
  2. Domain d1p3fg_: 1p3f G: [94004]
    Other proteins in same PDB: d1p3fa_, d1p3fb_, d1p3fd_, d1p3fe_, d1p3ff_, d1p3fh_
    mutant
12. Domains for 1p3g:
  1. Domain d1p3gc_: 1p3g C: [94008]
    Other proteins in same PDB: d1p3ga_, d1p3gb_, d1p3gd_, d1p3ge_, d1p3gf_, d1p3gh_
  2. Domain d1p3gg_: 1p3g G: [94012]
    Other proteins in same PDB: d1p3ga_, d1p3gb_, d1p3gd_, d1p3ge_, d1p3gf_, d1p3gh_
    mutant
13. Domains for 1p3i:
  1. Domain d1p3ic_: 1p3i C: [94016]
    Other proteins in same PDB: d1p3ia_, d1p3ib_, d1p3id_, d1p3ie_, d1p3if_, d1p3ih_
  2. Domain d1p3ig_: 1p3i G: [94020]
    Other proteins in same PDB: d1p3ia_, d1p3ib_, d1p3id_, d1p3ie_, d1p3if_, d1p3ih_
    mutant
14. Domains for 1p3k:
  1. Domain d1p3kc_: 1p3k C: [94026]
    Other proteins in same PDB: d1p3ka_, d1p3kb_, d1p3kd_, d1p3ke_, d1p3kf_, d1p3kh_
  2. Domain d1p3kg_: 1p3k G: [94030]
    Other proteins in same PDB: d1p3ka_, d1p3kb_, d1p3kd_, d1p3ke_, d1p3kf_, d1p3kh_
    mutant
15. Domains for 1p3l:
  1. Domain d1p3lc_: 1p3l C: [94034]
    Other proteins in same PDB: d1p3la_, d1p3lb_, d1p3ld_, d1p3le_, d1p3lf_, d1p3lh_
  2. Domain d1p3lg_: 1p3l G: [94038]
    Other proteins in same PDB: d1p3la_, d1p3lb_, d1p3ld_, d1p3le_, d1p3lf_, d1p3lh_
    mutant
16. Domains for 1p3m:
  1. Domain d1p3mc_: 1p3m C: [94042]
    Other proteins in same PDB: d1p3ma_, d1p3mb_, d1p3md_, d1p3me_, d1p3mf_, d1p3mh_
  2. Domain d1p3mg_: 1p3m G: [94046]
    Other proteins in same PDB: d1p3ma_, d1p3mb_, d1p3md_, d1p3me_, d1p3mf_, d1p3mh_
    mutant
17. Domains for 1p3o:
  1. Domain d1p3oc_: 1p3o C: [94051]
    Other proteins in same PDB: d1p3oa_, d1p3ob_, d1p3od_, d1p3oe_, d1p3of_, d1p3oh_
  2. Domain d1p3og_: 1p3o G: [94055]
    Other proteins in same PDB: d1p3oa_, d1p3ob_, d1p3od_, d1p3oe_, d1p3of_, d1p3oh_
    mutant
18. Domains for 1p3p:
  1. Domain d1p3pc_: 1p3p C: [94059]
    Other proteins in same PDB: d1p3pa_, d1p3pb_, d1p3pd_, d1p3pe_, d1p3pf_, d1p3ph_
  2. Domain d1p3pg_: 1p3p G: [94063]
    Other proteins in same PDB: d1p3pa_, d1p3pb_, d1p3pd_, d1p3pe_, d1p3pf_, d1p3ph_
    mutant
19. Domains for 1s32:
  1. Domain d1s32c_: 1s32 C: [98414]
    Other proteins in same PDB: d1s32a_, d1s32b_, d1s32d_, d1s32e_, d1s32f_, d1s32h_
  2. Domain d1s32g_: 1s32 G: [98418]
    Other proteins in same PDB: d1s32a_, d1s32b_, d1s32d_, d1s32e_, d1s32f_, d1s32h_
    complexed with abu, bal, cl, dib, imt, mn, ogg, pyb
20. Domains for 2nzd:
  1. Domain d2nzdc1: 2nzd C:14-118 [138850]
    Other proteins in same PDB: d2nzda1, d2nzdb1, d2nzde1, d2nzdf1
    automatically matched to d1aoic_
    complexed with mn
  2. Domain d2nzdg1: 2nzd G:14-118 [138853]
    Other proteins in same PDB: d2nzda1, d2nzdb1, d2nzde1, d2nzdf1
    automatically matched to d1aoic_
    complexed with mn
Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae), H2A.1 [TaxId:4932] [68984] (1 PDB entry)
- Domains for 1id3:
  1. Domain d1id3c_: 1id3 C: [66114]
    Other proteins in same PDB: d1id3a_, d1id3b_, d1id3d_, d1id3e_, d1id3f_, d1id3h_
  2. Domain d1id3g_: 1id3 G: [66118]
    Other proteins in same PDB: d1id3a_, d1id3b_, d1id3d_, d1id3e_, d1id3f_, d1id3h_
    complexed with mn
Chicken (Gallus gallus), erythrocytes [TaxId:9031] [47116] (6 PDB entries)
1. Domains for 1eqz:
  1. Domain d1eqza_: 1eqz A: [16436]
    Other proteins in same PDB: d1eqzb_, d1eqzc_, d1eqzd_, d1eqzf_, d1eqzg_, d1eqzh_
  2. Domain d1eqze_: 1eqz E: [16437]
    Other proteins in same PDB: d1eqzb_, d1eqzc_, d1eqzd_, d1eqzf_, d1eqzg_, d1eqzh_
    protein/DNA complex; complexed with cac, cl, k, mn; mutant
2. Domain for 1hio:
  - Domain d1hioa_: 1hio A: [16439]
    Other proteins in same PDB: d1hiob_, d1hioc_, d1hiod_
3. Domains for 1hq3:
  1. Domain d1hq3a_: 1hq3 A: [16434]
    Other proteins in same PDB: d1hq3b_, d1hq3c_, d1hq3d_, d1hq3f_, d1hq3g_, d1hq3h_
  2. Domain d1hq3e_: 1hq3 E: [16435]
    Other proteins in same PDB: d1hq3b_, d1hq3c_, d1hq3d_, d1hq3f_, d1hq3g_, d1hq3h_
    complexed with cl, po4
4. Domains for 1tzy:
  1. Domain d1tzya_: 1tzy A: [107530]
    Other proteins in same PDB: d1tzyb_, d1tzyc_, d1tzyd_, d1tzyf_, d1tzyg_, d1tzyh_
  2. Domain d1tzye_: 1tzy E: [107534]
    Other proteins in same PDB: d1tzyb_, d1tzyc_, d1tzyd_, d1tzyf_, d1tzyg_, d1tzyh_
    complexed with cl, po4
5. Domains for 2aro:
  1. Domain d2aroa1: 2aro A:13-118 [127209]
    Other proteins in same PDB: d2arob1, d2aroc1, d2arod1, d2arof1, d2arog1, d2aroh1
    automatically matched to d1eqze_
    complexed with cl, po4
  2. Domain d2aroe1: 2aro E:14-117 [127213]
    Other proteins in same PDB: d2arob1, d2aroc1, d2arod1, d2arof1, d2arog1, d2aroh1
    automatically matched to d1eqze_
    complexed with cl, po4
6. Domain for 2hio:
  - Domain d2hioa_: 2hio A: [16438]
    Other proteins in same PDB: d2hiob_, d2hioc_, d2hiod_
Human (Homo sapiens), H2A.a [TaxId:9606] [140392] (1 PDB entry)
- Domains for 2cv5:
  1. Domain d2cv5c1: 2cv5 C:11-118 [130849]
    Other proteins in same PDB: d2cv5a1, d2cv5b1, d2cv5d1, d2cv5e1, d2cv5f1, d2cv5h1
    complexed with cl, mn
  2. Domain d2cv5g1: 2cv5 G:15-118 [130853]
    Other proteins in same PDB: d2cv5a1, d2cv5b1, d2cv5d1, d2cv5e1, d2cv5f1, d2cv5h1
    automatically matched to 2CV5 C:11-118
    complexed with cl, mn
Human (Homo sapiens), variant H2A.Z [TaxId:9606] [47118] (1 PDB entry)
- Domains for 1f66:
  1. Domain d1f66c_: 1f66 C: [16442]
    Other proteins in same PDB: d1f66a_, d1f66b_, d1f66d_, d1f66e_, d1f66f_, d1f66h_
  2. Domain d1f66g_: 1f66 G: [16443]
    Other proteins in same PDB: d1f66a_, d1f66b_, d1f66d_, d1f66e_, d1f66f_, d1f66h_
    protein/DNA complex; complexed with mn

More info for Protein Histone H2A from a.22.1.1: Nucleosome core histones

Timeline for Protein Histone H2A from a.22.1.1: Nucleosome core histones:

Protein Histone H2A from a.22.1.1: Nucleosome core histones first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55
Protein Histone H2A from a.22.1.1: Nucleosome core histones appears in SCOP 1.71
Protein Histone H2A from a.22.1.1: Nucleosome core histones appears in SCOP 1.75
Protein Histone H2A from a.22.1.1: Nucleosome core histones appears in the current release, SCOPe 2.08