Lineage for Species: Spinach (Spinacia oleracea) [TaxId: 3562]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2078559Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 2078560Fold c.1: TIM beta/alpha-barrel [51350] (33 superfamilies)
    contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678
    the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
  4. 2088460Superfamily c.1.14: RuBisCo, C-terminal domain [51649] (2 families) (S)
    automatically mapped to Pfam PF00016
  5. 2088461Family c.1.14.1: RuBisCo, large subunit, C-terminal domain [51650] (2 protein domains)
    N-terminal domain is alpha+beta
  6. 2088462Protein Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase [51651] (12 species)
  7. 2088560Species Spinach (Spinacia oleracea) [TaxId:3562] [51653] (11 PDB entries)

PDB entries in Species: Spinach (Spinacia oleracea) [TaxId: 3562]:

  1. Domain(s) for 1aa1:
    1. 2088577Domain d1aa1b1: 1aa1 B:148-463 [29348]
      Other proteins in same PDB: d1aa1b2, d1aa1c_, d1aa1e2, d1aa1f_, d1aa1h2, d1aa1i_, d1aa1l2, d1aa1s_
      complexed with 3pg, mg
    2. 2088578Domain d1aa1e1: 1aa1 E:148-463 [29349]
      Other proteins in same PDB: d1aa1b2, d1aa1c_, d1aa1e2, d1aa1f_, d1aa1h2, d1aa1i_, d1aa1l2, d1aa1s_
      complexed with 3pg, mg
    3. 2088579Domain d1aa1h1: 1aa1 H:148-463 [29350]
      Other proteins in same PDB: d1aa1b2, d1aa1c_, d1aa1e2, d1aa1f_, d1aa1h2, d1aa1i_, d1aa1l2, d1aa1s_
      complexed with 3pg, mg
    4. 2088580Domain d1aa1l1: 1aa1 L:148-463 [29347]
      Other proteins in same PDB: d1aa1b2, d1aa1c_, d1aa1e2, d1aa1f_, d1aa1h2, d1aa1i_, d1aa1l2, d1aa1s_
      complexed with 3pg, mg
  2. Domain(s) for 1aus:
    1. 2088585Domain d1ausl1: 1aus L:148-463 [29355]
      Other proteins in same PDB: d1ausl2, d1ausm2, d1ausn2, d1auso2, d1auss_, d1aust_, d1ausu_, d1ausv_
      complexed with fmt, mg
    2. 2088586Domain d1ausm1: 1aus M:148-463 [118409]
      Other proteins in same PDB: d1ausl2, d1ausm2, d1ausn2, d1auso2, d1auss_, d1aust_, d1ausu_, d1ausv_
      duplicate of 1AUS L:148-463
      complexed with fmt, mg
    3. 2088587Domain d1ausn1: 1aus N:148-463 [118411]
      Other proteins in same PDB: d1ausl2, d1ausm2, d1ausn2, d1auso2, d1auss_, d1aust_, d1ausu_, d1ausv_
      duplicate of 1AUS L:148-463
      complexed with fmt, mg
    4. 2088588Domain d1auso1: 1aus O:148-463 [118413]
      Other proteins in same PDB: d1ausl2, d1ausm2, d1ausn2, d1auso2, d1auss_, d1aust_, d1ausu_, d1ausv_
      duplicate of 1AUS L:148-463
      complexed with fmt, mg
  3. Domain(s) for 1bur:
    1. 2088565Domain d1bura4: 1bur A:148-475 [302248]
      Other proteins in same PDB: d1bura3, d1burb3, d1burc3, d1burd3, d1burs_, d1burt_, d1buru_, d1burv_
      automated match to d8ruca1
      complexed with cap, mg
    2. 2088566Domain d1burb4: 1bur B:148-475 [302250]
      Other proteins in same PDB: d1bura3, d1burb3, d1burc3, d1burd3, d1burs_, d1burt_, d1buru_, d1burv_
      automated match to d8ruca1
      complexed with cap, mg
    3. 2088567Domain d1burc4: 1bur C:148-475 [302252]
      Other proteins in same PDB: d1bura3, d1burb3, d1burc3, d1burd3, d1burs_, d1burt_, d1buru_, d1burv_
      automated match to d8ruca1
      complexed with cap, mg
    4. 2088568Domain d1burd4: 1bur D:148-475 [302254]
      Other proteins in same PDB: d1bura3, d1burb3, d1burc3, d1burd3, d1burs_, d1burt_, d1buru_, d1burv_
      automated match to d8ruca1
      complexed with cap, mg
  4. Domain(s) for 1ir1:
    1. 2088569Domain d1ir1a1: 1ir1 A:148-475 [71282]
      Other proteins in same PDB: d1ir1a2, d1ir1b2, d1ir1c2, d1ir1d2, d1ir1s_, d1ir1t_, d1ir1u_, d1ir1v_
      complexed with cap, mg
    2. 2088570Domain d1ir1b1: 1ir1 B:148-475 [71284]
      Other proteins in same PDB: d1ir1a2, d1ir1b2, d1ir1c2, d1ir1d2, d1ir1s_, d1ir1t_, d1ir1u_, d1ir1v_
      complexed with cap, mg
    3. 2088571Domain d1ir1c1: 1ir1 C:148-475 [71286]
      Other proteins in same PDB: d1ir1a2, d1ir1b2, d1ir1c2, d1ir1d2, d1ir1s_, d1ir1t_, d1ir1u_, d1ir1v_
      complexed with cap, mg
    4. 2088572Domain d1ir1d1: 1ir1 D:148-475 [71288]
      Other proteins in same PDB: d1ir1a2, d1ir1b2, d1ir1c2, d1ir1d2, d1ir1s_, d1ir1t_, d1ir1u_, d1ir1v_
      complexed with cap, mg
  5. Domain(s) for 1rbo:
    1. 2088573Domain d1rbob1: 1rbo B:148-475 [29344]
      Other proteins in same PDB: d1rbob2, d1rboc_, d1rboe2, d1rbof_, d1rboh2, d1rboi_, d1rbol2, d1rbos_
      complexed with cap
    2. 2088574Domain d1rboe1: 1rbo E:148-475 [29345]
      Other proteins in same PDB: d1rbob2, d1rboc_, d1rboe2, d1rbof_, d1rboh2, d1rboi_, d1rbol2, d1rbos_
      complexed with cap
    3. 2088575Domain d1rboh1: 1rbo H:148-475 [29346]
      Other proteins in same PDB: d1rbob2, d1rboc_, d1rboe2, d1rbof_, d1rboh2, d1rboi_, d1rbol2, d1rbos_
      complexed with cap
    4. 2088576Domain d1rbol1: 1rbo L:148-475 [29343]
      Other proteins in same PDB: d1rbob2, d1rboc_, d1rboe2, d1rbof_, d1rboh2, d1rboi_, d1rbol2, d1rbos_
      complexed with cap
  6. Domain(s) for 1rco:
    1. 2088589Domain d1rcob1: 1rco B:148-475 [29357]
      Other proteins in same PDB: d1rcob2, d1rcoc_, d1rcoe2, d1rcof_, d1rcoh2, d1rcoi_, d1rcok2, d1rcol2, d1rcom_, d1rcoo2, d1rcop_, d1rcor2, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov2, d1rcow_
      complexed with xdp
    2. 2088590Domain d1rcoe1: 1rco E:148-475 [29358]
      Other proteins in same PDB: d1rcob2, d1rcoc_, d1rcoe2, d1rcof_, d1rcoh2, d1rcoi_, d1rcok2, d1rcol2, d1rcom_, d1rcoo2, d1rcop_, d1rcor2, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov2, d1rcow_
      complexed with xdp
    3. 2088591Domain d1rcoh1: 1rco H:148-475 [29359]
      Other proteins in same PDB: d1rcob2, d1rcoc_, d1rcoe2, d1rcof_, d1rcoh2, d1rcoi_, d1rcok2, d1rcol2, d1rcom_, d1rcoo2, d1rcop_, d1rcor2, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov2, d1rcow_
      complexed with xdp
    4. 2088592Domain d1rcok1: 1rco K:148-475 [29360]
      Other proteins in same PDB: d1rcob2, d1rcoc_, d1rcoe2, d1rcof_, d1rcoh2, d1rcoi_, d1rcok2, d1rcol2, d1rcom_, d1rcoo2, d1rcop_, d1rcor2, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov2, d1rcow_
      complexed with xdp
    5. 2088593Domain d1rcol1: 1rco L:148-475 [29356]
      Other proteins in same PDB: d1rcob2, d1rcoc_, d1rcoe2, d1rcof_, d1rcoh2, d1rcoi_, d1rcok2, d1rcol2, d1rcom_, d1rcoo2, d1rcop_, d1rcor2, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov2, d1rcow_
      complexed with xdp
    6. 2088594Domain d1rcoo1: 1rco O:148-475 [29361]
      Other proteins in same PDB: d1rcob2, d1rcoc_, d1rcoe2, d1rcof_, d1rcoh2, d1rcoi_, d1rcok2, d1rcol2, d1rcom_, d1rcoo2, d1rcop_, d1rcor2, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov2, d1rcow_
      complexed with xdp
    7. 2088595Domain d1rcor1: 1rco R:148-475 [29362]
      Other proteins in same PDB: d1rcob2, d1rcoc_, d1rcoe2, d1rcof_, d1rcoh2, d1rcoi_, d1rcok2, d1rcol2, d1rcom_, d1rcoo2, d1rcop_, d1rcor2, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov2, d1rcow_
      complexed with xdp
    8. 2088596Domain d1rcov1: 1rco V:148-475 [29363]
      Other proteins in same PDB: d1rcob2, d1rcoc_, d1rcoe2, d1rcof_, d1rcoh2, d1rcoi_, d1rcok2, d1rcol2, d1rcom_, d1rcoo2, d1rcop_, d1rcor2, d1rcos_, d1rcot_, d1rcov2, d1rcow_
      complexed with xdp
  7. Domain(s) for 1rcx:
    1. 2088605Domain d1rcxb1: 1rcx B:148-475 [29365]
      Other proteins in same PDB: d1rcxb2, d1rcxc_, d1rcxe2, d1rcxf_, d1rcxh2, d1rcxi_, d1rcxk2, d1rcxl2, d1rcxm_, d1rcxo2, d1rcxp_, d1rcxr2, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv2, d1rcxw_
      complexed with rub
    2. 2088606Domain d1rcxe1: 1rcx E:148-475 [29366]
      Other proteins in same PDB: d1rcxb2, d1rcxc_, d1rcxe2, d1rcxf_, d1rcxh2, d1rcxi_, d1rcxk2, d1rcxl2, d1rcxm_, d1rcxo2, d1rcxp_, d1rcxr2, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv2, d1rcxw_
      complexed with rub
    3. 2088607Domain d1rcxh1: 1rcx H:148-475 [29367]
      Other proteins in same PDB: d1rcxb2, d1rcxc_, d1rcxe2, d1rcxf_, d1rcxh2, d1rcxi_, d1rcxk2, d1rcxl2, d1rcxm_, d1rcxo2, d1rcxp_, d1rcxr2, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv2, d1rcxw_
      complexed with rub
    4. 2088608Domain d1rcxk1: 1rcx K:148-475 [29368]
      Other proteins in same PDB: d1rcxb2, d1rcxc_, d1rcxe2, d1rcxf_, d1rcxh2, d1rcxi_, d1rcxk2, d1rcxl2, d1rcxm_, d1rcxo2, d1rcxp_, d1rcxr2, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv2, d1rcxw_
      complexed with rub
    5. 2088609Domain d1rcxl1: 1rcx L:148-475 [29364]
      Other proteins in same PDB: d1rcxb2, d1rcxc_, d1rcxe2, d1rcxf_, d1rcxh2, d1rcxi_, d1rcxk2, d1rcxl2, d1rcxm_, d1rcxo2, d1rcxp_, d1rcxr2, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv2, d1rcxw_
      complexed with rub
    6. 2088610Domain d1rcxo1: 1rcx O:148-475 [29369]
      Other proteins in same PDB: d1rcxb2, d1rcxc_, d1rcxe2, d1rcxf_, d1rcxh2, d1rcxi_, d1rcxk2, d1rcxl2, d1rcxm_, d1rcxo2, d1rcxp_, d1rcxr2, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv2, d1rcxw_
      complexed with rub
    7. 2088611Domain d1rcxr1: 1rcx R:148-475 [29370]
      Other proteins in same PDB: d1rcxb2, d1rcxc_, d1rcxe2, d1rcxf_, d1rcxh2, d1rcxi_, d1rcxk2, d1rcxl2, d1rcxm_, d1rcxo2, d1rcxp_, d1rcxr2, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv2, d1rcxw_
      complexed with rub
    8. 2088612Domain d1rcxv1: 1rcx V:148-475 [29371]
      Other proteins in same PDB: d1rcxb2, d1rcxc_, d1rcxe2, d1rcxf_, d1rcxh2, d1rcxi_, d1rcxk2, d1rcxl2, d1rcxm_, d1rcxo2, d1rcxp_, d1rcxr2, d1rcxs_, d1rcxt_, d1rcxv2, d1rcxw_
      complexed with rub
  8. Domain(s) for 1rxo:
    1. 2088581Domain d1rxob1: 1rxo B:148-463 [29352]
      Other proteins in same PDB: d1rxob2, d1rxoc_, d1rxoe2, d1rxof_, d1rxoh2, d1rxoi_, d1rxol2, d1rxos_
      complexed with ca, rub
    2. 2088582Domain d1rxoe1: 1rxo E:148-463 [29353]
      Other proteins in same PDB: d1rxob2, d1rxoc_, d1rxoe2, d1rxof_, d1rxoh2, d1rxoi_, d1rxol2, d1rxos_
      complexed with ca, rub
    3. 2088583Domain d1rxoh1: 1rxo H:148-463 [29354]
      Other proteins in same PDB: d1rxob2, d1rxoc_, d1rxoe2, d1rxof_, d1rxoh2, d1rxoi_, d1rxol2, d1rxos_
      complexed with ca, rub
    4. 2088584Domain d1rxol1: 1rxo L:148-463 [29351]
      Other proteins in same PDB: d1rxob2, d1rxoc_, d1rxoe2, d1rxof_, d1rxoh2, d1rxoi_, d1rxol2, d1rxos_
      complexed with ca, rub
  9. Domain(s) for 1upm:
    1. 2088597Domain d1upmb2: 1upm B:148-475 [197556]
      Other proteins in same PDB: d1upmb1, d1upmc_, d1upme1, d1upmf_, d1upmh1, d1upmi_, d1upmk1, d1upml1, d1upmm_, d1upmo1, d1upmp_, d1upmr1, d1upms_, d1upmt_, d1upmv1, d1upmw_
      automated match to d8ruca1
      complexed with ca, cap
    2. 2088598Domain d1upme2: 1upm E:148-475 [197558]
      Other proteins in same PDB: d1upmb1, d1upmc_, d1upme1, d1upmf_, d1upmh1, d1upmi_, d1upmk1, d1upml1, d1upmm_, d1upmo1, d1upmp_, d1upmr1, d1upms_, d1upmt_, d1upmv1, d1upmw_
      automated match to d8ruca1
      complexed with ca, cap
    3. 2088599Domain d1upmh2: 1upm H:148-475 [197560]
      Other proteins in same PDB: d1upmb1, d1upmc_, d1upme1, d1upmf_, d1upmh1, d1upmi_, d1upmk1, d1upml1, d1upmm_, d1upmo1, d1upmp_, d1upmr1, d1upms_, d1upmt_, d1upmv1, d1upmw_
      automated match to d8ruca1
      complexed with ca, cap
    4. 2088600Domain d1upmk2: 1upm K:148-475 [197562]
      Other proteins in same PDB: d1upmb1, d1upmc_, d1upme1, d1upmf_, d1upmh1, d1upmi_, d1upmk1, d1upml1, d1upmm_, d1upmo1, d1upmp_, d1upmr1, d1upms_, d1upmt_, d1upmv1, d1upmw_
      automated match to d8ruca1
      complexed with ca, cap
    5. 2088601Domain d1upml2: 1upm L:148-475 [197564]
      Other proteins in same PDB: d1upmb1, d1upmc_, d1upme1, d1upmf_, d1upmh1, d1upmi_, d1upmk1, d1upml1, d1upmm_, d1upmo1, d1upmp_, d1upmr1, d1upms_, d1upmt_, d1upmv1, d1upmw_
      automated match to d8ruca1
      complexed with ca, cap
    6. 2088602Domain d1upmo2: 1upm O:148-475 [197566]
      Other proteins in same PDB: d1upmb1, d1upmc_, d1upme1, d1upmf_, d1upmh1, d1upmi_, d1upmk1, d1upml1, d1upmm_, d1upmo1, d1upmp_, d1upmr1, d1upms_, d1upmt_, d1upmv1, d1upmw_
      automated match to d8ruca1
      complexed with ca, cap
    7. 2088603Domain d1upmr2: 1upm R:148-475 [197568]
      Other proteins in same PDB: d1upmb1, d1upmc_, d1upme1, d1upmf_, d1upmh1, d1upmi_, d1upmk1, d1upml1, d1upmm_, d1upmo1, d1upmp_, d1upmr1, d1upms_, d1upmt_, d1upmv1, d1upmw_
      automated match to d8ruca1
      complexed with ca, cap
    8. 2088604Domain d1upmv2: 1upm V:148-475 [197570]
      Other proteins in same PDB: d1upmb1, d1upmc_, d1upme1, d1upmf_, d1upmh1, d1upmi_, d1upmk1, d1upml1, d1upmm_, d1upmo1, d1upmp_, d1upmr1, d1upms_, d1upmt_, d1upmv1, d1upmw_
      automated match to d8ruca1
      complexed with ca, cap
  10. Domain(s) for 1upp:
    1. 2088613Domain d1uppa2: 1upp A:148-475 [197572]
      Other proteins in same PDB: d1uppa1, d1uppc1, d1uppe1, d1uppg1, d1uppi_, d1uppj_, d1uppk_, d1uppl_
      automated match to d8ruca1
      complexed with ca, cap
    2. 2088614Domain d1uppc2: 1upp C:148-475 [197574]
      Other proteins in same PDB: d1uppa1, d1uppc1, d1uppe1, d1uppg1, d1uppi_, d1uppj_, d1uppk_, d1uppl_
      automated match to d8ruca1
      complexed with ca, cap
    3. 2088615Domain d1uppe2: 1upp E:148-475 [197576]
      Other proteins in same PDB: d1uppa1, d1uppc1, d1uppe1, d1uppg1, d1uppi_, d1uppj_, d1uppk_, d1uppl_
      automated match to d8ruca1
      complexed with ca, cap
    4. 2088616Domain d1uppg2: 1upp G:148-475 [197578]
      Other proteins in same PDB: d1uppa1, d1uppc1, d1uppe1, d1uppg1, d1uppi_, d1uppj_, d1uppk_, d1uppl_
      automated match to d8ruca1
      complexed with ca, cap
  11. Domain(s) for 8ruc:
    1. 2088561Domain d8ruca1: 8ruc A:148-475 [29339]
      Other proteins in same PDB: d8ruca2, d8rucc2, d8ruce2, d8rucg2, d8ruci_, d8rucj_, d8ruck_, d8rucl_
      complexed with cap, mg
    2. 2088562Domain d8rucc1: 8ruc C:148-475 [29340]
      Other proteins in same PDB: d8ruca2, d8rucc2, d8ruce2, d8rucg2, d8ruci_, d8rucj_, d8ruck_, d8rucl_
      complexed with cap, mg
    3. 2088563Domain d8ruce1: 8ruc E:148-475 [29341]
      Other proteins in same PDB: d8ruca2, d8rucc2, d8ruce2, d8rucg2, d8ruci_, d8rucj_, d8ruck_, d8rucl_
      complexed with cap, mg
    4. 2088564Domain d8rucg1: 8ruc G:148-475 [29342]
      Other proteins in same PDB: d8ruca2, d8rucc2, d8ruce2, d8rucg2, d8ruci_, d8rucj_, d8ruck_, d8rucl_
      complexed with cap, mg

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