Lineage for Protein: Thermosome, A-domain

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2078559Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 2097883Fold c.8: The "swivelling" beta/beta/alpha domain [52008] (10 superfamilies)
    3 layers: b/b/a; the central sheet is parallel, and the other one is antiparallel; there are some variations in topology
    this domain is thought to be mobile in most multi-domain proteins known to contain it
  4. 2098069Superfamily c.8.5: GroEL apical domain-like [52029] (3 families) (S)
  5. 2098275Family c.8.5.2: Group II chaperonin (CCT, TRIC), apical domain [52034] (1 protein)
  6. 2098276Protein Thermosome, A-domain [52035] (4 species)

Species:

  1. 2098277Mouse (Mus musculus), gamma chain [TaxId:10090] [75137] (2 PDB entries)
    1. Domains for 1gml:
      1. 2098278Domain d1gmla_: 1gml A: [70273]
        apical domain only
        complexed with gol
      2. 2098279Domain d1gmlb_: 1gml B: [70274]
        apical domain only
        complexed with gol
      3. 2098280Domain d1gmlc_: 1gml C: [70275]
        apical domain only
        complexed with gol
      4. 2098281Domain d1gmld_: 1gml D: [70276]
        apical domain only
        complexed with gol
    2. Domains for 1gn1:
      1. 2098282Domain d1gn1a_: 1gn1 A: [70277]
        apical domain only
        complexed with ca
      2. 2098283Domain d1gn1b_: 1gn1 B: [70278]
        apical domain only
        complexed with ca
      3. 2098284Domain d1gn1c_: 1gn1 C: [70279]
        apical domain only
        complexed with ca
      4. 2098285Domain d1gn1d_: 1gn1 D: [70280]
        apical domain only
        complexed with ca
      5. 2098286Domain d1gn1e_: 1gn1 E: [70281]
        apical domain only
        complexed with ca
      6. 2098287Domain d1gn1f_: 1gn1 F: [70282]
        apical domain only
        complexed with ca
      7. 2098288Domain d1gn1g_: 1gn1 G: [70283]
        apical domain only
        complexed with ca
      8. 2098289Domain d1gn1h_: 1gn1 H: [70284]
        apical domain only
        complexed with ca
  2. 2098290Thermococcus sp. ks-1, alpha chain [TaxId:79679] [102202] (4 PDB entries)
    1. Domains for 1q2v:
      1. 2098295Domain d1q2va2: 1q2v A:217-369 [95644]
        Other proteins in same PDB: d1q2va1, d1q2va3, d1q2vb1, d1q2vb3, d1q2vc1, d1q2vc3, d1q2vd1, d1q2vd3
        complexed with so4
      2. 2098296Domain d1q2vb2: 1q2v B:217-369 [95647]
        Other proteins in same PDB: d1q2va1, d1q2va3, d1q2vb1, d1q2vb3, d1q2vc1, d1q2vc3, d1q2vd1, d1q2vd3
        complexed with so4
      3. 2098297Domain d1q2vc2: 1q2v C:217-369 [95650]
        Other proteins in same PDB: d1q2va1, d1q2va3, d1q2vb1, d1q2vb3, d1q2vc1, d1q2vc3, d1q2vd1, d1q2vd3
        complexed with so4
      4. 2098298Domain d1q2vd2: 1q2v D:217-369 [95653]
        Other proteins in same PDB: d1q2va1, d1q2va3, d1q2vb1, d1q2vb3, d1q2vc1, d1q2vc3, d1q2vd1, d1q2vd3
        complexed with so4
    2. Domains for 1q3q:
      1. 2098291Domain d1q3qa2: 1q3q A:217-369 [95705]
        Other proteins in same PDB: d1q3qa1, d1q3qa3, d1q3qb1, d1q3qb3, d1q3qc1, d1q3qc3, d1q3qd1, d1q3qd3
        complexed with anp, mg; mutant
      2. 2098292Domain d1q3qb2: 1q3q B:217-369 [95708]
        Other proteins in same PDB: d1q3qa1, d1q3qa3, d1q3qb1, d1q3qb3, d1q3qc1, d1q3qc3, d1q3qd1, d1q3qd3
        complexed with anp, mg; mutant
      3. 2098293Domain d1q3qc2: 1q3q C:217-369 [95711]
        Other proteins in same PDB: d1q3qa1, d1q3qa3, d1q3qb1, d1q3qb3, d1q3qc1, d1q3qc3, d1q3qd1, d1q3qd3
        complexed with anp, mg; mutant
      4. 2098294Domain d1q3qd2: 1q3q D:217-369 [95714]
        Other proteins in same PDB: d1q3qa1, d1q3qa3, d1q3qb1, d1q3qb3, d1q3qc1, d1q3qc3, d1q3qd1, d1q3qd3
        complexed with anp, mg; mutant
    3. Domains for 1q3r:
      1. 2098299Domain d1q3ra2: 1q3r A:217-369 [95717]
        Other proteins in same PDB: d1q3ra1, d1q3ra3, d1q3rb1, d1q3rb3, d1q3rc1, d1q3rc3, d1q3rd1, d1q3rd3
        complexed with so4; mutant
      2. 2098300Domain d1q3rb2: 1q3r B:217-369 [95720]
        Other proteins in same PDB: d1q3ra1, d1q3ra3, d1q3rb1, d1q3rb3, d1q3rc1, d1q3rc3, d1q3rd1, d1q3rd3
        complexed with so4; mutant
      3. 2098301Domain d1q3rc2: 1q3r C:217-369 [95723]
        Other proteins in same PDB: d1q3ra1, d1q3ra3, d1q3rb1, d1q3rb3, d1q3rc1, d1q3rc3, d1q3rd1, d1q3rd3
        complexed with so4; mutant
      4. 2098302Domain d1q3rd2: 1q3r D:217-369 [95726]
        Other proteins in same PDB: d1q3ra1, d1q3ra3, d1q3rb1, d1q3rb3, d1q3rc1, d1q3rc3, d1q3rd1, d1q3rd3
        complexed with so4; mutant
    4. Domains for 1q3s:
      1. 2098303Domain d1q3sa2: 1q3s A:217-369 [95729]
        Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa3, d1q3sb1, d1q3sb3, d1q3sc1, d1q3sc3, d1q3sd1, d1q3sd3, d1q3se1, d1q3se3, d1q3sf1, d1q3sf3, d1q3sg1, d1q3sg3, d1q3sh1, d1q3sh3
        complexed with adp, mg
      2. 2098304Domain d1q3sb2: 1q3s B:217-369 [95732]
        Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa3, d1q3sb1, d1q3sb3, d1q3sc1, d1q3sc3, d1q3sd1, d1q3sd3, d1q3se1, d1q3se3, d1q3sf1, d1q3sf3, d1q3sg1, d1q3sg3, d1q3sh1, d1q3sh3
        complexed with adp, mg
      3. 2098305Domain d1q3sc2: 1q3s C:217-369 [95735]
        Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa3, d1q3sb1, d1q3sb3, d1q3sc1, d1q3sc3, d1q3sd1, d1q3sd3, d1q3se1, d1q3se3, d1q3sf1, d1q3sf3, d1q3sg1, d1q3sg3, d1q3sh1, d1q3sh3
        complexed with adp, mg
      4. 2098306Domain d1q3sd2: 1q3s D:217-369 [95738]
        Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa3, d1q3sb1, d1q3sb3, d1q3sc1, d1q3sc3, d1q3sd1, d1q3sd3, d1q3se1, d1q3se3, d1q3sf1, d1q3sf3, d1q3sg1, d1q3sg3, d1q3sh1, d1q3sh3
        complexed with adp, mg
      5. 2098307Domain d1q3se2: 1q3s E:217-369 [95741]
        Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa3, d1q3sb1, d1q3sb3, d1q3sc1, d1q3sc3, d1q3sd1, d1q3sd3, d1q3se1, d1q3se3, d1q3sf1, d1q3sf3, d1q3sg1, d1q3sg3, d1q3sh1, d1q3sh3
        complexed with adp, mg
      6. 2098308Domain d1q3sf2: 1q3s F:217-369 [95744]
        Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa3, d1q3sb1, d1q3sb3, d1q3sc1, d1q3sc3, d1q3sd1, d1q3sd3, d1q3se1, d1q3se3, d1q3sf1, d1q3sf3, d1q3sg1, d1q3sg3, d1q3sh1, d1q3sh3
        complexed with adp, mg
      7. 2098309Domain d1q3sg2: 1q3s G:217-369 [95747]
        Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa3, d1q3sb1, d1q3sb3, d1q3sc1, d1q3sc3, d1q3sd1, d1q3sd3, d1q3se1, d1q3se3, d1q3sf1, d1q3sf3, d1q3sg1, d1q3sg3, d1q3sh1, d1q3sh3
        complexed with adp, mg
      8. 2098310Domain d1q3sh2: 1q3s H:217-369 [95750]
        Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa3, d1q3sb1, d1q3sb3, d1q3sc1, d1q3sc3, d1q3sd1, d1q3sd3, d1q3se1, d1q3se3, d1q3sf1, d1q3sf3, d1q3sg1, d1q3sg3, d1q3sh1, d1q3sh3
        complexed with adp, mg
  3. 2098311Thermoplasma acidophilum, alpha chain [TaxId:2303] [100946] (4 PDB entries)
    1. Domain for 1a6d:
    2. Domain for 1a6e:
    3. Domain for 1ass:
    4. Domain for 1asx:
  4. 2098316Thermoplasma acidophilum, beta chain [TaxId:2303] [100947] (3 PDB entries)
    1. Domain for 1a6d:
    2. Domain for 1a6e:
    3. Domain for 1e0r:

More info for Protein Thermosome, A-domain from c.8.5.2: Group II chaperonin (CCT, TRIC), apical domain

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