Lineage for Species: Thermococcus sp. ks-1, alpha chain [TaxId: 79679]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2078559Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 2097883Fold c.8: The "swivelling" beta/beta/alpha domain [52008] (10 superfamilies)
    3 layers: b/b/a; the central sheet is parallel, and the other one is antiparallel; there are some variations in topology
    this domain is thought to be mobile in most multi-domain proteins known to contain it
  4. 2098069Superfamily c.8.5: GroEL apical domain-like [52029] (3 families) (S)
  5. 2098275Family c.8.5.2: Group II chaperonin (CCT, TRIC), apical domain [52034] (1 protein)
  6. 2098276Protein Thermosome, A-domain [52035] (4 species)
  7. 2098290Species Thermococcus sp. ks-1, alpha chain [TaxId:79679] [102202] (4 PDB entries)

PDB entries in Species: Thermococcus sp. ks-1, alpha chain [TaxId: 79679]:

  1. Domain(s) for 1q2v:
    1. 2098295Domain d1q2va2: 1q2v A:217-369 [95644]
      Other proteins in same PDB: d1q2va1, d1q2va3, d1q2vb1, d1q2vb3, d1q2vc1, d1q2vc3, d1q2vd1, d1q2vd3
      complexed with so4
    2. 2098296Domain d1q2vb2: 1q2v B:217-369 [95647]
      Other proteins in same PDB: d1q2va1, d1q2va3, d1q2vb1, d1q2vb3, d1q2vc1, d1q2vc3, d1q2vd1, d1q2vd3
      complexed with so4
    3. 2098297Domain d1q2vc2: 1q2v C:217-369 [95650]
      Other proteins in same PDB: d1q2va1, d1q2va3, d1q2vb1, d1q2vb3, d1q2vc1, d1q2vc3, d1q2vd1, d1q2vd3
      complexed with so4
    4. 2098298Domain d1q2vd2: 1q2v D:217-369 [95653]
      Other proteins in same PDB: d1q2va1, d1q2va3, d1q2vb1, d1q2vb3, d1q2vc1, d1q2vc3, d1q2vd1, d1q2vd3
      complexed with so4
  2. Domain(s) for 1q3q:
    1. 2098291Domain d1q3qa2: 1q3q A:217-369 [95705]
      Other proteins in same PDB: d1q3qa1, d1q3qa3, d1q3qb1, d1q3qb3, d1q3qc1, d1q3qc3, d1q3qd1, d1q3qd3
      complexed with anp, mg; mutant
    2. 2098292Domain d1q3qb2: 1q3q B:217-369 [95708]
      Other proteins in same PDB: d1q3qa1, d1q3qa3, d1q3qb1, d1q3qb3, d1q3qc1, d1q3qc3, d1q3qd1, d1q3qd3
      complexed with anp, mg; mutant
    3. 2098293Domain d1q3qc2: 1q3q C:217-369 [95711]
      Other proteins in same PDB: d1q3qa1, d1q3qa3, d1q3qb1, d1q3qb3, d1q3qc1, d1q3qc3, d1q3qd1, d1q3qd3
      complexed with anp, mg; mutant
    4. 2098294Domain d1q3qd2: 1q3q D:217-369 [95714]
      Other proteins in same PDB: d1q3qa1, d1q3qa3, d1q3qb1, d1q3qb3, d1q3qc1, d1q3qc3, d1q3qd1, d1q3qd3
      complexed with anp, mg; mutant
  3. Domain(s) for 1q3r:
    1. 2098299Domain d1q3ra2: 1q3r A:217-369 [95717]
      Other proteins in same PDB: d1q3ra1, d1q3ra3, d1q3rb1, d1q3rb3, d1q3rc1, d1q3rc3, d1q3rd1, d1q3rd3
      complexed with so4; mutant
    2. 2098300Domain d1q3rb2: 1q3r B:217-369 [95720]
      Other proteins in same PDB: d1q3ra1, d1q3ra3, d1q3rb1, d1q3rb3, d1q3rc1, d1q3rc3, d1q3rd1, d1q3rd3
      complexed with so4; mutant
    3. 2098301Domain d1q3rc2: 1q3r C:217-369 [95723]
      Other proteins in same PDB: d1q3ra1, d1q3ra3, d1q3rb1, d1q3rb3, d1q3rc1, d1q3rc3, d1q3rd1, d1q3rd3
      complexed with so4; mutant
    4. 2098302Domain d1q3rd2: 1q3r D:217-369 [95726]
      Other proteins in same PDB: d1q3ra1, d1q3ra3, d1q3rb1, d1q3rb3, d1q3rc1, d1q3rc3, d1q3rd1, d1q3rd3
      complexed with so4; mutant
  4. Domain(s) for 1q3s:
    1. 2098303Domain d1q3sa2: 1q3s A:217-369 [95729]
      Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa3, d1q3sb1, d1q3sb3, d1q3sc1, d1q3sc3, d1q3sd1, d1q3sd3, d1q3se1, d1q3se3, d1q3sf1, d1q3sf3, d1q3sg1, d1q3sg3, d1q3sh1, d1q3sh3
      complexed with adp, mg
    2. 2098304Domain d1q3sb2: 1q3s B:217-369 [95732]
      Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa3, d1q3sb1, d1q3sb3, d1q3sc1, d1q3sc3, d1q3sd1, d1q3sd3, d1q3se1, d1q3se3, d1q3sf1, d1q3sf3, d1q3sg1, d1q3sg3, d1q3sh1, d1q3sh3
      complexed with adp, mg
    3. 2098305Domain d1q3sc2: 1q3s C:217-369 [95735]
      Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa3, d1q3sb1, d1q3sb3, d1q3sc1, d1q3sc3, d1q3sd1, d1q3sd3, d1q3se1, d1q3se3, d1q3sf1, d1q3sf3, d1q3sg1, d1q3sg3, d1q3sh1, d1q3sh3
      complexed with adp, mg
    4. 2098306Domain d1q3sd2: 1q3s D:217-369 [95738]
      Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa3, d1q3sb1, d1q3sb3, d1q3sc1, d1q3sc3, d1q3sd1, d1q3sd3, d1q3se1, d1q3se3, d1q3sf1, d1q3sf3, d1q3sg1, d1q3sg3, d1q3sh1, d1q3sh3
      complexed with adp, mg
    5. 2098307Domain d1q3se2: 1q3s E:217-369 [95741]
      Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa3, d1q3sb1, d1q3sb3, d1q3sc1, d1q3sc3, d1q3sd1, d1q3sd3, d1q3se1, d1q3se3, d1q3sf1, d1q3sf3, d1q3sg1, d1q3sg3, d1q3sh1, d1q3sh3
      complexed with adp, mg
    6. 2098308Domain d1q3sf2: 1q3s F:217-369 [95744]
      Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa3, d1q3sb1, d1q3sb3, d1q3sc1, d1q3sc3, d1q3sd1, d1q3sd3, d1q3se1, d1q3se3, d1q3sf1, d1q3sf3, d1q3sg1, d1q3sg3, d1q3sh1, d1q3sh3
      complexed with adp, mg
    7. 2098309Domain d1q3sg2: 1q3s G:217-369 [95747]
      Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa3, d1q3sb1, d1q3sb3, d1q3sc1, d1q3sc3, d1q3sd1, d1q3sd3, d1q3se1, d1q3se3, d1q3sf1, d1q3sf3, d1q3sg1, d1q3sg3, d1q3sh1, d1q3sh3
      complexed with adp, mg
    8. 2098310Domain d1q3sh2: 1q3s H:217-369 [95750]
      Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa3, d1q3sb1, d1q3sb3, d1q3sc1, d1q3sc3, d1q3sd1, d1q3sd3, d1q3se1, d1q3se3, d1q3sf1, d1q3sf3, d1q3sg1, d1q3sg3, d1q3sh1, d1q3sh3
      complexed with adp, mg

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