Lineage for Protein: Methylamine dehydrogenase, H-chain

  1. Root: SCOP 1.73
  2. 651986Class b: All beta proteins [48724] (165 folds)
  3. 675262Fold b.69: 7-bladed beta-propeller [50964] (14 superfamilies)
    consists of seven 4-stranded beta-sheet motifs; meander
  4. 675277Superfamily b.69.2: YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase [50969] (3 families) (S)
  5. 675278Family b.69.2.1: Methylamine dehydrogenase, H-chain [50970] (1 protein)
    less regular propeller without notable sequence repeats; quinone cofactor is a tryptophan derivative in another subunit
    this is a repeat family; one repeat unit is 1mg2 A:132-178 found in domain
  6. 675279Protein Methylamine dehydrogenase, H-chain [50971] (2 species)

Species:

  1. 675280Gram negative methylotrophic bacteria (Thiobacillus versutus) [TaxId:34007] [50973] (3 PDB entries)
    1. Domain for 1mae:
    2. Domain for 1maf:
    3. Domain for 2mad:
  2. 675284Paracoccus denitrificans [TaxId:266] [50972] (10 PDB entries)
    1. Domains for 1mda:
      1. 675312Domain d1mdah_: 1mda H: [27637]
        Other proteins in same PDB: d1mdaa_, d1mdab_, d1mdal_, d1mdam_
      2. 675313Domain d1mdaj_: 1mda J: [27638]
        Other proteins in same PDB: d1mdaa_, d1mdab_, d1mdal_, d1mdam_
        complexed with cu, owq
    2. Domains for 1mg2:
      1. 675304Domain d1mg2a_: 1mg2 A: [79059]
        Other proteins in same PDB: d1mg2b_, d1mg2c_, d1mg2d_, d1mg2f_, d1mg2g_, d1mg2h_, d1mg2j_, d1mg2k_, d1mg2l_, d1mg2n_, d1mg2o_, d1mg2p_
      2. 675305Domain d1mg2e_: 1mg2 E: [79063]
        Other proteins in same PDB: d1mg2b_, d1mg2c_, d1mg2d_, d1mg2f_, d1mg2g_, d1mg2h_, d1mg2j_, d1mg2k_, d1mg2l_, d1mg2n_, d1mg2o_, d1mg2p_
      3. 675306Domain d1mg2i_: 1mg2 I: [79067]
        Other proteins in same PDB: d1mg2b_, d1mg2c_, d1mg2d_, d1mg2f_, d1mg2g_, d1mg2h_, d1mg2j_, d1mg2k_, d1mg2l_, d1mg2n_, d1mg2o_, d1mg2p_
      4. 675307Domain d1mg2m_: 1mg2 M: [79071]
        Other proteins in same PDB: d1mg2b_, d1mg2c_, d1mg2d_, d1mg2f_, d1mg2g_, d1mg2h_, d1mg2j_, d1mg2k_, d1mg2l_, d1mg2n_, d1mg2o_, d1mg2p_
        complexed with cu, hem, na, po4, trq; mutant
    3. Domains for 1mg3:
      1. 675308Domain d1mg3a_: 1mg3 A: [79075]
        Other proteins in same PDB: d1mg3b_, d1mg3c_, d1mg3d_, d1mg3f_, d1mg3g_, d1mg3h_, d1mg3j_, d1mg3k_, d1mg3l_, d1mg3n_, d1mg3o_, d1mg3p_
      2. 675309Domain d1mg3e_: 1mg3 E: [79079]
        Other proteins in same PDB: d1mg3b_, d1mg3c_, d1mg3d_, d1mg3f_, d1mg3g_, d1mg3h_, d1mg3j_, d1mg3k_, d1mg3l_, d1mg3n_, d1mg3o_, d1mg3p_
      3. 675310Domain d1mg3i_: 1mg3 I: [79083]
        Other proteins in same PDB: d1mg3b_, d1mg3c_, d1mg3d_, d1mg3f_, d1mg3g_, d1mg3h_, d1mg3j_, d1mg3k_, d1mg3l_, d1mg3n_, d1mg3o_, d1mg3p_
      4. 675311Domain d1mg3m_: 1mg3 M: [79087]
        Other proteins in same PDB: d1mg3b_, d1mg3c_, d1mg3d_, d1mg3f_, d1mg3g_, d1mg3h_, d1mg3j_, d1mg3k_, d1mg3l_, d1mg3n_, d1mg3o_, d1mg3p_
        complexed with cu, hem, na, po4, trw; mutant
    4. Domains for 2bbk:
      1. 675285Domain d2bbkh_: 2bbk H: [27634]
        Other proteins in same PDB: d2bbkl_, d2bbkm_
      2. 675286Domain d2bbkj_: 2bbk J: [27635]
        Other proteins in same PDB: d2bbkl_, d2bbkm_
        complexed with owq
    5. Domains for 2gc4:
      1. 675299Domain d2gc4a1: 2gc4 A:32-386 [134934]
        Other proteins in same PDB: d2gc4b1, d2gc4c1, d2gc4d1, d2gc4f1, d2gc4g1, d2gc4h1, d2gc4j1, d2gc4k1, d2gc4l1, d2gc4n1, d2gc4o1, d2gc4p1
        automatically matched to d2bbkh_
        complexed with cu, hem, na, trq
      2. 675300Domain d2gc4e1: 2gc4 E:32-386 [134938]
        Other proteins in same PDB: d2gc4b1, d2gc4c1, d2gc4d1, d2gc4f1, d2gc4g1, d2gc4h1, d2gc4j1, d2gc4k1, d2gc4l1, d2gc4n1, d2gc4o1, d2gc4p1
        automatically matched to d2bbkh_
        complexed with cu, hem, na, trq
      3. 675301Domain d2gc4i1: 2gc4 I:32-386 [134942]
        Other proteins in same PDB: d2gc4b1, d2gc4c1, d2gc4d1, d2gc4f1, d2gc4g1, d2gc4h1, d2gc4j1, d2gc4k1, d2gc4l1, d2gc4n1, d2gc4o1, d2gc4p1
        automatically matched to d2bbkh_
        complexed with cu, hem, na, trq
      4. 675302Domain d2gc4m1: 2gc4 M:32-386 [134946]
        Other proteins in same PDB: d2gc4b1, d2gc4c1, d2gc4d1, d2gc4f1, d2gc4g1, d2gc4h1, d2gc4j1, d2gc4k1, d2gc4l1, d2gc4n1, d2gc4o1, d2gc4p1
        automatically matched to d2bbkh_
        complexed with cu, hem, na, trq
    6. Domains for 2gc7:
      1. 675287Domain d2gc7a1: 2gc7 A:32-386 [134954]
        Other proteins in same PDB: d2gc7b1, d2gc7c1, d2gc7d1, d2gc7f1, d2gc7g1, d2gc7h1, d2gc7j1, d2gc7k1, d2gc7l1, d2gc7n1, d2gc7o1, d2gc7p1
        automatically matched to d2bbkh_
        complexed with hem, na, trq
      2. 675288Domain d2gc7e1: 2gc7 E:32-386 [134958]
        Other proteins in same PDB: d2gc7b1, d2gc7c1, d2gc7d1, d2gc7f1, d2gc7g1, d2gc7h1, d2gc7j1, d2gc7k1, d2gc7l1, d2gc7n1, d2gc7o1, d2gc7p1
        automatically matched to d2bbkh_
        complexed with hem, na, trq
      3. 675289Domain d2gc7i1: 2gc7 I:32-386 [134962]
        Other proteins in same PDB: d2gc7b1, d2gc7c1, d2gc7d1, d2gc7f1, d2gc7g1, d2gc7h1, d2gc7j1, d2gc7k1, d2gc7l1, d2gc7n1, d2gc7o1, d2gc7p1
        automatically matched to d2bbkh_
        complexed with hem, na, trq
      4. 675290Domain d2gc7m1: 2gc7 M:32-386 [134966]
        Other proteins in same PDB: d2gc7b1, d2gc7c1, d2gc7d1, d2gc7f1, d2gc7g1, d2gc7h1, d2gc7j1, d2gc7k1, d2gc7l1, d2gc7n1, d2gc7o1, d2gc7p1
        automatically matched to d2bbkh_
        complexed with hem, na, trq
    7. Domains for 2j55:
      1. 675297Domain d2j55h1: 2j55 H:32-386 [138015]
        Other proteins in same PDB: d2j55a1, d2j55b1
        automatically matched to d2bbkh_
        complexed with cu, gol, trq
      2. 675298Domain d2j55j1: 2j55 J:32-386 [138016]
        Other proteins in same PDB: d2j55a1, d2j55b1
        automatically matched to d2bbkh_
        complexed with cu, gol, trq
    8. Domains for 2j56:
      1. 675291Domain d2j56h1: 2j56 H:32-386 [138019]
        Other proteins in same PDB: d2j56a1, d2j56b1
        automatically matched to d2bbkh_
        complexed with cu, gol, na, tqq
      2. 675292Domain d2j56j1: 2j56 J:32-386 [138020]
        Other proteins in same PDB: d2j56a1, d2j56b1
        automatically matched to d2bbkh_
        complexed with cu, gol, na, tqq
    9. Domains for 2j57:
      1. 675293Domain d2j57g1: 2j57 G:32-386 [138025]
        Other proteins in same PDB: d2j57a1, d2j57b1, d2j57c1, d2j57d1
        automatically matched to d2bbkh_
        complexed with cu, tqq
      2. 675294Domain d2j57h1: 2j57 H:32-386 [138026]
        Other proteins in same PDB: d2j57a1, d2j57b1, d2j57c1, d2j57d1
        automatically matched to d2bbkh_
        complexed with cu, tqq
      3. 675295Domain d2j57i1: 2j57 I:32-386 [138027]
        Other proteins in same PDB: d2j57a1, d2j57b1, d2j57c1, d2j57d1
        automatically matched to d2bbkh_
        complexed with cu, tqq
      4. 675296Domain d2j57j1: 2j57 J:32-386 [138028]
        Other proteins in same PDB: d2j57a1, d2j57b1, d2j57c1, d2j57d1
        automatically matched to d2bbkh_
        complexed with cu, tqq
    10. Domain for 2mta:

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