Lineage for Species: Bacteroides thetaiotaomicron [TaxId: 226186]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2078559Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 2078560Fold c.1: TIM beta/alpha-barrel [51350] (33 superfamilies)
    contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678
    the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
  4. 2081496Superfamily c.1.8: (Trans)glycosidases [51445] (15 families) (S)
  5. 2082160Family c.1.8.3: beta-glycanases [51487] (27 protein domains)
    consist of a number of sequence families
  6. 2082782Protein automated matches [190057] (26 species)
    not a true protein
  7. 2082813Species Bacteroides thetaiotaomicron [TaxId:226186] [255614] (7 PDB entries)

PDB entries in Species: Bacteroides thetaiotaomicron [TaxId: 226186]:

  1. Domain(s) for 2vjx:
    1. 2082814Domain d2vjxa5: 2vjx A:331-678 [153207]
      Other proteins in same PDB: d2vjxa1, d2vjxa2, d2vjxa3, d2vjxa4, d2vjxb1, d2vjxb2, d2vjxb3, d2vjxb4, d2vjxb6
      automated match to d2je8a5
      complexed with br, cl, edo, ifl
    2. 2082815Domain d2vjxb5: 2vjx B:331-678 [153212]
      Other proteins in same PDB: d2vjxa1, d2vjxa2, d2vjxa3, d2vjxa4, d2vjxb1, d2vjxb2, d2vjxb3, d2vjxb4, d2vjxb6
      automated match to d2je8a5
      complexed with br, cl, edo, ifl
  2. Domain(s) for 2vl4:
    1. 2082818Domain d2vl4a5: 2vl4 A:331-678 [153258]
      Other proteins in same PDB: d2vl4a1, d2vl4a2, d2vl4a3, d2vl4a4, d2vl4b1, d2vl4b2, d2vl4b3, d2vl4b4, d2vl4b6
      automated match to d2je8a5
      complexed with br, cl, edo, mnm
    2. 2082819Domain d2vl4b5: 2vl4 B:331-678 [153263]
      Other proteins in same PDB: d2vl4a1, d2vl4a2, d2vl4a3, d2vl4a4, d2vl4b1, d2vl4b2, d2vl4b3, d2vl4b4, d2vl4b6
      automated match to d2je8a5
      complexed with br, cl, edo, mnm
  3. Domain(s) for 2vmf:
    1. 2082822Domain d2vmfa5: 2vmf A:331-678 [153320]
      Other proteins in same PDB: d2vmfa1, d2vmfa2, d2vmfa3, d2vmfa4, d2vmfb1, d2vmfb2, d2vmfb3, d2vmfb4, d2vmfb6
      automated match to d2je8a5
      complexed with br, cl, edo, mvl
    2. 2082823Domain d2vmfb5: 2vmf B:331-678 [153325]
      Other proteins in same PDB: d2vmfa1, d2vmfa2, d2vmfa3, d2vmfa4, d2vmfb1, d2vmfb2, d2vmfb3, d2vmfb4, d2vmfb6
      automated match to d2je8a5
      complexed with br, cl, edo, mvl
  4. Domain(s) for 2vo5:
    1. 2082824Domain d2vo5a5: 2vo5 A:331-678 [153354]
      Other proteins in same PDB: d2vo5a1, d2vo5a2, d2vo5a3, d2vo5a4, d2vo5b1, d2vo5b2, d2vo5b3, d2vo5b4, d2vo5b6
      automated match to d2je8a5
      complexed with br, cl, edo, vbz
    2. 2082825Domain d2vo5b5: 2vo5 B:331-678 [153359]
      Other proteins in same PDB: d2vo5a1, d2vo5a2, d2vo5a3, d2vo5a4, d2vo5b1, d2vo5b2, d2vo5b3, d2vo5b4, d2vo5b6
      automated match to d2je8a5
      complexed with br, cl, edo, vbz
  5. Domain(s) for 2vot:
    1. 2082820Domain d2vota5: 2vot A:331-678 [153383]
      Other proteins in same PDB: d2vota1, d2vota2, d2vota3, d2vota4, d2votb1, d2votb2, d2votb3, d2votb4, d2votb6
      automated match to d2je8a5
      complexed with br, cl, edo, nhv
    2. 2082821Domain d2votb5: 2vot B:331-678 [153388]
      Other proteins in same PDB: d2vota1, d2vota2, d2vota3, d2vota4, d2votb1, d2votb2, d2votb3, d2votb4, d2votb6
      automated match to d2je8a5
      complexed with br, cl, edo, nhv
  6. Domain(s) for 2vr4:
    1. 2082816Domain d2vr4a5: 2vr4 A:331-678 [153499]
      Other proteins in same PDB: d2vr4a1, d2vr4a2, d2vr4a3, d2vr4a4, d2vr4b1, d2vr4b2, d2vr4b3, d2vr4b4, d2vr4b6
      automated match to d2je8a5
      complexed with 17b, br, cl, edo
    2. 2082817Domain d2vr4b5: 2vr4 B:331-678 [153504]
      Other proteins in same PDB: d2vr4a1, d2vr4a2, d2vr4a3, d2vr4a4, d2vr4b1, d2vr4b2, d2vr4b3, d2vr4b4, d2vr4b6
      automated match to d2je8a5
      complexed with 17b, br, cl, edo
  7. Domain(s) for 2wbk:
    1. 2082826Domain d2wbka3: 2wbk A:331-678 [244098]
      Other proteins in same PDB: d2wbka1, d2wbka2, d2wbka4, d2wbka5, d2wbkb1, d2wbkb2, d2wbkb4, d2wbkb5, d2wbkb6
      automated match to d2je8a5
      complexed with br, cl, edo, m2f
    2. 2082827Domain d2wbkb3: 2wbk B:331-678 [244103]
      Other proteins in same PDB: d2wbka1, d2wbka2, d2wbka4, d2wbka5, d2wbkb1, d2wbkb2, d2wbkb4, d2wbkb5, d2wbkb6
      automated match to d2je8a5
      complexed with br, cl, edo, m2f

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