Lineage for Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]

  1. Root: SCOPe 2.08
  2. 2923792Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (396 folds)
  3. 2949054Fold d.58: Ferredoxin-like [54861] (62 superfamilies)
    alpha+beta sandwich with antiparallel beta-sheet; (beta-alpha-beta)x2
  4. 2953474Superfamily d.58.11: EF-G C-terminal domain-like [54980] (4 families) (S)
  5. 2953573Family d.58.11.0: automated matches [254210] (1 protein)
    not a true family
  6. 2953574Protein automated matches [254469] (4 species)
    not a true protein
  7. 2953577Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [255012] (4 PDB entries)

PDB entries in Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]:

  1. Domain(s) for 1zm2:
    1. 2953578Domain d1zm2a4: 1zm2 A:482-560 [125283]
      Other proteins in same PDB: d1zm2a1, d1zm2a2, d1zm2a3, d1zm2b_, d1zm2c1, d1zm2c2, d1zm2c3, d1zm2d_, d1zm2e1, d1zm2e2, d1zm2e3, d1zm2f_
      automated match to d1n0ua4
      complexed with apr
    2. 2953579Domain d1zm2a5: 1zm2 A:726-842 [125284]
      Other proteins in same PDB: d1zm2a1, d1zm2a2, d1zm2a3, d1zm2b_, d1zm2c1, d1zm2c2, d1zm2c3, d1zm2d_, d1zm2e1, d1zm2e2, d1zm2e3, d1zm2f_
      automated match to d1n0ua5
      complexed with apr
    3. 2953580Domain d1zm2c4: 1zm2 C:482-560 [125289]
      Other proteins in same PDB: d1zm2a1, d1zm2a2, d1zm2a3, d1zm2b_, d1zm2c1, d1zm2c2, d1zm2c3, d1zm2d_, d1zm2e1, d1zm2e2, d1zm2e3, d1zm2f_
      automated match to d1n0ua4
      complexed with apr
    4. 2953581Domain d1zm2c5: 1zm2 C:726-842 [125290]
      Other proteins in same PDB: d1zm2a1, d1zm2a2, d1zm2a3, d1zm2b_, d1zm2c1, d1zm2c2, d1zm2c3, d1zm2d_, d1zm2e1, d1zm2e2, d1zm2e3, d1zm2f_
      automated match to d1n0ua5
      complexed with apr
    5. 2953582Domain d1zm2e4: 1zm2 E:482-560 [125295]
      Other proteins in same PDB: d1zm2a1, d1zm2a2, d1zm2a3, d1zm2b_, d1zm2c1, d1zm2c2, d1zm2c3, d1zm2d_, d1zm2e1, d1zm2e2, d1zm2e3, d1zm2f_
      automated match to d1n0ua4
      complexed with apr
    6. 2953583Domain d1zm2e5: 1zm2 E:726-842 [125296]
      Other proteins in same PDB: d1zm2a1, d1zm2a2, d1zm2a3, d1zm2b_, d1zm2c1, d1zm2c2, d1zm2c3, d1zm2d_, d1zm2e1, d1zm2e2, d1zm2e3, d1zm2f_
      automated match to d1n0ua5
      complexed with apr
  2. Domain(s) for 1zm3:
    1. 2953584Domain d1zm3a4: 1zm3 A:482-560 [125301]
      Other proteins in same PDB: d1zm3a1, d1zm3a2, d1zm3a3, d1zm3b_, d1zm3c1, d1zm3c2, d1zm3c3, d1zm3d_, d1zm3e1, d1zm3e2, d1zm3e3, d1zm3f_
      automated match to d1n0ua4
    2. 2953585Domain d1zm3a5: 1zm3 A:726-842 [125302]
      Other proteins in same PDB: d1zm3a1, d1zm3a2, d1zm3a3, d1zm3b_, d1zm3c1, d1zm3c2, d1zm3c3, d1zm3d_, d1zm3e1, d1zm3e2, d1zm3e3, d1zm3f_
      automated match to d1n0ua5
    3. 2953586Domain d1zm3c4: 1zm3 C:482-560 [125307]
      Other proteins in same PDB: d1zm3a1, d1zm3a2, d1zm3a3, d1zm3b_, d1zm3c1, d1zm3c2, d1zm3c3, d1zm3d_, d1zm3e1, d1zm3e2, d1zm3e3, d1zm3f_
      automated match to d1n0ua4
    4. 2953587Domain d1zm3c5: 1zm3 C:726-842 [125308]
      Other proteins in same PDB: d1zm3a1, d1zm3a2, d1zm3a3, d1zm3b_, d1zm3c1, d1zm3c2, d1zm3c3, d1zm3d_, d1zm3e1, d1zm3e2, d1zm3e3, d1zm3f_
      automated match to d1n0ua5
    5. 2953588Domain d1zm3e4: 1zm3 E:482-560 [125313]
      Other proteins in same PDB: d1zm3a1, d1zm3a2, d1zm3a3, d1zm3b_, d1zm3c1, d1zm3c2, d1zm3c3, d1zm3d_, d1zm3e1, d1zm3e2, d1zm3e3, d1zm3f_
      automated match to d1n0ua4
    6. 2953589Domain d1zm3e5: 1zm3 E:726-842 [125314]
      Other proteins in same PDB: d1zm3a1, d1zm3a2, d1zm3a3, d1zm3b_, d1zm3c1, d1zm3c2, d1zm3c3, d1zm3d_, d1zm3e1, d1zm3e2, d1zm3e3, d1zm3f_
      automated match to d1n0ua5
  3. Domain(s) for 2e1r:
    1. 2953596Domain d2e1ra4: 2e1r A:482-560 [131969]
      Other proteins in same PDB: d2e1ra1, d2e1ra2, d2e1ra3
      automated match to d1n0ua4
      complexed with gdp, sod
    2. 2953597Domain d2e1ra5: 2e1r A:726-842 [131970]
      Other proteins in same PDB: d2e1ra1, d2e1ra2, d2e1ra3
      automated match to d1n0ua5
      complexed with gdp, sod
  4. Domain(s) for 2zit:
    1. 2953590Domain d2zita3: 2zit A:482-560 [239066]
      Other proteins in same PDB: d2zita1, d2zita2, d2zita4, d2zitb2, d2zitb3, d2zitc1, d2zitc2, d2zitc4, d2zitd2, d2zitd3, d2zite1, d2zite2, d2zite4, d2zitf2, d2zitf3
      automated match to d1n0ua4
      protein/RNA complex; complexed with nad
    2. 2953591Domain d2zita5: 2zit A:726-842 [239068]
      Other proteins in same PDB: d2zita1, d2zita2, d2zita4, d2zitb2, d2zitb3, d2zitc1, d2zitc2, d2zitc4, d2zitd2, d2zitd3, d2zite1, d2zite2, d2zite4, d2zitf2, d2zitf3
      automated match to d1n0ua5
      protein/RNA complex; complexed with nad
    3. 2953592Domain d2zitc3: 2zit C:482-560 [239071]
      Other proteins in same PDB: d2zita1, d2zita2, d2zita4, d2zitb2, d2zitb3, d2zitc1, d2zitc2, d2zitc4, d2zitd2, d2zitd3, d2zite1, d2zite2, d2zite4, d2zitf2, d2zitf3
      automated match to d1n0ua4
      protein/RNA complex; complexed with nad
    4. 2953593Domain d2zitc5: 2zit C:726-842 [239073]
      Other proteins in same PDB: d2zita1, d2zita2, d2zita4, d2zitb2, d2zitb3, d2zitc1, d2zitc2, d2zitc4, d2zitd2, d2zitd3, d2zite1, d2zite2, d2zite4, d2zitf2, d2zitf3
      automated match to d1n0ua5
      protein/RNA complex; complexed with nad
    5. 2953594Domain d2zite3: 2zit E:482-560 [239076]
      Other proteins in same PDB: d2zita1, d2zita2, d2zita4, d2zitb2, d2zitb3, d2zitc1, d2zitc2, d2zitc4, d2zitd2, d2zitd3, d2zite1, d2zite2, d2zite4, d2zitf2, d2zitf3
      automated match to d1n0ua4
      protein/RNA complex; complexed with nad
    6. 2953595Domain d2zite5: 2zit E:726-842 [239078]
      Other proteins in same PDB: d2zita1, d2zita2, d2zita4, d2zitb2, d2zitb3, d2zitc1, d2zitc2, d2zitc4, d2zitd2, d2zitd3, d2zite1, d2zite2, d2zite4, d2zitf2, d2zitf3
      automated match to d1n0ua5
      protein/RNA complex; complexed with nad

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