Lineage for Protein: automated matches

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2152203Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (385 folds)
  3. 2172288Fold d.58: Ferredoxin-like [54861] (59 superfamilies)
    alpha+beta sandwich with antiparallel beta-sheet; (beta-alpha-beta)x2
  4. 2175773Superfamily d.58.11: EF-G C-terminal domain-like [54980] (4 families) (S)
  5. 2175863Family d.58.11.0: automated matches [254210] (1 protein)
    not a true family
  6. 2175864Protein automated matches [254469] (2 species)
    not a true protein

Species:

  1. 2175865Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [255012] (4 PDB entries)
    1. Domains for 1zm2:
      1. 2175874Domain d1zm2a4: 1zm2 A:482-560 [125283]
        Other proteins in same PDB: d1zm2a1, d1zm2a2, d1zm2a3, d1zm2b_, d1zm2c1, d1zm2c2, d1zm2c3, d1zm2d_, d1zm2e1, d1zm2e2, d1zm2e3, d1zm2f_
        automated match to d1n0ua4
        complexed with apr
      2. 2175875Domain d1zm2a5: 1zm2 A:726-842 [125284]
        Other proteins in same PDB: d1zm2a1, d1zm2a2, d1zm2a3, d1zm2b_, d1zm2c1, d1zm2c2, d1zm2c3, d1zm2d_, d1zm2e1, d1zm2e2, d1zm2e3, d1zm2f_
        automated match to d1n0ua5
        complexed with apr
      3. 2175876Domain d1zm2c4: 1zm2 C:482-560 [125289]
        Other proteins in same PDB: d1zm2a1, d1zm2a2, d1zm2a3, d1zm2b_, d1zm2c1, d1zm2c2, d1zm2c3, d1zm2d_, d1zm2e1, d1zm2e2, d1zm2e3, d1zm2f_
        automated match to d1n0ua4
        complexed with apr
      4. 2175877Domain d1zm2c5: 1zm2 C:726-842 [125290]
        Other proteins in same PDB: d1zm2a1, d1zm2a2, d1zm2a3, d1zm2b_, d1zm2c1, d1zm2c2, d1zm2c3, d1zm2d_, d1zm2e1, d1zm2e2, d1zm2e3, d1zm2f_
        automated match to d1n0ua5
        complexed with apr
      5. 2175878Domain d1zm2e4: 1zm2 E:482-560 [125295]
        Other proteins in same PDB: d1zm2a1, d1zm2a2, d1zm2a3, d1zm2b_, d1zm2c1, d1zm2c2, d1zm2c3, d1zm2d_, d1zm2e1, d1zm2e2, d1zm2e3, d1zm2f_
        automated match to d1n0ua4
        complexed with apr
      6. 2175879Domain d1zm2e5: 1zm2 E:726-842 [125296]
        Other proteins in same PDB: d1zm2a1, d1zm2a2, d1zm2a3, d1zm2b_, d1zm2c1, d1zm2c2, d1zm2c3, d1zm2d_, d1zm2e1, d1zm2e2, d1zm2e3, d1zm2f_
        automated match to d1n0ua5
        complexed with apr
    2. Domains for 1zm3:
      1. 2175880Domain d1zm3a4: 1zm3 A:482-560 [125301]
        Other proteins in same PDB: d1zm3a1, d1zm3a2, d1zm3a3, d1zm3b_, d1zm3c1, d1zm3c2, d1zm3c3, d1zm3d_, d1zm3e1, d1zm3e2, d1zm3e3, d1zm3f_
        automated match to d1n0ua4
      2. 2175881Domain d1zm3a5: 1zm3 A:726-842 [125302]
        Other proteins in same PDB: d1zm3a1, d1zm3a2, d1zm3a3, d1zm3b_, d1zm3c1, d1zm3c2, d1zm3c3, d1zm3d_, d1zm3e1, d1zm3e2, d1zm3e3, d1zm3f_
        automated match to d1n0ua5
      3. 2175882Domain d1zm3c4: 1zm3 C:482-560 [125307]
        Other proteins in same PDB: d1zm3a1, d1zm3a2, d1zm3a3, d1zm3b_, d1zm3c1, d1zm3c2, d1zm3c3, d1zm3d_, d1zm3e1, d1zm3e2, d1zm3e3, d1zm3f_
        automated match to d1n0ua4
      4. 2175883Domain d1zm3c5: 1zm3 C:726-842 [125308]
        Other proteins in same PDB: d1zm3a1, d1zm3a2, d1zm3a3, d1zm3b_, d1zm3c1, d1zm3c2, d1zm3c3, d1zm3d_, d1zm3e1, d1zm3e2, d1zm3e3, d1zm3f_
        automated match to d1n0ua5
      5. 2175884Domain d1zm3e4: 1zm3 E:482-560 [125313]
        Other proteins in same PDB: d1zm3a1, d1zm3a2, d1zm3a3, d1zm3b_, d1zm3c1, d1zm3c2, d1zm3c3, d1zm3d_, d1zm3e1, d1zm3e2, d1zm3e3, d1zm3f_
        automated match to d1n0ua4
      6. 2175885Domain d1zm3e5: 1zm3 E:726-842 [125314]
        Other proteins in same PDB: d1zm3a1, d1zm3a2, d1zm3a3, d1zm3b_, d1zm3c1, d1zm3c2, d1zm3c3, d1zm3d_, d1zm3e1, d1zm3e2, d1zm3e3, d1zm3f_
        automated match to d1n0ua5
    3. Domains for 2e1r:
      1. 2175872Domain d2e1ra4: 2e1r A:482-560 [131969]
        Other proteins in same PDB: d2e1ra1, d2e1ra2, d2e1ra3
        automated match to d1n0ua4
        complexed with gdp, sod
      2. 2175873Domain d2e1ra5: 2e1r A:726-842 [131970]
        Other proteins in same PDB: d2e1ra1, d2e1ra2, d2e1ra3
        automated match to d1n0ua5
        complexed with gdp, sod
    4. Domains for 2zit:
      1. 2175866Domain d2zita3: 2zit A:482-560 [239066]
        Other proteins in same PDB: d2zita1, d2zita2, d2zita4, d2zitb2, d2zitb3, d2zitc1, d2zitc2, d2zitc4, d2zitd2, d2zitd3, d2zite1, d2zite2, d2zite4, d2zitf2, d2zitf3
        automated match to d1n0ua4
        protein/RNA complex; complexed with nad
      2. 2175867Domain d2zita5: 2zit A:726-842 [239068]
        Other proteins in same PDB: d2zita1, d2zita2, d2zita4, d2zitb2, d2zitb3, d2zitc1, d2zitc2, d2zitc4, d2zitd2, d2zitd3, d2zite1, d2zite2, d2zite4, d2zitf2, d2zitf3
        automated match to d1n0ua5
        protein/RNA complex; complexed with nad
      3. 2175868Domain d2zitc3: 2zit C:482-560 [239071]
        Other proteins in same PDB: d2zita1, d2zita2, d2zita4, d2zitb2, d2zitb3, d2zitc1, d2zitc2, d2zitc4, d2zitd2, d2zitd3, d2zite1, d2zite2, d2zite4, d2zitf2, d2zitf3
        automated match to d1n0ua4
        protein/RNA complex; complexed with nad
      4. 2175869Domain d2zitc5: 2zit C:726-842 [239073]
        Other proteins in same PDB: d2zita1, d2zita2, d2zita4, d2zitb2, d2zitb3, d2zitc1, d2zitc2, d2zitc4, d2zitd2, d2zitd3, d2zite1, d2zite2, d2zite4, d2zitf2, d2zitf3
        automated match to d1n0ua5
        protein/RNA complex; complexed with nad
      5. 2175870Domain d2zite3: 2zit E:482-560 [239076]
        Other proteins in same PDB: d2zita1, d2zita2, d2zita4, d2zitb2, d2zitb3, d2zitc1, d2zitc2, d2zitc4, d2zitd2, d2zitd3, d2zite1, d2zite2, d2zite4, d2zitf2, d2zitf3
        automated match to d1n0ua4
        protein/RNA complex; complexed with nad
      6. 2175871Domain d2zite5: 2zit E:726-842 [239078]
        Other proteins in same PDB: d2zita1, d2zita2, d2zita4, d2zitb2, d2zitb3, d2zitc1, d2zitc2, d2zitc4, d2zitd2, d2zitd3, d2zite1, d2zite2, d2zite4, d2zitf2, d2zitf3
        automated match to d1n0ua5
        protein/RNA complex; complexed with nad
  2. 2175886Methanothermobacter thermautotrophicus [TaxId:187420] [255646] (1 PDB entry)

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