Lineage for Species: Trypanosome (Trypanosoma brucei) [TaxId: 5691]

  1. Root: SCOPe 2.08
  2. 2685877Class a: All alpha proteins [46456] (290 folds)
  3. 2699446Fold a.24: Four-helical up-and-down bundle [47161] (29 superfamilies)
    core: 4 helices; bundle, closed or partly opened, left-handed twist; up-and-down
  4. 2700032Superfamily a.24.8: Proteasome activator [47216] (1 family) (S)
  5. 2700033Family a.24.8.1: Proteasome activator [47217] (3 proteins)
  6. 2700046Protein automated matches [190828] (1 species)
    not a true protein
  7. 2700047Species Trypanosome (Trypanosoma brucei) [TaxId:5691] [188131] (7 PDB entries)

PDB entries in Species: Trypanosome (Trypanosoma brucei) [TaxId: 5691]:

  1. Domain(s) for 1ya7:
    1. 2700055Domain d1ya7p_: 1ya7 P: [144609]
      Other proteins in same PDB: d1ya7a_, d1ya7b_, d1ya7c_, d1ya7d_, d1ya7e_, d1ya7f_, d1ya7g_, d1ya7h_, d1ya7i_, d1ya7j_, d1ya7k_, d1ya7l_, d1ya7m_, d1ya7n_, d1ya7o1
      automated match to d1ya7o1
      complexed with gol, so4
    2. 2700056Domain d1ya7q_: 1ya7 Q: [144610]
      Other proteins in same PDB: d1ya7a_, d1ya7b_, d1ya7c_, d1ya7d_, d1ya7e_, d1ya7f_, d1ya7g_, d1ya7h_, d1ya7i_, d1ya7j_, d1ya7k_, d1ya7l_, d1ya7m_, d1ya7n_, d1ya7o1
      automated match to d1ya7o1
      complexed with gol, so4
    3. 2700057Domain d1ya7r_: 1ya7 R: [144611]
      Other proteins in same PDB: d1ya7a_, d1ya7b_, d1ya7c_, d1ya7d_, d1ya7e_, d1ya7f_, d1ya7g_, d1ya7h_, d1ya7i_, d1ya7j_, d1ya7k_, d1ya7l_, d1ya7m_, d1ya7n_, d1ya7o1
      automated match to d1ya7o1
      complexed with gol, so4
    4. 2700058Domain d1ya7s_: 1ya7 S: [144612]
      Other proteins in same PDB: d1ya7a_, d1ya7b_, d1ya7c_, d1ya7d_, d1ya7e_, d1ya7f_, d1ya7g_, d1ya7h_, d1ya7i_, d1ya7j_, d1ya7k_, d1ya7l_, d1ya7m_, d1ya7n_, d1ya7o1
      automated match to d1ya7o1
      complexed with gol, so4
    5. 2700059Domain d1ya7t_: 1ya7 T: [144613]
      Other proteins in same PDB: d1ya7a_, d1ya7b_, d1ya7c_, d1ya7d_, d1ya7e_, d1ya7f_, d1ya7g_, d1ya7h_, d1ya7i_, d1ya7j_, d1ya7k_, d1ya7l_, d1ya7m_, d1ya7n_, d1ya7o1
      automated match to d1ya7o1
      complexed with gol, so4
    6. 2700060Domain d1ya7u_: 1ya7 U: [144614]
      Other proteins in same PDB: d1ya7a_, d1ya7b_, d1ya7c_, d1ya7d_, d1ya7e_, d1ya7f_, d1ya7g_, d1ya7h_, d1ya7i_, d1ya7j_, d1ya7k_, d1ya7l_, d1ya7m_, d1ya7n_, d1ya7o1
      automated match to d1ya7o1
      complexed with gol, so4
  2. Domain(s) for 1yar:
    1. 2700048Domain d1yaro_: 1yar O: [144615]
      Other proteins in same PDB: d1yara_, d1yarb_, d1yarc_, d1yard_, d1yare_, d1yarf_, d1yarg_, d1yarh_, d1yari_, d1yarj_, d1yark_, d1yarl_, d1yarm_, d1yarn_
      automated match to d1ya7o1
      complexed with gol, so4; mutant
    2. 2700049Domain d1yarp_: 1yar P: [144616]
      Other proteins in same PDB: d1yara_, d1yarb_, d1yarc_, d1yard_, d1yare_, d1yarf_, d1yarg_, d1yarh_, d1yari_, d1yarj_, d1yark_, d1yarl_, d1yarm_, d1yarn_
      automated match to d1ya7o1
      complexed with gol, so4; mutant
    3. 2700050Domain d1yarq_: 1yar Q: [144617]
      Other proteins in same PDB: d1yara_, d1yarb_, d1yarc_, d1yard_, d1yare_, d1yarf_, d1yarg_, d1yarh_, d1yari_, d1yarj_, d1yark_, d1yarl_, d1yarm_, d1yarn_
      automated match to d1ya7o1
      complexed with gol, so4; mutant
    4. 2700051Domain d1yarr_: 1yar R: [144618]
      Other proteins in same PDB: d1yara_, d1yarb_, d1yarc_, d1yard_, d1yare_, d1yarf_, d1yarg_, d1yarh_, d1yari_, d1yarj_, d1yark_, d1yarl_, d1yarm_, d1yarn_
      automated match to d1ya7o1
      complexed with gol, so4; mutant
    5. 2700052Domain d1yars_: 1yar S: [144619]
      Other proteins in same PDB: d1yara_, d1yarb_, d1yarc_, d1yard_, d1yare_, d1yarf_, d1yarg_, d1yarh_, d1yari_, d1yarj_, d1yark_, d1yarl_, d1yarm_, d1yarn_
      automated match to d1ya7o1
      complexed with gol, so4; mutant
    6. 2700053Domain d1yart_: 1yar T: [144620]
      Other proteins in same PDB: d1yara_, d1yarb_, d1yarc_, d1yard_, d1yare_, d1yarf_, d1yarg_, d1yarh_, d1yari_, d1yarj_, d1yark_, d1yarl_, d1yarm_, d1yarn_
      automated match to d1ya7o1
      complexed with gol, so4; mutant
    7. 2700054Domain d1yaru_: 1yar U: [144621]
      Other proteins in same PDB: d1yara_, d1yarb_, d1yarc_, d1yard_, d1yare_, d1yarf_, d1yarg_, d1yarh_, d1yari_, d1yarj_, d1yark_, d1yarl_, d1yarm_, d1yarn_
      automated match to d1ya7o1
      complexed with gol, so4; mutant
  3. Domain(s) for 1yau:
    1. 2700061Domain d1yauo_: 1yau O: [144622]
      Other proteins in same PDB: d1yaua_, d1yaub_, d1yauc_, d1yaud_, d1yaue_, d1yauf_, d1yaug_, d1yauh_, d1yaui_, d1yauj_, d1yauk_, d1yaul_, d1yaum_, d1yaun_
      automated match to d1ya7o1
      complexed with gol, so4
    2. 2700062Domain d1yaup_: 1yau P: [144623]
      Other proteins in same PDB: d1yaua_, d1yaub_, d1yauc_, d1yaud_, d1yaue_, d1yauf_, d1yaug_, d1yauh_, d1yaui_, d1yauj_, d1yauk_, d1yaul_, d1yaum_, d1yaun_
      automated match to d1ya7o1
      complexed with gol, so4
    3. 2700063Domain d1yauq_: 1yau Q: [144624]
      Other proteins in same PDB: d1yaua_, d1yaub_, d1yauc_, d1yaud_, d1yaue_, d1yauf_, d1yaug_, d1yauh_, d1yaui_, d1yauj_, d1yauk_, d1yaul_, d1yaum_, d1yaun_
      automated match to d1ya7o1
      complexed with gol, so4
    4. 2700064Domain d1yaur_: 1yau R: [144625]
      Other proteins in same PDB: d1yaua_, d1yaub_, d1yauc_, d1yaud_, d1yaue_, d1yauf_, d1yaug_, d1yauh_, d1yaui_, d1yauj_, d1yauk_, d1yaul_, d1yaum_, d1yaun_
      automated match to d1ya7o1
      complexed with gol, so4
    5. 2700065Domain d1yaus_: 1yau S: [144626]
      Other proteins in same PDB: d1yaua_, d1yaub_, d1yauc_, d1yaud_, d1yaue_, d1yauf_, d1yaug_, d1yauh_, d1yaui_, d1yauj_, d1yauk_, d1yaul_, d1yaum_, d1yaun_
      automated match to d1ya7o1
      complexed with gol, so4
    6. 2700066Domain d1yaut_: 1yau T: [144627]
      Other proteins in same PDB: d1yaua_, d1yaub_, d1yauc_, d1yaud_, d1yaue_, d1yauf_, d1yaug_, d1yauh_, d1yaui_, d1yauj_, d1yauk_, d1yaul_, d1yaum_, d1yaun_
      automated match to d1ya7o1
      complexed with gol, so4
    7. 2700067Domain d1yauu_: 1yau U: [144628]
      Other proteins in same PDB: d1yaua_, d1yaub_, d1yauc_, d1yaud_, d1yaue_, d1yauf_, d1yaug_, d1yauh_, d1yaui_, d1yauj_, d1yauk_, d1yaul_, d1yaum_, d1yaun_
      automated match to d1ya7o1
      complexed with gol, so4
  4. Domain(s) for 3jrm:
    1. 2700082Domain d3jrmo_: 3jrm O: [178738]
      Other proteins in same PDB: d3jrma_, d3jrmb_, d3jrmc_, d3jrmd_, d3jrme_, d3jrmf_, d3jrmg_, d3jrmh_, d3jrmi_, d3jrmj_, d3jrmk_, d3jrml_, d3jrmm_, d3jrmn_
      automated match to d1ya7o1
    2. 2700083Domain d3jrmp_: 3jrm P: [178739]
      Other proteins in same PDB: d3jrma_, d3jrmb_, d3jrmc_, d3jrmd_, d3jrme_, d3jrmf_, d3jrmg_, d3jrmh_, d3jrmi_, d3jrmj_, d3jrmk_, d3jrml_, d3jrmm_, d3jrmn_
      automated match to d1ya7o1
    3. 2700084Domain d3jrmq_: 3jrm Q: [178740]
      Other proteins in same PDB: d3jrma_, d3jrmb_, d3jrmc_, d3jrmd_, d3jrme_, d3jrmf_, d3jrmg_, d3jrmh_, d3jrmi_, d3jrmj_, d3jrmk_, d3jrml_, d3jrmm_, d3jrmn_
      automated match to d1ya7o1
    4. 2700085Domain d3jrmr_: 3jrm R: [178741]
      Other proteins in same PDB: d3jrma_, d3jrmb_, d3jrmc_, d3jrmd_, d3jrme_, d3jrmf_, d3jrmg_, d3jrmh_, d3jrmi_, d3jrmj_, d3jrmk_, d3jrml_, d3jrmm_, d3jrmn_
      automated match to d1ya7o1
    5. 2700086Domain d3jrms_: 3jrm S: [178742]
      Other proteins in same PDB: d3jrma_, d3jrmb_, d3jrmc_, d3jrmd_, d3jrme_, d3jrmf_, d3jrmg_, d3jrmh_, d3jrmi_, d3jrmj_, d3jrmk_, d3jrml_, d3jrmm_, d3jrmn_
      automated match to d1ya7o1
    6. 2700087Domain d3jrmt_: 3jrm T: [178743]
      Other proteins in same PDB: d3jrma_, d3jrmb_, d3jrmc_, d3jrmd_, d3jrme_, d3jrmf_, d3jrmg_, d3jrmh_, d3jrmi_, d3jrmj_, d3jrmk_, d3jrml_, d3jrmm_, d3jrmn_
      automated match to d1ya7o1
    7. 2700088Domain d3jrmu_: 3jrm U: [178744]
      Other proteins in same PDB: d3jrma_, d3jrmb_, d3jrmc_, d3jrmd_, d3jrme_, d3jrmf_, d3jrmg_, d3jrmh_, d3jrmi_, d3jrmj_, d3jrmk_, d3jrml_, d3jrmm_, d3jrmn_
      automated match to d1ya7o1
  5. Domain(s) for 3jse:
    1. 2700089Domain d3jseo_: 3jse O: [178772]
      Other proteins in same PDB: d3jsea_, d3jseb_, d3jsec_, d3jsed_, d3jsee_, d3jsef_, d3jseg_, d3jseh_, d3jsei_, d3jsej_, d3jsek_, d3jsel_, d3jsem_, d3jsen_
      automated match to d1ya7o1
    2. 2700090Domain d3jsep_: 3jse P: [178773]
      Other proteins in same PDB: d3jsea_, d3jseb_, d3jsec_, d3jsed_, d3jsee_, d3jsef_, d3jseg_, d3jseh_, d3jsei_, d3jsej_, d3jsek_, d3jsel_, d3jsem_, d3jsen_
      automated match to d1ya7o1
    3. 2700091Domain d3jseq_: 3jse Q: [178774]
      Other proteins in same PDB: d3jsea_, d3jseb_, d3jsec_, d3jsed_, d3jsee_, d3jsef_, d3jseg_, d3jseh_, d3jsei_, d3jsej_, d3jsek_, d3jsel_, d3jsem_, d3jsen_
      automated match to d1ya7o1
    4. 2700092Domain d3jser_: 3jse R: [178775]
      Other proteins in same PDB: d3jsea_, d3jseb_, d3jsec_, d3jsed_, d3jsee_, d3jsef_, d3jseg_, d3jseh_, d3jsei_, d3jsej_, d3jsek_, d3jsel_, d3jsem_, d3jsen_
      automated match to d1ya7o1
    5. 2700093Domain d3jses_: 3jse S: [178776]
      Other proteins in same PDB: d3jsea_, d3jseb_, d3jsec_, d3jsed_, d3jsee_, d3jsef_, d3jseg_, d3jseh_, d3jsei_, d3jsej_, d3jsek_, d3jsel_, d3jsem_, d3jsen_
      automated match to d1ya7o1
    6. 2700094Domain d3jset_: 3jse T: [178777]
      Other proteins in same PDB: d3jsea_, d3jseb_, d3jsec_, d3jsed_, d3jsee_, d3jsef_, d3jseg_, d3jseh_, d3jsei_, d3jsej_, d3jsek_, d3jsel_, d3jsem_, d3jsen_
      automated match to d1ya7o1
    7. 2700095Domain d3jseu_: 3jse U: [178778]
      Other proteins in same PDB: d3jsea_, d3jseb_, d3jsec_, d3jsed_, d3jsee_, d3jsef_, d3jseg_, d3jseh_, d3jsei_, d3jsej_, d3jsek_, d3jsel_, d3jsem_, d3jsen_
      automated match to d1ya7o1
  6. Domain(s) for 6utj:
    1. 2700068Domain d6utjo1: 6utj O:4-223 [392447]
      Other proteins in same PDB: d6utj1_, d6utj2_, d6utja_, d6utjb_, d6utjc_, d6utjd_, d6utje_, d6utjf_, d6utjg_, d6utjh_, d6utji_, d6utjj_, d6utjk_, d6utjl_, d6utjm_, d6utjn_, d6utjo2, d6utjp2, d6utjq2, d6utjr2, d6utjs2, d6utjt2, d6utju2, d6utjv_, d6utjw_, d6utjx_, d6utjy_, d6utjz_
      automated match to d3jrmo_
    2. 2700069Domain d6utjp1: 6utj P:4-223 [392534]
      Other proteins in same PDB: d6utj1_, d6utj2_, d6utja_, d6utjb_, d6utjc_, d6utjd_, d6utje_, d6utjf_, d6utjg_, d6utjh_, d6utji_, d6utjj_, d6utjk_, d6utjl_, d6utjm_, d6utjn_, d6utjo2, d6utjp2, d6utjq2, d6utjr2, d6utjs2, d6utjt2, d6utju2, d6utjv_, d6utjw_, d6utjx_, d6utjy_, d6utjz_
      automated match to d3jrmo_
    3. 2700070Domain d6utjq1: 6utj Q:4-223 [392532]
      Other proteins in same PDB: d6utj1_, d6utj2_, d6utja_, d6utjb_, d6utjc_, d6utjd_, d6utje_, d6utjf_, d6utjg_, d6utjh_, d6utji_, d6utjj_, d6utjk_, d6utjl_, d6utjm_, d6utjn_, d6utjo2, d6utjp2, d6utjq2, d6utjr2, d6utjs2, d6utjt2, d6utju2, d6utjv_, d6utjw_, d6utjx_, d6utjy_, d6utjz_
      automated match to d3jrmo_
    4. 2700071Domain d6utjr1: 6utj R:4-223 [392500]
      Other proteins in same PDB: d6utj1_, d6utj2_, d6utja_, d6utjb_, d6utjc_, d6utjd_, d6utje_, d6utjf_, d6utjg_, d6utjh_, d6utji_, d6utjj_, d6utjk_, d6utjl_, d6utjm_, d6utjn_, d6utjo2, d6utjp2, d6utjq2, d6utjr2, d6utjs2, d6utjt2, d6utju2, d6utjv_, d6utjw_, d6utjx_, d6utjy_, d6utjz_
      automated match to d3jrmo_
    5. 2700072Domain d6utjs1: 6utj S:4-223 [392396]
      Other proteins in same PDB: d6utj1_, d6utj2_, d6utja_, d6utjb_, d6utjc_, d6utjd_, d6utje_, d6utjf_, d6utjg_, d6utjh_, d6utji_, d6utjj_, d6utjk_, d6utjl_, d6utjm_, d6utjn_, d6utjo2, d6utjp2, d6utjq2, d6utjr2, d6utjs2, d6utjt2, d6utju2, d6utjv_, d6utjw_, d6utjx_, d6utjy_, d6utjz_
      automated match to d3jrmo_
    6. 2700073Domain d6utjt1: 6utj T:4-223 [392703]
      Other proteins in same PDB: d6utj1_, d6utj2_, d6utja_, d6utjb_, d6utjc_, d6utjd_, d6utje_, d6utjf_, d6utjg_, d6utjh_, d6utji_, d6utjj_, d6utjk_, d6utjl_, d6utjm_, d6utjn_, d6utjo2, d6utjp2, d6utjq2, d6utjr2, d6utjs2, d6utjt2, d6utju2, d6utjv_, d6utjw_, d6utjx_, d6utjy_, d6utjz_
      automated match to d3jrmo_
    7. 2700074Domain d6utju1: 6utj U:4-223 [392376]
      Other proteins in same PDB: d6utj1_, d6utj2_, d6utja_, d6utjb_, d6utjc_, d6utjd_, d6utje_, d6utjf_, d6utjg_, d6utjh_, d6utji_, d6utjj_, d6utjk_, d6utjl_, d6utjm_, d6utjn_, d6utjo2, d6utjp2, d6utjq2, d6utjr2, d6utjs2, d6utjt2, d6utju2, d6utjv_, d6utjw_, d6utjx_, d6utjy_, d6utjz_
      automated match to d3jrmo_
  7. Domain(s) for 6xmj:
    1. 2700075Domain d6xmjo1: 6xmj O:4-226 [393388]
      Other proteins in same PDB: d6xmja_, d6xmjb_, d6xmjc_, d6xmje_, d6xmjf_, d6xmjg_, d6xmjh_, d6xmji_, d6xmjj_, d6xmjk_, d6xmjl_, d6xmjm_, d6xmjn_, d6xmjo2, d6xmjp2, d6xmjq2, d6xmjr2, d6xmjs2, d6xmjt2, d6xmju2
      automated match to d3jrmo_
    2. 2700076Domain d6xmjp1: 6xmj P:4-226 [393358]
      Other proteins in same PDB: d6xmja_, d6xmjb_, d6xmjc_, d6xmje_, d6xmjf_, d6xmjg_, d6xmjh_, d6xmji_, d6xmjj_, d6xmjk_, d6xmjl_, d6xmjm_, d6xmjn_, d6xmjo2, d6xmjp2, d6xmjq2, d6xmjr2, d6xmjs2, d6xmjt2, d6xmju2
      automated match to d3jrmo_
    3. 2700077Domain d6xmjq1: 6xmj Q:4-226 [393328]
      Other proteins in same PDB: d6xmja_, d6xmjb_, d6xmjc_, d6xmje_, d6xmjf_, d6xmjg_, d6xmjh_, d6xmji_, d6xmjj_, d6xmjk_, d6xmjl_, d6xmjm_, d6xmjn_, d6xmjo2, d6xmjp2, d6xmjq2, d6xmjr2, d6xmjs2, d6xmjt2, d6xmju2
      automated match to d3jrmo_
    4. 2700078Domain d6xmjr1: 6xmj R:4-226 [393368]
      Other proteins in same PDB: d6xmja_, d6xmjb_, d6xmjc_, d6xmje_, d6xmjf_, d6xmjg_, d6xmjh_, d6xmji_, d6xmjj_, d6xmjk_, d6xmjl_, d6xmjm_, d6xmjn_, d6xmjo2, d6xmjp2, d6xmjq2, d6xmjr2, d6xmjs2, d6xmjt2, d6xmju2
      automated match to d3jrmo_
    5. 2700079Domain d6xmjs1: 6xmj S:4-226 [393381]
      Other proteins in same PDB: d6xmja_, d6xmjb_, d6xmjc_, d6xmje_, d6xmjf_, d6xmjg_, d6xmjh_, d6xmji_, d6xmjj_, d6xmjk_, d6xmjl_, d6xmjm_, d6xmjn_, d6xmjo2, d6xmjp2, d6xmjq2, d6xmjr2, d6xmjs2, d6xmjt2, d6xmju2
      automated match to d3jrmo_
    6. 2700080Domain d6xmjt1: 6xmj T:4-226 [393360]
      Other proteins in same PDB: d6xmja_, d6xmjb_, d6xmjc_, d6xmje_, d6xmjf_, d6xmjg_, d6xmjh_, d6xmji_, d6xmjj_, d6xmjk_, d6xmjl_, d6xmjm_, d6xmjn_, d6xmjo2, d6xmjp2, d6xmjq2, d6xmjr2, d6xmjs2, d6xmjt2, d6xmju2
      automated match to d3jrmo_
    7. 2700081Domain d6xmju1: 6xmj U:4-226 [393556]
      Other proteins in same PDB: d6xmja_, d6xmjb_, d6xmjc_, d6xmje_, d6xmjf_, d6xmjg_, d6xmjh_, d6xmji_, d6xmjj_, d6xmjk_, d6xmjl_, d6xmjm_, d6xmjn_, d6xmjo2, d6xmjp2, d6xmjq2, d6xmjr2, d6xmjs2, d6xmjt2, d6xmju2
      automated match to d3jrmo_

More info for Species Trypanosome (Trypanosoma brucei) [TaxId:5691] from a.24.8.1 automated matches

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