SCOP 1.75: Protein: Fibrinogen C-terminal domains

Lineage for Protein: Fibrinogen C-terminal domains

Root: SCOP 1.75
Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (376 folds)
Fold d.171: Fibrinogen C-terminal domain-like [56495] (1 superfamily)
unusual fold
Superfamily d.171.1: Fibrinogen C-terminal domain-like [56496] (1 family)
Family d.171.1.1: Fibrinogen C-terminal domain-like [56497] (2 proteins)
Protein Fibrinogen C-terminal domains [56498] (7 species)

Species:

Chicken (Gallus gallus), beta [TaxId:9031] [69860] (1 PDB entry)
- Domains for 1m1j:
  1. Domain d1m1jb1: 1m1j B:200-464 [74370]
    Other proteins in same PDB: d1m1ja_, d1m1jb2, d1m1jc2, d1m1jd_, d1m1je2, d1m1jf2
  2. Domain d1m1je1: 1m1j E:200-463 [74375]
    Other proteins in same PDB: d1m1ja_, d1m1jb2, d1m1jc2, d1m1jd_, d1m1je2, d1m1jf2
    complexed with ca, nag
Chicken (Gallus gallus), gamma [TaxId:9031] [69859] (1 PDB entry)
- Domains for 1m1j:
  1. Domain d1m1jc1: 1m1j C:142-393 [74372]
    Other proteins in same PDB: d1m1ja_, d1m1jb2, d1m1jc2, d1m1jd_, d1m1je2, d1m1jf2
  2. Domain d1m1jf1: 1m1j F:142-393 [74377]
    Other proteins in same PDB: d1m1ja_, d1m1jb2, d1m1jc2, d1m1jd_, d1m1je2, d1m1jf2
    complexed with ca, nag
Human (Homo sapiens), beta [TaxId:9606] [68903] (14 PDB entries)
Uniprot P02675
1. Domains for 1fza:
  1. Domain d1fzab1: 1fza B:200-460 [42480]
    Other proteins in same PDB: d1fzaa_, d1fzab2, d1fzac2, d1fzad_, d1fzae2, d1fzaf2
  2. Domain d1fzae1: 1fza E:200-460 [42482]
    Other proteins in same PDB: d1fzaa_, d1fzab2, d1fzac2, d1fzad_, d1fzae2, d1fzaf2
    complexed with ca, nag
2. Domains for 1fzb:
  1. Domain d1fzbb1: 1fzb B:200-459 [42472]
    Other proteins in same PDB: d1fzba_, d1fzbb2, d1fzbc2, d1fzbd_, d1fzbe2, d1fzbf2
  2. Domain d1fzbe1: 1fzb E:200-459 [42474]
    Other proteins in same PDB: d1fzba_, d1fzbb2, d1fzbc2, d1fzbd_, d1fzbe2, d1fzbf2
    complexed with ca, nag
3. Domains for 1fzc:
  1. Domain d1fzcb1: 1fzc B:200-458 [42460]
    Other proteins in same PDB: d1fzca_, d1fzcb2, d1fzcc2, d1fzcd_, d1fzce2, d1fzcf2
  2. Domain d1fzce1: 1fzc E:200-458 [42462]
    Other proteins in same PDB: d1fzca_, d1fzcb2, d1fzcc2, d1fzcd_, d1fzce2, d1fzcf2
    complexed with ca, man, nag
4. Domains for 1fze:
  1. Domain d1fzeb1: 1fze B:200-459 [42476]
    Other proteins in same PDB: d1fzea_, d1fzeb2, d1fzec2, d1fzed_, d1fzee2, d1fzef2
  2. Domain d1fzee1: 1fze E:200-458 [42478]
    Other proteins in same PDB: d1fzea_, d1fzeb2, d1fzec2, d1fzed_, d1fzee2, d1fzef2
    complexed with ca, nag
5. Domains for 1fzf:
  1. Domain d1fzfb1: 1fzf B:200-459 [42464]
    Other proteins in same PDB: d1fzfa_, d1fzfb2, d1fzfc2, d1fzfd_, d1fzfe2, d1fzff2
  2. Domain d1fzfe1: 1fzf E:200-459 [42466]
    Other proteins in same PDB: d1fzfa_, d1fzfb2, d1fzfc2, d1fzfd_, d1fzfe2, d1fzff2
    complexed with ca, nag
6. Domains for 1fzg:
  1. Domain d1fzgb1: 1fzg B:200-459 [42468]
    Other proteins in same PDB: d1fzga_, d1fzgb2, d1fzgc2, d1fzgd_, d1fzge2, d1fzgf2
  2. Domain d1fzge1: 1fzg E:200-459 [42470]
    Other proteins in same PDB: d1fzga_, d1fzgb2, d1fzgc2, d1fzgd_, d1fzge2, d1fzgf2
    complexed with ca, nag
7. Domains for 1lt9:
  1. Domain d1lt9b1: 1lt9 B:200-458 [78189]
    Other proteins in same PDB: d1lt9a_, d1lt9b2, d1lt9c2, d1lt9d_, d1lt9e2, d1lt9f2
  2. Domain d1lt9e1: 1lt9 E:200-458 [78194]
    Other proteins in same PDB: d1lt9a_, d1lt9b2, d1lt9c2, d1lt9d_, d1lt9e2, d1lt9f2
    complexed with ca, nag
8. Domains for 1ltj:
  1. Domain d1ltjb1: 1ltj B:200-458 [78199]
    Other proteins in same PDB: d1ltja_, d1ltjb2, d1ltjc2, d1ltjd_, d1ltje2, d1ltjf2
  2. Domain d1ltje1: 1ltj E:200-458 [78204]
    Other proteins in same PDB: d1ltja_, d1ltjb2, d1ltjc2, d1ltjd_, d1ltje2, d1ltjf2
    complexed with ca, fuc, nag
9. Domains for 1n86:
  1. Domain d1n86b1: 1n86 B:200-457 [80278]
    Other proteins in same PDB: d1n86a_, d1n86b2, d1n86c2, d1n86d_, d1n86e2, d1n86f2
  2. Domain d1n86e1: 1n86 E:200-457 [80283]
    Other proteins in same PDB: d1n86a_, d1n86b2, d1n86c2, d1n86d_, d1n86e2, d1n86f2
    complexed with ca, man, nag
10. Domains for 1n8e:
  1. Domain d1n8eb1: 1n8e B:200-457 [80288]
    Other proteins in same PDB: d1n8ea_, d1n8eb2, d1n8ec2, d1n8ed_, d1n8ee2, d1n8ef2
  2. Domain d1n8ee1: 1n8e E:200-457 [80293]
    Other proteins in same PDB: d1n8ea_, d1n8eb2, d1n8ec2, d1n8ed_, d1n8ee2, d1n8ef2
11. Domains for 1re3:
  1. Domain d1re3b1: 1re3 B:200-458 [104892]
    Other proteins in same PDB: d1re3a_, d1re3b2, d1re3c2, d1re3d_, d1re3e2, d1re3f2
  2. Domain d1re3e1: 1re3 E:200-458 [104897]
    Other proteins in same PDB: d1re3a_, d1re3b2, d1re3c2, d1re3d_, d1re3e2, d1re3f2
    complexed with ca, nag; mutant
12. Domains for 1re4:
  1. Domain d1re4b1: 1re4 B:200-458 [104902]
    Other proteins in same PDB: d1re4a_, d1re4b2, d1re4c2, d1re4d_, d1re4e2, d1re4f2
  2. Domain d1re4e1: 1re4 E:200-458 [104907]
    Other proteins in same PDB: d1re4a_, d1re4b2, d1re4c2, d1re4d_, d1re4e2, d1re4f2
    complexed with ca, nag; mutant
13. Domains for 1rf0:
  1. Domain d1rf0b1: 1rf0 B:200-459 [97339]
    Other proteins in same PDB: d1rf0a_, d1rf0b2, d1rf0c2, d1rf0d_, d1rf0e2, d1rf0f2
  2. Domain d1rf0e1: 1rf0 E:200-459 [97344]
    Other proteins in same PDB: d1rf0a_, d1rf0b2, d1rf0c2, d1rf0d_, d1rf0e2, d1rf0f2
    complexed with ca, nag; mutant
14. Domains for 1rf1:
  1. Domain d1rf1b1: 1rf1 B:200-459 [97349]
    Other proteins in same PDB: d1rf1a_, d1rf1b2, d1rf1c2, d1rf1d_, d1rf1e2, d1rf1f2
  2. Domain d1rf1e1: 1rf1 E:200-459 [97354]
    Other proteins in same PDB: d1rf1a_, d1rf1b2, d1rf1c2, d1rf1d_, d1rf1e2, d1rf1f2
    complexed with ca, fuc, nag; mutant
Human (Homo sapiens), fibrinogen-420, alpha-E [TaxId:9606] [56500] (1 PDB entry)
- Domains for 1fzd:
  1. Domain d1fzda_: 1fzd A: [42484]
  2. Domain d1fzdb_: 1fzd B: [42485]
  3. Domain d1fzdc_: 1fzd C: [42486]
  4. Domain d1fzdd_: 1fzd D: [42487]
  5. Domain d1fzde_: 1fzd E: [42488]
  6. Domain d1fzdf_: 1fzd F: [42489]
  7. Domain d1fzdg_: 1fzd G: [42490]
  8. Domain d1fzdh_: 1fzd H: [42491]
    complexed with ca, man, nag
Human (Homo sapiens), gamma [TaxId:9606] [68904] (21 PDB entries)
Uniprot P02679
1. Domain for 1fib:
  - Domain d1fiba_: 1fib A: [42456]
    CASP2
    complexed with ca
2. Domains for 1fic:
  1. Domain d1fica_: 1fic A: [42458]
  2. Domain d1ficb_: 1fic B: [42459]
    complexed with ca
3. Domain for 1fid:
  - Domain d1fida_: 1fid A: [42454]
    complexed with ca
4. Domains for 1fza:
  1. Domain d1fzac1: 1fza C:142-396 [42481]
    Other proteins in same PDB: d1fzaa_, d1fzab2, d1fzac2, d1fzad_, d1fzae2, d1fzaf2
  2. Domain d1fzaf1: 1fza F:142-396 [42483]
    Other proteins in same PDB: d1fzaa_, d1fzab2, d1fzac2, d1fzad_, d1fzae2, d1fzaf2
    complexed with ca, nag
5. Domains for 1fzb:
  1. Domain d1fzbc1: 1fzb C:142-396 [42473]
    Other proteins in same PDB: d1fzba_, d1fzbb2, d1fzbc2, d1fzbd_, d1fzbe2, d1fzbf2
  2. Domain d1fzbf1: 1fzb F:142-398 [42475]
    Other proteins in same PDB: d1fzba_, d1fzbb2, d1fzbc2, d1fzbd_, d1fzbe2, d1fzbf2
    complexed with ca, nag
6. Domains for 1fzc:
  1. Domain d1fzcc1: 1fzc C:142-397 [42461]
    Other proteins in same PDB: d1fzca_, d1fzcb2, d1fzcc2, d1fzcd_, d1fzce2, d1fzcf2
  2. Domain d1fzcf1: 1fzc F:142-397 [42463]
    Other proteins in same PDB: d1fzca_, d1fzcb2, d1fzcc2, d1fzcd_, d1fzce2, d1fzcf2
    complexed with ca, man, nag
7. Domains for 1fze:
  1. Domain d1fzec1: 1fze C:142-394 [42477]
    Other proteins in same PDB: d1fzea_, d1fzeb2, d1fzec2, d1fzed_, d1fzee2, d1fzef2
  2. Domain d1fzef1: 1fze F:142-393 [42479]
    Other proteins in same PDB: d1fzea_, d1fzeb2, d1fzec2, d1fzed_, d1fzee2, d1fzef2
    complexed with ca, nag
8. Domains for 1fzf:
  1. Domain d1fzfc1: 1fzf C:142-393 [42465]
    Other proteins in same PDB: d1fzfa_, d1fzfb2, d1fzfc2, d1fzfd_, d1fzfe2, d1fzff2
  2. Domain d1fzff1: 1fzf F:142-393 [42467]
    Other proteins in same PDB: d1fzfa_, d1fzfb2, d1fzfc2, d1fzfd_, d1fzfe2, d1fzff2
    complexed with ca, nag
9. Domains for 1fzg:
  1. Domain d1fzgc1: 1fzg C:142-393 [42469]
    Other proteins in same PDB: d1fzga_, d1fzgb2, d1fzgc2, d1fzgd_, d1fzge2, d1fzgf2
  2. Domain d1fzgf1: 1fzg F:142-393 [42471]
    Other proteins in same PDB: d1fzga_, d1fzgb2, d1fzgc2, d1fzgd_, d1fzge2, d1fzgf2
    complexed with ca, nag
10. Domains for 1lt9:
  1. Domain d1lt9c1: 1lt9 C:142-394 [78191]
    Other proteins in same PDB: d1lt9a_, d1lt9b2, d1lt9c2, d1lt9d_, d1lt9e2, d1lt9f2
  2. Domain d1lt9f1: 1lt9 F:142-394 [78196]
    Other proteins in same PDB: d1lt9a_, d1lt9b2, d1lt9c2, d1lt9d_, d1lt9e2, d1lt9f2
    complexed with ca, nag
11. Domains for 1ltj:
  1. Domain d1ltjc1: 1ltj C:142-394 [78201]
    Other proteins in same PDB: d1ltja_, d1ltjb2, d1ltjc2, d1ltjd_, d1ltje2, d1ltjf2
  2. Domain d1ltjf1: 1ltj F:142-394 [78206]
    Other proteins in same PDB: d1ltja_, d1ltjb2, d1ltjc2, d1ltjd_, d1ltje2, d1ltjf2
    complexed with ca, fuc, nag
12. Domains for 1n86:
  1. Domain d1n86c1: 1n86 C:142-391 [80280]
    Other proteins in same PDB: d1n86a_, d1n86b2, d1n86c2, d1n86d_, d1n86e2, d1n86f2
  2. Domain d1n86f1: 1n86 F:142-391 [80285]
    Other proteins in same PDB: d1n86a_, d1n86b2, d1n86c2, d1n86d_, d1n86e2, d1n86f2
    complexed with ca, man, nag
13. Domains for 1n8e:
  1. Domain d1n8ec1: 1n8e C:142-391 [80290]
    Other proteins in same PDB: d1n8ea_, d1n8eb2, d1n8ec2, d1n8ed_, d1n8ee2, d1n8ef2
  2. Domain d1n8ef1: 1n8e F:142-391 [80295]
    Other proteins in same PDB: d1n8ea_, d1n8eb2, d1n8ec2, d1n8ed_, d1n8ee2, d1n8ef2
14. Domains for 1re3:
  1. Domain d1re3c1: 1re3 C:142-393 [104894]
    Other proteins in same PDB: d1re3a_, d1re3b2, d1re3c2, d1re3d_, d1re3e2, d1re3f2
  2. Domain d1re3f1: 1re3 F:142-393 [104899]
    Other proteins in same PDB: d1re3a_, d1re3b2, d1re3c2, d1re3d_, d1re3e2, d1re3f2
    complexed with ca, nag; mutant
15. Domains for 1re4:
  1. Domain d1re4c1: 1re4 C:142-393 [104904]
    Other proteins in same PDB: d1re4a_, d1re4b2, d1re4c2, d1re4d_, d1re4e2, d1re4f2
  2. Domain d1re4f1: 1re4 F:142-393 [104909]
    Other proteins in same PDB: d1re4a_, d1re4b2, d1re4c2, d1re4d_, d1re4e2, d1re4f2
    complexed with ca, nag; mutant
16. Domains for 1rf0:
  1. Domain d1rf0c1: 1rf0 C:142-393 [97341]
    Other proteins in same PDB: d1rf0a_, d1rf0b2, d1rf0c2, d1rf0d_, d1rf0e2, d1rf0f2
  2. Domain d1rf0f1: 1rf0 F:142-394 [97346]
    Other proteins in same PDB: d1rf0a_, d1rf0b2, d1rf0c2, d1rf0d_, d1rf0e2, d1rf0f2
    complexed with ca, nag; mutant
17. Domains for 1rf1:
  1. Domain d1rf1c1: 1rf1 C:142-393 [97351]
    Other proteins in same PDB: d1rf1a_, d1rf1b2, d1rf1c2, d1rf1d_, d1rf1e2, d1rf1f2
  2. Domain d1rf1f1: 1rf1 F:142-393 [97356]
    Other proteins in same PDB: d1rf1a_, d1rf1b2, d1rf1c2, d1rf1d_, d1rf1e2, d1rf1f2
    complexed with ca, fuc, nag; mutant
18. Domain for 2fib:
  - Domain d2fiba_: 2fib A: [42457]
    complexed with ca
19. Domain for 2oyh:
  - Domain d2oyhc1: 2oyh C:142-394 [145738]
    Other proteins in same PDB: d2oyha1, d2oyhc2, d2oyhd1
    complexed with ca, fuc, nag; mutant
20. Domain for 2oyi:
  - Domain d2oyic1: 2oyi C:142-394 [145740]
    Other proteins in same PDB: d2oyia1, d2oyic2, d2oyid1
    automatically matched to 2OYH C:142-394
    complexed with ca, fuc, nag; mutant
21. Domain for 3fib:
  - Domain d3fiba_: 3fib A: [42455]
    complexed with ca

Sea lamprey (Petromyzon marinus), beta [TaxId:7757] [75588] (2 PDB entries)

Domains for 1lwu:

Domain d1lwub1: 1lwu B:219-477 [74310]
Other proteins in same PDB: d1lwua_, d1lwub2, d1lwuc2, d1lwud_, d1lwue2, d1lwuf2, d1lwug_, d1lwuh2, d1lwui2, d1lwuj_, d1lwuk2, d1lwul2
Domain d1lwue1: 1lwu E:219-477 [74315]
Other proteins in same PDB: d1lwua_, d1lwub2, d1lwuc2, d1lwud_, d1lwue2, d1lwuf2, d1lwug_, d1lwuh2, d1lwui2, d1lwuj_, d1lwuk2, d1lwul2
Domain d1lwuh1: 1lwu H:219-477 [74320]
Other proteins in same PDB: d1lwua_, d1lwub2, d1lwuc2, d1lwud_, d1lwue2, d1lwuf2, d1lwug_, d1lwuh2, d1lwui2, d1lwuj_, d1lwuk2, d1lwul2

Domain d1lwuk1: 1lwu K:219-477 [74325]
Other proteins in same PDB: d1lwua_, d1lwub2, d1lwuc2, d1lwud_, d1lwue2, d1lwuf2, d1lwug_, d1lwuh2, d1lwui2, d1lwuj_, d1lwuk2, d1lwul2
complexed with ca, gal, man, nag, nh2

Domains for 1n73:
1. Domain d1n73b1: 1n73 B:219-477 [80215]
  Other proteins in same PDB: d1n73a_, d1n73b2, d1n73c2, d1n73d_, d1n73e2, d1n73f2
2. Domain d1n73e1: 1n73 E:219-477 [80220]
  Other proteins in same PDB: d1n73a_, d1n73b2, d1n73c2, d1n73d_, d1n73e2, d1n73f2
  complexed with ca, nag

Sea lamprey (Petromyzon marinus), gamma [TaxId:7757] [75589] (2 PDB entries)

Domains for 1lwu:

Domain d1lwuc1: 1lwu C:138-399 [74312]
Other proteins in same PDB: d1lwua_, d1lwub2, d1lwuc2, d1lwud_, d1lwue2, d1lwuf2, d1lwug_, d1lwuh2, d1lwui2, d1lwuj_, d1lwuk2, d1lwul2
Domain d1lwuf1: 1lwu F:138-399 [74317]
Other proteins in same PDB: d1lwua_, d1lwub2, d1lwuc2, d1lwud_, d1lwue2, d1lwuf2, d1lwug_, d1lwuh2, d1lwui2, d1lwuj_, d1lwuk2, d1lwul2
Domain d1lwui1: 1lwu I:138-395 [74322]
Other proteins in same PDB: d1lwua_, d1lwub2, d1lwuc2, d1lwud_, d1lwue2, d1lwuf2, d1lwug_, d1lwuh2, d1lwui2, d1lwuj_, d1lwuk2, d1lwul2

Domain d1lwul1: 1lwu L:138-395 [74327]
Other proteins in same PDB: d1lwua_, d1lwub2, d1lwuc2, d1lwud_, d1lwue2, d1lwuf2, d1lwug_, d1lwuh2, d1lwui2, d1lwuj_, d1lwuk2, d1lwul2
complexed with ca, gal, man, nag, nh2

Domains for 1n73:
1. Domain d1n73c1: 1n73 C:138-404 [80217]
  Other proteins in same PDB: d1n73a_, d1n73b2, d1n73c2, d1n73d_, d1n73e2, d1n73f2
2. Domain d1n73f1: 1n73 F:138-404 [80222]
  Other proteins in same PDB: d1n73a_, d1n73b2, d1n73c2, d1n73d_, d1n73e2, d1n73f2
  complexed with ca, nag

More info for Protein Fibrinogen C-terminal domains from d.171.1.1: Fibrinogen C-terminal domain-like

Timeline for Protein Fibrinogen C-terminal domains from d.171.1.1: Fibrinogen C-terminal domain-like:

Protein Fibrinogen C-terminal domains from d.171.1.1: Fibrinogen C-terminal domain-like first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55, called Protein Fibrinogen C-terminal domains from d.171.1.1: Fibrinogen C-terminal domains
Protein Fibrinogen C-terminal domains from d.171.1.1: Fibrinogen C-terminal domain-like appears in SCOP 1.73
Protein Fibrinogen C-terminal domains from d.171.1.1: Fibrinogen C-terminal domain-like appears in SCOPe 2.01
Protein Fibrinogen C-terminal domains from d.171.1.1: Fibrinogen C-terminal domain-like appears in the current release, SCOPe 2.08