Lineage for Protein: automated matches

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 1976409Class a: All alpha proteins [46456] (289 folds)
  3. 2000915Fold a.56: CO dehydrogenase ISP C-domain like [47740] (1 superfamily)
    core: 4 helices, bundle
  4. 2000916Superfamily a.56.1: CO dehydrogenase ISP C-domain like [47741] (2 families) (S)
    contains 2Fe-2S cluster
  5. 2001023Family a.56.1.0: automated matches [227241] (1 protein)
    not a true family
  6. 2001024Protein automated matches [227007] (5 species)
    not a true protein

Species:

  1. 2001025Desulfovibrio gigas [TaxId:879] [311145] (1 PDB entry)
  2. 2001027Escherichia coli [TaxId:83333] [323304] (2 PDB entries)
    1. Domain for 5g5g:
    2. Domain for 5g5h:
  3. 2001030Eubacterium barkeri [TaxId:1528] [225696] (1 PDB entry)
  4. 2001033Rhodobacter capsulatus [TaxId:1061] [255636] (2 PDB entries)
    1. Domains for 2w3r:
      1. 2001038Domain d2w3ra2: 2w3r A:85-166 [238897]
        Other proteins in same PDB: d2w3ra1, d2w3ra3, d2w3ra4, d2w3rb1, d2w3rb2, d2w3rc1, d2w3rc3, d2w3rc4, d2w3rd1, d2w3rd2, d2w3re1, d2w3re3, d2w3re4, d2w3rf1, d2w3rf2, d2w3rg1, d2w3rg3, d2w3rg4, d2w3rh1, d2w3rh2
        automated match to d1jroa1
        complexed with ca, fad, fes, hpa, mom, mte
      2. 2001039Domain d2w3rc2: 2w3r C:85-166 [238901]
        Other proteins in same PDB: d2w3ra1, d2w3ra3, d2w3ra4, d2w3rb1, d2w3rb2, d2w3rc1, d2w3rc3, d2w3rc4, d2w3rd1, d2w3rd2, d2w3re1, d2w3re3, d2w3re4, d2w3rf1, d2w3rf2, d2w3rg1, d2w3rg3, d2w3rg4, d2w3rh1, d2w3rh2
        automated match to d1jroa1
        complexed with ca, fad, fes, hpa, mom, mte
      3. 2001040Domain d2w3re2: 2w3r E:85-166 [238905]
        Other proteins in same PDB: d2w3ra1, d2w3ra3, d2w3ra4, d2w3rb1, d2w3rb2, d2w3rc1, d2w3rc3, d2w3rc4, d2w3rd1, d2w3rd2, d2w3re1, d2w3re3, d2w3re4, d2w3rf1, d2w3rf2, d2w3rg1, d2w3rg3, d2w3rg4, d2w3rh1, d2w3rh2
        automated match to d1jroa1
        complexed with ca, fad, fes, hpa, mom, mte
      4. 2001041Domain d2w3rg2: 2w3r G:85-166 [238909]
        Other proteins in same PDB: d2w3ra1, d2w3ra3, d2w3ra4, d2w3rb1, d2w3rb2, d2w3rc1, d2w3rc3, d2w3rc4, d2w3rd1, d2w3rd2, d2w3re1, d2w3re3, d2w3re4, d2w3rf1, d2w3rf2, d2w3rg1, d2w3rg3, d2w3rg4, d2w3rh1, d2w3rh2
        automated match to d1jroa1
        complexed with ca, fad, fes, hpa, mom, mte
    2. Domains for 2w3s:
      1. 2001034Domain d2w3sa2: 2w3s A:85-166 [238913]
        Other proteins in same PDB: d2w3sa1, d2w3sa3, d2w3sa4, d2w3sb1, d2w3sb2, d2w3sc1, d2w3sc3, d2w3sc4, d2w3sd1, d2w3sd2, d2w3se1, d2w3se3, d2w3se4, d2w3sf1, d2w3sf2, d2w3sg1, d2w3sg3, d2w3sg4, d2w3sh1, d2w3sh2
        automated match to d1jroa1
        complexed with ca, fad, fes, mom, mte, xan
      2. 2001035Domain d2w3sc2: 2w3s C:85-166 [238917]
        Other proteins in same PDB: d2w3sa1, d2w3sa3, d2w3sa4, d2w3sb1, d2w3sb2, d2w3sc1, d2w3sc3, d2w3sc4, d2w3sd1, d2w3sd2, d2w3se1, d2w3se3, d2w3se4, d2w3sf1, d2w3sf2, d2w3sg1, d2w3sg3, d2w3sg4, d2w3sh1, d2w3sh2
        automated match to d1jroa1
        complexed with ca, fad, fes, mom, mte, xan
      3. 2001036Domain d2w3se2: 2w3s E:85-166 [238921]
        Other proteins in same PDB: d2w3sa1, d2w3sa3, d2w3sa4, d2w3sb1, d2w3sb2, d2w3sc1, d2w3sc3, d2w3sc4, d2w3sd1, d2w3sd2, d2w3se1, d2w3se3, d2w3se4, d2w3sf1, d2w3sf2, d2w3sg1, d2w3sg3, d2w3sg4, d2w3sh1, d2w3sh2
        automated match to d1jroa1
        complexed with ca, fad, fes, mom, mte, xan
      4. 2001037Domain d2w3sg2: 2w3s G:85-166 [238925]
        Other proteins in same PDB: d2w3sa1, d2w3sa3, d2w3sa4, d2w3sb1, d2w3sb2, d2w3sc1, d2w3sc3, d2w3sc4, d2w3sd1, d2w3sd2, d2w3se1, d2w3se3, d2w3se4, d2w3sf1, d2w3sf2, d2w3sg1, d2w3sg3, d2w3sg4, d2w3sh1, d2w3sh2
        automated match to d1jroa1
        complexed with ca, fad, fes, mom, mte, xan
  5. 2001042Sulfolobus tokodaii [TaxId:273063] [312380] (1 PDB entry)

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