Lineage for Protein: automated matches

  1. Root: SCOPe 2.08
  2. Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (396 folds)
  3. Fold d.79: Bacillus chorismate mutase-like [55297] (9 superfamilies)
    core: beta-alpha-beta-alpha-beta(2); mixed beta-sheet: order: 1423, strand 4 is antiparallel to the rest
  4. Superfamily d.79.7: OmpA-like [103088] (2 families) (S)
  5. Family d.79.7.1: OmpA-like [103089] (3 proteins)
    Pfam PF00691
  6. Protein automated matches [190318] (2 species)
    not a true protein

Species:

  1. Escherichia coli [TaxId:562] [187135] (2 PDB entries)
    1. Domains for 2hqs:
      1. Domain d2hqsc2: 2hqs C:68-173 [136666]
        Other proteins in same PDB: d2hqsa1, d2hqsa2, d2hqsa3, d2hqsb1, d2hqsb2, d2hqsb3, d2hqsc3, d2hqsd1, d2hqsd2, d2hqsd3, d2hqse3, d2hqsf1, d2hqsf2, d2hqsf3, d2hqsg3, d2hqsh3
        automated match to d1oapa_
        complexed with act, gol, so4
      2. Domain d2hqse2: 2hqs E:68-173 [136669]
        Other proteins in same PDB: d2hqsa1, d2hqsa2, d2hqsa3, d2hqsb1, d2hqsb2, d2hqsb3, d2hqsc3, d2hqsd1, d2hqsd2, d2hqsd3, d2hqse3, d2hqsf1, d2hqsf2, d2hqsf3, d2hqsg3, d2hqsh3
        automated match to d1oapa_
        complexed with act, gol, so4
      3. Domain d2hqsg2: 2hqs G:67-173 [136672]
        Other proteins in same PDB: d2hqsa1, d2hqsa2, d2hqsa3, d2hqsb1, d2hqsb2, d2hqsb3, d2hqsc3, d2hqsd1, d2hqsd2, d2hqsd3, d2hqse3, d2hqsf1, d2hqsf2, d2hqsf3, d2hqsg3, d2hqsh3
        automated match to d1oapa_
        complexed with act, gol, so4
      4. Domain d2hqsh2: 2hqs H:67-173 [136673]
        Other proteins in same PDB: d2hqsa1, d2hqsa2, d2hqsa3, d2hqsb1, d2hqsb2, d2hqsb3, d2hqsc3, d2hqsd1, d2hqsd2, d2hqsd3, d2hqse3, d2hqsf1, d2hqsf2, d2hqsf3, d2hqsg3, d2hqsh3
        automated match to d1oapa_
        complexed with act, gol, so4
    2. Domains for 2w8b:
      1. Domain d2w8bc_: 2w8b C: [169106]
        Other proteins in same PDB: d2w8ba1, d2w8ba2, d2w8bb1, d2w8bb2, d2w8bd1, d2w8bd2, d2w8be2, d2w8bf1, d2w8bf2, d2w8bg2, d2w8bh2
        automated match to d1oapa_
        complexed with act, gol, so4
      2. Domain d2w8be1: 2w8b E:68-173 [169107]
        Other proteins in same PDB: d2w8ba1, d2w8ba2, d2w8bb1, d2w8bb2, d2w8bd1, d2w8bd2, d2w8be2, d2w8bf1, d2w8bf2, d2w8bg2, d2w8bh2
        automated match to d1oapa_
        complexed with act, gol, so4
      3. Domain d2w8bg1: 2w8b G:67-173 [169108]
        Other proteins in same PDB: d2w8ba1, d2w8ba2, d2w8bb1, d2w8bb2, d2w8bd1, d2w8bd2, d2w8be2, d2w8bf1, d2w8bf2, d2w8bg2, d2w8bh2
        automated match to d1oapa_
        complexed with act, gol, so4
      4. Domain d2w8bh1: 2w8b H:67-173 [169109]
        Other proteins in same PDB: d2w8ba1, d2w8ba2, d2w8bb1, d2w8bb2, d2w8bd1, d2w8bd2, d2w8be2, d2w8bf1, d2w8bf2, d2w8bg2, d2w8bh2
        automated match to d1oapa_
        complexed with act, gol, so4
  2. Yersinia pestis [TaxId:214092] [238503] (2 PDB entries)
    1. Domains for 4pwt:
      1. Domain d4pwta_: 4pwt A: [238504]
        automated match to d1oapa_
        complexed with fmt, pop, so4
      2. Domain d4pwtb_: 4pwt B: [240744]
        automated match to d4pwta_
        complexed with fmt, pop, so4
      3. Domain d4pwtc_: 4pwt C: [240745]
        automated match to d4pwta_
        complexed with fmt, pop, so4
    2. Domains for 4r40:
      1. Domain d4r40b_: 4r40 B: [263811]
        Other proteins in same PDB: d4r40a1, d4r40a2, d4r40c1, d4r40c2
        automated match to d4pwta_
        complexed with fmt, gol, so4
      2. Domain d4r40d_: 4r40 D: [259513]
        Other proteins in same PDB: d4r40a1, d4r40a2, d4r40c1, d4r40c2
        automated match to d4pwta_
        complexed with fmt, gol, so4

More info for Protein automated matches from d.79.7.1: OmpA-like

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