Lineage for Species: Paracoccus denitrificans [TaxId: 266]

  1. Root: SCOPe 2.08
  2. 2739516Class b: All beta proteins [48724] (180 folds)
  3. 2808719Fold b.69: 7-bladed beta-propeller [50964] (15 superfamilies)
    consists of seven 4-stranded beta-sheet motifs; meander
  4. 2808749Superfamily b.69.2: YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase [50969] (4 families) (S)
  5. 2808750Family b.69.2.1: Methylamine dehydrogenase, H-chain [50970] (1 protein)
    less regular propeller without notable sequence repeats; quinone cofactor is a tryptophan derivative in another subunit
    automatically mapped to Pfam PF06433
    this is a repeat family; one repeat unit is 1mg2 A:132-178 found in domain
  6. 2808751Protein Methylamine dehydrogenase, H-chain [50971] (2 species)
  7. 2808752Species Paracoccus denitrificans [TaxId:266] [50972] (5 PDB entries)

PDB entries in Species: Paracoccus denitrificans [TaxId: 266]:

  1. Domain(s) for 1mda:
    1. 2808764Domain d1mdah_: 1mda H: [27637]
      Other proteins in same PDB: d1mdaa_, d1mdab_, d1mdal_, d1mdam_
      complexed with cu
    2. 2808765Domain d1mdaj_: 1mda J: [27638]
      Other proteins in same PDB: d1mdaa_, d1mdab_, d1mdal_, d1mdam_
      complexed with cu
  2. Domain(s) for 1mg2:
    1. 2808755Domain d1mg2a_: 1mg2 A: [79059]
      Other proteins in same PDB: d1mg2b_, d1mg2c_, d1mg2d_, d1mg2f_, d1mg2g_, d1mg2h_, d1mg2j_, d1mg2k_, d1mg2l_, d1mg2n_, d1mg2o_, d1mg2p_
      complexed with cu, hec, na, po4; mutant
    2. 2808756Domain d1mg2e_: 1mg2 E: [79063]
      Other proteins in same PDB: d1mg2b_, d1mg2c_, d1mg2d_, d1mg2f_, d1mg2g_, d1mg2h_, d1mg2j_, d1mg2k_, d1mg2l_, d1mg2n_, d1mg2o_, d1mg2p_
      complexed with cu, hec, na, po4; mutant
    3. 2808757Domain d1mg2i_: 1mg2 I: [79067]
      Other proteins in same PDB: d1mg2b_, d1mg2c_, d1mg2d_, d1mg2f_, d1mg2g_, d1mg2h_, d1mg2j_, d1mg2k_, d1mg2l_, d1mg2n_, d1mg2o_, d1mg2p_
      complexed with cu, hec, na, po4; mutant
    4. 2808758Domain d1mg2m_: 1mg2 M: [79071]
      Other proteins in same PDB: d1mg2b_, d1mg2c_, d1mg2d_, d1mg2f_, d1mg2g_, d1mg2h_, d1mg2j_, d1mg2k_, d1mg2l_, d1mg2n_, d1mg2o_, d1mg2p_
      complexed with cu, hec, na, po4; mutant
  3. Domain(s) for 1mg3:
    1. 2808759Domain d1mg3a_: 1mg3 A: [79075]
      Other proteins in same PDB: d1mg3b_, d1mg3c_, d1mg3d_, d1mg3f_, d1mg3g_, d1mg3h_, d1mg3j_, d1mg3k_, d1mg3l_, d1mg3n_, d1mg3o_, d1mg3p_
      complexed with cu, hec, na, po4; mutant
    2. 2808760Domain d1mg3e_: 1mg3 E: [79079]
      Other proteins in same PDB: d1mg3b_, d1mg3c_, d1mg3d_, d1mg3f_, d1mg3g_, d1mg3h_, d1mg3j_, d1mg3k_, d1mg3l_, d1mg3n_, d1mg3o_, d1mg3p_
      complexed with cu, hec, na, po4; mutant
    3. 2808761Domain d1mg3i_: 1mg3 I: [79083]
      Other proteins in same PDB: d1mg3b_, d1mg3c_, d1mg3d_, d1mg3f_, d1mg3g_, d1mg3h_, d1mg3j_, d1mg3k_, d1mg3l_, d1mg3n_, d1mg3o_, d1mg3p_
      complexed with cu, hec, na, po4; mutant
    4. 2808762Domain d1mg3m_: 1mg3 M: [79087]
      Other proteins in same PDB: d1mg3b_, d1mg3c_, d1mg3d_, d1mg3f_, d1mg3g_, d1mg3h_, d1mg3j_, d1mg3k_, d1mg3l_, d1mg3n_, d1mg3o_, d1mg3p_
      complexed with cu, hec, na, po4; mutant
  4. Domain(s) for 2bbk:
    1. 2808753Domain d2bbkh_: 2bbk H: [27634]
      Other proteins in same PDB: d2bbkl_, d2bbkm_
      missing some secondary structures that made up less than one-third of the common domain
    2. 2808754Domain d2bbkj_: 2bbk J: [27635]
      Other proteins in same PDB: d2bbkl_, d2bbkm_
      missing some secondary structures that made up less than one-third of the common domain
  5. Domain(s) for 2mta:

More info for Species Paracoccus denitrificans [TaxId:266] from b.69.2.1 Methylamine dehydrogenase, H-chain

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