Lineage for Species: Streptomyces clavuligerus [TaxId: 1901]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2078559Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 2108258Fold c.36: Thiamin diphosphate-binding fold (THDP-binding) [52517] (1 superfamily)
    3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 213465
  4. 2108259Superfamily c.36.1: Thiamin diphosphate-binding fold (THDP-binding) [52518] (9 families) (S)
    there are two different functional modules of this fold: pyridine-binding (Pyr) and pyrophosphate-binding (PP) modules
    two Pyr and two PP modules assemble together in a conserved heterotetrameric core that binds two THDP coenzyme molecules
  5. 2108260Family c.36.1.5: Pyruvate oxidase and decarboxylase Pyr module [88724] (8 protein domains)
    the N-terminal, Pyr module is separated from the C-terminal, PP module by an alpha/beta domain of Rossmann-like topology
    automatically mapped to Pfam PF02776
  6. 2108308Protein Carboxyethylarginine synthase [102330] (1 species)
  7. 2108309Species Streptomyces clavuligerus [TaxId:1901] [102331] (6 PDB entries)

PDB entries in Species: Streptomyces clavuligerus [TaxId: 1901]:

  1. Domain(s) for 1upa:
    1. 2108326Domain d1upaa2: 1upa A:12-197 [99715]
      Other proteins in same PDB: d1upaa1, d1upaa3, d1upab1, d1upab3, d1upac1, d1upac3, d1upad1, d1upad3
      complexed with mg, so4, tpp
    2. 2108327Domain d1upab2: 1upa B:12-197 [99718]
      Other proteins in same PDB: d1upaa1, d1upaa3, d1upab1, d1upab3, d1upac1, d1upac3, d1upad1, d1upad3
      complexed with mg, so4, tpp
    3. 2108328Domain d1upac2: 1upa C:12-197 [99721]
      Other proteins in same PDB: d1upaa1, d1upaa3, d1upab1, d1upab3, d1upac1, d1upac3, d1upad1, d1upad3
      complexed with mg, so4, tpp
    4. 2108329Domain d1upad2: 1upa D:12-197 [99724]
      Other proteins in same PDB: d1upaa1, d1upaa3, d1upab1, d1upab3, d1upac1, d1upac3, d1upad1, d1upad3
      complexed with mg, so4, tpp
  2. Domain(s) for 1upb:
    1. 2108322Domain d1upba2: 1upb A:12-197 [99727]
      Other proteins in same PDB: d1upba1, d1upba3, d1upbb1, d1upbb3, d1upbc1, d1upbc3, d1upbd1, d1upbd3
      complexed with mg, so4, tpp
    2. 2108323Domain d1upbb2: 1upb B:12-197 [99730]
      Other proteins in same PDB: d1upba1, d1upba3, d1upbb1, d1upbb3, d1upbc1, d1upbc3, d1upbd1, d1upbd3
      complexed with mg, so4, tpp
    3. 2108324Domain d1upbc2: 1upb C:12-197 [99733]
      Other proteins in same PDB: d1upba1, d1upba3, d1upbb1, d1upbb3, d1upbc1, d1upbc3, d1upbd1, d1upbd3
      complexed with mg, so4, tpp
    4. 2108325Domain d1upbd2: 1upb D:12-197 [99736]
      Other proteins in same PDB: d1upba1, d1upba3, d1upbb1, d1upbb3, d1upbc1, d1upbc3, d1upbd1, d1upbd3
      complexed with mg, so4, tpp
  3. Domain(s) for 1upc:
    1. 2108330Domain d1upca2: 1upc A:12-197 [99739]
      Other proteins in same PDB: d1upca1, d1upca3, d1upcb1, d1upcb3, d1upcc1, d1upcc3, d1upcd1, d1upcd3, d1upce1, d1upce3, d1upcf1, d1upcf3
      complexed with mg, so4, tpp
    2. 2108331Domain d1upcb2: 1upc B:12-197 [99742]
      Other proteins in same PDB: d1upca1, d1upca3, d1upcb1, d1upcb3, d1upcc1, d1upcc3, d1upcd1, d1upcd3, d1upce1, d1upce3, d1upcf1, d1upcf3
      complexed with mg, so4, tpp
    3. 2108332Domain d1upcc2: 1upc C:12-197 [99745]
      Other proteins in same PDB: d1upca1, d1upca3, d1upcb1, d1upcb3, d1upcc1, d1upcc3, d1upcd1, d1upcd3, d1upce1, d1upce3, d1upcf1, d1upcf3
      complexed with mg, so4, tpp
    4. 2108333Domain d1upcd2: 1upc D:12-197 [99748]
      Other proteins in same PDB: d1upca1, d1upca3, d1upcb1, d1upcb3, d1upcc1, d1upcc3, d1upcd1, d1upcd3, d1upce1, d1upce3, d1upcf1, d1upcf3
      complexed with mg, so4, tpp
    5. 2108334Domain d1upce2: 1upc E:12-197 [99751]
      Other proteins in same PDB: d1upca1, d1upca3, d1upcb1, d1upcb3, d1upcc1, d1upcc3, d1upcd1, d1upcd3, d1upce1, d1upce3, d1upcf1, d1upcf3
      complexed with mg, so4, tpp
    6. 2108335Domain d1upcf2: 1upc F:12-197 [99754]
      Other proteins in same PDB: d1upca1, d1upca3, d1upcb1, d1upcb3, d1upcc1, d1upcc3, d1upcd1, d1upcd3, d1upce1, d1upce3, d1upcf1, d1upcf3
      complexed with mg, so4, tpp
  4. Domain(s) for 2iht:
    1. 2108310Domain d2ihta2: 2iht A:11-197 [147686]
      Other proteins in same PDB: d2ihta1, d2ihta3, d2ihtb1, d2ihtb3, d2ihtc1, d2ihtc3, d2ihtd1, d2ihtd3
      automated match to d1upaa2
      complexed with gol, mg, so4, tpp
    2. 2108311Domain d2ihtb2: 2iht B:11-197 [147689]
      Other proteins in same PDB: d2ihta1, d2ihta3, d2ihtb1, d2ihtb3, d2ihtc1, d2ihtc3, d2ihtd1, d2ihtd3
      automated match to d1upaa2
      complexed with gol, mg, so4, tpp
    3. 2108312Domain d2ihtc2: 2iht C:11-197 [147692]
      Other proteins in same PDB: d2ihta1, d2ihta3, d2ihtb1, d2ihtb3, d2ihtc1, d2ihtc3, d2ihtd1, d2ihtd3
      automated match to d1upaa2
      complexed with gol, mg, so4, tpp
    4. 2108313Domain d2ihtd2: 2iht D:11-197 [147695]
      Other proteins in same PDB: d2ihta1, d2ihta3, d2ihtb1, d2ihtb3, d2ihtc1, d2ihtc3, d2ihtd1, d2ihtd3
      automated match to d1upaa2
      complexed with gol, mg, so4, tpp
  5. Domain(s) for 2ihu:
    1. 2108314Domain d2ihua2: 2ihu A:11-197 [147698]
      Other proteins in same PDB: d2ihua1, d2ihua3, d2ihub2, d2ihub3, d2ihuc2, d2ihuc3, d2ihud2, d2ihud3
      automated match to d1upaa2
      complexed with gol, k, mg, tar, tp8, tp9
    2. 2108315Domain d2ihub1: 2ihu B:11-197 [198065]
      Other proteins in same PDB: d2ihua1, d2ihua3, d2ihub2, d2ihub3, d2ihuc2, d2ihuc3, d2ihud2, d2ihud3
      automated match to d1upaa2
      complexed with gol, k, mg, tar, tp8, tp9
    3. 2108316Domain d2ihuc1: 2ihu C:11-197 [198068]
      Other proteins in same PDB: d2ihua1, d2ihua3, d2ihub2, d2ihub3, d2ihuc2, d2ihuc3, d2ihud2, d2ihud3
      automated match to d1upaa2
      complexed with gol, k, mg, tar, tp8, tp9
    4. 2108317Domain d2ihud1: 2ihu D:11-197 [198071]
      Other proteins in same PDB: d2ihua1, d2ihua3, d2ihub2, d2ihub3, d2ihuc2, d2ihuc3, d2ihud2, d2ihud3
      automated match to d1upaa2
      complexed with gol, k, mg, tar, tp8, tp9
  6. Domain(s) for 2ihv:
    1. 2108318Domain d2ihva2: 2ihv A:11-197 [147701]
      Other proteins in same PDB: d2ihva1, d2ihva3, d2ihvb1, d2ihvb3, d2ihvc2, d2ihvc3, d2ihvd1, d2ihvd3
      automated match to d1upaa2
      complexed with gva, k, mg, tpp
    2. 2108319Domain d2ihvb2: 2ihv B:11-197 [147704]
      Other proteins in same PDB: d2ihva1, d2ihva3, d2ihvb1, d2ihvb3, d2ihvc2, d2ihvc3, d2ihvd1, d2ihvd3
      automated match to d1upaa2
      complexed with gva, k, mg, tpp
    3. 2108320Domain d2ihvc1: 2ihv C:11-197 [198074]
      Other proteins in same PDB: d2ihva1, d2ihva3, d2ihvb1, d2ihvb3, d2ihvc2, d2ihvc3, d2ihvd1, d2ihvd3
      automated match to d1upaa2
      complexed with gva, k, mg, tpp
    4. 2108321Domain d2ihvd2: 2ihv D:11-197 [147707]
      Other proteins in same PDB: d2ihva1, d2ihva3, d2ihvb1, d2ihvb3, d2ihvc2, d2ihvc3, d2ihvd1, d2ihvd3
      automated match to d1upaa2
      complexed with gva, k, mg, tpp

More info for Species Streptomyces clavuligerus [TaxId:1901] from c.36.1.5 Carboxyethylarginine synthase

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