Lineage for Species: Streptomyces clavuligerus

  1. Root: SCOP 1.67
  2. 383641Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (130 folds)
  3. 393047Fold c.36: Thiamin diphosphate-binding fold (THDP-binding) [52517] (1 superfamily)
    3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 213465
  4. 393048Superfamily c.36.1: Thiamin diphosphate-binding fold (THDP-binding) [52518] (8 families) (S)
    there are two different functional modules of this fold: pyridine-binding (Pyr) and pyrophosphate-binding (PP) modules
    two Pyr and two PP modules assemble together in a conserved heterotetrameric core that binds two THDP coenzyme molecules
  5. 393049Family c.36.1.5: Pyruvate oxidase and decarboxylase Pyr module [88724] (7 proteins)
    the N-terminal, Pyr module is separated from the C-terminal, PP module by an alpha/beta domain of Rossmann-like topology
  6. 393075Protein Carboxyethylarginine synthase [102330] (1 species)
  7. 393076Species Streptomyces clavuligerus [TaxId:1901] [102331] (3 PDB entries)

PDB entries in Species: Streptomyces clavuligerus:

  1. Domain(s) for 1upa:
    1. 393077Domain d1upaa2: 1upa A:12-197 [99715]
      Other proteins in same PDB: d1upaa1, d1upaa3, d1upab1, d1upab3, d1upac1, d1upac3, d1upad1, d1upad3
    2. 393078Domain d1upab2: 1upa B:12-197 [99718]
      Other proteins in same PDB: d1upaa1, d1upaa3, d1upab1, d1upab3, d1upac1, d1upac3, d1upad1, d1upad3
    3. 393079Domain d1upac2: 1upa C:12-197 [99721]
      Other proteins in same PDB: d1upaa1, d1upaa3, d1upab1, d1upab3, d1upac1, d1upac3, d1upad1, d1upad3
    4. 393080Domain d1upad2: 1upa D:12-197 [99724]
      Other proteins in same PDB: d1upaa1, d1upaa3, d1upab1, d1upab3, d1upac1, d1upac3, d1upad1, d1upad3
      complexed with mg, so4, tpp
  2. Domain(s) for 1upb:
    1. 393081Domain d1upba2: 1upb A:12-197 [99727]
      Other proteins in same PDB: d1upba1, d1upba3, d1upbb1, d1upbb3, d1upbc1, d1upbc3, d1upbd1, d1upbd3
    2. 393082Domain d1upbb2: 1upb B:12-197 [99730]
      Other proteins in same PDB: d1upba1, d1upba3, d1upbb1, d1upbb3, d1upbc1, d1upbc3, d1upbd1, d1upbd3
    3. 393083Domain d1upbc2: 1upb C:12-197 [99733]
      Other proteins in same PDB: d1upba1, d1upba3, d1upbb1, d1upbb3, d1upbc1, d1upbc3, d1upbd1, d1upbd3
    4. 393084Domain d1upbd2: 1upb D:12-197 [99736]
      Other proteins in same PDB: d1upba1, d1upba3, d1upbb1, d1upbb3, d1upbc1, d1upbc3, d1upbd1, d1upbd3
      complexed with mg, so4, tpp
  3. Domain(s) for 1upc:
    1. 393085Domain d1upca2: 1upc A:12-197 [99739]
      Other proteins in same PDB: d1upca1, d1upca3, d1upcb1, d1upcb3, d1upcc1, d1upcc3, d1upcd1, d1upcd3, d1upce1, d1upce3, d1upcf1, d1upcf3
    2. 393086Domain d1upcb2: 1upc B:12-197 [99742]
      Other proteins in same PDB: d1upca1, d1upca3, d1upcb1, d1upcb3, d1upcc1, d1upcc3, d1upcd1, d1upcd3, d1upce1, d1upce3, d1upcf1, d1upcf3
    3. 393087Domain d1upcc2: 1upc C:12-197 [99745]
      Other proteins in same PDB: d1upca1, d1upca3, d1upcb1, d1upcb3, d1upcc1, d1upcc3, d1upcd1, d1upcd3, d1upce1, d1upce3, d1upcf1, d1upcf3
    4. 393088Domain d1upcd2: 1upc D:12-197 [99748]
      Other proteins in same PDB: d1upca1, d1upca3, d1upcb1, d1upcb3, d1upcc1, d1upcc3, d1upcd1, d1upcd3, d1upce1, d1upce3, d1upcf1, d1upcf3
    5. 393089Domain d1upce2: 1upc E:12-197 [99751]
      Other proteins in same PDB: d1upca1, d1upca3, d1upcb1, d1upcb3, d1upcc1, d1upcc3, d1upcd1, d1upcd3, d1upce1, d1upce3, d1upcf1, d1upcf3
    6. 393090Domain d1upcf2: 1upc F:12-197 [99754]
      Other proteins in same PDB: d1upca1, d1upca3, d1upcb1, d1upcb3, d1upcc1, d1upcc3, d1upcd1, d1upcd3, d1upce1, d1upce3, d1upcf1, d1upcf3
      complexed with mg, so4, tpp

More info for Species Streptomyces clavuligerus [TaxId:1901] from c.36.1.5 Carboxyethylarginine synthase

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