SCOPe 2.08: Protein: Thermosome, I domain

Lineage for Protein: Thermosome, I domain

Root: SCOPe 2.08
Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (396 folds)
Fold d.56: GroEL-intermediate domain like [54848] (1 superfamily)
3-helical bundle packed against 3-stranded mixed beta-sheet
Superfamily d.56.1: GroEL-intermediate domain like [54849] (2 families)
Family d.56.1.2: Group II chaperonin (CCT, TRIC), intermediate domain [54853] (1 protein)
Protein Thermosome, I domain [54854] (3 species)

Species:

Thermococcus sp. ks-1, alpha chain [TaxId:79679] [102951] (4 PDB entries)

Domains for 1q2v:
1. Domain d1q2va3: 1q2v A:146-216,A:370-405 [95645]
  Other proteins in same PDB: d1q2va1, d1q2va2, d1q2vb1, d1q2vb2, d1q2vc1, d1q2vc2, d1q2vd1, d1q2vd2
  complexed with so4
2. Domain d1q2vb3: 1q2v B:146-216,B:370-405 [95648]
  Other proteins in same PDB: d1q2va1, d1q2va2, d1q2vb1, d1q2vb2, d1q2vc1, d1q2vc2, d1q2vd1, d1q2vd2
  complexed with so4
3. Domain d1q2vc3: 1q2v C:146-216,C:370-405 [95651]
  Other proteins in same PDB: d1q2va1, d1q2va2, d1q2vb1, d1q2vb2, d1q2vc1, d1q2vc2, d1q2vd1, d1q2vd2
  complexed with so4
4. Domain d1q2vd3: 1q2v D:146-216,D:370-405 [95654]
  Other proteins in same PDB: d1q2va1, d1q2va2, d1q2vb1, d1q2vb2, d1q2vc1, d1q2vc2, d1q2vd1, d1q2vd2
  complexed with so4
Domains for 1q3q:
1. Domain d1q3qa3: 1q3q A:146-216,A:370-405 [95706]
  Other proteins in same PDB: d1q3qa1, d1q3qa2, d1q3qb1, d1q3qb2, d1q3qc1, d1q3qc2, d1q3qd1, d1q3qd2
  complexed with anp, mg; mutant
2. Domain d1q3qb3: 1q3q B:146-216,B:370-405 [95709]
  Other proteins in same PDB: d1q3qa1, d1q3qa2, d1q3qb1, d1q3qb2, d1q3qc1, d1q3qc2, d1q3qd1, d1q3qd2
  complexed with anp, mg; mutant
3. Domain d1q3qc3: 1q3q C:146-216,C:370-405 [95712]
  Other proteins in same PDB: d1q3qa1, d1q3qa2, d1q3qb1, d1q3qb2, d1q3qc1, d1q3qc2, d1q3qd1, d1q3qd2
  complexed with anp, mg; mutant
4. Domain d1q3qd3: 1q3q D:146-216,D:370-405 [95715]
  Other proteins in same PDB: d1q3qa1, d1q3qa2, d1q3qb1, d1q3qb2, d1q3qc1, d1q3qc2, d1q3qd1, d1q3qd2
  complexed with anp, mg; mutant
Domains for 1q3r:
1. Domain d1q3ra3: 1q3r A:146-216,A:370-405 [95718]
  Other proteins in same PDB: d1q3ra1, d1q3ra2, d1q3rb1, d1q3rb2, d1q3rc1, d1q3rc2, d1q3rd1, d1q3rd2
  complexed with so4; mutant
2. Domain d1q3rb3: 1q3r B:146-216,B:370-405 [95721]
  Other proteins in same PDB: d1q3ra1, d1q3ra2, d1q3rb1, d1q3rb2, d1q3rc1, d1q3rc2, d1q3rd1, d1q3rd2
  complexed with so4; mutant
3. Domain d1q3rc3: 1q3r C:146-216,C:370-405 [95724]
  Other proteins in same PDB: d1q3ra1, d1q3ra2, d1q3rb1, d1q3rb2, d1q3rc1, d1q3rc2, d1q3rd1, d1q3rd2
  complexed with so4; mutant
4. Domain d1q3rd3: 1q3r D:146-216,D:370-405 [95727]
  Other proteins in same PDB: d1q3ra1, d1q3ra2, d1q3rb1, d1q3rb2, d1q3rc1, d1q3rc2, d1q3rd1, d1q3rd2
  complexed with so4; mutant

Domains for 1q3s:

Domain d1q3sa3: 1q3s A:146-216,A:370-405 [95730]
Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa2, d1q3sb1, d1q3sb2, d1q3sc1, d1q3sc2, d1q3sd1, d1q3sd2, d1q3se1, d1q3se2, d1q3sf1, d1q3sf2, d1q3sg1, d1q3sg2, d1q3sh1, d1q3sh2
complexed with adp, mg

Domain d1q3sb3: 1q3s B:146-216,B:370-405 [95733]
Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa2, d1q3sb1, d1q3sb2, d1q3sc1, d1q3sc2, d1q3sd1, d1q3sd2, d1q3se1, d1q3se2, d1q3sf1, d1q3sf2, d1q3sg1, d1q3sg2, d1q3sh1, d1q3sh2
complexed with adp, mg

Domain d1q3sc3: 1q3s C:146-216,C:370-405 [95736]
Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa2, d1q3sb1, d1q3sb2, d1q3sc1, d1q3sc2, d1q3sd1, d1q3sd2, d1q3se1, d1q3se2, d1q3sf1, d1q3sf2, d1q3sg1, d1q3sg2, d1q3sh1, d1q3sh2
complexed with adp, mg

Domain d1q3sd3: 1q3s D:146-216,D:370-405 [95739]
Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa2, d1q3sb1, d1q3sb2, d1q3sc1, d1q3sc2, d1q3sd1, d1q3sd2, d1q3se1, d1q3se2, d1q3sf1, d1q3sf2, d1q3sg1, d1q3sg2, d1q3sh1, d1q3sh2
complexed with adp, mg

Domain d1q3se3: 1q3s E:146-216,E:370-405 [95742]
Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa2, d1q3sb1, d1q3sb2, d1q3sc1, d1q3sc2, d1q3sd1, d1q3sd2, d1q3se1, d1q3se2, d1q3sf1, d1q3sf2, d1q3sg1, d1q3sg2, d1q3sh1, d1q3sh2
complexed with adp, mg

Domain d1q3sf3: 1q3s F:146-216,F:370-405 [95745]
Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa2, d1q3sb1, d1q3sb2, d1q3sc1, d1q3sc2, d1q3sd1, d1q3sd2, d1q3se1, d1q3se2, d1q3sf1, d1q3sf2, d1q3sg1, d1q3sg2, d1q3sh1, d1q3sh2
complexed with adp, mg

Domain d1q3sg3: 1q3s G:146-216,G:370-405 [95748]
Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa2, d1q3sb1, d1q3sb2, d1q3sc1, d1q3sc2, d1q3sd1, d1q3sd2, d1q3se1, d1q3se2, d1q3sf1, d1q3sf2, d1q3sg1, d1q3sg2, d1q3sh1, d1q3sh2
complexed with adp, mg

Domain d1q3sh3: 1q3s H:146-216,H:370-405 [95751]
Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa2, d1q3sb1, d1q3sb2, d1q3sc1, d1q3sc2, d1q3sd1, d1q3sd2, d1q3se1, d1q3se2, d1q3sf1, d1q3sf2, d1q3sg1, d1q3sg2, d1q3sh1, d1q3sh2
complexed with adp, mg

Thermoplasma acidophilum, alpha chain [TaxId:2303] [100973] (2 PDB entries)
1. Domain for 1a6d:
  - Domain d1a6da3: 1a6d A:146-214,A:368-403 [38936]
    Other proteins in same PDB: d1a6da1, d1a6da2, d1a6db1, d1a6db2
2. Domain for 1a6e:
  - Domain d1a6ea3: 1a6e A:146-214,A:368-403 [38938]
    Other proteins in same PDB: d1a6ea1, d1a6ea2, d1a6eb1, d1a6eb2
    complexed with adp, af3, mg
Thermoplasma acidophilum, beta chain [TaxId:2303] [100974] (2 PDB entries)
1. Domain for 1a6d:
  - Domain d1a6db3: 1a6d B:145-215,B:368-403 [38937]
    Other proteins in same PDB: d1a6da1, d1a6da2, d1a6db1, d1a6db2
2. Domain for 1a6e:
  - Domain d1a6eb3: 1a6e B:145-215,B:368-403 [38939]
    Other proteins in same PDB: d1a6ea1, d1a6ea2, d1a6eb1, d1a6eb2
    complexed with adp, af3, mg

More info for Protein Thermosome, I domain from d.56.1.2: Group II chaperonin (CCT, TRIC), intermediate domain

Timeline for Protein Thermosome, I domain from d.56.1.2: Group II chaperonin (CCT, TRIC), intermediate domain:

Protein Thermosome, I domain from d.56.1.2: Group II chaperonin (CCT, TRIC), intermediate domain first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55, called Protein Thermosome from d.56.1.2: Group II chaperonin (CCT, TRIC)
Protein Thermosome, I domain from d.56.1.2: Group II chaperonin (CCT, TRIC), intermediate domain appears in SCOPe 2.07