Lineage for Species: Synechococcus sp., strain pcc 6301 [TaxId: 1131]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2078559Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 2078560Fold c.1: TIM beta/alpha-barrel [51350] (33 superfamilies)
    contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678
    the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
  4. 2088460Superfamily c.1.14: RuBisCo, C-terminal domain [51649] (2 families) (S)
    automatically mapped to Pfam PF00016
  5. 2088461Family c.1.14.1: RuBisCo, large subunit, C-terminal domain [51650] (2 protein domains)
    N-terminal domain is alpha+beta
  6. 2088462Protein Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase [51651] (12 species)
  7. 2088617Species Synechococcus sp., strain pcc 6301 [TaxId:1131] [51656] (2 PDB entries)

PDB entries in Species: Synechococcus sp., strain pcc 6301 [TaxId: 1131]:

  1. Domain(s) for 1rbl:
    1. 2088618Domain d1rbla1: 1rbl A:148-475 [29380]
      Other proteins in same PDB: d1rbla2, d1rblb2, d1rblc2, d1rbld2, d1rble2, d1rblf2, d1rblg2, d1rblh2, d1rbli_, d1rblj_, d1rblk_, d1rbll_, d1rblm_, d1rbln_, d1rblo_, d1rblp_
      complexed with cap, fmt, mg
    2. 2088619Domain d1rblb1: 1rbl B:148-475 [118585]
      Other proteins in same PDB: d1rbla2, d1rblb2, d1rblc2, d1rbld2, d1rble2, d1rblf2, d1rblg2, d1rblh2, d1rbli_, d1rblj_, d1rblk_, d1rbll_, d1rblm_, d1rbln_, d1rblo_, d1rblp_
      duplicate of 1RBL A:148-475
      complexed with cap, fmt, mg
    3. 2088620Domain d1rblc1: 1rbl C:148-475 [118587]
      Other proteins in same PDB: d1rbla2, d1rblb2, d1rblc2, d1rbld2, d1rble2, d1rblf2, d1rblg2, d1rblh2, d1rbli_, d1rblj_, d1rblk_, d1rbll_, d1rblm_, d1rbln_, d1rblo_, d1rblp_
      duplicate of 1RBL A:148-475
      complexed with cap, fmt, mg
    4. 2088621Domain d1rbld1: 1rbl D:148-475 [118589]
      Other proteins in same PDB: d1rbla2, d1rblb2, d1rblc2, d1rbld2, d1rble2, d1rblf2, d1rblg2, d1rblh2, d1rbli_, d1rblj_, d1rblk_, d1rbll_, d1rblm_, d1rbln_, d1rblo_, d1rblp_
      duplicate of 1RBL A:148-475
      complexed with cap, fmt, mg
    5. 2088622Domain d1rble1: 1rbl E:148-475 [118591]
      Other proteins in same PDB: d1rbla2, d1rblb2, d1rblc2, d1rbld2, d1rble2, d1rblf2, d1rblg2, d1rblh2, d1rbli_, d1rblj_, d1rblk_, d1rbll_, d1rblm_, d1rbln_, d1rblo_, d1rblp_
      duplicate of 1RBL A:148-475
      complexed with cap, fmt, mg
    6. 2088623Domain d1rblf1: 1rbl F:148-475 [118593]
      Other proteins in same PDB: d1rbla2, d1rblb2, d1rblc2, d1rbld2, d1rble2, d1rblf2, d1rblg2, d1rblh2, d1rbli_, d1rblj_, d1rblk_, d1rbll_, d1rblm_, d1rbln_, d1rblo_, d1rblp_
      duplicate of 1RBL A:148-475
      complexed with cap, fmt, mg
    7. 2088624Domain d1rblg1: 1rbl G:148-475 [118595]
      Other proteins in same PDB: d1rbla2, d1rblb2, d1rblc2, d1rbld2, d1rble2, d1rblf2, d1rblg2, d1rblh2, d1rbli_, d1rblj_, d1rblk_, d1rbll_, d1rblm_, d1rbln_, d1rblo_, d1rblp_
      duplicate of 1RBL A:148-475
      complexed with cap, fmt, mg
    8. 2088625Domain d1rblh1: 1rbl H:148-475 [118597]
      Other proteins in same PDB: d1rbla2, d1rblb2, d1rblc2, d1rbld2, d1rble2, d1rblf2, d1rblg2, d1rblh2, d1rbli_, d1rblj_, d1rblk_, d1rbll_, d1rblm_, d1rbln_, d1rblo_, d1rblp_
      duplicate of 1RBL A:148-475
      complexed with cap, fmt, mg
  2. Domain(s) for 1rsc:
    1. 2088626Domain d1rsca1: 1rsc A:148-475 [29381]
      Other proteins in same PDB: d1rsca2, d1rscb2, d1rscc2, d1rscd2, d1rsce2, d1rscf2, d1rscg2, d1rsch2, d1rsci_, d1rscj_, d1rsck_, d1rscl_, d1rscm_, d1rscn_, d1rsco_, d1rscp_
      complexed with xbp
    2. 2088627Domain d1rscb1: 1rsc B:148-475 [118606]
      Other proteins in same PDB: d1rsca2, d1rscb2, d1rscc2, d1rscd2, d1rsce2, d1rscf2, d1rscg2, d1rsch2, d1rsci_, d1rscj_, d1rsck_, d1rscl_, d1rscm_, d1rscn_, d1rsco_, d1rscp_
      duplicate of 1RSC A:148-475
      complexed with xbp
    3. 2088628Domain d1rscc1: 1rsc C:148-475 [118608]
      Other proteins in same PDB: d1rsca2, d1rscb2, d1rscc2, d1rscd2, d1rsce2, d1rscf2, d1rscg2, d1rsch2, d1rsci_, d1rscj_, d1rsck_, d1rscl_, d1rscm_, d1rscn_, d1rsco_, d1rscp_
      duplicate of 1RSC A:148-475
      complexed with xbp
    4. 2088629Domain d1rscd1: 1rsc D:148-475 [118610]
      Other proteins in same PDB: d1rsca2, d1rscb2, d1rscc2, d1rscd2, d1rsce2, d1rscf2, d1rscg2, d1rsch2, d1rsci_, d1rscj_, d1rsck_, d1rscl_, d1rscm_, d1rscn_, d1rsco_, d1rscp_
      duplicate of 1RSC A:148-475
      complexed with xbp
    5. 2088630Domain d1rsce1: 1rsc E:148-475 [118612]
      Other proteins in same PDB: d1rsca2, d1rscb2, d1rscc2, d1rscd2, d1rsce2, d1rscf2, d1rscg2, d1rsch2, d1rsci_, d1rscj_, d1rsck_, d1rscl_, d1rscm_, d1rscn_, d1rsco_, d1rscp_
      duplicate of 1RSC A:148-475
      complexed with xbp
    6. 2088631Domain d1rscf1: 1rsc F:148-475 [118614]
      Other proteins in same PDB: d1rsca2, d1rscb2, d1rscc2, d1rscd2, d1rsce2, d1rscf2, d1rscg2, d1rsch2, d1rsci_, d1rscj_, d1rsck_, d1rscl_, d1rscm_, d1rscn_, d1rsco_, d1rscp_
      duplicate of 1RSC A:148-475
      complexed with xbp
    7. 2088632Domain d1rscg1: 1rsc G:148-475 [118616]
      Other proteins in same PDB: d1rsca2, d1rscb2, d1rscc2, d1rscd2, d1rsce2, d1rscf2, d1rscg2, d1rsch2, d1rsci_, d1rscj_, d1rsck_, d1rscl_, d1rscm_, d1rscn_, d1rsco_, d1rscp_
      duplicate of 1RSC A:148-475
      complexed with xbp
    8. 2088633Domain d1rsch1: 1rsc H:148-475 [118618]
      Other proteins in same PDB: d1rsca2, d1rscb2, d1rscc2, d1rscd2, d1rsce2, d1rscf2, d1rscg2, d1rsch2, d1rsci_, d1rscj_, d1rsck_, d1rscl_, d1rscm_, d1rscn_, d1rsco_, d1rscp_
      duplicate of 1RSC A:148-475
      complexed with xbp

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