Lineage for Species: Thermus thermophilus [TaxId: 274]

  1. Root: SCOPe 2.01
  2. 901761Class a: All alpha proteins [46456] (284 folds)
  3. 926369Fold a.143: RPB6/omega subunit-like [63561] (1 superfamily)
    core: 2 helices and adjacent loops
  4. 926370Superfamily a.143.1: RPB6/omega subunit-like [63562] (2 families) (S)
    the bacterial omega and eukaryotic RPB6 subunits both function in polymerase assembly; the common core is involved in conserved interactions with other subunits
  5. 926371Family a.143.1.1: RNA polymerase omega subunit [63563] (2 proteins)
    4 helices; irregular array
  6. 926389Protein automated matches [190193] (2 species)
    not a true protein
  7. 926390Species Thermus thermophilus [TaxId:274] [186933] (6 PDB entries)

PDB entries in Species: Thermus thermophilus [TaxId: 274]:

  1. Domain(s) for 2a68:
    1. 926395Domain d2a68e_: 2a68 E: [126197]
      Other proteins in same PDB: d2a68a1, d2a68a2, d2a68b1, d2a68b2, d2a68c_, d2a68d1, d2a68f1, d2a68f2, d2a68f3, d2a68k1, d2a68k2, d2a68l1, d2a68l2, d2a68m_, d2a68n1, d2a68p1, d2a68p2, d2a68p3
      automated match to d1iw7e_
      protein/RNA complex; complexed with mg, rbt, zn
    2. 926396Domain d2a68o_: 2a68 O: [126207]
      Other proteins in same PDB: d2a68a1, d2a68a2, d2a68b1, d2a68b2, d2a68c_, d2a68d1, d2a68f1, d2a68f2, d2a68f3, d2a68k1, d2a68k2, d2a68l1, d2a68l2, d2a68m_, d2a68n1, d2a68p1, d2a68p2, d2a68p3
      automated match to d1iw7e_
      protein/RNA complex; complexed with mg, rbt, zn
  2. Domain(s) for 2a69:
    1. 926397Domain d2a69e_: 2a69 E: [126217]
      Other proteins in same PDB: d2a69a1, d2a69a2, d2a69b1, d2a69b2, d2a69c_, d2a69d1, d2a69f1, d2a69f2, d2a69f3, d2a69k1, d2a69k2, d2a69l1, d2a69l2, d2a69m_, d2a69n1, d2a69p1, d2a69p2, d2a69p3
      automated match to d1iw7e_
      protein/RNA complex; complexed with mg, rpt, zn
    2. 926398Domain d2a69o_: 2a69 O: [126227]
      Other proteins in same PDB: d2a69a1, d2a69a2, d2a69b1, d2a69b2, d2a69c_, d2a69d1, d2a69f1, d2a69f2, d2a69f3, d2a69k1, d2a69k2, d2a69l1, d2a69l2, d2a69m_, d2a69n1, d2a69p1, d2a69p2, d2a69p3
      automated match to d1iw7e_
      protein/RNA complex; complexed with mg, rpt, zn
  3. Domain(s) for 2a6e:
    1. 926401Domain d2a6ee_: 2a6e E: [126246]
      Other proteins in same PDB: d2a6ea1, d2a6ea2, d2a6eb1, d2a6eb2, d2a6ec_, d2a6ed1, d2a6ef1, d2a6ef2, d2a6ef3, d2a6ek1, d2a6ek2, d2a6el1, d2a6el2, d2a6em_, d2a6en1, d2a6ep1, d2a6ep2, d2a6ep3
      automated match to d1iw7e_
      complexed with mg, zn
    2. 926402Domain d2a6eo_: 2a6e O: [126256]
      Other proteins in same PDB: d2a6ea1, d2a6ea2, d2a6eb1, d2a6eb2, d2a6ec_, d2a6ed1, d2a6ef1, d2a6ef2, d2a6ef3, d2a6ek1, d2a6ek2, d2a6el1, d2a6el2, d2a6em_, d2a6en1, d2a6ep1, d2a6ep2, d2a6ep3
      automated match to d1iw7e_
      complexed with mg, zn
  4. Domain(s) for 2a6h:
    1. 926391Domain d2a6he_: 2a6h E: [126266]
      Other proteins in same PDB: d2a6ha1, d2a6ha2, d2a6hb1, d2a6hb2, d2a6hc_, d2a6hd1, d2a6hf1, d2a6hf2, d2a6hf3, d2a6hk1, d2a6hk2, d2a6hl1, d2a6hl2, d2a6hm_, d2a6hn1, d2a6hp1, d2a6hp2, d2a6hp3
      automated match to d1iw7e_
      protein/RNA complex; complexed with mg, std, zn
    2. 926392Domain d2a6ho_: 2a6h O: [126276]
      Other proteins in same PDB: d2a6ha1, d2a6ha2, d2a6hb1, d2a6hb2, d2a6hc_, d2a6hd1, d2a6hf1, d2a6hf2, d2a6hf3, d2a6hk1, d2a6hk2, d2a6hl1, d2a6hl2, d2a6hm_, d2a6hn1, d2a6hp1, d2a6hp2, d2a6hp3
      automated match to d1iw7e_
      protein/RNA complex; complexed with mg, std, zn
  5. Domain(s) for 2be5:
    1. 926393Domain d2be5e_: 2be5 E: [128357]
      Other proteins in same PDB: d2be5a1, d2be5a2, d2be5b1, d2be5b2, d2be5c_, d2be5d1, d2be5f1, d2be5f2, d2be5f3, d2be5k1, d2be5k2, d2be5l1, d2be5l2, d2be5m_, d2be5n1, d2be5p1, d2be5p2, d2be5p3
      automated match to d1iw7e_
      protein/RNA complex; complexed with mg, tgt, zn
    2. 926394Domain d2be5o_: 2be5 O: [128367]
      Other proteins in same PDB: d2be5a1, d2be5a2, d2be5b1, d2be5b2, d2be5c_, d2be5d1, d2be5f1, d2be5f2, d2be5f3, d2be5k1, d2be5k2, d2be5l1, d2be5l2, d2be5m_, d2be5n1, d2be5p1, d2be5p2, d2be5p3
      automated match to d1iw7e_
      protein/RNA complex; complexed with mg, tgt, zn
  6. Domain(s) for 3eql:
    1. 926399Domain d3eqle_: 3eql E: [175157]
      Other proteins in same PDB: d3eqlc_, d3eqlm_
      automated match to d1i6ve_
      protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with mg, mxp, zn
    2. 926400Domain d3eqlo_: 3eql O: [175159]
      Other proteins in same PDB: d3eqlc_, d3eqlm_
      automated match to d1i6ve_
      protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with mg, mxp, zn

More info for Species Thermus thermophilus [TaxId:274] from a.143.1.1 automated matches

Timeline for Species Thermus thermophilus [TaxId:274] from a.143.1.1 automated matches: