Lineage for Species: Bradyrhizobium japonicum [TaxId: 375]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2078559Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 2078560Fold c.1: TIM beta/alpha-barrel [51350] (33 superfamilies)
    contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678
    the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
  4. 2086988Superfamily c.1.11: Enolase C-terminal domain-like [51604] (3 families) (S)
    binds metal ion (magnesium or manganese) in conserved site inside barrel
    N-terminal alpha+beta domain is common to this superfamily
  5. 2087095Family c.1.11.2: D-glucarate dehydratase-like [51609] (15 protein domains)
  6. 2087289Protein automated matches [226997] (13 species)
    not a true protein
  7. Species Bradyrhizobium japonicum [TaxId:375] [255123] (2 PDB entries)

PDB entries in Species: Bradyrhizobium japonicum [TaxId: 375]:

  1. Domain(s) for 2dw6:
    1. 2087311Domain d2dw6a1: 2dw6 A:143-389 [131808]
      Other proteins in same PDB: d2dw6a2, d2dw6b2, d2dw6c2, d2dw6d2
      automated match to d1tzza1
      complexed with mg, tar, tla; mutant
    2. 2087312Domain d2dw6b1: 2dw6 B:143-389 [131810]
      Other proteins in same PDB: d2dw6a2, d2dw6b2, d2dw6c2, d2dw6d2
      automated match to d1tzza1
      complexed with mg, tar, tla; mutant
    3. 2087313Domain d2dw6c1: 2dw6 C:143-389 [131812]
      Other proteins in same PDB: d2dw6a2, d2dw6b2, d2dw6c2, d2dw6d2
      automated match to d1tzza1
      complexed with mg, tar, tla; mutant
    4. 2087314Domain d2dw6d1: 2dw6 D:143-389 [131814]
      Other proteins in same PDB: d2dw6a2, d2dw6b2, d2dw6c2, d2dw6d2
      automated match to d1tzza1
      complexed with mg, tar, tla; mutant
  2. Domain(s) for 2dw7:
    1. 2087315Domain d2dw7a1: 2dw7 A:143-389 [131816]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automated match to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    2. 2087316Domain d2dw7b1: 2dw7 B:143-389 [131818]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automated match to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    3. 2087317Domain d2dw7c1: 2dw7 C:143-389 [131820]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automated match to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    4. 2087318Domain d2dw7d1: 2dw7 D:143-389 [131822]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automated match to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    5. 2087319Domain d2dw7e1: 2dw7 E:143-389 [131824]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automated match to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    6. 2087320Domain d2dw7f1: 2dw7 F:143-389 [131826]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automated match to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    7. 2087321Domain d2dw7g1: 2dw7 G:143-389 [131828]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automated match to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    8. 2087322Domain d2dw7h1: 2dw7 H:143-389 [131830]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automated match to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    9. 2087323Domain d2dw7i1: 2dw7 I:143-389 [131832]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automated match to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    10. 2087324Domain d2dw7j1: 2dw7 J:143-389 [131834]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automated match to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    11. 2087325Domain d2dw7k1: 2dw7 K:143-389 [131836]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automated match to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    12. 2087326Domain d2dw7l1: 2dw7 L:143-389 [131838]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automated match to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    13. 2087327Domain d2dw7m1: 2dw7 M:143-389 [131840]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automated match to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    14. 2087328Domain d2dw7n1: 2dw7 N:143-389 [131842]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automated match to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    15. 2087329Domain d2dw7o1: 2dw7 O:143-389 [131844]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automated match to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    16. 2087330Domain d2dw7p1: 2dw7 P:143-389 [131846]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automated match to d1tzza1
      complexed with mg, srt

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