Lineage for Species: Spinach (Spinacia oleracea) [TaxId: 3562]

  1. Root: SCOPe 2.07
  2. 2494617Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (388 folds)
  3. 2527131Fold d.81: FwdE/GAPDH domain-like [55346] (4 superfamilies)
    core: alpha-beta-alpha-beta(3); mixed sheet: 2134, strand 2 is parallel to strand 1
  4. 2527132Superfamily d.81.1: Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like, C-terminal domain [55347] (5 families) (S)
    N-terminal domain is the classic Rossmann-fold
  5. 2527133Family d.81.1.1: GAPDH-like [55348] (6 proteins)
    has many additional secondary structures
  6. 2527224Protein Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) [55349] (21 species)
  7. 2527361Species Spinach (Spinacia oleracea) [TaxId:3562] [69769] (8 PDB entries)
    Uniprot P19866

PDB entries in Species: Spinach (Spinacia oleracea) [TaxId: 3562]:

  1. Domain(s) for 1jn0:
    1. 2527387Domain d1jn0a2: 1jn0 A:149-312 [66916]
      Other proteins in same PDB: d1jn0a1, d1jn0b1, d1jn0o1
      complexed with ndp, so4
    2. 2527388Domain d1jn0b2: 1jn0 B:149-312 [66918]
      Other proteins in same PDB: d1jn0a1, d1jn0b1, d1jn0o1
      complexed with ndp, so4
    3. 2527389Domain d1jn0o2: 1jn0 O:149-312 [66920]
      Other proteins in same PDB: d1jn0a1, d1jn0b1, d1jn0o1
      complexed with ndp, so4
  2. Domain(s) for 1nbo:
    1. 2527371Domain d1nboa2: 1nbo A:149-312 [85527]
      Other proteins in same PDB: d1nboa1, d1nboa3, d1nbob1, d1nboo1, d1nboo3
      complexed with nad, so4
    2. 2527372Domain d1nbob2: 1nbo B:149-312 [85529]
      Other proteins in same PDB: d1nboa1, d1nboa3, d1nbob1, d1nboo1, d1nboo3
      complexed with nad, so4
    3. 2527373Domain d1nboo2: 1nbo O:149-312 [85531]
      Other proteins in same PDB: d1nboa1, d1nboa3, d1nbob1, d1nboo1, d1nboo3
      complexed with nad, so4
  3. Domain(s) for 1rm3:
    1. 2527368Domain d1rm3a2: 1rm3 A:149-312 [104995]
      Other proteins in same PDB: d1rm3a1, d1rm3b1, d1rm3o1
      complexed with ndp, so4; mutant
    2. 2527369Domain d1rm3b2: 1rm3 B:149-312 [104997]
      Other proteins in same PDB: d1rm3a1, d1rm3b1, d1rm3o1
      complexed with ndp, so4; mutant
    3. 2527370Domain d1rm3o2: 1rm3 O:149-312 [104999]
      Other proteins in same PDB: d1rm3a1, d1rm3b1, d1rm3o1
      complexed with ndp, so4; mutant
  4. Domain(s) for 1rm4:
    1. 2527362Domain d1rm4a2: 1rm4 A:149-312 [105001]
      Other proteins in same PDB: d1rm4a1, d1rm4b1, d1rm4o1
      complexed with ndp, so4
    2. 2527363Domain d1rm4b2: 1rm4 B:149-312 [105003]
      Other proteins in same PDB: d1rm4a1, d1rm4b1, d1rm4o1
      complexed with ndp, so4
    3. 2527364Domain d1rm4o2: 1rm4 O:149-312 [105005]
      Other proteins in same PDB: d1rm4a1, d1rm4b1, d1rm4o1
      complexed with ndp, so4
  5. Domain(s) for 1rm5:
    1. 2527365Domain d1rm5a2: 1rm5 A:149-312 [105007]
      Other proteins in same PDB: d1rm5a1, d1rm5b1, d1rm5o1
      complexed with ndp, so4; mutant
    2. 2527366Domain d1rm5b2: 1rm5 B:149-312 [105009]
      Other proteins in same PDB: d1rm5a1, d1rm5b1, d1rm5o1
      complexed with ndp, so4; mutant
    3. 2527367Domain d1rm5o2: 1rm5 O:149-312 [105011]
      Other proteins in same PDB: d1rm5a1, d1rm5b1, d1rm5o1
      complexed with ndp, so4; mutant
  6. Domain(s) for 2hki:
  7. Domain(s) for 2pkq:
    1. 2527390Domain d2pkqo2: 2pkq O:149-312 [145749]
      Other proteins in same PDB: d2pkqo1, d2pkqp1, d2pkqp3, d2pkqq1, d2pkqr1, d2pkqr3, d2pkqs1, d2pkqt1
      complexed with ndp, so4
    2. 2527391Domain d2pkqp2: 2pkq P:149-312 [139711]
      Other proteins in same PDB: d2pkqo1, d2pkqp1, d2pkqp3, d2pkqq1, d2pkqr1, d2pkqr3, d2pkqs1, d2pkqt1
      automatically matched to d1nboa2
      complexed with ndp, so4
    3. 2527392Domain d2pkqq2: 2pkq Q:149-312 [145751]
      Other proteins in same PDB: d2pkqo1, d2pkqp1, d2pkqp3, d2pkqq1, d2pkqr1, d2pkqr3, d2pkqs1, d2pkqt1
      automatically matched to 2PKQ O:149-312
      complexed with ndp, so4
    4. 2527393Domain d2pkqr2: 2pkq R:149-312 [139713]
      Other proteins in same PDB: d2pkqo1, d2pkqp1, d2pkqp3, d2pkqq1, d2pkqr1, d2pkqr3, d2pkqs1, d2pkqt1
      automatically matched to d1nboa2
      complexed with ndp, so4
    5. 2527394Domain d2pkqs2: 2pkq S:149-312 [139715]
      Other proteins in same PDB: d2pkqo1, d2pkqp1, d2pkqp3, d2pkqq1, d2pkqr1, d2pkqr3, d2pkqs1, d2pkqt1
      automatically matched to d1nboa2
      complexed with ndp, so4
    6. 2527395Domain d2pkqt2: 2pkq T:149-312 [145753]
      Other proteins in same PDB: d2pkqo1, d2pkqp1, d2pkqp3, d2pkqq1, d2pkqr1, d2pkqr3, d2pkqs1, d2pkqt1
      automatically matched to 2PKQ O:149-312
      complexed with ndp, so4
  8. Domain(s) for 2pkr:
    1. 2527375Domain d2pkra2: 2pkr A:149-312 [139717]
      Other proteins in same PDB: d2pkra1, d2pkrb1, d2pkrc1, d2pkrd1, d2pkrh1, d2pkri1, d2pkrl1, d2pkrm1, d2pkro1, d2pkrp1, d2pkrq1, d2pkrr1
      automatically matched to d1nboa2
      complexed with ndp, so4
    2. 2527376Domain d2pkrb2: 2pkr B:149-312 [139719]
      Other proteins in same PDB: d2pkra1, d2pkrb1, d2pkrc1, d2pkrd1, d2pkrh1, d2pkri1, d2pkrl1, d2pkrm1, d2pkro1, d2pkrp1, d2pkrq1, d2pkrr1
      automatically matched to d1nboa2
      complexed with ndp, so4
    3. 2527377Domain d2pkrc2: 2pkr C:149-312 [139721]
      Other proteins in same PDB: d2pkra1, d2pkrb1, d2pkrc1, d2pkrd1, d2pkrh1, d2pkri1, d2pkrl1, d2pkrm1, d2pkro1, d2pkrp1, d2pkrq1, d2pkrr1
      automatically matched to d1nboa2
      complexed with ndp, so4
    4. 2527378Domain d2pkrd2: 2pkr D:149-312 [139723]
      Other proteins in same PDB: d2pkra1, d2pkrb1, d2pkrc1, d2pkrd1, d2pkrh1, d2pkri1, d2pkrl1, d2pkrm1, d2pkro1, d2pkrp1, d2pkrq1, d2pkrr1
      automatically matched to d1nboa2
      complexed with ndp, so4
    5. 2527379Domain d2pkrh2: 2pkr H:149-312 [139725]
      Other proteins in same PDB: d2pkra1, d2pkrb1, d2pkrc1, d2pkrd1, d2pkrh1, d2pkri1, d2pkrl1, d2pkrm1, d2pkro1, d2pkrp1, d2pkrq1, d2pkrr1
      automatically matched to d1nboa2
      complexed with ndp, so4
    6. 2527380Domain d2pkri2: 2pkr I:149-312 [139727]
      Other proteins in same PDB: d2pkra1, d2pkrb1, d2pkrc1, d2pkrd1, d2pkrh1, d2pkri1, d2pkrl1, d2pkrm1, d2pkro1, d2pkrp1, d2pkrq1, d2pkrr1
      automatically matched to d1nboa2
      complexed with ndp, so4
    7. 2527381Domain d2pkrl2: 2pkr L:149-312 [139729]
      Other proteins in same PDB: d2pkra1, d2pkrb1, d2pkrc1, d2pkrd1, d2pkrh1, d2pkri1, d2pkrl1, d2pkrm1, d2pkro1, d2pkrp1, d2pkrq1, d2pkrr1
      automatically matched to d1nboa2
      complexed with ndp, so4
    8. 2527382Domain d2pkrm2: 2pkr M:149-312 [139731]
      Other proteins in same PDB: d2pkra1, d2pkrb1, d2pkrc1, d2pkrd1, d2pkrh1, d2pkri1, d2pkrl1, d2pkrm1, d2pkro1, d2pkrp1, d2pkrq1, d2pkrr1
      automatically matched to d1nboa2
      complexed with ndp, so4
    9. 2527383Domain d2pkro2: 2pkr O:149-312 [139733]
      Other proteins in same PDB: d2pkra1, d2pkrb1, d2pkrc1, d2pkrd1, d2pkrh1, d2pkri1, d2pkrl1, d2pkrm1, d2pkro1, d2pkrp1, d2pkrq1, d2pkrr1
      automatically matched to d1nboa2
      complexed with ndp, so4
    10. 2527384Domain d2pkrp2: 2pkr P:149-312 [139735]
      Other proteins in same PDB: d2pkra1, d2pkrb1, d2pkrc1, d2pkrd1, d2pkrh1, d2pkri1, d2pkrl1, d2pkrm1, d2pkro1, d2pkrp1, d2pkrq1, d2pkrr1
      automatically matched to d1nboa2
      complexed with ndp, so4
    11. 2527385Domain d2pkrq2: 2pkr Q:149-312 [139737]
      Other proteins in same PDB: d2pkra1, d2pkrb1, d2pkrc1, d2pkrd1, d2pkrh1, d2pkri1, d2pkrl1, d2pkrm1, d2pkro1, d2pkrp1, d2pkrq1, d2pkrr1
      automatically matched to d1nboa2
      complexed with ndp, so4
    12. 2527386Domain d2pkrr2: 2pkr R:149-312 [139739]
      Other proteins in same PDB: d2pkra1, d2pkrb1, d2pkrc1, d2pkrd1, d2pkrh1, d2pkri1, d2pkrl1, d2pkrm1, d2pkro1, d2pkrp1, d2pkrq1, d2pkrr1
      automatically matched to d1nboa2
      complexed with ndp, so4

More info for Species Spinach (Spinacia oleracea) [TaxId:3562] from d.81.1.1 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH)

Timeline for Species Spinach (Spinacia oleracea) [TaxId:3562] from d.81.1.1 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH):