SCOPe 2.06: Protein: Rho termination factor, N-terminal domain

Lineage for Protein: Rho termination factor, N-terminal domain

Root: SCOPe 2.06
Class a: All alpha proteins [46456] (289 folds)
Fold a.140: LEM/SAP HeH motif [63450] (6 superfamilies)
helix-extended loop-helix; parallel helices
Superfamily a.140.3: Rho N-terminal domain-like [68912] (2 families)
Family a.140.3.1: Rho termination factor, N-terminal domain [68913] (1 protein)
automatically mapped to Pfam PF07498
Protein Rho termination factor, N-terminal domain [68914] (1 species)

Species:

Escherichia coli [TaxId:562] [50295] (9 PDB entries)
Uniprot P03002

Domain for 1a62:
- Domain d1a62a1: 1a62 A:1-47 [64708]
  Other proteins in same PDB: d1a62a2
Domain for 1a63:
- Domain d1a63a1: 1a63 A:1-47 [64710]
  Other proteins in same PDB: d1a63a2
Domains for 1a8v:
1. Domain d1a8va1: 1a8v A:-1-47 [64712]
  Other proteins in same PDB: d1a8va2, d1a8vb2
  complexed with cu
2. Domain d1a8vb1: 1a8v B:-1-47 [64714]
  Other proteins in same PDB: d1a8va2, d1a8vb2
  complexed with cu
Domains for 1pv4:
1. Domain d1pv4a1: 1pv4 A:1-47 [88295]
  Other proteins in same PDB: d1pv4a2, d1pv4a3, d1pv4b1, d1pv4b2, d1pv4c2, d1pv4c3, d1pv4d2, d1pv4d3, d1pv4e2, d1pv4e3, d1pv4f2, d1pv4f3
  protein/DNA complex
2. Domain d1pv4c1: 1pv4 C:1-47 [88300]
  Other proteins in same PDB: d1pv4a2, d1pv4a3, d1pv4b1, d1pv4b2, d1pv4c2, d1pv4c3, d1pv4d2, d1pv4d3, d1pv4e2, d1pv4e3, d1pv4f2, d1pv4f3
  protein/DNA complex
3. Domain d1pv4d1: 1pv4 D:1-47 [88303]
  Other proteins in same PDB: d1pv4a2, d1pv4a3, d1pv4b1, d1pv4b2, d1pv4c2, d1pv4c3, d1pv4d2, d1pv4d3, d1pv4e2, d1pv4e3, d1pv4f2, d1pv4f3
  protein/DNA complex
4. Domain d1pv4e1: 1pv4 E:1-47 [88306]
  Other proteins in same PDB: d1pv4a2, d1pv4a3, d1pv4b1, d1pv4b2, d1pv4c2, d1pv4c3, d1pv4d2, d1pv4d3, d1pv4e2, d1pv4e3, d1pv4f2, d1pv4f3
  protein/DNA complex
5. Domain d1pv4f1: 1pv4 F:1-47 [88309]
  Other proteins in same PDB: d1pv4a2, d1pv4a3, d1pv4b1, d1pv4b2, d1pv4c2, d1pv4c3, d1pv4d2, d1pv4d3, d1pv4e2, d1pv4e3, d1pv4f2, d1pv4f3
  protein/DNA complex

Domains for 1pvo:

Domain d1pvoa1: 1pvo A:1-47 [88316]
Other proteins in same PDB: d1pvoa2, d1pvoa3, d1pvob1, d1pvob2, d1pvoc2, d1pvoc3, d1pvod2, d1pvod3, d1pvoe2, d1pvoe3, d1pvof2, d1pvof3
protein/RNA complex; complexed with anp

Domain d1pvoc1: 1pvo C:1-47 [88321]
Other proteins in same PDB: d1pvoa2, d1pvoa3, d1pvob1, d1pvob2, d1pvoc2, d1pvoc3, d1pvod2, d1pvod3, d1pvoe2, d1pvoe3, d1pvof2, d1pvof3
protein/RNA complex; complexed with anp

Domain d1pvod1: 1pvo D:1-47 [88324]
Other proteins in same PDB: d1pvoa2, d1pvoa3, d1pvob1, d1pvob2, d1pvoc2, d1pvoc3, d1pvod2, d1pvod3, d1pvoe2, d1pvoe3, d1pvof2, d1pvof3
protein/RNA complex; complexed with anp

Domain d1pvoe1: 1pvo E:1-47 [88327]
Other proteins in same PDB: d1pvoa2, d1pvoa3, d1pvob1, d1pvob2, d1pvoc2, d1pvoc3, d1pvod2, d1pvod3, d1pvoe2, d1pvoe3, d1pvof2, d1pvof3
protein/RNA complex; complexed with anp

Domain d1pvof1: 1pvo F:1-47 [88330]
Other proteins in same PDB: d1pvoa2, d1pvoa3, d1pvob1, d1pvob2, d1pvoc2, d1pvoc3, d1pvod2, d1pvod3, d1pvoe2, d1pvoe3, d1pvof2, d1pvof3
protein/RNA complex; complexed with anp

Domains for 1xpo:

Domain d1xpoa1: 1xpo A:1-47 [122212]
Other proteins in same PDB: d1xpoa2, d1xpoa3, d1xpob2, d1xpob3, d1xpoc2, d1xpoc3, d1xpod2, d1xpod3, d1xpoe2, d1xpoe3, d1xpof2, d1xpof3
automatically matched to d1a8va1
protein/RNA complex; complexed with ags, bcm, mg

Domain d1xpob1: 1xpo B:1-47 [122215]
Other proteins in same PDB: d1xpoa2, d1xpoa3, d1xpob2, d1xpob3, d1xpoc2, d1xpoc3, d1xpod2, d1xpod3, d1xpoe2, d1xpoe3, d1xpof2, d1xpof3
automatically matched to d1a8va1
protein/RNA complex; complexed with ags, bcm, mg

Domain d1xpoc1: 1xpo C:1-47 [122218]
Other proteins in same PDB: d1xpoa2, d1xpoa3, d1xpob2, d1xpob3, d1xpoc2, d1xpoc3, d1xpod2, d1xpod3, d1xpoe2, d1xpoe3, d1xpof2, d1xpof3
automatically matched to d1a8va1
protein/RNA complex; complexed with ags, bcm, mg

Domain d1xpod1: 1xpo D:1-47 [122221]
Other proteins in same PDB: d1xpoa2, d1xpoa3, d1xpob2, d1xpob3, d1xpoc2, d1xpoc3, d1xpod2, d1xpod3, d1xpoe2, d1xpoe3, d1xpof2, d1xpof3
automatically matched to d1a8va1
protein/RNA complex; complexed with ags, bcm, mg

Domain d1xpoe1: 1xpo E:1-47 [122224]
Other proteins in same PDB: d1xpoa2, d1xpoa3, d1xpob2, d1xpob3, d1xpoc2, d1xpoc3, d1xpod2, d1xpod3, d1xpoe2, d1xpoe3, d1xpof2, d1xpof3
automatically matched to d1a8va1
protein/RNA complex; complexed with ags, bcm, mg

Domain d1xpof1: 1xpo F:1-47 [122227]
Other proteins in same PDB: d1xpoa2, d1xpoa3, d1xpob2, d1xpob3, d1xpoc2, d1xpoc3, d1xpod2, d1xpod3, d1xpoe2, d1xpoe3, d1xpof2, d1xpof3
automatically matched to d1a8va1
protein/RNA complex; complexed with ags, bcm, mg

Domains for 1xpr:

Domain d1xpra1: 1xpr A:1-47 [115772]
Other proteins in same PDB: d1xpra2, d1xpra3, d1xprb2, d1xprb3, d1xprc2, d1xprc3, d1xprd2, d1xprd3, d1xpre2, d1xpre3, d1xprf2, d1xprf3
protein/RNA complex; complexed with ags, fb, mg

Domain d1xprb1: 1xpr B:1-47 [115775]
Other proteins in same PDB: d1xpra2, d1xpra3, d1xprb2, d1xprb3, d1xprc2, d1xprc3, d1xprd2, d1xprd3, d1xpre2, d1xpre3, d1xprf2, d1xprf3
protein/RNA complex; complexed with ags, fb, mg

Domain d1xprc1: 1xpr C:1-47 [115778]
Other proteins in same PDB: d1xpra2, d1xpra3, d1xprb2, d1xprb3, d1xprc2, d1xprc3, d1xprd2, d1xprd3, d1xpre2, d1xpre3, d1xprf2, d1xprf3
protein/RNA complex; complexed with ags, fb, mg

Domain d1xprd1: 1xpr D:1-47 [115781]
Other proteins in same PDB: d1xpra2, d1xpra3, d1xprb2, d1xprb3, d1xprc2, d1xprc3, d1xprd2, d1xprd3, d1xpre2, d1xpre3, d1xprf2, d1xprf3
protein/RNA complex; complexed with ags, fb, mg

Domain d1xpre1: 1xpr E:1-47 [115784]
Other proteins in same PDB: d1xpra2, d1xpra3, d1xprb2, d1xprb3, d1xprc2, d1xprc3, d1xprd2, d1xprd3, d1xpre2, d1xpre3, d1xprf2, d1xprf3
protein/RNA complex; complexed with ags, fb, mg

Domain d1xprf1: 1xpr F:1-47 [115787]
Other proteins in same PDB: d1xpra2, d1xpra3, d1xprb2, d1xprb3, d1xprc2, d1xprc3, d1xprd2, d1xprd3, d1xpre2, d1xpre3, d1xprf2, d1xprf3
protein/RNA complex; complexed with ags, fb, mg

Domains for 1xpu:

Domain d1xpua1: 1xpu A:1-47 [115790]
Other proteins in same PDB: d1xpua2, d1xpua3, d1xpub2, d1xpub3, d1xpuc2, d1xpuc3, d1xpud2, d1xpud3, d1xpue2, d1xpue3, d1xpuf2, d1xpuf3
protein/RNA complex; complexed with ags, fpd, mg

Domain d1xpub1: 1xpu B:1-47 [115793]
Other proteins in same PDB: d1xpua2, d1xpua3, d1xpub2, d1xpub3, d1xpuc2, d1xpuc3, d1xpud2, d1xpud3, d1xpue2, d1xpue3, d1xpuf2, d1xpuf3
protein/RNA complex; complexed with ags, fpd, mg

Domain d1xpuc1: 1xpu C:1-47 [115796]
Other proteins in same PDB: d1xpua2, d1xpua3, d1xpub2, d1xpub3, d1xpuc2, d1xpuc3, d1xpud2, d1xpud3, d1xpue2, d1xpue3, d1xpuf2, d1xpuf3
protein/RNA complex; complexed with ags, fpd, mg

Domain d1xpud1: 1xpu D:1-47 [115799]
Other proteins in same PDB: d1xpua2, d1xpua3, d1xpub2, d1xpub3, d1xpuc2, d1xpuc3, d1xpud2, d1xpud3, d1xpue2, d1xpue3, d1xpuf2, d1xpuf3
protein/RNA complex; complexed with ags, fpd, mg

Domain d1xpue1: 1xpu E:1-47 [115802]
Other proteins in same PDB: d1xpua2, d1xpua3, d1xpub2, d1xpub3, d1xpuc2, d1xpuc3, d1xpud2, d1xpud3, d1xpue2, d1xpue3, d1xpuf2, d1xpuf3
protein/RNA complex; complexed with ags, fpd, mg

Domain d1xpuf1: 1xpu F:1-47 [115805]
Other proteins in same PDB: d1xpua2, d1xpua3, d1xpub2, d1xpub3, d1xpuc2, d1xpuc3, d1xpud2, d1xpud3, d1xpue2, d1xpue3, d1xpuf2, d1xpuf3
protein/RNA complex; complexed with ags, fpd, mg

Domains for 2a8v:
1. Domain d2a8va1: 2a8v A:1-47 [64752]
  Other proteins in same PDB: d2a8va2, d2a8vb2, d2a8vc2
  protein/RNA complex
2. Domain d2a8vb1: 2a8v B:1-47 [64754]
  Other proteins in same PDB: d2a8va2, d2a8vb2, d2a8vc2
  protein/RNA complex
3. Domain d2a8vc1: 2a8v C:1-47 [64756]
  Other proteins in same PDB: d2a8va2, d2a8vb2, d2a8vc2
  protein/RNA complex

More info for Protein Rho termination factor, N-terminal domain from a.140.3.1: Rho termination factor, N-terminal domain

Timeline for Protein Rho termination factor, N-terminal domain from a.140.3.1: Rho termination factor, N-terminal domain:

Protein Rho termination factor, N-terminal domain from a.140.3.1: Rho termination factor, N-terminal domain first appeared in SCOP 1.59
Protein Rho termination factor, N-terminal domain from a.140.3.1: Rho termination factor, N-terminal domain appears in SCOPe 2.05
Protein Rho termination factor, N-terminal domain from a.140.3.1: Rho termination factor, N-terminal domain appears in SCOPe 2.07
Protein Rho termination factor, N-terminal domain from a.140.3.1: Rho termination factor, N-terminal domain appears in the current release, SCOPe 2.08