Lineage for Protein: RNA polymerase omega subunit

  1. Root: SCOPe 2.01
  2. 901761Class a: All alpha proteins [46456] (284 folds)
  3. 926369Fold a.143: RPB6/omega subunit-like [63561] (1 superfamily)
    core: 2 helices and adjacent loops
  4. 926370Superfamily a.143.1: RPB6/omega subunit-like [63562] (2 families) (S)
    the bacterial omega and eukaryotic RPB6 subunits both function in polymerase assembly; the common core is involved in conserved interactions with other subunits
  5. 926371Family a.143.1.1: RNA polymerase omega subunit [63563] (2 proteins)
    4 helices; irregular array
  6. 926372Protein RNA polymerase omega subunit [63564] (3 species)

Species:

  1. 926373Thermus aquaticus [TaxId:271] [63565] (3 PDB entries)
    1. Domain for 1i6v:
    2. Domain for 1ynj:
    3. Domain for 1ynn:
  2. 926377Thermus thermophilus HB8 [TaxId:300852] [158241] (1 PDB entry)
  3. 926380Thermus thermophilus [TaxId:274] [74729] (4 PDB entries)
    Uniprot Q8RQE7; part of multichain biological unit
    1. Domains for 1iw7:
      1. 926383Domain d1iw7e_: 1iw7 E: [71476]
        Other proteins in same PDB: d1iw7a1, d1iw7a2, d1iw7b1, d1iw7b2, d1iw7c_, d1iw7d_, d1iw7f1, d1iw7f2, d1iw7f3, d1iw7k1, d1iw7k2, d1iw7l1, d1iw7l2, d1iw7m_, d1iw7n_, d1iw7p1, d1iw7p2, d1iw7p3
        complexed with mg, pb
      2. 926384Domain d1iw7o_: 1iw7 O: [71484]
        Other proteins in same PDB: d1iw7a1, d1iw7a2, d1iw7b1, d1iw7b2, d1iw7c_, d1iw7d_, d1iw7f1, d1iw7f2, d1iw7f3, d1iw7k1, d1iw7k2, d1iw7l1, d1iw7l2, d1iw7m_, d1iw7n_, d1iw7p1, d1iw7p2, d1iw7p3
        complexed with mg, pb
    2. Domains for 1smy:
      1. 926381Domain d1smye_: 1smy E: [105780]
        Other proteins in same PDB: d1smya1, d1smya2, d1smyb1, d1smyb2, d1smyc_, d1smyd_, d1smyf1, d1smyf2, d1smyf3, d1smyk1, d1smyk2, d1smyl1, d1smyl2, d1smym_, d1smyn_, d1smyp1, d1smyp2, d1smyp3
        complexed with g4p, mg, zn
      2. 926382Domain d1smyo_: 1smy O: [105790]
        Other proteins in same PDB: d1smya1, d1smya2, d1smyb1, d1smyb2, d1smyc_, d1smyd_, d1smyf1, d1smyf2, d1smyf3, d1smyk1, d1smyk2, d1smyl1, d1smyl2, d1smym_, d1smyn_, d1smyp1, d1smyp2, d1smyp3
        complexed with g4p, mg, zn
    3. Domains for 1zyr:
      1. 926385Domain d1zyre1: 1zyr E:2-96 [125855]
        Other proteins in same PDB: d1zyra1, d1zyra2, d1zyrb1, d1zyrb2, d1zyrc1, d1zyrd1, d1zyrf1, d1zyrf2, d1zyrf3, d1zyrk1, d1zyrk2, d1zyrl1, d1zyrl2, d1zyrm1, d1zyrn1, d1zyrp1, d1zyrp2, d1zyrp3
        automatically matched to d1iw7e_
        protein/RNA complex; complexed with mg, std, zn
      2. 926386Domain d1zyro1: 1zyr O:2-96 [125865]
        Other proteins in same PDB: d1zyra1, d1zyra2, d1zyrb1, d1zyrb2, d1zyrc1, d1zyrd1, d1zyrf1, d1zyrf2, d1zyrf3, d1zyrk1, d1zyrk2, d1zyrl1, d1zyrl2, d1zyrm1, d1zyrn1, d1zyrp1, d1zyrp2, d1zyrp3
        automatically matched to d1iw7e_
        protein/RNA complex; complexed with mg, std, zn
    4. Domains for 2cw0:
      1. 926387Domain d2cw0e1: 2cw0 E:2-96 [130904]
        Other proteins in same PDB: d2cw0a1, d2cw0a2, d2cw0b1, d2cw0b2, d2cw0c1, d2cw0d1, d2cw0f1, d2cw0f2, d2cw0f3, d2cw0k1, d2cw0k2, d2cw0l1, d2cw0l2, d2cw0m1, d2cw0n1, d2cw0p1, d2cw0p2, d2cw0p3
        automatically matched to d1iw7e_
        complexed with mg, zn
      2. 926388Domain d2cw0o1: 2cw0 O:2-96 [130914]
        Other proteins in same PDB: d2cw0a1, d2cw0a2, d2cw0b1, d2cw0b2, d2cw0c1, d2cw0d1, d2cw0f1, d2cw0f2, d2cw0f3, d2cw0k1, d2cw0k2, d2cw0l1, d2cw0l2, d2cw0m1, d2cw0n1, d2cw0p1, d2cw0p2, d2cw0p3
        automatically matched to d1iw7e_
        complexed with mg, zn

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