SCOPe 2.03: Species: Pseudomonas putida [TaxId: 303]

Lineage for Species: Pseudomonas putida [TaxId: 303]

Root: SCOPe 2.03
Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (147 folds)
Fold c.31: DHS-like NAD/FAD-binding domain [52466] (1 superfamily)
3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 321456; Rossmann-like
Superfamily c.31.1: DHS-like NAD/FAD-binding domain [52467] (7 families)
binds cofactor molecules in the opposite direction than classical Rossmann fold
Family c.31.1.3: Pyruvate oxidase and decarboxylase, middle domain [52475] (8 proteins)
N-terminal domain is Pyr module, and C-terminal domain is PP module of thiamin diphosphate-binding fold
Protein Benzoylformate decarboxylase [52482] (1 species)
Species Pseudomonas putida [TaxId:303] [52483] (10 PDB entries)
Uniprot P20906

PDB entries in Species: Pseudomonas putida [TaxId: 303]:

Domain(s) for 1bfd:
- Domain d1bfda1: 1bfd A:182-341 [31745]
  Other proteins in same PDB: d1bfda2, d1bfda3
  complexed with ca, mg, tpp

Domain(s) for 1mcz:

Domain d1mcza1: 1mcz A:182-341 [78952]
Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
complexed with mg, rmn, tdp

Domain d1mczb1: 1mcz B:182-341 [78955]
Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
complexed with mg, rmn, tdp

Domain d1mczc1: 1mcz C:182-341 [78958]
Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
complexed with mg, rmn, tdp

Domain d1mczd1: 1mcz D:182-341 [78961]
Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
complexed with mg, rmn, tdp

Domain d1mcze1: 1mcz E:182-341 [78964]
Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
complexed with mg, rmn, tdp

Domain d1mczf1: 1mcz F:182-341 [78967]
Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
complexed with mg, rmn, tdp

Domain d1mczg1: 1mcz G:182-341 [78970]
Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
complexed with mg, rmn, tdp

Domain d1mczh1: 1mcz H:182-341 [78973]
Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
complexed with mg, rmn, tdp

Domain d1mczi1: 1mcz I:182-341 [78976]
Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
complexed with mg, rmn, tdp

Domain d1mczj1: 1mcz J:182-341 [78979]
Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
complexed with mg, rmn, tdp

Domain d1mczk1: 1mcz K:182-341 [78982]
Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
complexed with mg, rmn, tdp

Domain d1mczl1: 1mcz L:182-341 [78985]
Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
complexed with mg, rmn, tdp

Domain d1mczm1: 1mcz M:182-341 [78988]
Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
complexed with mg, rmn, tdp

Domain d1mczn1: 1mcz N:182-341 [78991]
Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
complexed with mg, rmn, tdp

Domain d1mczo1: 1mcz O:182-341 [78994]
Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
complexed with mg, rmn, tdp

Domain d1mczp1: 1mcz P:182-341 [78997]
Other proteins in same PDB: d1mcza2, d1mcza3, d1mczb2, d1mczb3, d1mczc2, d1mczc3, d1mczd2, d1mczd3, d1mcze2, d1mcze3, d1mczf2, d1mczf3, d1mczg2, d1mczg3, d1mczh2, d1mczh3, d1mczi2, d1mczi3, d1mczj2, d1mczj3, d1mczk2, d1mczk3, d1mczl2, d1mczl3, d1mczm2, d1mczm3, d1mczn2, d1mczn3, d1mczo2, d1mczo3, d1mczp2, d1mczp3
complexed with mg, rmn, tdp

Domain(s) for 1pi3:
- Domain d1pi3a1: 1pi3 A:182-341 [111633]
  Other proteins in same PDB: d1pi3a2, d1pi3a3
  complexed with ca, mg, tzd; mutant
Domain(s) for 1po7:
- Domain d1po7a1: 1po7 A:182-341 [111636]
  Other proteins in same PDB: d1po7a2, d1po7a3
  complexed with ca, mg, tzd; mutant
Domain(s) for 1q6z:
- Domain d1q6za1: 1q6z A:182-341 [111655]
  Other proteins in same PDB: d1q6za2, d1q6za3
  complexed with ca, mg, tzd; mutant
Domain(s) for 1yno:
- Domain d1ynoa1: 1yno A:182-341 [123747]
  Other proteins in same PDB: d1ynoa2, d1ynoa3
  automatically matched to d1bfd_1
  complexed with ca, mg, tzd
Domain(s) for 2fn3:
- Domain d2fn3a1: 2fn3 A:182-341 [133803]
  Other proteins in same PDB: d2fn3a2, d2fn3a3
  automatically matched to d1bfd_1
  complexed with ca, mg, tzd; mutant
Domain(s) for 2fwn:
- Domain d2fwna1: 2fwn A:182-341 [134249]
  Other proteins in same PDB: d2fwna2, d2fwna3
  automated match to d1mcza1
  complexed with ca, mg, tdp
Domain(s) for 2v3w:
1. Domain d2v3wa1: 2v3w A:182-341 [152465]
  Other proteins in same PDB: d2v3wa2, d2v3wa3, d2v3wb2, d2v3wb3, d2v3wc2, d2v3wc3, d2v3wd2, d2v3wd3
  automatically matched to d1bfda1
  complexed with mg, so4, tpp
2. Domain d2v3wb1: 2v3w B:182-341 [152468]
  Other proteins in same PDB: d2v3wa2, d2v3wa3, d2v3wb2, d2v3wb3, d2v3wc2, d2v3wc3, d2v3wd2, d2v3wd3
  automatically matched to d1bfda1
  complexed with mg, so4, tpp
3. Domain d2v3wc1: 2v3w C:182-341 [152471]
  Other proteins in same PDB: d2v3wa2, d2v3wa3, d2v3wb2, d2v3wb3, d2v3wc2, d2v3wc3, d2v3wd2, d2v3wd3
  automatically matched to d1bfda1
  complexed with mg, so4, tpp
4. Domain d2v3wd1: 2v3w D:182-341 [152474]
  Other proteins in same PDB: d2v3wa2, d2v3wa3, d2v3wb2, d2v3wb3, d2v3wc2, d2v3wc3, d2v3wd2, d2v3wd3
  automatically matched to d1bfda1
  complexed with mg, so4, tpp
Domain(s) for 3fsj:
- Domain d3fsjx2: 3fsj X:182-341 [210085]
  Other proteins in same PDB: d3fsjx1, d3fsjx3
  automated match to d1mcza1
  complexed with ca, d7k

More info for Species Pseudomonas putida [TaxId:303] from c.31.1.3 Benzoylformate decarboxylase

Timeline for Species Pseudomonas putida [TaxId:303] from c.31.1.3 Benzoylformate decarboxylase:

Species Pseudomonas putida [TaxId:303] from c.31.1.3 Benzoylformate decarboxylase first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55
Species Pseudomonas putida [TaxId:303] from c.31.1.3 Benzoylformate decarboxylase appears in SCOPe 2.02
Species Pseudomonas putida [TaxId:303] from c.31.1.3 Benzoylformate decarboxylase appears in SCOPe 2.04
Species Pseudomonas putida [TaxId:303] from c.31.1.3 Benzoylformate decarboxylase appears in the current release, SCOPe 2.08