SCOPe 2.06: Protein: Carboxyethylarginine synthase

Lineage for Protein: Carboxyethylarginine synthase

Root: SCOPe 2.06
Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
Fold c.31: DHS-like NAD/FAD-binding domain [52466] (1 superfamily)
3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 321456; Rossmann-like
Superfamily c.31.1: DHS-like NAD/FAD-binding domain [52467] (7 families)
binds cofactor molecules in the opposite direction than classical Rossmann fold
Family c.31.1.3: Pyruvate oxidase and decarboxylase, middle domain [52475] (8 proteins)
N-terminal domain is Pyr module, and C-terminal domain is PP module of thiamin diphosphate-binding fold
Protein Carboxyethylarginine synthase [102290] (1 species)

Species:

Streptomyces clavuligerus [TaxId:1901] [102291] (6 PDB entries)

Domains for 1upa:
1. Domain d1upaa1: 1upa A:198-374 [99714]
  Other proteins in same PDB: d1upaa2, d1upaa3, d1upab2, d1upab3, d1upac2, d1upac3, d1upad2, d1upad3
  complexed with mg, so4, tpp
2. Domain d1upab1: 1upa B:198-374 [99717]
  Other proteins in same PDB: d1upaa2, d1upaa3, d1upab2, d1upab3, d1upac2, d1upac3, d1upad2, d1upad3
  complexed with mg, so4, tpp
3. Domain d1upac1: 1upa C:198-374 [99720]
  Other proteins in same PDB: d1upaa2, d1upaa3, d1upab2, d1upab3, d1upac2, d1upac3, d1upad2, d1upad3
  complexed with mg, so4, tpp
4. Domain d1upad1: 1upa D:198-374 [99723]
  Other proteins in same PDB: d1upaa2, d1upaa3, d1upab2, d1upab3, d1upac2, d1upac3, d1upad2, d1upad3
  complexed with mg, so4, tpp
Domains for 1upb:
1. Domain d1upba1: 1upb A:198-374 [99726]
  Other proteins in same PDB: d1upba2, d1upba3, d1upbb2, d1upbb3, d1upbc2, d1upbc3, d1upbd2, d1upbd3
  complexed with mg, so4, tpp
2. Domain d1upbb1: 1upb B:198-374 [99729]
  Other proteins in same PDB: d1upba2, d1upba3, d1upbb2, d1upbb3, d1upbc2, d1upbc3, d1upbd2, d1upbd3
  complexed with mg, so4, tpp
3. Domain d1upbc1: 1upb C:198-374 [99732]
  Other proteins in same PDB: d1upba2, d1upba3, d1upbb2, d1upbb3, d1upbc2, d1upbc3, d1upbd2, d1upbd3
  complexed with mg, so4, tpp
4. Domain d1upbd1: 1upb D:198-374 [99735]
  Other proteins in same PDB: d1upba2, d1upba3, d1upbb2, d1upbb3, d1upbc2, d1upbc3, d1upbd2, d1upbd3
  complexed with mg, so4, tpp
Domains for 1upc:
1. Domain d1upca1: 1upc A:198-374 [99738]
  Other proteins in same PDB: d1upca2, d1upca3, d1upcb2, d1upcb3, d1upcc2, d1upcc3, d1upcd2, d1upcd3, d1upce2, d1upce3, d1upcf2, d1upcf3
  complexed with mg, so4, tpp
2. Domain d1upcb1: 1upc B:198-374 [99741]
  Other proteins in same PDB: d1upca2, d1upca3, d1upcb2, d1upcb3, d1upcc2, d1upcc3, d1upcd2, d1upcd3, d1upce2, d1upce3, d1upcf2, d1upcf3
  complexed with mg, so4, tpp
3. Domain d1upcc1: 1upc C:198-374 [99744]
  Other proteins in same PDB: d1upca2, d1upca3, d1upcb2, d1upcb3, d1upcc2, d1upcc3, d1upcd2, d1upcd3, d1upce2, d1upce3, d1upcf2, d1upcf3
  complexed with mg, so4, tpp
4. Domain d1upcd1: 1upc D:198-374 [99747]
  Other proteins in same PDB: d1upca2, d1upca3, d1upcb2, d1upcb3, d1upcc2, d1upcc3, d1upcd2, d1upcd3, d1upce2, d1upce3, d1upcf2, d1upcf3
  complexed with mg, so4, tpp
5. Domain d1upce1: 1upc E:198-374 [99750]
  Other proteins in same PDB: d1upca2, d1upca3, d1upcb2, d1upcb3, d1upcc2, d1upcc3, d1upcd2, d1upcd3, d1upce2, d1upce3, d1upcf2, d1upcf3
  complexed with mg, so4, tpp
6. Domain d1upcf1: 1upc F:198-374 [99753]
  Other proteins in same PDB: d1upca2, d1upca3, d1upcb2, d1upcb3, d1upcc2, d1upcc3, d1upcd2, d1upcd3, d1upce2, d1upce3, d1upcf2, d1upcf3
  complexed with mg, so4, tpp
Domains for 2iht:
1. Domain d2ihta1: 2iht A:198-374 [147685]
  Other proteins in same PDB: d2ihta2, d2ihta3, d2ihtb2, d2ihtb3, d2ihtc2, d2ihtc3, d2ihtd2, d2ihtd3
  automated match to d1upaa1
  complexed with gol, mg, so4, tpp
2. Domain d2ihtb1: 2iht B:198-374 [147688]
  Other proteins in same PDB: d2ihta2, d2ihta3, d2ihtb2, d2ihtb3, d2ihtc2, d2ihtc3, d2ihtd2, d2ihtd3
  automated match to d1upaa1
  complexed with gol, mg, so4, tpp
3. Domain d2ihtc1: 2iht C:198-374 [147691]
  Other proteins in same PDB: d2ihta2, d2ihta3, d2ihtb2, d2ihtb3, d2ihtc2, d2ihtc3, d2ihtd2, d2ihtd3
  automated match to d1upaa1
  complexed with gol, mg, so4, tpp
4. Domain d2ihtd1: 2iht D:198-374 [147694]
  Other proteins in same PDB: d2ihta2, d2ihta3, d2ihtb2, d2ihtb3, d2ihtc2, d2ihtc3, d2ihtd2, d2ihtd3
  automated match to d1upaa1
  complexed with gol, mg, so4, tpp

Domains for 2ihu:

Domain d2ihua1: 2ihu A:198-374 [147697]
Other proteins in same PDB: d2ihua2, d2ihua3, d2ihub1, d2ihub3, d2ihuc1, d2ihuc3, d2ihud1, d2ihud3
automated match to d1upaa1
complexed with gol, k, mg, tar, tp8, tp9

Domain d2ihub2: 2ihu B:198-374 [198066]
Other proteins in same PDB: d2ihua2, d2ihua3, d2ihub1, d2ihub3, d2ihuc1, d2ihuc3, d2ihud1, d2ihud3
automated match to d1upaa1
complexed with gol, k, mg, tar, tp8, tp9

Domain d2ihuc2: 2ihu C:198-374 [198069]
Other proteins in same PDB: d2ihua2, d2ihua3, d2ihub1, d2ihub3, d2ihuc1, d2ihuc3, d2ihud1, d2ihud3
automated match to d1upaa1
complexed with gol, k, mg, tar, tp8, tp9

Domain d2ihud2: 2ihu D:198-374 [198072]
Other proteins in same PDB: d2ihua2, d2ihua3, d2ihub1, d2ihub3, d2ihuc1, d2ihuc3, d2ihud1, d2ihud3
automated match to d1upaa1
complexed with gol, k, mg, tar, tp8, tp9

Domains for 2ihv:
1. Domain d2ihva1: 2ihv A:198-374 [147700]
  Other proteins in same PDB: d2ihva2, d2ihva3, d2ihvb2, d2ihvb3, d2ihvc1, d2ihvc3, d2ihvd2, d2ihvd3
  automated match to d1upaa1
  complexed with gva, k, mg, tpp
2. Domain d2ihvb1: 2ihv B:198-374 [147703]
  Other proteins in same PDB: d2ihva2, d2ihva3, d2ihvb2, d2ihvb3, d2ihvc1, d2ihvc3, d2ihvd2, d2ihvd3
  automated match to d1upaa1
  complexed with gva, k, mg, tpp
3. Domain d2ihvc2: 2ihv C:198-374 [198075]
  Other proteins in same PDB: d2ihva2, d2ihva3, d2ihvb2, d2ihvb3, d2ihvc1, d2ihvc3, d2ihvd2, d2ihvd3
  automated match to d1upaa1
  complexed with gva, k, mg, tpp
4. Domain d2ihvd1: 2ihv D:198-374 [147706]
  Other proteins in same PDB: d2ihva2, d2ihva3, d2ihvb2, d2ihvb3, d2ihvc1, d2ihvc3, d2ihvd2, d2ihvd3
  automated match to d1upaa1
  complexed with gva, k, mg, tpp

More info for Protein Carboxyethylarginine synthase from c.31.1.3: Pyruvate oxidase and decarboxylase, middle domain

Timeline for Protein Carboxyethylarginine synthase from c.31.1.3: Pyruvate oxidase and decarboxylase, middle domain:

Protein Carboxyethylarginine synthase from c.31.1.3: Pyruvate oxidase and decarboxylase, middle domain first appeared in SCOP 1.67
Protein Carboxyethylarginine synthase from c.31.1.3: Pyruvate oxidase and decarboxylase, middle domain appears in SCOPe 2.05
Protein Carboxyethylarginine synthase from c.31.1.3: Pyruvate oxidase and decarboxylase, middle domain appears in SCOPe 2.07
Protein Carboxyethylarginine synthase from c.31.1.3: Pyruvate oxidase and decarboxylase, middle domain appears in the current release, SCOPe 2.08