Lineage for Species: Pseudomonas putida [TaxId: 303]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2078559Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 2108258Fold c.36: Thiamin diphosphate-binding fold (THDP-binding) [52517] (1 superfamily)
    3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 213465
  4. 2108259Superfamily c.36.1: Thiamin diphosphate-binding fold (THDP-binding) [52518] (9 families) (S)
    there are two different functional modules of this fold: pyridine-binding (Pyr) and pyrophosphate-binding (PP) modules
    two Pyr and two PP modules assemble together in a conserved heterotetrameric core that binds two THDP coenzyme molecules
  5. 2108535Family c.36.1.9: Pyruvate oxidase and decarboxylase PP module [88749] (8 protein domains)
    the N-terminal, Pyr module is separated from the C-terminal, PP module by an alpa/beta domain of Rossmann-like topology
  6. 2108559Protein Benzoylformate decarboxylase [88756] (1 species)
  7. 2108560Species Pseudomonas putida [TaxId:303] [88757] (7 PDB entries)
    Uniprot P20906

PDB entries in Species: Pseudomonas putida [TaxId: 303]:

  1. Domain(s) for 1bfd:
  2. Domain(s) for 1mcz:
    1. 2108567Domain d1mcza3: 1mcz A:342-525 [78954]
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      complexed with mg, rmn, tdp
    2. 2108568Domain d1mczb3: 1mcz B:342-525 [78957]
      Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mcza2, d1mczb1, d1mczb2, d1mczc1, d1mczc2, d1mczd1, d1mczd2, d1mcze1, d1mcze2, d1mczf1, d1mczf2, d1mczg1, d1mczg2, d1mczh1, d1mczh2, d1mczi1, d1mczi2, d1mczj1, d1mczj2, d1mczk1, d1mczk2, d1mczl1, d1mczl2, d1mczm1, d1mczm2, d1mczn1, d1mczn2, d1mczo1, d1mczo2, d1mczp1, d1mczp2
      complexed with mg, rmn, tdp
    3. 2108569Domain d1mczc3: 1mcz C:342-525 [78960]
      Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mcza2, d1mczb1, d1mczb2, d1mczc1, d1mczc2, d1mczd1, d1mczd2, d1mcze1, d1mcze2, d1mczf1, d1mczf2, d1mczg1, d1mczg2, d1mczh1, d1mczh2, d1mczi1, d1mczi2, d1mczj1, d1mczj2, d1mczk1, d1mczk2, d1mczl1, d1mczl2, d1mczm1, d1mczm2, d1mczn1, d1mczn2, d1mczo1, d1mczo2, d1mczp1, d1mczp2
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    4. 2108570Domain d1mczd3: 1mcz D:342-525 [78963]
      Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mcza2, d1mczb1, d1mczb2, d1mczc1, d1mczc2, d1mczd1, d1mczd2, d1mcze1, d1mcze2, d1mczf1, d1mczf2, d1mczg1, d1mczg2, d1mczh1, d1mczh2, d1mczi1, d1mczi2, d1mczj1, d1mczj2, d1mczk1, d1mczk2, d1mczl1, d1mczl2, d1mczm1, d1mczm2, d1mczn1, d1mczn2, d1mczo1, d1mczo2, d1mczp1, d1mczp2
      complexed with mg, rmn, tdp
    5. 2108571Domain d1mcze3: 1mcz E:342-525 [78966]
      Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mcza2, d1mczb1, d1mczb2, d1mczc1, d1mczc2, d1mczd1, d1mczd2, d1mcze1, d1mcze2, d1mczf1, d1mczf2, d1mczg1, d1mczg2, d1mczh1, d1mczh2, d1mczi1, d1mczi2, d1mczj1, d1mczj2, d1mczk1, d1mczk2, d1mczl1, d1mczl2, d1mczm1, d1mczm2, d1mczn1, d1mczn2, d1mczo1, d1mczo2, d1mczp1, d1mczp2
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    6. 2108572Domain d1mczf3: 1mcz F:342-525 [78969]
      Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mcza2, d1mczb1, d1mczb2, d1mczc1, d1mczc2, d1mczd1, d1mczd2, d1mcze1, d1mcze2, d1mczf1, d1mczf2, d1mczg1, d1mczg2, d1mczh1, d1mczh2, d1mczi1, d1mczi2, d1mczj1, d1mczj2, d1mczk1, d1mczk2, d1mczl1, d1mczl2, d1mczm1, d1mczm2, d1mczn1, d1mczn2, d1mczo1, d1mczo2, d1mczp1, d1mczp2
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    7. 2108573Domain d1mczg3: 1mcz G:342-525 [78972]
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    8. 2108574Domain d1mczh3: 1mcz H:342-525 [78975]
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    9. 2108575Domain d1mczi3: 1mcz I:342-525 [78978]
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    10. 2108576Domain d1mczj3: 1mcz J:342-525 [78981]
      Other proteins in same PDB: d1mcza1, d1mcza2, d1mczb1, d1mczb2, d1mczc1, d1mczc2, d1mczd1, d1mczd2, d1mcze1, d1mcze2, d1mczf1, d1mczf2, d1mczg1, d1mczg2, d1mczh1, d1mczh2, d1mczi1, d1mczi2, d1mczj1, d1mczj2, d1mczk1, d1mczk2, d1mczl1, d1mczl2, d1mczm1, d1mczm2, d1mczn1, d1mczn2, d1mczo1, d1mczo2, d1mczp1, d1mczp2
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    11. 2108577Domain d1mczk3: 1mcz K:342-525 [78984]
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    12. 2108578Domain d1mczl3: 1mcz L:342-525 [78987]
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      complexed with mg, rmn, tdp
    13. 2108579Domain d1mczm3: 1mcz M:342-525 [78990]
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      complexed with mg, rmn, tdp
  3. Domain(s) for 1pi3:
  4. Domain(s) for 1po7:
  5. Domain(s) for 1q6z:
  6. Domain(s) for 2fwn:
  7. Domain(s) for 3fsj:

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