Lineage for Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae)

  1. Root: SCOP 1.63
  2. 251695Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (224 folds)
  3. 263343Fold d.153: Ntn hydrolase-like [56234] (2 superfamilies)
    4 layers: alpha/beta/beta/alpha; has an unusual sheet-to-sheet packing
  4. 263344Superfamily d.153.1: N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) [56235] (5 families) (S)
    N-terminal residue provides two catalytic groups, nucleophile and proton donor
  5. 263459Family d.153.1.4: Proteasome subunits [56251] (3 proteins)
  6. 263616Protein Proteasome beta subunit (catalytic) [56252] (3 species)
  7. 263632Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [56254] (4 PDB entries)
    The structure of yeast proteasome complexed with the proteasome activator pa26 is available from PDB (1fnt). The 1FNT entry designates protein chains by both upper case and lower case letters creating problems with its processing and presentation in SCOP; the proteasome activator pa26 structure is classified elsewhere in SCOP (a.24.8)

PDB entries in Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae):

  1. Domain(s) for 1g0u:
    1. 263647Domain d1g0u1_: 1g0u 1: [41902]
      Other proteins in same PDB: d1g0ua_, d1g0ub_, d1g0uc_, d1g0ud_, d1g0ue_, d1g0uf_, d1g0ug_, d1g0uo_, d1g0up_, d1g0uq_, d1g0ur_, d1g0us_, d1g0ut_, d1g0uu_
    2. 263648Domain d1g0u2_: 1g0u 2: [41903]
      Other proteins in same PDB: d1g0ua_, d1g0ub_, d1g0uc_, d1g0ud_, d1g0ue_, d1g0uf_, d1g0ug_, d1g0uo_, d1g0up_, d1g0uq_, d1g0ur_, d1g0us_, d1g0ut_, d1g0uu_
      different sequences
      complexed with mg
    3. 263649Domain d1g0uh_: 1g0u H: [41890]
      Other proteins in same PDB: d1g0ua_, d1g0ub_, d1g0uc_, d1g0ud_, d1g0ue_, d1g0uf_, d1g0ug_, d1g0uo_, d1g0up_, d1g0uq_, d1g0ur_, d1g0us_, d1g0ut_, d1g0uu_
    4. 263650Domain d1g0ui_: 1g0u I: [41891]
      Other proteins in same PDB: d1g0ua_, d1g0ub_, d1g0uc_, d1g0ud_, d1g0ue_, d1g0uf_, d1g0ug_, d1g0uo_, d1g0up_, d1g0uq_, d1g0ur_, d1g0us_, d1g0ut_, d1g0uu_
    5. 263651Domain d1g0uj_: 1g0u J: [41892]
      Other proteins in same PDB: d1g0ua_, d1g0ub_, d1g0uc_, d1g0ud_, d1g0ue_, d1g0uf_, d1g0ug_, d1g0uo_, d1g0up_, d1g0uq_, d1g0ur_, d1g0us_, d1g0ut_, d1g0uu_
    6. 263652Domain d1g0uk_: 1g0u K: [41893]
      Other proteins in same PDB: d1g0ua_, d1g0ub_, d1g0uc_, d1g0ud_, d1g0ue_, d1g0uf_, d1g0ug_, d1g0uo_, d1g0up_, d1g0uq_, d1g0ur_, d1g0us_, d1g0ut_, d1g0uu_
    7. 263653Domain d1g0ul_: 1g0u L: [41894]
      Other proteins in same PDB: d1g0ua_, d1g0ub_, d1g0uc_, d1g0ud_, d1g0ue_, d1g0uf_, d1g0ug_, d1g0uo_, d1g0up_, d1g0uq_, d1g0ur_, d1g0us_, d1g0ut_, d1g0uu_
    8. 263654Domain d1g0um_: 1g0u M: [41895]
      Other proteins in same PDB: d1g0ua_, d1g0ub_, d1g0uc_, d1g0ud_, d1g0ue_, d1g0uf_, d1g0ug_, d1g0uo_, d1g0up_, d1g0uq_, d1g0ur_, d1g0us_, d1g0ut_, d1g0uu_
    9. 263655Domain d1g0un_: 1g0u N: [41896]
      Other proteins in same PDB: d1g0ua_, d1g0ub_, d1g0uc_, d1g0ud_, d1g0ue_, d1g0uf_, d1g0ug_, d1g0uo_, d1g0up_, d1g0uq_, d1g0ur_, d1g0us_, d1g0ut_, d1g0uu_
    10. 263656Domain d1g0uv_: 1g0u V: [41897]
      Other proteins in same PDB: d1g0ua_, d1g0ub_, d1g0uc_, d1g0ud_, d1g0ue_, d1g0uf_, d1g0ug_, d1g0uo_, d1g0up_, d1g0uq_, d1g0ur_, d1g0us_, d1g0ut_, d1g0uu_
    11. 263657Domain d1g0uw_: 1g0u W: [41898]
      Other proteins in same PDB: d1g0ua_, d1g0ub_, d1g0uc_, d1g0ud_, d1g0ue_, d1g0uf_, d1g0ug_, d1g0uo_, d1g0up_, d1g0uq_, d1g0ur_, d1g0us_, d1g0ut_, d1g0uu_
    12. 263658Domain d1g0ux_: 1g0u X: [41899]
      Other proteins in same PDB: d1g0ua_, d1g0ub_, d1g0uc_, d1g0ud_, d1g0ue_, d1g0uf_, d1g0ug_, d1g0uo_, d1g0up_, d1g0uq_, d1g0ur_, d1g0us_, d1g0ut_, d1g0uu_
    13. 263659Domain d1g0uy_: 1g0u Y: [41900]
      Other proteins in same PDB: d1g0ua_, d1g0ub_, d1g0uc_, d1g0ud_, d1g0ue_, d1g0uf_, d1g0ug_, d1g0uo_, d1g0up_, d1g0uq_, d1g0ur_, d1g0us_, d1g0ut_, d1g0uu_
    14. 263660Domain d1g0uz_: 1g0u Z: [41901]
      Other proteins in same PDB: d1g0ua_, d1g0ub_, d1g0uc_, d1g0ud_, d1g0ue_, d1g0uf_, d1g0ug_, d1g0uo_, d1g0up_, d1g0uq_, d1g0ur_, d1g0us_, d1g0ut_, d1g0uu_
  2. Domain(s) for 1g65:
    1. 263661Domain d1g651_: 1g65 1: [41916]
      Other proteins in same PDB: d1g65a_, d1g65b_, d1g65c_, d1g65d_, d1g65e_, d1g65f_, d1g65g_, d1g65o_, d1g65p_, d1g65q_, d1g65r_, d1g65s_, d1g65t_, d1g65u_
    2. 263662Domain d1g652_: 1g65 2: [41917]
      Other proteins in same PDB: d1g65a_, d1g65b_, d1g65c_, d1g65d_, d1g65e_, d1g65f_, d1g65g_, d1g65o_, d1g65p_, d1g65q_, d1g65r_, d1g65s_, d1g65t_, d1g65u_
      different sequences
      complexed with epx, mg
    3. 263663Domain d1g65h_: 1g65 H: [41904]
      Other proteins in same PDB: d1g65a_, d1g65b_, d1g65c_, d1g65d_, d1g65e_, d1g65f_, d1g65g_, d1g65o_, d1g65p_, d1g65q_, d1g65r_, d1g65s_, d1g65t_, d1g65u_
    4. 263664Domain d1g65i_: 1g65 I: [41905]
      Other proteins in same PDB: d1g65a_, d1g65b_, d1g65c_, d1g65d_, d1g65e_, d1g65f_, d1g65g_, d1g65o_, d1g65p_, d1g65q_, d1g65r_, d1g65s_, d1g65t_, d1g65u_
    5. 263665Domain d1g65j_: 1g65 J: [41906]
      Other proteins in same PDB: d1g65a_, d1g65b_, d1g65c_, d1g65d_, d1g65e_, d1g65f_, d1g65g_, d1g65o_, d1g65p_, d1g65q_, d1g65r_, d1g65s_, d1g65t_, d1g65u_
    6. 263666Domain d1g65k_: 1g65 K: [41907]
      Other proteins in same PDB: d1g65a_, d1g65b_, d1g65c_, d1g65d_, d1g65e_, d1g65f_, d1g65g_, d1g65o_, d1g65p_, d1g65q_, d1g65r_, d1g65s_, d1g65t_, d1g65u_
    7. 263667Domain d1g65l_: 1g65 L: [41908]
      Other proteins in same PDB: d1g65a_, d1g65b_, d1g65c_, d1g65d_, d1g65e_, d1g65f_, d1g65g_, d1g65o_, d1g65p_, d1g65q_, d1g65r_, d1g65s_, d1g65t_, d1g65u_
    8. 263668Domain d1g65m_: 1g65 M: [41909]
      Other proteins in same PDB: d1g65a_, d1g65b_, d1g65c_, d1g65d_, d1g65e_, d1g65f_, d1g65g_, d1g65o_, d1g65p_, d1g65q_, d1g65r_, d1g65s_, d1g65t_, d1g65u_
    9. 263669Domain d1g65n_: 1g65 N: [41910]
      Other proteins in same PDB: d1g65a_, d1g65b_, d1g65c_, d1g65d_, d1g65e_, d1g65f_, d1g65g_, d1g65o_, d1g65p_, d1g65q_, d1g65r_, d1g65s_, d1g65t_, d1g65u_
    10. 263670Domain d1g65v_: 1g65 V: [41911]
      Other proteins in same PDB: d1g65a_, d1g65b_, d1g65c_, d1g65d_, d1g65e_, d1g65f_, d1g65g_, d1g65o_, d1g65p_, d1g65q_, d1g65r_, d1g65s_, d1g65t_, d1g65u_
    11. 263671Domain d1g65w_: 1g65 W: [41912]
      Other proteins in same PDB: d1g65a_, d1g65b_, d1g65c_, d1g65d_, d1g65e_, d1g65f_, d1g65g_, d1g65o_, d1g65p_, d1g65q_, d1g65r_, d1g65s_, d1g65t_, d1g65u_
    12. 263672Domain d1g65x_: 1g65 X: [41913]
      Other proteins in same PDB: d1g65a_, d1g65b_, d1g65c_, d1g65d_, d1g65e_, d1g65f_, d1g65g_, d1g65o_, d1g65p_, d1g65q_, d1g65r_, d1g65s_, d1g65t_, d1g65u_
    13. 263673Domain d1g65y_: 1g65 Y: [41914]
      Other proteins in same PDB: d1g65a_, d1g65b_, d1g65c_, d1g65d_, d1g65e_, d1g65f_, d1g65g_, d1g65o_, d1g65p_, d1g65q_, d1g65r_, d1g65s_, d1g65t_, d1g65u_
    14. 263674Domain d1g65z_: 1g65 Z: [41915]
      Other proteins in same PDB: d1g65a_, d1g65b_, d1g65c_, d1g65d_, d1g65e_, d1g65f_, d1g65g_, d1g65o_, d1g65p_, d1g65q_, d1g65r_, d1g65s_, d1g65t_, d1g65u_
  3. Domain(s) for 1jd2:
    1. 263675Domain d1jd21_: 1jd2 1: [66514]
      Other proteins in same PDB: d1jd2a_, d1jd2b_, d1jd2c_, d1jd2d_, d1jd2e_, d1jd2f_, d1jd2g_, d1jd2o_, d1jd2p_, d1jd2q_, d1jd2r_, d1jd2s_, d1jd2t_, d1jd2u_
    2. 263676Domain d1jd22_: 1jd2 2: [66515]
      Other proteins in same PDB: d1jd2a_, d1jd2b_, d1jd2c_, d1jd2d_, d1jd2e_, d1jd2f_, d1jd2g_, d1jd2o_, d1jd2p_, d1jd2q_, d1jd2r_, d1jd2s_, d1jd2t_, d1jd2u_
      complexed with 95a, mg
    3. 263677Domain d1jd2h_: 1jd2 H: [66523]
      Other proteins in same PDB: d1jd2a_, d1jd2b_, d1jd2c_, d1jd2d_, d1jd2e_, d1jd2f_, d1jd2g_, d1jd2o_, d1jd2p_, d1jd2q_, d1jd2r_, d1jd2s_, d1jd2t_, d1jd2u_
    4. 263678Domain d1jd2i_: 1jd2 I: [66524]
      Other proteins in same PDB: d1jd2a_, d1jd2b_, d1jd2c_, d1jd2d_, d1jd2e_, d1jd2f_, d1jd2g_, d1jd2o_, d1jd2p_, d1jd2q_, d1jd2r_, d1jd2s_, d1jd2t_, d1jd2u_
    5. 263679Domain d1jd2j_: 1jd2 J: [66525]
      Other proteins in same PDB: d1jd2a_, d1jd2b_, d1jd2c_, d1jd2d_, d1jd2e_, d1jd2f_, d1jd2g_, d1jd2o_, d1jd2p_, d1jd2q_, d1jd2r_, d1jd2s_, d1jd2t_, d1jd2u_
    6. 263680Domain d1jd2k_: 1jd2 K: [66526]
      Other proteins in same PDB: d1jd2a_, d1jd2b_, d1jd2c_, d1jd2d_, d1jd2e_, d1jd2f_, d1jd2g_, d1jd2o_, d1jd2p_, d1jd2q_, d1jd2r_, d1jd2s_, d1jd2t_, d1jd2u_
    7. 263681Domain d1jd2l_: 1jd2 L: [66527]
      Other proteins in same PDB: d1jd2a_, d1jd2b_, d1jd2c_, d1jd2d_, d1jd2e_, d1jd2f_, d1jd2g_, d1jd2o_, d1jd2p_, d1jd2q_, d1jd2r_, d1jd2s_, d1jd2t_, d1jd2u_
    8. 263682Domain d1jd2m_: 1jd2 M: [66528]
      Other proteins in same PDB: d1jd2a_, d1jd2b_, d1jd2c_, d1jd2d_, d1jd2e_, d1jd2f_, d1jd2g_, d1jd2o_, d1jd2p_, d1jd2q_, d1jd2r_, d1jd2s_, d1jd2t_, d1jd2u_
    9. 263683Domain d1jd2n_: 1jd2 N: [66529]
      Other proteins in same PDB: d1jd2a_, d1jd2b_, d1jd2c_, d1jd2d_, d1jd2e_, d1jd2f_, d1jd2g_, d1jd2o_, d1jd2p_, d1jd2q_, d1jd2r_, d1jd2s_, d1jd2t_, d1jd2u_
    10. 263684Domain d1jd2v_: 1jd2 V: [66537]
      Other proteins in same PDB: d1jd2a_, d1jd2b_, d1jd2c_, d1jd2d_, d1jd2e_, d1jd2f_, d1jd2g_, d1jd2o_, d1jd2p_, d1jd2q_, d1jd2r_, d1jd2s_, d1jd2t_, d1jd2u_
    11. 263685Domain d1jd2w_: 1jd2 W: [66538]
      Other proteins in same PDB: d1jd2a_, d1jd2b_, d1jd2c_, d1jd2d_, d1jd2e_, d1jd2f_, d1jd2g_, d1jd2o_, d1jd2p_, d1jd2q_, d1jd2r_, d1jd2s_, d1jd2t_, d1jd2u_
    12. 263686Domain d1jd2x_: 1jd2 X: [66539]
      Other proteins in same PDB: d1jd2a_, d1jd2b_, d1jd2c_, d1jd2d_, d1jd2e_, d1jd2f_, d1jd2g_, d1jd2o_, d1jd2p_, d1jd2q_, d1jd2r_, d1jd2s_, d1jd2t_, d1jd2u_
    13. 263687Domain d1jd2y_: 1jd2 Y: [66540]
      Other proteins in same PDB: d1jd2a_, d1jd2b_, d1jd2c_, d1jd2d_, d1jd2e_, d1jd2f_, d1jd2g_, d1jd2o_, d1jd2p_, d1jd2q_, d1jd2r_, d1jd2s_, d1jd2t_, d1jd2u_
    14. 263688Domain d1jd2z_: 1jd2 Z: [66541]
      Other proteins in same PDB: d1jd2a_, d1jd2b_, d1jd2c_, d1jd2d_, d1jd2e_, d1jd2f_, d1jd2g_, d1jd2o_, d1jd2p_, d1jd2q_, d1jd2r_, d1jd2s_, d1jd2t_, d1jd2u_
  4. Domain(s) for 1ryp:
    1. 263633Domain d1ryp1_: 1ryp 1: [41888]
      Other proteins in same PDB: d1rypa_, d1rypb_, d1rypc_, d1rypd_, d1rype_, d1rypf_, d1rypg_, d1rypo_, d1rypp_, d1rypq_, d1rypr_, d1ryps_, d1rypt_, d1rypu_
    2. 263634Domain d1ryp2_: 1ryp 2: [41889]
      Other proteins in same PDB: d1rypa_, d1rypb_, d1rypc_, d1rypd_, d1rype_, d1rypf_, d1rypg_, d1rypo_, d1rypp_, d1rypq_, d1rypr_, d1ryps_, d1rypt_, d1rypu_
      different sequences
      complexed with mg; mutant
    3. 263635Domain d1ryph_: 1ryp H: [41876]
      Other proteins in same PDB: d1rypa_, d1rypb_, d1rypc_, d1rypd_, d1rype_, d1rypf_, d1rypg_, d1rypo_, d1rypp_, d1rypq_, d1rypr_, d1ryps_, d1rypt_, d1rypu_
    4. 263636Domain d1rypi_: 1ryp I: [41877]
      Other proteins in same PDB: d1rypa_, d1rypb_, d1rypc_, d1rypd_, d1rype_, d1rypf_, d1rypg_, d1rypo_, d1rypp_, d1rypq_, d1rypr_, d1ryps_, d1rypt_, d1rypu_
    5. 263637Domain d1rypj_: 1ryp J: [41878]
      Other proteins in same PDB: d1rypa_, d1rypb_, d1rypc_, d1rypd_, d1rype_, d1rypf_, d1rypg_, d1rypo_, d1rypp_, d1rypq_, d1rypr_, d1ryps_, d1rypt_, d1rypu_
    6. 263638Domain d1rypk_: 1ryp K: [41879]
      Other proteins in same PDB: d1rypa_, d1rypb_, d1rypc_, d1rypd_, d1rype_, d1rypf_, d1rypg_, d1rypo_, d1rypp_, d1rypq_, d1rypr_, d1ryps_, d1rypt_, d1rypu_
    7. 263639Domain d1rypl_: 1ryp L: [41880]
      Other proteins in same PDB: d1rypa_, d1rypb_, d1rypc_, d1rypd_, d1rype_, d1rypf_, d1rypg_, d1rypo_, d1rypp_, d1rypq_, d1rypr_, d1ryps_, d1rypt_, d1rypu_
    8. 263640Domain d1rypm_: 1ryp M: [41881]
      Other proteins in same PDB: d1rypa_, d1rypb_, d1rypc_, d1rypd_, d1rype_, d1rypf_, d1rypg_, d1rypo_, d1rypp_, d1rypq_, d1rypr_, d1ryps_, d1rypt_, d1rypu_
    9. 263641Domain d1rypn_: 1ryp N: [41882]
      Other proteins in same PDB: d1rypa_, d1rypb_, d1rypc_, d1rypd_, d1rype_, d1rypf_, d1rypg_, d1rypo_, d1rypp_, d1rypq_, d1rypr_, d1ryps_, d1rypt_, d1rypu_
    10. 263642Domain d1rypv_: 1ryp V: [41883]
      Other proteins in same PDB: d1rypa_, d1rypb_, d1rypc_, d1rypd_, d1rype_, d1rypf_, d1rypg_, d1rypo_, d1rypp_, d1rypq_, d1rypr_, d1ryps_, d1rypt_, d1rypu_
    11. 263643Domain d1rypw_: 1ryp W: [41884]
      Other proteins in same PDB: d1rypa_, d1rypb_, d1rypc_, d1rypd_, d1rype_, d1rypf_, d1rypg_, d1rypo_, d1rypp_, d1rypq_, d1rypr_, d1ryps_, d1rypt_, d1rypu_
    12. 263644Domain d1rypx_: 1ryp X: [41885]
      Other proteins in same PDB: d1rypa_, d1rypb_, d1rypc_, d1rypd_, d1rype_, d1rypf_, d1rypg_, d1rypo_, d1rypp_, d1rypq_, d1rypr_, d1ryps_, d1rypt_, d1rypu_
    13. 263645Domain d1rypy_: 1ryp Y: [41886]
      Other proteins in same PDB: d1rypa_, d1rypb_, d1rypc_, d1rypd_, d1rype_, d1rypf_, d1rypg_, d1rypo_, d1rypp_, d1rypq_, d1rypr_, d1ryps_, d1rypt_, d1rypu_
    14. 263646Domain d1rypz_: 1ryp Z: [41887]
      Other proteins in same PDB: d1rypa_, d1rypb_, d1rypc_, d1rypd_, d1rype_, d1rypf_, d1rypg_, d1rypo_, d1rypp_, d1rypq_, d1rypr_, d1ryps_, d1rypt_, d1rypu_

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