SCOP 1.71: Species: Archaeon Thermococcus sp. ks-1, alpha chain

Lineage for Species: Archaeon Thermococcus sp. ks-1, alpha chain

Root: SCOP 1.71
Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (134 folds)

Fold c.8: The "swivelling" beta/beta/alpha domain [52008] (9 superfamilies)
3 layers: b/b/a; the central sheet is parallel, and the other one is antiparallel; there are some variations in topology
this domain is thought to be mobile in most multi-domain proteins known to contain it

Superfamily c.8.5: GroEL apical domain-like [52029] (2 families)
Family c.8.5.2: Group II chaperonin (CCT, TRIC), apical domain [52034] (1 protein)
Protein Thermosome, A-domain [52035] (4 species)
Species Archaeon Thermococcus sp. ks-1, alpha chain [TaxId:79679] [102202] (4 PDB entries)

PDB entries in Species: Archaeon Thermococcus sp. ks-1, alpha chain:

Domain(s) for 1q2v:
1. Domain d1q2va2: 1q2v A:217-369 [95644]
  Other proteins in same PDB: d1q2va1, d1q2va3, d1q2vb1, d1q2vb3, d1q2vc1, d1q2vc3, d1q2vd1, d1q2vd3
2. Domain d1q2vb2: 1q2v B:217-369 [95647]
  Other proteins in same PDB: d1q2va1, d1q2va3, d1q2vb1, d1q2vb3, d1q2vc1, d1q2vc3, d1q2vd1, d1q2vd3
3. Domain d1q2vc2: 1q2v C:217-369 [95650]
  Other proteins in same PDB: d1q2va1, d1q2va3, d1q2vb1, d1q2vb3, d1q2vc1, d1q2vc3, d1q2vd1, d1q2vd3
4. Domain d1q2vd2: 1q2v D:217-369 [95653]
  Other proteins in same PDB: d1q2va1, d1q2va3, d1q2vb1, d1q2vb3, d1q2vc1, d1q2vc3, d1q2vd1, d1q2vd3
  complexed with so4; mutant
Domain(s) for 1q3q:
1. Domain d1q3qa2: 1q3q A:217-369 [95705]
  Other proteins in same PDB: d1q3qa1, d1q3qa3, d1q3qb1, d1q3qb3, d1q3qc1, d1q3qc3, d1q3qd1, d1q3qd3
2. Domain d1q3qb2: 1q3q B:217-369 [95708]
  Other proteins in same PDB: d1q3qa1, d1q3qa3, d1q3qb1, d1q3qb3, d1q3qc1, d1q3qc3, d1q3qd1, d1q3qd3
3. Domain d1q3qc2: 1q3q C:217-369 [95711]
  Other proteins in same PDB: d1q3qa1, d1q3qa3, d1q3qb1, d1q3qb3, d1q3qc1, d1q3qc3, d1q3qd1, d1q3qd3
4. Domain d1q3qd2: 1q3q D:217-369 [95714]
  Other proteins in same PDB: d1q3qa1, d1q3qa3, d1q3qb1, d1q3qb3, d1q3qc1, d1q3qc3, d1q3qd1, d1q3qd3
  complexed with anp, mg; mutant
Domain(s) for 1q3r:
1. Domain d1q3ra2: 1q3r A:217-369 [95717]
  Other proteins in same PDB: d1q3ra1, d1q3ra3, d1q3rb1, d1q3rb3, d1q3rc1, d1q3rc3, d1q3rd1, d1q3rd3
2. Domain d1q3rb2: 1q3r B:217-369 [95720]
  Other proteins in same PDB: d1q3ra1, d1q3ra3, d1q3rb1, d1q3rb3, d1q3rc1, d1q3rc3, d1q3rd1, d1q3rd3
3. Domain d1q3rc2: 1q3r C:217-369 [95723]
  Other proteins in same PDB: d1q3ra1, d1q3ra3, d1q3rb1, d1q3rb3, d1q3rc1, d1q3rc3, d1q3rd1, d1q3rd3
4. Domain d1q3rd2: 1q3r D:217-369 [95726]
  Other proteins in same PDB: d1q3ra1, d1q3ra3, d1q3rb1, d1q3rb3, d1q3rc1, d1q3rc3, d1q3rd1, d1q3rd3
  complexed with so4; mutant

Domain(s) for 1q3s:

Domain d1q3sa2: 1q3s A:217-369 [95729]
Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa3, d1q3sb1, d1q3sb3, d1q3sc1, d1q3sc3, d1q3sd1, d1q3sd3, d1q3se1, d1q3se3, d1q3sf1, d1q3sf3, d1q3sg1, d1q3sg3, d1q3sh1, d1q3sh3

Domain d1q3sb2: 1q3s B:217-369 [95732]
Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa3, d1q3sb1, d1q3sb3, d1q3sc1, d1q3sc3, d1q3sd1, d1q3sd3, d1q3se1, d1q3se3, d1q3sf1, d1q3sf3, d1q3sg1, d1q3sg3, d1q3sh1, d1q3sh3

Domain d1q3sc2: 1q3s C:217-369 [95735]
Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa3, d1q3sb1, d1q3sb3, d1q3sc1, d1q3sc3, d1q3sd1, d1q3sd3, d1q3se1, d1q3se3, d1q3sf1, d1q3sf3, d1q3sg1, d1q3sg3, d1q3sh1, d1q3sh3

Domain d1q3sd2: 1q3s D:217-369 [95738]
Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa3, d1q3sb1, d1q3sb3, d1q3sc1, d1q3sc3, d1q3sd1, d1q3sd3, d1q3se1, d1q3se3, d1q3sf1, d1q3sf3, d1q3sg1, d1q3sg3, d1q3sh1, d1q3sh3

Domain d1q3se2: 1q3s E:217-369 [95741]
Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa3, d1q3sb1, d1q3sb3, d1q3sc1, d1q3sc3, d1q3sd1, d1q3sd3, d1q3se1, d1q3se3, d1q3sf1, d1q3sf3, d1q3sg1, d1q3sg3, d1q3sh1, d1q3sh3

Domain d1q3sf2: 1q3s F:217-369 [95744]
Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa3, d1q3sb1, d1q3sb3, d1q3sc1, d1q3sc3, d1q3sd1, d1q3sd3, d1q3se1, d1q3se3, d1q3sf1, d1q3sf3, d1q3sg1, d1q3sg3, d1q3sh1, d1q3sh3

Domain d1q3sg2: 1q3s G:217-369 [95747]
Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa3, d1q3sb1, d1q3sb3, d1q3sc1, d1q3sc3, d1q3sd1, d1q3sd3, d1q3se1, d1q3se3, d1q3sf1, d1q3sf3, d1q3sg1, d1q3sg3, d1q3sh1, d1q3sh3

Domain d1q3sh2: 1q3s H:217-369 [95750]
Other proteins in same PDB: d1q3sa1, d1q3sa3, d1q3sb1, d1q3sb3, d1q3sc1, d1q3sc3, d1q3sd1, d1q3sd3, d1q3se1, d1q3se3, d1q3sf1, d1q3sf3, d1q3sg1, d1q3sg3, d1q3sh1, d1q3sh3
complexed with adp, mg; mutant

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Timeline for Species Archaeon Thermococcus sp. ks-1, alpha chain [TaxId:79679] from c.8.5.2 Thermosome, A-domain:

Species Archaeon Thermococcus sp. ks-1, alpha chain [TaxId:79679] from c.8.5.2 Thermosome, A-domain first appeared in SCOP 1.67
Species Archaeon Thermococcus sp. ks-1, alpha chain [TaxId:79679] from c.8.5.2 Thermosome, A-domain appears in SCOP 1.69
Species Archaeon Thermococcus sp. ks-1, alpha chain [TaxId:79679] from c.8.5.2 Thermosome, A-domain appears in SCOP 1.73
Species Archaeon Thermococcus sp. ks-1, alpha chain [TaxId:79679] from c.8.5.2 Thermosome, A-domain appears in the current release, SCOPe 2.08, called Species Thermococcus sp. ks-1, alpha chain [TaxId:79679] from c.8.5.2 Thermosome, A-domain