SCOPe 2.08: Domain d1q7ym_: 1q7y M:

Lineage for d1q7ym_ (1q7y M:)

1. Root: SCOPe 2.08

2. Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)

3. Fold c.12: Ribosomal proteins L15p and L18e [52079] (1 superfamily)
   core: three turns of irregular (beta-beta-alpha)n superhelix

4. Superfamily c.12.1: Ribosomal proteins L15p and L18e [52080] (1 family)

5. Family c.12.1.1: Ribosomal proteins L15p and L18e [52081] (2 proteins)

6. Protein Ribosomal protein L15 (L15p) [52082] (4 species)

7. Species Haloarcula marismortui [TaxId:2238] [52083] (40 PDB entries)
   Uniprot P12737

8. Domain d1q7ym_: 1q7y M: [96076]
   Other proteins in same PDB: d1q7y1_, d1q7y2_, d1q7y3_, d1q7y4_, d1q7yc1, d1q7yc2, d1q7yd_, d1q7ye_, d1q7yf_, d1q7yg1, d1q7yg2, d1q7yh_, d1q7yi_, d1q7yj_, d1q7yk_, d1q7yl_, d1q7yn_, d1q7yo_, d1q7yp_, d1q7yq_, d1q7yr_, d1q7ys_, d1q7yt_, d1q7yu_, d1q7yv_, d1q7yw_, d1q7yx_, d1q7yy_, d1q7yz_
   protein/RNA complex; complexed with cd, cl, k, mg, na, po4, puy

Details for d1q7ym_

PDB Entry: 1q7y, 3.2 Å

PDB Description: crystal structure of ccdap-puromycin bound at the peptidyl transferase center of the 50s ribosomal subunit

PDB Compounds: (M:) 50S ribosomal protein L15P

SCOPe Domain Sequences for d1q7ym_:

Sequence, based on SEQRES records:

>d1q7ym_ c.12.1.1 (M:) Ribosomal protein L15 (L15p) {Haloarcula marismortui [TaxId: 2238]}
tskkkrqrgsrthgggshknrrgaghrggrgdagrdkhefhnheplgksgfkrpqkvqee
aatidvreidenvtllaaddvaevedggfrvdvrdvveeaddadyvkvlgagqvrheltl
iaddfsegarekvegaggsveltdlgeerq

Sequence, based on observed residues (ATOM records):

>d1q7ym_ c.12.1.1 (M:) Ribosomal protein L15 (L15p) {Haloarcula marismortui [TaxId: 2238]}
tskkkrqrgsrthgggshknrrgaghrggrgdagrdkhefhnheplgksgfkrpqkvqee
aatidvreidenvtllaaddvaefrvdvrdvveeaddadyvkvlgagqvrheltliaddf
segarekvegaggsveltdlgeerq

Timeline for d1q7ym_:

• d1q7ym_ first appeared in SCOP 1.67
  
• d1q7ym_ appears in SCOPe 2.07