SCOPe 2.06: Species: Spirulina platensis [TaxId: 118562]

Lineage for Species: Spirulina platensis [TaxId: 118562]

Root: SCOPe 2.06
Class a: All alpha proteins [46456] (289 folds)
Fold a.1: Globin-like [46457] (2 superfamilies)
core: 6 helices; folded leaf, partly opened
Superfamily a.1.1: Globin-like [46458] (5 families)

Family a.1.1.3: Phycocyanin-like phycobilisome proteins [46532] (7 proteins)
oligomers of two different types of globin-like subunits containing two extra helices at the N-terminus
binds a bilin chromophore
automatically mapped to Pfam PF00502

Protein Phycocyanin beta subunit [88940] (8 species)
Species Spirulina platensis [TaxId:118562] [88952] (2 PDB entries)

PDB entries in Species: Spirulina platensis [TaxId: 118562]:

Domain(s) for 1gh0:
1. Domain d1gh0b_: 1gh0 B: [60492]
  Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
  complexed with cyc
2. Domain d1gh0d_: 1gh0 D: [60494]
  Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
  complexed with cyc
3. Domain d1gh0f_: 1gh0 F: [60496]
  Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
  complexed with cyc
4. Domain d1gh0h_: 1gh0 H: [60498]
  Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
  complexed with cyc
5. Domain d1gh0j_: 1gh0 J: [60500]
  Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
  complexed with cyc
6. Domain d1gh0l_: 1gh0 L: [60502]
  Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
  complexed with cyc
7. Domain d1gh0n_: 1gh0 N: [60504]
  Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
  complexed with cyc
8. Domain d1gh0p_: 1gh0 P: [60506]
  Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
  complexed with cyc
9. Domain d1gh0r_: 1gh0 R: [60508]
  Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
  complexed with cyc
10. Domain d1gh0t_: 1gh0 T: [60510]
  Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
  complexed with cyc
11. Domain d1gh0v_: 1gh0 V: [60512]
  Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
  complexed with cyc
12. Domain d1gh0x_: 1gh0 X: [60514]
  Other proteins in same PDB: d1gh0a_, d1gh0c_, d1gh0e_, d1gh0g_, d1gh0i_, d1gh0k_, d1gh0m_, d1gh0o_, d1gh0q_, d1gh0s_, d1gh0u_, d1gh0w_
  complexed with cyc
Domain(s) for 1ha7:
1. Domain d1ha7b_: 1ha7 B: [70936]
  Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
  complexed with cyc
2. Domain d1ha7d_: 1ha7 D: [70938]
  Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
  complexed with cyc
3. Domain d1ha7f_: 1ha7 F: [70940]
  Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
  complexed with cyc
4. Domain d1ha7h_: 1ha7 H: [70942]
  Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
  complexed with cyc
5. Domain d1ha7j_: 1ha7 J: [70944]
  Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
  complexed with cyc
6. Domain d1ha7l_: 1ha7 L: [70946]
  Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
  complexed with cyc
7. Domain d1ha7n_: 1ha7 N: [70948]
  Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
  complexed with cyc
8. Domain d1ha7p_: 1ha7 P: [70950]
  Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
  complexed with cyc
9. Domain d1ha7r_: 1ha7 R: [70952]
  Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
  complexed with cyc
10. Domain d1ha7t_: 1ha7 T: [70954]
  Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
  complexed with cyc
11. Domain d1ha7v_: 1ha7 V: [70956]
  Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
  complexed with cyc
12. Domain d1ha7x_: 1ha7 X: [70958]
  Other proteins in same PDB: d1ha7a_, d1ha7c_, d1ha7e_, d1ha7g_, d1ha7i_, d1ha7k_, d1ha7m_, d1ha7o_, d1ha7q_, d1ha7s_, d1ha7u_, d1ha7w_
  complexed with cyc

More info for Species Spirulina platensis [TaxId:118562] from a.1.1.3 Phycocyanin beta subunit

Timeline for Species Spirulina platensis [TaxId:118562] from a.1.1.3 Phycocyanin beta subunit:

Species Spirulina platensis [TaxId:118562] from a.1.1.3 Phycocyanin beta subunit first appeared in SCOP 1.65
Species Spirulina platensis [TaxId:118562] from a.1.1.3 Phycocyanin beta subunit appears in SCOPe 2.05
Species Spirulina platensis [TaxId:118562] from a.1.1.3 Phycocyanin beta subunit appears in SCOPe 2.07
Species Spirulina platensis [TaxId:118562] from a.1.1.3 Phycocyanin beta subunit appears in the current release, SCOPe 2.08