SCOP 1.67: Protein: Phycocyanin alpha subunit

Lineage for Protein: Phycocyanin alpha subunit

Root: SCOP 1.67
Class a: All alpha proteins [46456] (202 folds)
Fold a.1: Globin-like [46457] (2 superfamilies)
core: 6 helices; folded leaf, partly opened
Superfamily a.1.1: Globin-like [46458] (4 families)

Family a.1.1.3: Phycocyanin-like phycobilisome proteins [46532] (6 proteins)
oligomers of two different types of globin-like subunits containing two extra helices at the N-terminus
binds a bilin chromophore

Protein Phycocyanin alpha subunit [88933] (6 species)

Species:

Cyanobacterium (Fremyella diplosiphon) [TaxId:1197] [88937] (1 PDB entry)
- Domains for 1cpc:
  1. Domain d1cpca_: 1cpc A: [15643]
    Other proteins in same PDB: d1cpcb_, d1cpcl_
  2. Domain d1cpck_: 1cpc K: [15645]
    Other proteins in same PDB: d1cpcb_, d1cpcl_
    complexed with cyc, nma
Red alga (Cyanidium caldarium) [TaxId:2771] [88934] (1 PDB entry)
- Domain for 1phn:
  - Domain d1phna_: 1phn A: [15641]
    Other proteins in same PDB: d1phnb_
    complexed with cyc
Red alga (Polysiphonia urceolata) [TaxId:65404] [88936] (1 PDB entry)
- Domains for 1f99:
  1. Domain d1f99a_: 1f99 A: [59722]
    Other proteins in same PDB: d1f99b_, d1f99l_, d1f99n_
  2. Domain d1f99k_: 1f99 K: [59724]
    Other proteins in same PDB: d1f99b_, d1f99l_, d1f99n_
  3. Domain d1f99m_: 1f99 M: [59726]
    Other proteins in same PDB: d1f99b_, d1f99l_, d1f99n_
    complexed with cyc, peb
Spirulina platensis [TaxId:118562] [88939] (2 PDB entries)
1. Domains for 1gh0:
  1. Domain d1gh0a_: 1gh0 A: [60491]
    Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
  2. Domain d1gh0c_: 1gh0 C: [60493]
    Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
  3. Domain d1gh0e_: 1gh0 E: [60495]
    Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
  4. Domain d1gh0g_: 1gh0 G: [60497]
    Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
  5. Domain d1gh0i_: 1gh0 I: [60499]
    Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
  6. Domain d1gh0k_: 1gh0 K: [60501]
    Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
  7. Domain d1gh0m_: 1gh0 M: [60503]
    Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
  8. Domain d1gh0o_: 1gh0 O: [60505]
    Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
  9. Domain d1gh0q_: 1gh0 Q: [60507]
    Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
  10. Domain d1gh0s_: 1gh0 S: [60509]
    Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
  11. Domain d1gh0u_: 1gh0 U: [60511]
    Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
  12. Domain d1gh0w_: 1gh0 W: [60513]
    Other proteins in same PDB: d1gh0b_, d1gh0d_, d1gh0f_, d1gh0h_, d1gh0j_, d1gh0l_, d1gh0n_, d1gh0p_, d1gh0r_, d1gh0t_, d1gh0v_, d1gh0x_
    complexed with cyc
2. Domains for 1ha7:
  1. Domain d1ha7a_: 1ha7 A: [70935]
    Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
  2. Domain d1ha7c_: 1ha7 C: [70937]
    Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
  3. Domain d1ha7e_: 1ha7 E: [70939]
    Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
  4. Domain d1ha7g_: 1ha7 G: [70941]
    Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
  5. Domain d1ha7i_: 1ha7 I: [70943]
    Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
  6. Domain d1ha7k_: 1ha7 K: [70945]
    Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
  7. Domain d1ha7m_: 1ha7 M: [70947]
    Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
  8. Domain d1ha7o_: 1ha7 O: [70949]
    Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
  9. Domain d1ha7q_: 1ha7 Q: [70951]
    Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
  10. Domain d1ha7s_: 1ha7 S: [70953]
    Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
  11. Domain d1ha7u_: 1ha7 U: [70955]
    Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
  12. Domain d1ha7w_: 1ha7 W: [70957]
    Other proteins in same PDB: d1ha7b_, d1ha7d_, d1ha7f_, d1ha7h_, d1ha7j_, d1ha7l_, d1ha7n_, d1ha7p_, d1ha7r_, d1ha7t_, d1ha7v_, d1ha7x_
    complexed with cyc, men
Synechococcus elongatus [TaxId:32046] [88967] (1 PDB entry)
- Domain for 1jbo:
  - Domain d1jboa_: 1jbo A: [84150]
    Other proteins in same PDB: d1jbob_
    complexed with cyc, men
Synechococcus vulcanus [TaxId:32053] [88938] (3 PDB entries)
1. Domain for 1i7y:
  - Domain d1i7ya_: 1i7y A: [61917]
    complexed with cyc
2. Domain for 1ktp:
  - Domain d1ktpa_: 1ktp A: [72990]
    Other proteins in same PDB: d1ktpb_
    complexed with cyc, men
3. Domain for 1on7:
  - Domain d1on7a_: 1on7 A: [87121]
    Other proteins in same PDB: d1on7b_
    complexed with cyc

More info for Protein Phycocyanin alpha subunit from a.1.1.3: Phycocyanin-like phycobilisome proteins

Timeline for Protein Phycocyanin alpha subunit from a.1.1.3: Phycocyanin-like phycobilisome proteins:

Protein Phycocyanin alpha subunit from a.1.1.3: Phycocyanin-like phycobilisome proteins first appeared in SCOP 1.65
Protein Phycocyanin alpha subunit from a.1.1.3: Phycocyanin-like phycobilisome proteins appears in SCOP 1.69
Protein Phycocyanin alpha subunit from a.1.1.3: Phycocyanin-like phycobilisome proteins appears in the current release, SCOPe 2.08