Lineage for d2br2v2 (2br2 V:156-248)

  1. Root: SCOPe 2.07
  2. 2494617Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (388 folds)
  3. 2532281Fold d.101: Ribonuclease PH domain 2-like [55665] (1 superfamily)
    beta(2)-alpha-beta(2)-alpha; 3 layers: alpha/beta/alpha; antiparallel sheet: order 2134
  4. 2532282Superfamily d.101.1: Ribonuclease PH domain 2-like [55666] (2 families) (S)
  5. 2532283Family d.101.1.1: Ribonuclease PH domain 2-like [55667] (11 proteins)
  6. 2532284Protein Exosome complex exonuclease 1, ECX1 [160590] (2 species)
  7. 2532292Species Sulfolobus solfataricus [TaxId:2287] [160591] (9 PDB entries)
    Uniprot Q9UXC2 156-241! Uniprot Q9UXC2 156-248
  8. 2532307Domain d2br2v2: 2br2 V:156-248 [146208]
    Other proteins in same PDB: d2br2a1, d2br2a2, d2br2b1, d2br2c1, d2br2c2, d2br2d1, d2br2e1, d2br2e2, d2br2f1, d2br2g1, d2br2g2, d2br2h1, d2br2i1, d2br2i2, d2br2j1, d2br2k1, d2br2k2, d2br2l1, d2br2m1, d2br2m2, d2br2n1, d2br2o1, d2br2o2, d2br2p1, d2br2q1, d2br2q2, d2br2r1, d2br2s1, d2br2s2, d2br2t1, d2br2u1, d2br2u2, d2br2v1, d2br2w1, d2br2w2, d2br2x1
    automated match to d2br2b2
    complexed with cl

Details for d2br2v2

PDB Entry: 2br2 (more details), 2.8 Å

PDB Description: rnase ph core of the archaeal exosome
PDB Compounds: (V:) exosome complex exonuclease 1

SCOPe Domain Sequences for d2br2v2:

Sequence; same for both SEQRES and ATOM records: (download)

>d2br2v2 d.101.1.1 (V:156-248) Exosome complex exonuclease 1, ECX1 {Sulfolobus solfataricus [TaxId: 2287]}
pmrdliagvavgkadgviildlnetedmwgeadmpiammpslnqvtlfqlngsmtpdefr
qafdlavkginiiynlerealkskyvefkeegv

SCOPe Domain Coordinates for d2br2v2:

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Timeline for d2br2v2:

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Domains from same chain:
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d2br2v1
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d2br2a1, d2br2a2, d2br2b1, d2br2b2, d2br2c1, d2br2c2, d2br2d1, d2br2d2, d2br2e1, d2br2e2, d2br2f1, d2br2f2, d2br2g1, d2br2g2, d2br2h1, d2br2h2, d2br2i1, d2br2i2, d2br2j1, d2br2j2, d2br2k1, d2br2k2, d2br2l1, d2br2l2, d2br2m1, d2br2m2, d2br2n1, d2br2n2, d2br2o1, d2br2o2, d2br2p1, d2br2p2, d2br2q1, d2br2q2, d2br2r1, d2br2r2, d2br2s1, d2br2s2, d2br2t1, d2br2t2, d2br2u1, d2br2u2, d2br2w1, d2br2w2, d2br2x1, d2br2x2