Lineage for Species: Bradyrhizobium japonicum [TaxId: 375]

  1. Root: SCOPe 2.01
  2. 968085Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (147 folds)
  3. 968086Fold c.1: TIM beta/alpha-barrel [51350] (33 superfamilies)
    contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678
    the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
  4. 973407Superfamily c.1.11: Enolase C-terminal domain-like [51604] (2 families) (S)
    binds metal ion (magnesium or manganese) in conserved site inside barrel
    N-terminal alpha+beta domain is common to this superfamily
  5. 973472Family c.1.11.2: D-glucarate dehydratase-like [51609] (13 proteins)
  6. 973518Protein Hypothetical protein Bll6730 [117384] (1 species)
  7. 973519Species Bradyrhizobium japonicum [TaxId:375] [117385] (3 PDB entries)
    Uniprot Q89FH0

PDB entries in Species: Bradyrhizobium japonicum [TaxId: 375]:

  1. Domain(s) for 1tzz:
    1. 973520Domain d1tzza1: 1tzz A:1146-1392 [112896]
      Other proteins in same PDB: d1tzza2, d1tzzb2
      Structural genomics target
      complexed with mg
    2. 973521Domain d1tzzb1: 1tzz B:2146-2392 [112898]
      Other proteins in same PDB: d1tzza2, d1tzzb2
      Structural genomics target
      complexed with mg
  2. Domain(s) for 2dw6:
    1. 973522Domain d2dw6a1: 2dw6 A:143-389 [131808]
      Other proteins in same PDB: d2dw6a2, d2dw6b2, d2dw6c2, d2dw6d2
      automatically matched to d1tzza1
      complexed with mg, tar, tla; mutant
    2. 973523Domain d2dw6b1: 2dw6 B:143-389 [131810]
      Other proteins in same PDB: d2dw6a2, d2dw6b2, d2dw6c2, d2dw6d2
      automatically matched to d1tzza1
      complexed with mg, tar, tla; mutant
    3. 973524Domain d2dw6c1: 2dw6 C:143-389 [131812]
      Other proteins in same PDB: d2dw6a2, d2dw6b2, d2dw6c2, d2dw6d2
      automatically matched to d1tzza1
      complexed with mg, tar, tla; mutant
    4. 973525Domain d2dw6d1: 2dw6 D:143-389 [131814]
      Other proteins in same PDB: d2dw6a2, d2dw6b2, d2dw6c2, d2dw6d2
      automatically matched to d1tzza1
      complexed with mg, tar, tla; mutant
  3. Domain(s) for 2dw7:
    1. 973526Domain d2dw7a1: 2dw7 A:143-389 [131816]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automatically matched to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    2. 973527Domain d2dw7b1: 2dw7 B:143-389 [131818]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automatically matched to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    3. 973528Domain d2dw7c1: 2dw7 C:143-389 [131820]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automatically matched to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    4. 973529Domain d2dw7d1: 2dw7 D:143-389 [131822]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automatically matched to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    5. 973530Domain d2dw7e1: 2dw7 E:143-389 [131824]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automatically matched to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    6. 973531Domain d2dw7f1: 2dw7 F:143-389 [131826]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automatically matched to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    7. 973532Domain d2dw7g1: 2dw7 G:143-389 [131828]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automatically matched to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    8. 973533Domain d2dw7h1: 2dw7 H:143-389 [131830]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automatically matched to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    9. 973534Domain d2dw7i1: 2dw7 I:143-389 [131832]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automatically matched to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    10. 973535Domain d2dw7j1: 2dw7 J:143-389 [131834]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automatically matched to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    11. 973536Domain d2dw7k1: 2dw7 K:143-389 [131836]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automatically matched to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    12. 973537Domain d2dw7l1: 2dw7 L:143-389 [131838]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automatically matched to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    13. 973538Domain d2dw7m1: 2dw7 M:143-389 [131840]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automatically matched to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    14. 973539Domain d2dw7n1: 2dw7 N:143-389 [131842]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automatically matched to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    15. 973540Domain d2dw7o1: 2dw7 O:143-389 [131844]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automatically matched to d1tzza1
      complexed with mg, srt
    16. 973541Domain d2dw7p1: 2dw7 P:143-389 [131846]
      Other proteins in same PDB: d2dw7a2, d2dw7b2, d2dw7c2, d2dw7d2, d2dw7e2, d2dw7f2, d2dw7g2, d2dw7h2, d2dw7i2, d2dw7j2, d2dw7k2, d2dw7l2, d2dw7m2, d2dw7n2, d2dw7o2, d2dw7p2
      automatically matched to d1tzza1
      complexed with mg, srt

More info for Species Bradyrhizobium japonicum [TaxId:375] from c.1.11.2 Hypothetical protein Bll6730

Timeline for Species Bradyrhizobium japonicum [TaxId:375] from c.1.11.2 Hypothetical protein Bll6730: