Lineage for Species: Cow (Bos taurus) [TaxId: 9913]

  1. Root: SCOPe 2.07
  2. 2494617Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (388 folds)
  3. 2562006Fold d.185: LuxS/MPP-like metallohydrolase [63410] (1 superfamily)
    core: beta-alpha-beta(2)-alpha(2); 2 layers: alpha/beta
  4. 2562007Superfamily d.185.1: LuxS/MPP-like metallohydrolase [63411] (3 families) (S)
    Share the same "active site motif" HxxEH located in the first core helix, but differ in one of the zinc-binding residues
  5. 2562008Family d.185.1.1: MPP-like [63412] (7 proteins)
    Common fold elaborated with many additional structures; duplication: each family member consists of two similar domains of beta(2)-alpha(2)-beta(2)-alpha(5)-beta structure, but only the N-terminal domain of MPP beta chain binds the catalytic metal
  6. 2562083Protein Cytochrome bc1 core subunit 2 [63409] (3 species)
  7. 2562112Species Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] [56000] (18 PDB entries)
    Uniprot P23004

PDB entries in Species: Cow (Bos taurus) [TaxId: 9913]:

  1. Domain(s) for 1be3:
    1. 2562149Domain d1be3b1: 1be3 B:21-235 [58952]
      Other proteins in same PDB: d1be3a1, d1be3a2, d1be3c2, d1be3c3, d1be3d2, d1be3d3, d1be3e1, d1be3e2, d1be3f_, d1be3g_, d1be3h_, d1be3i_, d1be3j_, d1be3k_
      complexed with fes, hec, hem
    2. 2562150Domain d1be3b2: 1be3 B:236-439 [58953]
      Other proteins in same PDB: d1be3a1, d1be3a2, d1be3c2, d1be3c3, d1be3d2, d1be3d3, d1be3e1, d1be3e2, d1be3f_, d1be3g_, d1be3h_, d1be3i_, d1be3j_, d1be3k_
      complexed with fes, hec, hem
  2. Domain(s) for 1bgy:
    1. 2562151Domain d1bgyb1: 1bgy B:21-235 [58956]
      Other proteins in same PDB: d1bgya1, d1bgya2, d1bgyc2, d1bgyc3, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyi_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgym1, d1bgym2, d1bgyo2, d1bgyo3, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyu_, d1bgyv_, d1bgyw_
      complexed with fes, hec, hem
    2. 2562152Domain d1bgyb2: 1bgy B:236-439 [58957]
      Other proteins in same PDB: d1bgya1, d1bgya2, d1bgyc2, d1bgyc3, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyi_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgym1, d1bgym2, d1bgyo2, d1bgyo3, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyu_, d1bgyv_, d1bgyw_
      complexed with fes, hec, hem
    3. 2562153Domain d1bgyn1: 1bgy N:21-235 [58960]
      Other proteins in same PDB: d1bgya1, d1bgya2, d1bgyc2, d1bgyc3, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyi_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgym1, d1bgym2, d1bgyo2, d1bgyo3, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyu_, d1bgyv_, d1bgyw_
      complexed with fes, hec, hem
    4. 2562154Domain d1bgyn2: 1bgy N:236-439 [58961]
      Other proteins in same PDB: d1bgya1, d1bgya2, d1bgyc2, d1bgyc3, d1bgyd2, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyi_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgym1, d1bgym2, d1bgyo2, d1bgyo3, d1bgyp2, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyu_, d1bgyv_, d1bgyw_
      complexed with fes, hec, hem
  3. Domain(s) for 1l0l:
    1. 2562129Domain d1l0lb1: 1l0l B:17-235 [84484]
      Other proteins in same PDB: d1l0la1, d1l0la2, d1l0lc1, d1l0lc2, d1l0ld1, d1l0ld2, d1l0le1, d1l0le2, d1l0lf_, d1l0lg_, d1l0lh_, d1l0li_, d1l0lj_, d1l0lk_
      complexed with fes, fmx, hem
    2. 2562130Domain d1l0lb2: 1l0l B:236-439 [84485]
      Other proteins in same PDB: d1l0la1, d1l0la2, d1l0lc1, d1l0lc2, d1l0ld1, d1l0ld2, d1l0le1, d1l0le2, d1l0lf_, d1l0lg_, d1l0lh_, d1l0li_, d1l0lj_, d1l0lk_
      complexed with fes, fmx, hem
  4. Domain(s) for 1l0n:
    1. 2562135Domain d1l0nb1: 1l0n B:17-235 [84500]
      Other proteins in same PDB: d1l0na1, d1l0na2, d1l0nc1, d1l0nc2, d1l0nd1, d1l0nd2, d1l0ne1, d1l0ne2, d1l0nf_, d1l0ng_, d1l0nh_, d1l0ni_, d1l0nj_, d1l0nk_
      complexed with fes, hem
    2. 2562136Domain d1l0nb2: 1l0n B:236-439 [84501]
      Other proteins in same PDB: d1l0na1, d1l0na2, d1l0nc1, d1l0nc2, d1l0nd1, d1l0nd2, d1l0ne1, d1l0ne2, d1l0nf_, d1l0ng_, d1l0nh_, d1l0ni_, d1l0nj_, d1l0nk_
      complexed with fes, hem
  5. Domain(s) for 1ntk:
    1. 2562143Domain d1ntkb1: 1ntk B:17-235 [92107]
      Other proteins in same PDB: d1ntka1, d1ntka2, d1ntkc1, d1ntkc2, d1ntkd1, d1ntkd2, d1ntke1, d1ntke2, d1ntkf_, d1ntkg_, d1ntkh_, d1ntki_, d1ntkj_, d1ntkk_
      complexed with ay1, fes, hem
    2. 2562144Domain d1ntkb2: 1ntk B:236-439 [92108]
      Other proteins in same PDB: d1ntka1, d1ntka2, d1ntkc1, d1ntkc2, d1ntkd1, d1ntkd2, d1ntke1, d1ntke2, d1ntkf_, d1ntkg_, d1ntkh_, d1ntki_, d1ntkj_, d1ntkk_
      complexed with ay1, fes, hem
  6. Domain(s) for 1ntm:
    1. 2562127Domain d1ntmb1: 1ntm B:17-235 [92123]
      Other proteins in same PDB: d1ntma1, d1ntma2, d1ntmc1, d1ntmc2, d1ntmd1, d1ntmd2, d1ntme1, d1ntme2, d1ntmf_, d1ntmg_, d1ntmh_, d1ntmi_, d1ntmj_, d1ntmk_
      complexed with fes, hem
    2. 2562128Domain d1ntmb2: 1ntm B:236-439 [92124]
      Other proteins in same PDB: d1ntma1, d1ntma2, d1ntmc1, d1ntmc2, d1ntmd1, d1ntmd2, d1ntme1, d1ntme2, d1ntmf_, d1ntmg_, d1ntmh_, d1ntmi_, d1ntmj_, d1ntmk_
      complexed with fes, hem
  7. Domain(s) for 1ntz:
    1. 2562131Domain d1ntzb1: 1ntz B:17-235 [92151]
      Other proteins in same PDB: d1ntza1, d1ntza2, d1ntzc1, d1ntzc2, d1ntzd1, d1ntzd2, d1ntze1, d1ntze2, d1ntzf_, d1ntzg_, d1ntzh_, d1ntzi_, d1ntzj_, d1ntzk_
      complexed with fes, hem, uq2
    2. 2562132Domain d1ntzb2: 1ntz B:236-439 [92152]
      Other proteins in same PDB: d1ntza1, d1ntza2, d1ntzc1, d1ntzc2, d1ntzd1, d1ntzd2, d1ntze1, d1ntze2, d1ntzf_, d1ntzg_, d1ntzh_, d1ntzi_, d1ntzj_, d1ntzk_
      complexed with fes, hem, uq2
  8. Domain(s) for 1nu1:
    1. 2562145Domain d1nu1b1: 1nu1 B:17-235 [92169]
      Other proteins in same PDB: d1nu1a1, d1nu1a2, d1nu1c1, d1nu1c2, d1nu1d1, d1nu1d2, d1nu1e1, d1nu1e2, d1nu1f_, d1nu1g_, d1nu1h_, d1nu1i_, d1nu1j_, d1nu1k_
      complexed with fes, hem, qno
    2. 2562146Domain d1nu1b2: 1nu1 B:236-439 [92170]
      Other proteins in same PDB: d1nu1a1, d1nu1a2, d1nu1c1, d1nu1c2, d1nu1d1, d1nu1d2, d1nu1e1, d1nu1e2, d1nu1f_, d1nu1g_, d1nu1h_, d1nu1i_, d1nu1j_, d1nu1k_
      complexed with fes, hem, qno
  9. Domain(s) for 1pp9:
    1. 2562123Domain d1pp9b1: 1pp9 B:17-235 [104224]
      Other proteins in same PDB: d1pp9a1, d1pp9a2, d1pp9c1, d1pp9c2, d1pp9d1, d1pp9d2, d1pp9e1, d1pp9e2, d1pp9f_, d1pp9g_, d1pp9h_, d1pp9i_, d1pp9j_, d1pp9n1, d1pp9n2, d1pp9p1, d1pp9p2, d1pp9q1, d1pp9q2, d1pp9r1, d1pp9r2, d1pp9s_, d1pp9t_, d1pp9u_, d1pp9v_, d1pp9w_
      complexed with azi, cdl, fes, gol, hec, hem, jzr, pee, po4, sma, uq
    2. 2562124Domain d1pp9b2: 1pp9 B:236-439 [104225]
      Other proteins in same PDB: d1pp9a1, d1pp9a2, d1pp9c1, d1pp9c2, d1pp9d1, d1pp9d2, d1pp9e1, d1pp9e2, d1pp9f_, d1pp9g_, d1pp9h_, d1pp9i_, d1pp9j_, d1pp9n1, d1pp9n2, d1pp9p1, d1pp9p2, d1pp9q1, d1pp9q2, d1pp9r1, d1pp9r2, d1pp9s_, d1pp9t_, d1pp9u_, d1pp9v_, d1pp9w_
      complexed with azi, cdl, fes, gol, hec, hem, jzr, pee, po4, sma, uq
    3. 2562125Domain d1pp9o1: 1pp9 O:17-235 [104239]
      Other proteins in same PDB: d1pp9a1, d1pp9a2, d1pp9c1, d1pp9c2, d1pp9d1, d1pp9d2, d1pp9e1, d1pp9e2, d1pp9f_, d1pp9g_, d1pp9h_, d1pp9i_, d1pp9j_, d1pp9n1, d1pp9n2, d1pp9p1, d1pp9p2, d1pp9q1, d1pp9q2, d1pp9r1, d1pp9r2, d1pp9s_, d1pp9t_, d1pp9u_, d1pp9v_, d1pp9w_
      complexed with azi, cdl, fes, gol, hec, hem, jzr, pee, po4, sma, uq
    4. 2562126Domain d1pp9o2: 1pp9 O:236-439 [104240]
      Other proteins in same PDB: d1pp9a1, d1pp9a2, d1pp9c1, d1pp9c2, d1pp9d1, d1pp9d2, d1pp9e1, d1pp9e2, d1pp9f_, d1pp9g_, d1pp9h_, d1pp9i_, d1pp9j_, d1pp9n1, d1pp9n2, d1pp9p1, d1pp9p2, d1pp9q1, d1pp9q2, d1pp9r1, d1pp9r2, d1pp9s_, d1pp9t_, d1pp9u_, d1pp9v_, d1pp9w_
      complexed with azi, cdl, fes, gol, hec, hem, jzr, pee, po4, sma, uq
  10. Domain(s) for 1ppj:
    1. 2562115Domain d1ppjb1: 1ppj B:17-235 [104254]
      Other proteins in same PDB: d1ppja1, d1ppja2, d1ppjc1, d1ppjc2, d1ppjd1, d1ppjd2, d1ppje1, d1ppje2, d1ppjf_, d1ppjg_, d1ppjh_, d1ppji_, d1ppjj_, d1ppjn1, d1ppjn2, d1ppjp1, d1ppjp2, d1ppjq1, d1ppjq2, d1ppjr1, d1ppjr2, d1ppjs_, d1ppjt_, d1ppju_, d1ppjv_, d1ppjw_
      complexed with any, azi, cdl, fes, gol, hec, hem, jzr, pee, po4, sma
    2. 2562116Domain d1ppjb2: 1ppj B:236-439 [104255]
      Other proteins in same PDB: d1ppja1, d1ppja2, d1ppjc1, d1ppjc2, d1ppjd1, d1ppjd2, d1ppje1, d1ppje2, d1ppjf_, d1ppjg_, d1ppjh_, d1ppji_, d1ppjj_, d1ppjn1, d1ppjn2, d1ppjp1, d1ppjp2, d1ppjq1, d1ppjq2, d1ppjr1, d1ppjr2, d1ppjs_, d1ppjt_, d1ppju_, d1ppjv_, d1ppjw_
      complexed with any, azi, cdl, fes, gol, hec, hem, jzr, pee, po4, sma
    3. 2562117Domain d1ppjo1: 1ppj O:17-235 [104269]
      Other proteins in same PDB: d1ppja1, d1ppja2, d1ppjc1, d1ppjc2, d1ppjd1, d1ppjd2, d1ppje1, d1ppje2, d1ppjf_, d1ppjg_, d1ppjh_, d1ppji_, d1ppjj_, d1ppjn1, d1ppjn2, d1ppjp1, d1ppjp2, d1ppjq1, d1ppjq2, d1ppjr1, d1ppjr2, d1ppjs_, d1ppjt_, d1ppju_, d1ppjv_, d1ppjw_
      complexed with any, azi, cdl, fes, gol, hec, hem, jzr, pee, po4, sma
    4. 2562118Domain d1ppjo2: 1ppj O:236-439 [104270]
      Other proteins in same PDB: d1ppja1, d1ppja2, d1ppjc1, d1ppjc2, d1ppjd1, d1ppjd2, d1ppje1, d1ppje2, d1ppjf_, d1ppjg_, d1ppjh_, d1ppji_, d1ppjj_, d1ppjn1, d1ppjn2, d1ppjp1, d1ppjp2, d1ppjq1, d1ppjq2, d1ppjr1, d1ppjr2, d1ppjs_, d1ppjt_, d1ppju_, d1ppjv_, d1ppjw_
      complexed with any, azi, cdl, fes, gol, hec, hem, jzr, pee, po4, sma
  11. Domain(s) for 1qcr:
    1. 2562155Domain d1qcrb1: 1qcr B:17-235 [59027]
      Other proteins in same PDB: d1qcra1, d1qcra2, d1qcrc2, d1qcrc3, d1qcrd2, d1qcrd3, d1qcre1, d1qcre2, d1qcrf_, d1qcrg_, d1qcrh_, d1qcrj_, d1qcrk_
      complexed with hem
    2. 2562156Domain d1qcrb2: 1qcr B:236-439 [59028]
      Other proteins in same PDB: d1qcra1, d1qcra2, d1qcrc2, d1qcrc3, d1qcrd2, d1qcrd3, d1qcre1, d1qcre2, d1qcrf_, d1qcrg_, d1qcrh_, d1qcrj_, d1qcrk_
      complexed with hem
  12. Domain(s) for 1sqb:
    1. 2562137Domain d1sqbb1: 1sqb B:17-235 [105892]
      Other proteins in same PDB: d1sqba1, d1sqba2, d1sqbc1, d1sqbc2, d1sqbd1, d1sqbd2, d1sqbe1, d1sqbe2, d1sqbf_, d1sqbg_, d1sqbh_, d1sqbi_, d1sqbj_, d1sqbk_
      complexed with azo, fes, hem
    2. 2562138Domain d1sqbb2: 1sqb B:236-439 [105893]
      Other proteins in same PDB: d1sqba1, d1sqba2, d1sqbc1, d1sqbc2, d1sqbd1, d1sqbd2, d1sqbe1, d1sqbe2, d1sqbf_, d1sqbg_, d1sqbh_, d1sqbi_, d1sqbj_, d1sqbk_
      complexed with azo, fes, hem
  13. Domain(s) for 1sqp:
    1. 2562147Domain d1sqpb1: 1sqp B:17-235 [118997]
      Other proteins in same PDB: d1sqpa1, d1sqpa2, d1sqpc1, d1sqpc2, d1sqpd1, d1sqpd2, d1sqpe1, d1sqpe2, d1sqpf1, d1sqpg_, d1sqph_, d1sqpi_, d1sqpj_, d1sqpk1
      automated match to d1sqbb1
      complexed with cdl, fes, hem, myx, pee, plx
    2. 2562148Domain d1sqpb2: 1sqp B:236-439 [118998]
      Other proteins in same PDB: d1sqpa1, d1sqpa2, d1sqpc1, d1sqpc2, d1sqpd1, d1sqpd2, d1sqpe1, d1sqpe2, d1sqpf1, d1sqpg_, d1sqph_, d1sqpi_, d1sqpj_, d1sqpk1
      automated match to d1sqbb2
      complexed with cdl, fes, hem, myx, pee, plx
  14. Domain(s) for 1sqv:
    1. 2562139Domain d1sqvb1: 1sqv B:17-235 [119022]
      Other proteins in same PDB: d1sqva1, d1sqva2, d1sqvc1, d1sqvc2, d1sqvd1, d1sqvd2, d1sqve1, d1sqve2, d1sqvf_, d1sqvg_, d1sqvh_, d1sqvi_, d1sqvj_, d1sqvk_
      automated match to d1ppjb1
      complexed with fes, hem, uhd, uq2
    2. 2562140Domain d1sqvb2: 1sqv B:236-439 [119023]
      Other proteins in same PDB: d1sqva1, d1sqva2, d1sqvc1, d1sqvc2, d1sqvd1, d1sqvd2, d1sqve1, d1sqve2, d1sqvf_, d1sqvg_, d1sqvh_, d1sqvi_, d1sqvj_, d1sqvk_
      automated match to d1ppjb2
      complexed with fes, hem, uhd, uq2
  15. Domain(s) for 1sqx:
    1. 2562133Domain d1sqxb1: 1sqx B:17-235 [119037]
      Other proteins in same PDB: d1sqxa1, d1sqxa2, d1sqxc1, d1sqxc2, d1sqxd1, d1sqxd2, d1sqxe1, d1sqxe2, d1sqxf_, d1sqxg_, d1sqxh_, d1sqxi_, d1sqxj_, d1sqxk_
      automated match to d1ppjb1
      complexed with fes, hem, sma, uq2
    2. 2562134Domain d1sqxb2: 1sqx B:236-439 [119038]
      Other proteins in same PDB: d1sqxa1, d1sqxa2, d1sqxc1, d1sqxc2, d1sqxd1, d1sqxd2, d1sqxe1, d1sqxe2, d1sqxf_, d1sqxg_, d1sqxh_, d1sqxi_, d1sqxj_, d1sqxk_
      automated match to d1ppjb2
      complexed with fes, hem, sma, uq2
  16. Domain(s) for 2a06:
    1. 2562119Domain d2a06b1: 2a06 B:17-235 [125921]
      Other proteins in same PDB: d2a06a1, d2a06a2, d2a06c1, d2a06c2, d2a06d1, d2a06d2, d2a06e1, d2a06e2, d2a06f_, d2a06g_, d2a06h_, d2a06i_, d2a06j_, d2a06n1, d2a06n2, d2a06p1, d2a06p2, d2a06q1, d2a06q2, d2a06r1, d2a06r2, d2a06s_, d2a06t_, d2a06u_, d2a06v_, d2a06w_
      automated match to d1ppjb1
      complexed with azi, cdl, fes, gol, hec, hem, jzr, pee, po4, sma, unl, uq
    2. 2562120Domain d2a06b2: 2a06 B:236-439 [125922]
      Other proteins in same PDB: d2a06a1, d2a06a2, d2a06c1, d2a06c2, d2a06d1, d2a06d2, d2a06e1, d2a06e2, d2a06f_, d2a06g_, d2a06h_, d2a06i_, d2a06j_, d2a06n1, d2a06n2, d2a06p1, d2a06p2, d2a06q1, d2a06q2, d2a06r1, d2a06r2, d2a06s_, d2a06t_, d2a06u_, d2a06v_, d2a06w_
      automated match to d1ppjb2
      complexed with azi, cdl, fes, gol, hec, hem, jzr, pee, po4, sma, unl, uq
    3. 2562121Domain d2a06o1: 2a06 O:17-235 [125930]
      Other proteins in same PDB: d2a06a1, d2a06a2, d2a06c1, d2a06c2, d2a06d1, d2a06d2, d2a06e1, d2a06e2, d2a06f_, d2a06g_, d2a06h_, d2a06i_, d2a06j_, d2a06n1, d2a06n2, d2a06p1, d2a06p2, d2a06q1, d2a06q2, d2a06r1, d2a06r2, d2a06s_, d2a06t_, d2a06u_, d2a06v_, d2a06w_
      automated match to d1ppjb1
      complexed with azi, cdl, fes, gol, hec, hem, jzr, pee, po4, sma, unl, uq
    4. 2562122Domain d2a06o2: 2a06 O:236-439 [125931]
      Other proteins in same PDB: d2a06a1, d2a06a2, d2a06c1, d2a06c2, d2a06d1, d2a06d2, d2a06e1, d2a06e2, d2a06f_, d2a06g_, d2a06h_, d2a06i_, d2a06j_, d2a06n1, d2a06n2, d2a06p1, d2a06p2, d2a06q1, d2a06q2, d2a06r1, d2a06r2, d2a06s_, d2a06t_, d2a06u_, d2a06v_, d2a06w_
      automated match to d1ppjb2
      complexed with azi, cdl, fes, gol, hec, hem, jzr, pee, po4, sma, unl, uq
  17. Domain(s) for 2fyu:
    1. 2562113Domain d2fyub1: 2fyu B:17-235 [134394]
      Other proteins in same PDB: d2fyua1, d2fyua2, d2fyuc1, d2fyuc2, d2fyud1, d2fyud2, d2fyue1, d2fyue2, d2fyuf_, d2fyug_, d2fyuh_, d2fyui_, d2fyuj_, d2fyuk_
      automated match to d1ppjb1
      complexed with fdn, fes, hem
    2. 2562114Domain d2fyub2: 2fyu B:236-439 [134395]
      Other proteins in same PDB: d2fyua1, d2fyua2, d2fyuc1, d2fyuc2, d2fyud1, d2fyud2, d2fyue1, d2fyue2, d2fyuf_, d2fyug_, d2fyuh_, d2fyui_, d2fyuj_, d2fyuk_
      automated match to d1ppjb2
      complexed with fdn, fes, hem
  18. Domain(s) for 5klv:
    1. 2562141Domain d5klvb1: 5klv B:15-235 [323993]
      Other proteins in same PDB: d5klva1, d5klva2, d5klvc1, d5klvc2, d5klvd1, d5klvd2, d5klve1, d5klve2, d5klvg_, d5klvh_, d5klvj_, d5klvk_
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      complexed with 6pe, 8pe, cdl, cl, fes, fnm, gol, hec, hem, pef, px4
    2. 2562142Domain d5klvb2: 5klv B:236-439 [323994]
      Other proteins in same PDB: d5klva1, d5klva2, d5klvc1, d5klvc2, d5klvd1, d5klvd2, d5klve1, d5klve2, d5klvg_, d5klvh_, d5klvj_, d5klvk_
      automated match to d1ntmb2
      complexed with 6pe, 8pe, cdl, cl, fes, fnm, gol, hec, hem, pef, px4

More info for Species Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] from d.185.1.1 Cytochrome bc1 core subunit 2

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