Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (396 folds) |
Fold d.52: Alpha-lytic protease prodomain-like [54805] (10 superfamilies) core: alpha-beta(2)-(alpha)-beta; 2 layers: alpha/beta |
Superfamily d.52.3: Prokaryotic type KH domain (KH-domain type II) [54814] (2 families) Prokaryotic and eukaryotic domains share a KH-motif but have different topologies |
Family d.52.3.1: Prokaryotic type KH domain (KH-domain type II) [54815] (4 proteins) |
Protein Ribosomal protein S3 N-terminal domain [54816] (4 species) |
Dog (Canis familiaris) [TaxId:9615] [160237] (1 PDB entry) |
Escherichia coli [TaxId:562] [160236] (24 PDB entries) Uniprot P0A7V3 1-105 |
Domain d2avyc1: 2avy C:1-105 [144843] Other proteins in same PDB: d2avyb1, d2avyc2, d2avyd1, d2avye1, d2avye2, d2avyf1, d2avyg1, d2avyh1, d2avyi1, d2avyj1, d2avyk1, d2avyl1, d2avym1, d2avyn1, d2avyo1, d2avyp1, d2avyq1, d2avyr1, d2avys1, d2avyt1, d2avyu1 Representative structure protein/RNA complex; complexed with mg protein/RNA complex; complexed with mg |
Domain d2aw7c1: 2aw7 C:1-105 [144886] Other proteins in same PDB: d2aw7b1, d2aw7c2, d2aw7d1, d2aw7e1, d2aw7e2, d2aw7f1, d2aw7g1, d2aw7h1, d2aw7i1, d2aw7j1, d2aw7k1, d2aw7l1, d2aw7m1, d2aw7n1, d2aw7o1, d2aw7p1, d2aw7q1, d2aw7r1, d2aw7s1, d2aw7t1, d2aw7u1 protein/RNA complex; complexed with mg protein/RNA complex; complexed with mg |
Domain d2i2pc1: 2i2p C:1-105 [145421] Other proteins in same PDB: d2i2pb1, d2i2pc2, d2i2pd1, d2i2pe1, d2i2pe2, d2i2pf1, d2i2pg1, d2i2ph1, d2i2pi1, d2i2pj1, d2i2pk1, d2i2pl1, d2i2pm1, d2i2pn1, d2i2po1, d2i2pp1, d2i2pq1, d2i2pr1, d2i2ps1, d2i2pt1, d2i2pu1 protein/RNA complex; complexed with mg protein/RNA complex; complexed with mg |
Domain d2i2uc1: 2i2u C:1-105 [145463] Other proteins in same PDB: d2i2ub1, d2i2uc2, d2i2ud1, d2i2ue1, d2i2ue2, d2i2uf1, d2i2ug1, d2i2uh1, d2i2ui1, d2i2uj1, d2i2uk1, d2i2ul1, d2i2um1, d2i2un1, d2i2uo1, d2i2up1, d2i2uq1, d2i2ur1, d2i2us1, d2i2ut1, d2i2uu1 protein/RNA complex; complexed with mg protein/RNA complex; complexed with mg |
Domain d2qalc1: 2qal C:1-105 [150214] Other proteins in same PDB: d2qalb1, d2qalc2, d2qald1, d2qale1, d2qale2, d2qalf1, d2qalg1, d2qalh1, d2qali1, d2qalj1, d2qalk1, d2qall1, d2qalm1, d2qaln1, d2qalp1, d2qalq1, d2qalr1, d2qals1, d2qalt1, d2qalu1 protein/RNA complex; complexed with mg, nmy protein/RNA complex; complexed with mg, nmy |
Domain d2qanc1: 2qan C:1-105 [150268] Other proteins in same PDB: d2qanb1, d2qanc2, d2qand1, d2qane1, d2qane2, d2qanf1, d2qang1, d2qanh1, d2qani1, d2qanj1, d2qank1, d2qanl1, d2qanm1, d2qann1, d2qanp1, d2qanq1, d2qanr1, d2qans1, d2qant1, d2qanu1 protein/RNA complex; complexed with mg, nmy protein/RNA complex; complexed with mg, nmy |
Domain d2qb9c1: 2qb9 C:1-105 [150328] Other proteins in same PDB: d2qb9b1, d2qb9c2, d2qb9d1, d2qb9e1, d2qb9e2, d2qb9f1, d2qb9g1, d2qb9h1, d2qb9i1, d2qb9j1, d2qb9k1, d2qb9l1, d2qb9m1, d2qb9n1, d2qb9p1, d2qb9q1, d2qb9r1, d2qb9s1, d2qb9t1, d2qb9u1 protein/RNA complex; complexed with lll, mg protein/RNA complex; complexed with lll, mg |
Domain d2qbbc1: 2qbb C:1-105 [150381] Other proteins in same PDB: d2qbbb1, d2qbbc2, d2qbbd1, d2qbbe1, d2qbbe2, d2qbbf1, d2qbbg1, d2qbbh1, d2qbbi1, d2qbbj1, d2qbbk1, d2qbbl1, d2qbbm1, d2qbbn1, d2qbbp1, d2qbbq1, d2qbbr1, d2qbbs1, d2qbbt1, d2qbbu1 protein/RNA complex; complexed with lll, mg protein/RNA complex; complexed with lll, mg |
Domain d2qbdc1: 2qbd C:1-105 [150434] Other proteins in same PDB: d2qbdb1, d2qbdc2, d2qbdd1, d2qbde1, d2qbde2, d2qbdf1, d2qbdg1, d2qbdh1, d2qbdi1, d2qbdj1, d2qbdk1, d2qbdl1, d2qbdm1, d2qbdn1, d2qbdp1, d2qbdq1, d2qbdr1, d2qbds1, d2qbdt1, d2qbdu1 protein/RNA complex; complexed with mg protein/RNA complex; complexed with mg |
Domain d2qbfc1: 2qbf C:1-105 [150488] Other proteins in same PDB: d2qbfb1, d2qbfc2, d2qbfd1, d2qbfe1, d2qbfe2, d2qbff1, d2qbfg1, d2qbfh1, d2qbfi1, d2qbfj1, d2qbfk1, d2qbfl1, d2qbfm1, d2qbfn1, d2qbfp1, d2qbfq1, d2qbfr1, d2qbfs1, d2qbft1, d2qbfu1 protein/RNA complex; complexed with mg protein/RNA complex; complexed with mg |
Domain d2qbhc1: 2qbh C:1-105 [150542] Other proteins in same PDB: d2qbhb1, d2qbhc2, d2qbhd1, d2qbhe1, d2qbhe2, d2qbhf1, d2qbhg1, d2qbhh1, d2qbhi1, d2qbhj1, d2qbhk1, d2qbhl1, d2qbhm1, d2qbhn1, d2qbhp1, d2qbhq1, d2qbhr1, d2qbhs1, d2qbht1, d2qbhu1 protein/RNA complex; complexed with lll, mg protein/RNA complex; complexed with lll, mg |
Domain d2qbjc1: 2qbj C:1-105 [150596] Other proteins in same PDB: d2qbjb1, d2qbjc2, d2qbjd1, d2qbje1, d2qbje2, d2qbjf1, d2qbjg1, d2qbjh1, d2qbji1, d2qbjj1, d2qbjk1, d2qbjl1, d2qbjm1, d2qbjn1, d2qbjp1, d2qbjq1, d2qbjr1, d2qbjs1, d2qbjt1, d2qbju1 protein/RNA complex; complexed with lll, mg protein/RNA complex; complexed with lll, mg |
Domain d2qouc1: 2qou C:1-105 [150985] Other proteins in same PDB: d2qoub1, d2qouc2, d2qoud1, d2qoue1, d2qoue2, d2qouf1, d2qoug1, d2qouh1, d2qoui1, d2qouj1, d2qouk1, d2qoul1, d2qoum1, d2qoun1, d2qoup1, d2qouq1, d2qour1, d2qous1, d2qout1, d2qouu1 protein/RNA complex; complexed with mg, scm protein/RNA complex; complexed with mg, scm |
Domain d2qowc1: 2qow C:1-105 [151038] Other proteins in same PDB: d2qowb1, d2qowc2, d2qowd1, d2qowe1, d2qowe2, d2qowf1, d2qowg1, d2qowh1, d2qowi1, d2qowj1, d2qowk1, d2qowl1, d2qowm1, d2qown1, d2qowp1, d2qowq1, d2qowr1, d2qows1, d2qowt1, d2qowu1 protein/RNA complex; complexed with mg, scm protein/RNA complex; complexed with mg, scm |
Domain d2qoyc1: 2qoy C:1-105 [151091] Other proteins in same PDB: d2qoyb1, d2qoyc2, d2qoyd1, d2qoye1, d2qoye2, d2qoyf1, d2qoyg1, d2qoyh1, d2qoyi1, d2qoyj1, d2qoyk1, d2qoyl1, d2qoym1, d2qoyn1, d2qoyp1, d2qoyq1, d2qoyr1, d2qoys1, d2qoyt1, d2qoyu1 protein/RNA complex; complexed with mg, nmy, scm protein/RNA complex; complexed with mg, nmy, scm |
Domain d2qp0c1: 2qp0 C:1-105 [151144] Other proteins in same PDB: d2qp0b1, d2qp0c2, d2qp0d1, d2qp0e1, d2qp0e2, d2qp0f1, d2qp0g1, d2qp0h1, d2qp0i1, d2qp0j1, d2qp0k1, d2qp0l1, d2qp0m1, d2qp0n1, d2qp0p1, d2qp0q1, d2qp0r1, d2qp0s1, d2qp0t1, d2qp0u1 protein/RNA complex; complexed with mg, nmy, scm protein/RNA complex; complexed with mg, nmy, scm |
Domain d2vhoc1: 2vho C:1-105 [153123] Other proteins in same PDB: d2vhob1, d2vhoc2, d2vhod1, d2vhoe1, d2vhoe2, d2vhof1, d2vhog1, d2vhoh1, d2vhoi1, d2vhoj1, d2vhok1, d2vhol1, d2vhom1, d2vhon1, d2vhoo1, d2vhop1, d2vhoq1, d2vhor1, d2vhos1, d2vhot1, d2vhou1 protein/RNA complex; complexed with mg protein/RNA complex; complexed with mg |
Domain d2vhpc1: 2vhp C:1-105 [153145] Other proteins in same PDB: d2vhpb1, d2vhpc2, d2vhpd1, d2vhpe1, d2vhpe2, d2vhpf1, d2vhpg1, d2vhph1, d2vhpi1, d2vhpj1, d2vhpk1, d2vhpl1, d2vhpm1, d2vhpn1, d2vhpo1, d2vhpp1, d2vhpq1, d2vhpr1, d2vhps1, d2vhpt1, d2vhpu1 protein/RNA complex; complexed with mg protein/RNA complex; complexed with mg |
Domain d2z4kc1: 2z4k C:1-105 [154052] Other proteins in same PDB: d2z4kb1, d2z4kc2, d2z4kd1, d2z4ke1, d2z4ke2, d2z4kf1, d2z4kg1, d2z4kh1, d2z4ki1, d2z4kj1, d2z4kk1, d2z4kl1, d2z4km1, d2z4kn1, d2z4kp1, d2z4kq1, d2z4kr1, d2z4ks1, d2z4kt1, d2z4ku1 protein/RNA complex; complexed with mg, par protein/RNA complex; complexed with mg, par |
Domain d2z4mc1: 2z4m C:1-105 [154106] Other proteins in same PDB: d2z4mb1, d2z4mc2, d2z4md1, d2z4me1, d2z4me2, d2z4mf1, d2z4mg1, d2z4mh1, d2z4mi1, d2z4mj1, d2z4mk1, d2z4ml1, d2z4mm1, d2z4mn1, d2z4mp1, d2z4mq1, d2z4mr1, d2z4ms1, d2z4mt1, d2z4mu1 protein/RNA complex; complexed with mg, par protein/RNA complex; complexed with mg, par |
Domain d3df1c1: 3df1 C:1-105 [157603] Other proteins in same PDB: d3df1b1, d3df1c2, d3df1d1, d3df1e1, d3df1e2, d3df1f1, d3df1g1, d3df1h1, d3df1i1, d3df1j1, d3df1k1, d3df1l1, d3df1m1, d3df1n1, d3df1o1, d3df1p1, d3df1q1, d3df1r1, d3df1s1, d3df1t1, d3df1u1 protein/RNA complex; complexed with hyg, mg protein/RNA complex; complexed with hyg, mg |
Domain d3df3c1: 3df3 C:1-105 [157657] Other proteins in same PDB: d3df3b1, d3df3c2, d3df3d1, d3df3e1, d3df3e2, d3df3f1, d3df3g1, d3df3h1, d3df3i1, d3df3j1, d3df3k1, d3df3l1, d3df3m1, d3df3n1, d3df3o1, d3df3p1, d3df3q1, d3df3r1, d3df3s1, d3df3t1, d3df3u1 protein/RNA complex; complexed with hyg, mg protein/RNA complex; complexed with hyg, mg |
Mouse (Mus musculus) [TaxId:10090] [117914] (1 PDB entry) Uniprot P23396 17-95 |
Domain d1wh9a1: 1wh9 A:8-86 [114637] Other proteins in same PDB: d1wh9a2, d1wh9a3 Structural genomics target |
Thermus thermophilus [TaxId:274] [54817] (36 PDB entries) Uniprot P80372 |
Domain d1xmoc1: 1xmo C:2-106 [115500] Other proteins in same PDB: d1xmob_, d1xmoc2, d1xmod_, d1xmoe1, d1xmoe2, d1xmof_, d1xmog_, d1xmoh_, d1xmoi_, d1xmoj_, d1xmok_, d1xmol_, d1xmom_, d1xmon_, d1xmoo_, d1xmop_, d1xmoq_, d1xmor_, d1xmos_, d1xmot_, d1xmov_ protein/RNA complex; complexed with mg, par, zn |
Domain d2f4vc1: 2f4v C:2-106 [132938] Other proteins in same PDB: d2f4vb1, d2f4vc2, d2f4vd1, d2f4ve1, d2f4ve2, d2f4vf1, d2f4vg1, d2f4vh1, d2f4vi1, d2f4vj1, d2f4vk1, d2f4vl1, d2f4vm1, d2f4vn1, d2f4vo1, d2f4vp1, d2f4vq1, d2f4vr1, d2f4vs1, d2f4vt1 automatically matched to d1fjgc1 complexed with ab9, d2c, k, mg, zn |
Domain d2hhhc1: 2hhh C:2-106 [136477] Other proteins in same PDB: d2hhhb1, d2hhhc2, d2hhhd1, d2hhhe1, d2hhhe2, d2hhhf1, d2hhhg1, d2hhhh1, d2hhhi1, d2hhhj1, d2hhhk1, d2hhhl1, d2hhhm1, d2hhhn1, d2hhho1, d2hhhp1, d2hhhq1, d2hhhr1, d2hhhs1, d2hhht1, d2hhhu1 automatically matched to d1fjgc1 complexed with ksg |
Domain d2j00c1: 2j00 C:2-106 [137839] Other proteins in same PDB: d2j00b1, d2j00c2, d2j00d1, d2j00e1, d2j00e2, d2j00f1, d2j00g1, d2j00h1, d2j00i1, d2j00j1, d2j00k1, d2j00l1, d2j00m1, d2j00n1, d2j00o1, d2j00p1, d2j00q1, d2j00r1, d2j00s1, d2j00t1, d2j00u1 protein/RNA complex; complexed with mg, par, zn protein/RNA complex; complexed with mg, par, zn |
Domain d2j02c1: 2j02 C:2-106 [137866] Other proteins in same PDB: d2j02b1, d2j02c2, d2j02d1, d2j02e1, d2j02e2, d2j02f1, d2j02g1, d2j02h1, d2j02i1, d2j02j1, d2j02k1, d2j02l1, d2j02m1, d2j02n1, d2j02o1, d2j02p1, d2j02q1, d2j02r1, d2j02s1, d2j02t1, d2j02u1 protein/RNA complex; complexed with mg, par, zn protein/RNA complex; complexed with mg, par, zn |
Domain d2uu9c1: 2uu9 C:2-106 [139893] Other proteins in same PDB: d2uu9b1, d2uu9c2, d2uu9d1, d2uu9e1, d2uu9e2, d2uu9f1, d2uu9g1, d2uu9h1, d2uu9j1, d2uu9k1, d2uu9l1, d2uu9m1, d2uu9n1, d2uu9o1, d2uu9p1, d2uu9q1, d2uu9r1, d2uu9s1, d2uu9t1, d2uu9u1 automatically matched to d1fjgc1 protein/RNA complex; complexed with k, mg, par, zn |
Domain d2uuac1: 2uua C:2-106 [139913] Other proteins in same PDB: d2uuab1, d2uuac2, d2uuad1, d2uuae1, d2uuae2, d2uuaf1, d2uuag1, d2uuah1, d2uuaj1, d2uuak1, d2uual1, d2uuam1, d2uuan1, d2uuao1, d2uuap1, d2uuaq1, d2uuar1, d2uuas1, d2uuat1, d2uuau1 automatically matched to d1fjgc1 protein/RNA complex; complexed with k, mg, par, zn |
Domain d2uubc1: 2uub C:2-106 [139933] Other proteins in same PDB: d2uubb1, d2uubc2, d2uubd1, d2uube1, d2uube2, d2uubf1, d2uubg1, d2uubh1, d2uubj1, d2uubk1, d2uubl1, d2uubm1, d2uubn1, d2uubo1, d2uubp1, d2uubq1, d2uubr1, d2uubs1, d2uubt1, d2uubu1 automatically matched to d1fjgc1 protein/RNA complex; complexed with k, mg, par, zn |
Domain d2uucc1: 2uuc C:2-106 [139953] Other proteins in same PDB: d2uucb1, d2uucc2, d2uucd1, d2uuce1, d2uuce2, d2uucf1, d2uucg1, d2uuch1, d2uucj1, d2uuck1, d2uucl1, d2uucm1, d2uucn1, d2uuco1, d2uucp1, d2uucq1, d2uucr1, d2uucs1, d2uuct1, d2uucu1 automatically matched to d1fjgc1 protein/RNA complex; complexed with k, mg, par, zn |
Domain d2uxcc1: 2uxc C:2-106 [140004] Other proteins in same PDB: d2uxcb1, d2uxcc2, d2uxcd1, d2uxce1, d2uxce2, d2uxcf1, d2uxcg1, d2uxch1, d2uxci1, d2uxcj1, d2uxck1, d2uxcl1, d2uxcm1, d2uxcn1, d2uxco1, d2uxcp1, d2uxcq1, d2uxcr1, d2uxcs1, d2uxct1, d2uxcu1 automatically matched to d1fjgc1 protein/RNA complex; complexed with k, mg, par, zn |
Timeline for Protein Ribosomal protein S3 N-terminal domain from d.52.3.1: Prokaryotic type KH domain (KH-domain type II):