SCOP 1.67: Species: Rice dwarf virus

Lineage for Species: Rice dwarf virus

Root: SCOP 1.67
Class b: All beta proteins [48724] (141 folds)
Fold b.19: Viral protein domain [49817] (1 superfamily)
sandwich; 9 strands in 2 sheets; jelly-roll; form trimers
Superfamily b.19.1: Viral protein domain [49818] (3 families)
forms homotrimers
Family b.19.1.1: Top domain of virus capsid protein [49819] (3 proteins)
this domain is inserted into a multihelical domain
Protein RDV p8, central (top) domain [100924] (2 species)
Species Rice dwarf virus [TaxId:10991] [101592] (1 PDB entry)

PDB entry in Species: Rice dwarf virus:

Domain(s) for 1uf2:
1. Domain d1uf2c2: 1uf2 C:148-300 [99292]
  Other proteins in same PDB: d1uf2a_, d1uf2b_, d1uf2c1, d1uf2d1, d1uf2e1, d1uf2f1, d1uf2g1, d1uf2h1, d1uf2i1, d1uf2j1, d1uf2p1, d1uf2q1, d1uf2r1, d1uf2s1, d1uf2t1
2. Domain d1uf2d2: 1uf2 D:148-300 [99294]
  Other proteins in same PDB: d1uf2a_, d1uf2b_, d1uf2c1, d1uf2d1, d1uf2e1, d1uf2f1, d1uf2g1, d1uf2h1, d1uf2i1, d1uf2j1, d1uf2p1, d1uf2q1, d1uf2r1, d1uf2s1, d1uf2t1
3. Domain d1uf2e2: 1uf2 E:148-300 [99296]
  Other proteins in same PDB: d1uf2a_, d1uf2b_, d1uf2c1, d1uf2d1, d1uf2e1, d1uf2f1, d1uf2g1, d1uf2h1, d1uf2i1, d1uf2j1, d1uf2p1, d1uf2q1, d1uf2r1, d1uf2s1, d1uf2t1
4. Domain d1uf2f2: 1uf2 F:148-300 [99298]
  Other proteins in same PDB: d1uf2a_, d1uf2b_, d1uf2c1, d1uf2d1, d1uf2e1, d1uf2f1, d1uf2g1, d1uf2h1, d1uf2i1, d1uf2j1, d1uf2p1, d1uf2q1, d1uf2r1, d1uf2s1, d1uf2t1
5. Domain d1uf2g2: 1uf2 G:148-300 [99300]
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6. Domain d1uf2h2: 1uf2 H:148-300 [99302]
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7. Domain d1uf2i2: 1uf2 I:148-300 [99304]
  Other proteins in same PDB: d1uf2a_, d1uf2b_, d1uf2c1, d1uf2d1, d1uf2e1, d1uf2f1, d1uf2g1, d1uf2h1, d1uf2i1, d1uf2j1, d1uf2p1, d1uf2q1, d1uf2r1, d1uf2s1, d1uf2t1
8. Domain d1uf2j2: 1uf2 J:148-300 [99306]
  Other proteins in same PDB: d1uf2a_, d1uf2b_, d1uf2c1, d1uf2d1, d1uf2e1, d1uf2f1, d1uf2g1, d1uf2h1, d1uf2i1, d1uf2j1, d1uf2p1, d1uf2q1, d1uf2r1, d1uf2s1, d1uf2t1
9. Domain d1uf2p2: 1uf2 P:148-300 [99308]
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10. Domain d1uf2q2: 1uf2 Q:148-300 [99310]
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11. Domain d1uf2r2: 1uf2 R:148-300 [99312]
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12. Domain d1uf2s2: 1uf2 S:148-300 [99314]
  Other proteins in same PDB: d1uf2a_, d1uf2b_, d1uf2c1, d1uf2d1, d1uf2e1, d1uf2f1, d1uf2g1, d1uf2h1, d1uf2i1, d1uf2j1, d1uf2p1, d1uf2q1, d1uf2r1, d1uf2s1, d1uf2t1
13. Domain d1uf2t2: 1uf2 T:148-300 [99316]
  Other proteins in same PDB: d1uf2a_, d1uf2b_, d1uf2c1, d1uf2d1, d1uf2e1, d1uf2f1, d1uf2g1, d1uf2h1, d1uf2i1, d1uf2j1, d1uf2p1, d1uf2q1, d1uf2r1, d1uf2s1, d1uf2t1

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Species Rice dwarf virus [TaxId:10991] from b.19.1.1 RDV p8, central (top) domain appears in SCOP 1.69
Species Rice dwarf virus [TaxId:10991] from b.19.1.1 RDV p8, central (top) domain appears in the current release, SCOPe 2.08