SCOPe 2.02: Protein: Transcription termination factor Rho, ATPase domain

Lineage for Protein: Transcription termination factor Rho, ATPase domain

Root: SCOPe 2.02
Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (147 folds)
Fold c.37: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases [52539] (1 superfamily)
3 layers: a/b/a, parallel or mixed beta-sheets of variable sizes
Superfamily c.37.1: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases [52540] (25 families)
division into families based on beta-sheet topologies
Family c.37.1.11: RecA protein-like (ATPase-domain) [52670] (18 proteins)
core: mixed beta-sheet of 8 strands, order 32451678; strand 7 is antiparallel to the rest
Protein Transcription termination factor Rho, ATPase domain [89676] (1 species)

Species:

Escherichia coli [TaxId:562] [89677] (5 PDB entries)
Uniprot P03002

Domains for 1pv4:
1. Domain d1pv4a3: 1pv4 A:129-417 [88297]
  Other proteins in same PDB: d1pv4a1, d1pv4a2, d1pv4b1, d1pv4c1, d1pv4c2, d1pv4d1, d1pv4d2, d1pv4e1, d1pv4e2, d1pv4f1, d1pv4f2
  protein/DNA complex
2. Domain d1pv4b2: 1pv4 B:129-417 [88299]
  Other proteins in same PDB: d1pv4a1, d1pv4a2, d1pv4b1, d1pv4c1, d1pv4c2, d1pv4d1, d1pv4d2, d1pv4e1, d1pv4e2, d1pv4f1, d1pv4f2
  protein/DNA complex
3. Domain d1pv4c3: 1pv4 C:129-417 [88302]
  Other proteins in same PDB: d1pv4a1, d1pv4a2, d1pv4b1, d1pv4c1, d1pv4c2, d1pv4d1, d1pv4d2, d1pv4e1, d1pv4e2, d1pv4f1, d1pv4f2
  protein/DNA complex
4. Domain d1pv4d3: 1pv4 D:129-417 [88305]
  Other proteins in same PDB: d1pv4a1, d1pv4a2, d1pv4b1, d1pv4c1, d1pv4c2, d1pv4d1, d1pv4d2, d1pv4e1, d1pv4e2, d1pv4f1, d1pv4f2
  protein/DNA complex
5. Domain d1pv4e3: 1pv4 E:129-417 [88308]
  Other proteins in same PDB: d1pv4a1, d1pv4a2, d1pv4b1, d1pv4c1, d1pv4c2, d1pv4d1, d1pv4d2, d1pv4e1, d1pv4e2, d1pv4f1, d1pv4f2
  protein/DNA complex
6. Domain d1pv4f3: 1pv4 F:129-417 [88311]
  Other proteins in same PDB: d1pv4a1, d1pv4a2, d1pv4b1, d1pv4c1, d1pv4c2, d1pv4d1, d1pv4d2, d1pv4e1, d1pv4e2, d1pv4f1, d1pv4f2
  protein/DNA complex

Domains for 1pvo:

Domain d1pvoa3: 1pvo A:129-417 [88318]
Other proteins in same PDB: d1pvoa1, d1pvoa2, d1pvob1, d1pvoc1, d1pvoc2, d1pvod1, d1pvod2, d1pvoe1, d1pvoe2, d1pvof1, d1pvof2
protein/RNA complex; complexed with anp

Domain d1pvob2: 1pvo B:129-417 [88320]
Other proteins in same PDB: d1pvoa1, d1pvoa2, d1pvob1, d1pvoc1, d1pvoc2, d1pvod1, d1pvod2, d1pvoe1, d1pvoe2, d1pvof1, d1pvof2
protein/RNA complex; complexed with anp

Domain d1pvoc3: 1pvo C:129-417 [88323]
Other proteins in same PDB: d1pvoa1, d1pvoa2, d1pvob1, d1pvoc1, d1pvoc2, d1pvod1, d1pvod2, d1pvoe1, d1pvoe2, d1pvof1, d1pvof2
protein/RNA complex; complexed with anp

Domain d1pvod3: 1pvo D:129-417 [88326]
Other proteins in same PDB: d1pvoa1, d1pvoa2, d1pvob1, d1pvoc1, d1pvoc2, d1pvod1, d1pvod2, d1pvoe1, d1pvoe2, d1pvof1, d1pvof2
protein/RNA complex; complexed with anp

Domain d1pvoe3: 1pvo E:129-417 [88329]
Other proteins in same PDB: d1pvoa1, d1pvoa2, d1pvob1, d1pvoc1, d1pvoc2, d1pvod1, d1pvod2, d1pvoe1, d1pvoe2, d1pvof1, d1pvof2
protein/RNA complex; complexed with anp

Domain d1pvof3: 1pvo F:129-417 [88332]
Other proteins in same PDB: d1pvoa1, d1pvoa2, d1pvob1, d1pvoc1, d1pvoc2, d1pvod1, d1pvod2, d1pvoe1, d1pvoe2, d1pvof1, d1pvof2
protein/RNA complex; complexed with anp

Domains for 1xpo:

Domain d1xpoa3: 1xpo A:130-417 [122214]
Other proteins in same PDB: d1xpoa1, d1xpoa2, d1xpob1, d1xpob2, d1xpoc1, d1xpoc2, d1xpod1, d1xpod2, d1xpoe1, d1xpoe2, d1xpof1, d1xpof2
automatically matched to d1pv4a3
protein/RNA complex; complexed with ags, bcm, mg

Domain d1xpob3: 1xpo B:130-417 [122217]
Other proteins in same PDB: d1xpoa1, d1xpoa2, d1xpob1, d1xpob2, d1xpoc1, d1xpoc2, d1xpod1, d1xpod2, d1xpoe1, d1xpoe2, d1xpof1, d1xpof2
automatically matched to d1pv4a3
protein/RNA complex; complexed with ags, bcm, mg

Domain d1xpoc3: 1xpo C:130-417 [122220]
Other proteins in same PDB: d1xpoa1, d1xpoa2, d1xpob1, d1xpob2, d1xpoc1, d1xpoc2, d1xpod1, d1xpod2, d1xpoe1, d1xpoe2, d1xpof1, d1xpof2
automatically matched to d1pv4a3
protein/RNA complex; complexed with ags, bcm, mg

Domain d1xpod3: 1xpo D:130-417 [122223]
Other proteins in same PDB: d1xpoa1, d1xpoa2, d1xpob1, d1xpob2, d1xpoc1, d1xpoc2, d1xpod1, d1xpod2, d1xpoe1, d1xpoe2, d1xpof1, d1xpof2
automatically matched to d1pv4a3
protein/RNA complex; complexed with ags, bcm, mg

Domain d1xpoe3: 1xpo E:130-417 [122226]
Other proteins in same PDB: d1xpoa1, d1xpoa2, d1xpob1, d1xpob2, d1xpoc1, d1xpoc2, d1xpod1, d1xpod2, d1xpoe1, d1xpoe2, d1xpof1, d1xpof2
automatically matched to d1pv4a3
protein/RNA complex; complexed with ags, bcm, mg

Domain d1xpof3: 1xpo F:130-417 [122229]
Other proteins in same PDB: d1xpoa1, d1xpoa2, d1xpob1, d1xpob2, d1xpoc1, d1xpoc2, d1xpod1, d1xpod2, d1xpoe1, d1xpoe2, d1xpof1, d1xpof2
automatically matched to d1pv4a3
protein/RNA complex; complexed with ags, bcm, mg

Domains for 1xpr:

Domain d1xpra3: 1xpr A:129-417 [115774]
Other proteins in same PDB: d1xpra1, d1xpra2, d1xprb1, d1xprb2, d1xprc1, d1xprc2, d1xprd1, d1xprd2, d1xpre1, d1xpre2, d1xprf1, d1xprf2
protein/RNA complex; complexed with ags, fb, mg

Domain d1xprb3: 1xpr B:129-417 [115777]
Other proteins in same PDB: d1xpra1, d1xpra2, d1xprb1, d1xprb2, d1xprc1, d1xprc2, d1xprd1, d1xprd2, d1xpre1, d1xpre2, d1xprf1, d1xprf2
protein/RNA complex; complexed with ags, fb, mg

Domain d1xprc3: 1xpr C:129-417 [115780]
Other proteins in same PDB: d1xpra1, d1xpra2, d1xprb1, d1xprb2, d1xprc1, d1xprc2, d1xprd1, d1xprd2, d1xpre1, d1xpre2, d1xprf1, d1xprf2
protein/RNA complex; complexed with ags, fb, mg

Domain d1xprd3: 1xpr D:129-417 [115783]
Other proteins in same PDB: d1xpra1, d1xpra2, d1xprb1, d1xprb2, d1xprc1, d1xprc2, d1xprd1, d1xprd2, d1xpre1, d1xpre2, d1xprf1, d1xprf2
protein/RNA complex; complexed with ags, fb, mg

Domain d1xpre3: 1xpr E:129-417 [115786]
Other proteins in same PDB: d1xpra1, d1xpra2, d1xprb1, d1xprb2, d1xprc1, d1xprc2, d1xprd1, d1xprd2, d1xpre1, d1xpre2, d1xprf1, d1xprf2
protein/RNA complex; complexed with ags, fb, mg

Domain d1xprf3: 1xpr F:129-417 [115789]
Other proteins in same PDB: d1xpra1, d1xpra2, d1xprb1, d1xprb2, d1xprc1, d1xprc2, d1xprd1, d1xprd2, d1xpre1, d1xpre2, d1xprf1, d1xprf2
protein/RNA complex; complexed with ags, fb, mg

Domains for 1xpu:

Domain d1xpua3: 1xpu A:129-417 [115792]
Other proteins in same PDB: d1xpua1, d1xpua2, d1xpub1, d1xpub2, d1xpuc1, d1xpuc2, d1xpud1, d1xpud2, d1xpue1, d1xpue2, d1xpuf1, d1xpuf2
protein/RNA complex; complexed with ags, fpd, mg

Domain d1xpub3: 1xpu B:129-417 [115795]
Other proteins in same PDB: d1xpua1, d1xpua2, d1xpub1, d1xpub2, d1xpuc1, d1xpuc2, d1xpud1, d1xpud2, d1xpue1, d1xpue2, d1xpuf1, d1xpuf2
protein/RNA complex; complexed with ags, fpd, mg

Domain d1xpuc3: 1xpu C:129-417 [115798]
Other proteins in same PDB: d1xpua1, d1xpua2, d1xpub1, d1xpub2, d1xpuc1, d1xpuc2, d1xpud1, d1xpud2, d1xpue1, d1xpue2, d1xpuf1, d1xpuf2
protein/RNA complex; complexed with ags, fpd, mg

Domain d1xpud3: 1xpu D:129-417 [115801]
Other proteins in same PDB: d1xpua1, d1xpua2, d1xpub1, d1xpub2, d1xpuc1, d1xpuc2, d1xpud1, d1xpud2, d1xpue1, d1xpue2, d1xpuf1, d1xpuf2
protein/RNA complex; complexed with ags, fpd, mg

Domain d1xpue3: 1xpu E:129-417 [115804]
Other proteins in same PDB: d1xpua1, d1xpua2, d1xpub1, d1xpub2, d1xpuc1, d1xpuc2, d1xpud1, d1xpud2, d1xpue1, d1xpue2, d1xpuf1, d1xpuf2
protein/RNA complex; complexed with ags, fpd, mg

Domain d1xpuf3: 1xpu F:129-417 [115807]
Other proteins in same PDB: d1xpua1, d1xpua2, d1xpub1, d1xpub2, d1xpuc1, d1xpuc2, d1xpud1, d1xpud2, d1xpue1, d1xpue2, d1xpuf1, d1xpuf2
protein/RNA complex; complexed with ags, fpd, mg

More info for Protein Transcription termination factor Rho, ATPase domain from c.37.1.11: RecA protein-like (ATPase-domain)

Timeline for Protein Transcription termination factor Rho, ATPase domain from c.37.1.11: RecA protein-like (ATPase-domain):

Protein Transcription termination factor Rho, ATPase domain from c.37.1.11: RecA protein-like (ATPase-domain) first appeared in SCOP 1.65
Protein Transcription termination factor Rho, ATPase domain from c.37.1.11: RecA protein-like (ATPase-domain) appears in SCOPe 2.01
Protein Transcription termination factor Rho, ATPase domain from c.37.1.11: RecA protein-like (ATPase-domain) appears in SCOPe 2.03
Protein Transcription termination factor Rho, ATPase domain from c.37.1.11: RecA protein-like (ATPase-domain) appears in the current release, SCOPe 2.08