SCOP 1.73: Domain d1q7yc1: 1q7y C:91-237

Lineage for d1q7yc1 (1q7y C:91-237)

1. Root: SCOP 1.73

2. Class b: All beta proteins [48724] (165 folds)

3. Fold b.34: SH3-like barrel [50036] (18 superfamilies)
   barrel, partly opened; n*=4, S*=8; meander
   the last strand is interrupted by a turn of 3-10 helix

4. Superfamily b.34.5: Translation proteins SH3-like domain [50104] (6 families)
   many known members contain KOW motif

5. Family b.34.5.3: C-terminal domain of ribosomal protein L2 [50114] (1 protein)

6. Protein C-terminal domain of ribosomal protein L2 [50115] (2 species)

7. Species Archaeon Haloarcula marismortui [TaxId:2238] [50117] (40 PDB entries)

8. Domain d1q7yc1: 1q7y C:91-237 [96064]
   Other proteins in same PDB: d1q7y1_, d1q7y2_, d1q7y3_, d1q7y4_, d1q7yc2, d1q7yd_, d1q7ye_, d1q7yf_, d1q7yg1, d1q7yg2, d1q7yh_, d1q7yi_, d1q7yj_, d1q7yk_, d1q7yl_, d1q7ym_, d1q7yn_, d1q7yo_, d1q7yp_, d1q7yq_, d1q7yr_, d1q7ys_, d1q7yt_, d1q7yu_, d1q7yv_, d1q7yw_, d1q7yx_, d1q7yy_, d1q7yz_
   complexed with cd, cl, k, mg, na, po4, puy

Details for d1q7yc1

PDB Entry: 1q7y, 3.2 Å

PDB Description: crystal structure of ccdap-puromycin bound at the peptidyl transferase center of the 50s ribosomal subunit

PDB Compounds: (C:) 50S ribosomal protein L2P

SCOP Domain Sequences for d1q7yc1:

Sequence; same for both SEQRES and ATOM records:

>d1q7yc1 b.34.5.3 (C:91-237) C-terminal domain of ribosomal protein L2 {Archaeon Haloarcula marismortui [TaxId: 2238]}
gntlplaeipegvpvcnvesspgdggkfarasgvnaqllthdrnvavvklpsgemkrldp
qcratigvvggggrtdkpfvkagnkhhkmkargtkwpnvrgvamnavdhpfggggrqhpg
kpksisrnappgrkvgdiaskrtgrgg

Timeline for d1q7yc1:

• d1q7yc1 first appeared in SCOP 1.67
  
• d1q7yc1 appears in SCOP 1.71
  
• d1q7yc1 appears in SCOP 1.75
  
• d1q7yc1 appears in the current release, SCOPe 2.08