Lineage for Species: Escherichia coli

  1. Root: SCOP 1.67
  2. 383641Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (130 folds)
  3. 393331Fold c.37: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases [52539] (1 superfamily)
    3 layers: a/b/a, parallel or mixed beta-sheets of variable sizes
  4. 393332Superfamily c.37.1: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases [52540] (22 families) (S)
    division into families based on beta-sheet topologies
  5. 394452Family c.37.1.11: RecA protein-like (ATPase-domain) [52670] (12 proteins)
    core: mixed beta-sheet of 8 strands, order 32451678; strand 7 is antiparallel to the rest
  6. 394672Protein Transcription termination factor Rho, ATPase domain [89676] (1 species)
  7. 394673Species Escherichia coli [TaxId:562] [89677] (2 PDB entries)

PDB entries in Species: Escherichia coli:

  1. Domain(s) for 1pv4:
    1. 394680Domain d1pv4a3: 1pv4 A:129-417 [88297]
      Other proteins in same PDB: d1pv4a1, d1pv4a2, d1pv4b1, d1pv4c1, d1pv4c2, d1pv4d1, d1pv4d2, d1pv4e1, d1pv4e2, d1pv4f1, d1pv4f2
    2. 394681Domain d1pv4b2: 1pv4 B:129-417 [88299]
      Other proteins in same PDB: d1pv4a1, d1pv4a2, d1pv4b1, d1pv4c1, d1pv4c2, d1pv4d1, d1pv4d2, d1pv4e1, d1pv4e2, d1pv4f1, d1pv4f2
    3. 394682Domain d1pv4c3: 1pv4 C:129-417 [88302]
      Other proteins in same PDB: d1pv4a1, d1pv4a2, d1pv4b1, d1pv4c1, d1pv4c2, d1pv4d1, d1pv4d2, d1pv4e1, d1pv4e2, d1pv4f1, d1pv4f2
    4. 394683Domain d1pv4d3: 1pv4 D:129-417 [88305]
      Other proteins in same PDB: d1pv4a1, d1pv4a2, d1pv4b1, d1pv4c1, d1pv4c2, d1pv4d1, d1pv4d2, d1pv4e1, d1pv4e2, d1pv4f1, d1pv4f2
    5. 394684Domain d1pv4e3: 1pv4 E:129-417 [88308]
      Other proteins in same PDB: d1pv4a1, d1pv4a2, d1pv4b1, d1pv4c1, d1pv4c2, d1pv4d1, d1pv4d2, d1pv4e1, d1pv4e2, d1pv4f1, d1pv4f2
    6. 394685Domain d1pv4f3: 1pv4 F:129-417 [88311]
      Other proteins in same PDB: d1pv4a1, d1pv4a2, d1pv4b1, d1pv4c1, d1pv4c2, d1pv4d1, d1pv4d2, d1pv4e1, d1pv4e2, d1pv4f1, d1pv4f2
      complexed with mse
  2. Domain(s) for 1pvo:
    1. 394674Domain d1pvoa3: 1pvo A:129-417 [88318]
      Other proteins in same PDB: d1pvoa1, d1pvoa2, d1pvob1, d1pvoc1, d1pvoc2, d1pvod1, d1pvod2, d1pvoe1, d1pvoe2, d1pvof1, d1pvof2
    2. 394675Domain d1pvob2: 1pvo B:129-417 [88320]
      Other proteins in same PDB: d1pvoa1, d1pvoa2, d1pvob1, d1pvoc1, d1pvoc2, d1pvod1, d1pvod2, d1pvoe1, d1pvoe2, d1pvof1, d1pvof2
    3. 394676Domain d1pvoc3: 1pvo C:129-417 [88323]
      Other proteins in same PDB: d1pvoa1, d1pvoa2, d1pvob1, d1pvoc1, d1pvoc2, d1pvod1, d1pvod2, d1pvoe1, d1pvoe2, d1pvof1, d1pvof2
    4. 394677Domain d1pvod3: 1pvo D:129-417 [88326]
      Other proteins in same PDB: d1pvoa1, d1pvoa2, d1pvob1, d1pvoc1, d1pvoc2, d1pvod1, d1pvod2, d1pvoe1, d1pvoe2, d1pvof1, d1pvof2
    5. 394678Domain d1pvoe3: 1pvo E:129-417 [88329]
      Other proteins in same PDB: d1pvoa1, d1pvoa2, d1pvob1, d1pvoc1, d1pvoc2, d1pvod1, d1pvod2, d1pvoe1, d1pvoe2, d1pvof1, d1pvof2
    6. 394679Domain d1pvof3: 1pvo F:129-417 [88332]
      Other proteins in same PDB: d1pvoa1, d1pvoa2, d1pvob1, d1pvoc1, d1pvoc2, d1pvod1, d1pvod2, d1pvoe1, d1pvoe2, d1pvof1, d1pvof2
      complexed with anp

More info for Species Escherichia coli [TaxId:562] from c.37.1.11 Transcription termination factor Rho, ATPase domain

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